蛋白质的研究方法与原理 (2)精选课件.ppt
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1、关于蛋白质的研究方法与原理(2)第一页,本课件共有121页第一节第一节 概概 述述第二页,本课件共有121页 蛋白质的分离纯化包括以下过程:蛋白质的分离纯化包括以下过程:1.破碎生物组织,并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来;破碎生物组织,并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来;2.将有关的蛋白质分级沉淀下来将有关的蛋白质分级沉淀下来;(盐析法或有机溶剂法)(盐析法或有机溶剂法)3.应用应用层析法层析法或或电泳法电泳法使它们各自分开使它们各自分开;4.蛋白质结晶;蛋白质结晶;5.蛋白质纯度鉴定和含量测定。蛋白质纯度鉴定和含量测定。直接从生物组织中提纯蛋白直接从生物组织中提纯蛋白第三页,本课件共有121页
2、 制备过程中注意事项制备过程中注意事项:要求自始至终保持在要求自始至终保持在天然状态天然状态1.1.避免一切过激因素避免一切过激因素-如过酸或过碱,高温,如过酸或过碱,高温,重金属等的影响。重金属等的影响。2.2.通常都在低温条件下操作。通常都在低温条件下操作。3.3.尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高 水平。水平。第四页,本课件共有121页第二节第二节 蛋白质的分离与纯化技术蛋白质的分离与纯化技术第五页,本课件共有121页一、蛋白质沉淀与结晶一、蛋白质沉淀与结晶 第六页,本课件共有121页 (一)(一)盐析法盐析法 概念概念:将:将中性盐加入蛋白质溶液,
3、破坏水化膜和电中性盐加入蛋白质溶液,破坏水化膜和电荷而使蛋白质沉淀,叫盐析。各种蛋白质盐析所需荷而使蛋白质沉淀,叫盐析。各种蛋白质盐析所需的盐浓度及的盐浓度及PH不同,加入不同浓度的中性盐可不同,加入不同浓度的中性盐可使各种使各种蛋白质依次分别沉淀出来。蛋白质依次分别沉淀出来。优点:操作简便优点:操作简便 对易变性的蛋白质有一定的保护作用,对易变性的蛋白质有一定的保护作用,适用范围十分广泛。适用范围十分广泛。缺点:分辨能力差,纯化倍数低缺点:分辨能力差,纯化倍数低第七页,本课件共有121页(1 1)盐的种类)盐的种类对同一种对同一种PrPr而言,而言,价数愈高价数愈高的盐离子,盐析能力的盐离子
4、,盐析能力也愈强也愈强:PO3-4SO42-C2O42-(CHOHCOO-)2 ACCLNO3-Br-I-CNS-K+Rb+Na+Cs+Li+NH4+常用的中性盐常用的中性盐有如硫酸盐、磷酸盐等。有如硫酸盐、磷酸盐等。第八页,本课件共有121页硫酸铵硫酸铵(常用盐析剂)(常用盐析剂)优点:盐析能力较强优点:盐析能力较强 具有较高的溶解度具有较高的溶解度 较低的溶解度温度系数较低的溶解度温度系数 价格低廉价格低廉 不产生副作用。不产生副作用。缺点:缓冲能力较差缺点:缓冲能力较差 PHPH难控制难控制第九页,本课件共有121页(2 2)PHPH和温度和温度S S。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度。
5、代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度 除取决于除取决于PrPr的种类,还受的种类,还受PHPH及温度影响及温度影响:n PH=PI PH=PI时,时,S S。的数值极小。的数值极小n S S。随温度增加而减低。随温度增加而减低。盐析过程中,若增高温度,有助于盐析过程中,若增高温度,有助于PrPr的析出。的析出。第十页,本课件共有121页(3 3)蛋白质浓度)蛋白质浓度 PrPr较高较高,在较低无机盐浓度时,在较低无机盐浓度时,蛋白质便开蛋白质便开 始析出,盐析界限比较宽。始析出,盐析界限比较宽。PrPr较低较低,需要无机盐的浓度也高,即盐析,需要无机盐的浓度也高,即盐析 界限变窄。界限变窄。第十一
6、页,本课件共有121页1.1.基本原理基本原理(1)在)在PI附近,附近,Pr主要以中性离子形式存在。此时若添加主要以中性离子形式存在。此时若添加 有机溶剂,由于有机溶剂,由于有机溶剂有机溶剂可使溶液可使溶液电离电离常数常数减小,增强了减小,增强了 中性离子间静电引力,从而使分集合而沉淀出来。中性离子间静电引力,从而使分集合而沉淀出来。(2)有机溶剂有机溶剂本身的水合作用会破坏本身的水合作用会破坏Pr表面的水合层,也表面的水合层,也 促使促使Pr变得不稳定而聚集析出变得不稳定而聚集析出.常用的有机溶剂:乙醇和丙酮常用的有机溶剂:乙醇和丙酮 (二)有机溶剂沉淀法(二)有机溶剂沉淀法 分辨力比盐析
7、方法高,提纯效果好分辨力比盐析方法高,提纯效果好 第十二页,本课件共有121页(三)选择性沉淀法(三)选择性沉淀法 选择一定的条件使其它蛋白质变性沉淀而不影响目标蛋白质选择一定的条件使其它蛋白质变性沉淀而不影响目标蛋白质的分离方法。例如,将提取液加热至一定温度并维持一段时的分离方法。例如,将提取液加热至一定温度并维持一段时间,是某些不耐热的蛋白质变性沉淀等。应用选择星辰殿,间,是某些不耐热的蛋白质变性沉淀等。应用选择星辰殿,徐实现对系统中需除去的及欲提纯的蛋白质的理化性质均有徐实现对系统中需除去的及欲提纯的蛋白质的理化性质均有较全面的了解。较全面的了解。第十三页,本课件共有121页(四)蛋白质
8、结晶(四)蛋白质结晶 蛋白质结晶即是溶液中的蛋白质由随机状态转变为有蛋白质结晶即是溶液中的蛋白质由随机状态转变为有规则排列状态的固体,常用语分析研究其结构。规则排列状态的固体,常用语分析研究其结构。蛋白质结晶是一个有序化过程,当蛋白质溶液达到过饱蛋白质结晶是一个有序化过程,当蛋白质溶液达到过饱和状态,能够形成一定大小的晶核,溶液中的分子失去和状态,能够形成一定大小的晶核,溶液中的分子失去自由运动的能量,不断地结合到形成的晶核上,长成适自由运动的能量,不断地结合到形成的晶核上,长成适合于合于X X线衍射分析的晶体。线衍射分析的晶体。第十四页,本课件共有121页二、离心技术分离蛋白质二、离心技术分
9、离蛋白质 离心技术是利用物体告离心技术是利用物体告诉旋转时产生强大的离心力,诉旋转时产生强大的离心力,使置于旋转体中的悬浮颗粒使置于旋转体中的悬浮颗粒发生沉降或漂浮,从而使某发生沉降或漂浮,从而使某些颗粒达到浓缩或与其它颗些颗粒达到浓缩或与其它颗粒分离之目的。粒分离之目的。第十五页,本课件共有121页三、层析技术分离纯化蛋白质三、层析技术分离纯化蛋白质最基本的特征:最基本的特征:固定相固定相 流动相流动相层析技术层析技术(chromatography)又称色谱技术,是利又称色谱技术,是利用不同物质理化性质的差异而建立起来的技术。用不同物质理化性质的差异而建立起来的技术。各种物质得以分离的最基本
10、原因:各种物质得以分离的最基本原因:就在于它们在这就在于它们在这 两个相之间具有不同的分配系数两个相之间具有不同的分配系数.两相作相对运动时,两相作相对运动时,这些物质在两相间进行多次的分配,即使它们的分这些物质在两相间进行多次的分配,即使它们的分 配系数只有微小的差异,通过这个过程也能得到最配系数只有微小的差异,通过这个过程也能得到最 大的分离效果。大的分离效果。第十六页,本课件共有121页 气相层析气相层析 按按两相状态两相状态来分来分 液相层析液相层析 吸附层析吸附层析 分配层析分配层析 离子交换层析离子交换层析 按按层析机理层析机理来分来分 凝胶排阻层析凝胶排阻层析 亲和层析亲和层析
11、柱层析柱层析 按按操作方式操作方式来分来分 薄层层析薄层层析 纸层析纸层析层析技术的种类层析技术的种类第十七页,本课件共有121页 (一)凝胶过滤层析(一)凝胶过滤层析又称又称分子筛或凝胶过滤分子筛或凝胶过滤(gel filtrationgel filtration)原理:载体为有一定孔径的多孔性亲水性凝胶。当分原理:载体为有一定孔径的多孔性亲水性凝胶。当分子大小不同的混合物通过这种凝胶柱时,直径大于孔子大小不同的混合物通过这种凝胶柱时,直径大于孔径的分子将不能进入凝胶内部,便直接沿胶粒间隙流径的分子将不能进入凝胶内部,便直接沿胶粒间隙流出(全排出)。较小的分子进入能容纳它的孔穴,绕出(全排出
12、)。较小的分子进入能容纳它的孔穴,绕道而行,在柱内保留时间就比较长。这样,较大的分道而行,在柱内保留时间就比较长。这样,较大的分子被先洗脱下来,而较小的分子后被洗脱下来,从而子被先洗脱下来,而较小的分子后被洗脱下来,从而达到相互分离的目的。达到相互分离的目的。第十八页,本课件共有121页第十九页,本课件共有121页 离子交换层析法离子交换层析法*原理:原理:阴阴(阳)离子交换树脂颗粒(作为固定相)(阳)离子交换树脂颗粒(作为固定相)填充在层析柱内,由于填充在层析柱内,由于阴阴(阳)离子交换树(阳)离子交换树 脂颗粒上带脂颗粒上带正正(负)电荷,能吸引溶液中的(负)电荷,能吸引溶液中的 阴阴(阳
13、)离子。然后再用含阴(阳)离子的(阳)离子。然后再用含阴(阳)离子的 溶液洗柱。含负电量小的蛋白质首先被洗脱溶液洗柱。含负电量小的蛋白质首先被洗脱 下来,增加阴离子浓度,含负电量多的蛋白下来,增加阴离子浓度,含负电量多的蛋白 质也被洗脱下来,于是两种蛋白质被分开。质也被洗脱下来,于是两种蛋白质被分开。第二十页,本课件共有121页第二十一页,本课件共有121页 亲和层析法亲和层析法 原理原理:利用生物高分子具有能和某些相对应的专一利用生物高分子具有能和某些相对应的专一 分子可逆结合的特性。分子可逆结合的特性。如,如,酶的活性部位能和底物酶的活性部位能和底物 抑制剂抑制剂 辅助因子专辅助因子专 一
14、性地结合一性地结合,改变条件又能使这种结合解除改变条件又能使这种结合解除.酶的变构中心与变构因子(或称效应物)之酶的变构中心与变构因子(或称效应物)之 间、抗体与抗原之间、激素与受体之间,结间、抗体与抗原之间、激素与受体之间,结 合蛋白与结合物之间合蛋白与结合物之间。这些被作用的对象物质称之为这些被作用的对象物质称之为配基(配基(ligand)ligand)。第二十二页,本课件共有121页 高效液相层析法高效液相层析法(High Performance Liquid Chromatography,HPLCHPLC)又称又称“高压液相色谱高压液相色谱,是,是色谱法色谱法的一个重要分支,以的一个重
15、要分支,以液液体体为为流动相流动相,采用高压输液系统,将具有不同,采用高压输液系统,将具有不同极性极性的的单一单一溶剂溶剂或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入装有固定相的装有固定相的色谱柱色谱柱,在柱内各成分被分离后,进入检测,在柱内各成分被分离后,进入检测器进行检测,从而实现对试样的分析。器进行检测,从而实现对试样的分析。第二十三页,本课件共有121页四、电泳技术分离蛋白质四、电泳技术分离蛋白质 电泳(电泳(electrophoresis)是指带电粒子在电场中是指带电粒子在电场中向着与其所带电荷相反方向电极移动的现象。向着与其所带电荷相反方向电极移
16、动的现象。第二十四页,本课件共有121页 SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDSSDS(十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠)是阴离子型去污剂是阴离子型去污剂(Sodium dodecyl sulfate,SDS)(Sodium dodecyl sulfate,SDS)Q Q u=u=(迁移率)(迁移率)6r 6r u u 与与 Q Q、r r有关有关 若蛋白质分子带有足够的电荷,在若蛋白质分子带有足够的电荷,在SDS-PAGESDS-PAGE中进中进行电泳,由于分子筛效应,行电泳,由于分子筛效应,u u 仅取决于分子的大小。仅取决于分子的大小。因此因此 SDSSDS一凝胶电泳可
17、以按一凝胶电泳可以按蛋白质分子大小的不同蛋白质分子大小的不同将其将其分开。分开。这时,若以分子量的对数(这时,若以分子量的对数(logMlogM)对相对于染料前沿)对相对于染料前沿的迁移率(的迁移率(RfRf)作图,呈现线性关系。)作图,呈现线性关系。第二十五页,本课件共有121页第二十六页,本课件共有121页 这种关系,对一种胶浓度时,只适用于一定的这种关系,对一种胶浓度时,只适用于一定的 分子量范围:分子量范围:5 5胶浓度时,适用于分子量胶浓度时,适用于分子量6 6200200万的区间;万的区间;1010胶浓度时,适用于分子量胶浓度时,适用于分子量1.61.67 7万的区间;万的区间;1
18、515胶浓度时,适用于分子量胶浓度时,适用于分子量1.21.24.54.5万的区间。万的区间。第二十七页,本课件共有121页聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱第二十八页,本课件共有121页 等电聚焦电泳等电聚焦电泳(isoelectric focusing,IEF)是一种根据样品的等电点不同而使它们在是一种根据样品的等电点不同而使它们在pHpH梯度梯度中相互分离的中相互分离的一种电泳技术。一种电泳技术。利用特殊的一种缓冲液(两性电解质)在凝胶(常用聚丙利用特殊的一种缓冲液(两性电解质)在凝胶(常用聚丙烯酰胺凝胶)内制造一个烯酰胺凝胶)内制造一个pHpH梯度。梯度。pH梯度制作利用的两
19、性电解质(ampholyte,商品名为ampholine),是脂肪族多胺和多羧类的同系物,他们具有相近但不同的pKa和pI值。在外电场作用下,自然形成pH梯度。凝胶可用:聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶、葡聚糖凝胶等第二十九页,本课件共有121页 PrPr分子有一定的分子有一定的PIPI,它处在一个由,它处在一个由阳极到阴极阳极到阴极梯度梯度逐渐增加的介质中,并通过以直流电时,它便逐渐增加的介质中,并通过以直流电时,它便“聚焦聚焦”在与其在与其PIPI相同的相同的pHpH位置上。位置上。PIPI不同的蛋白质泳动后形不同的蛋白质泳动后形成位置不同的区带而得到分离。成位置不同的区带而得到分离。第三十页,
20、本课件共有121页优点:优点:1.1.有很高的分辨率;有很高的分辨率;2.2.可以区分等电点只有可以区分等电点只有 0.01 pH0.01 pH单位差异的蛋白质;单位差异的蛋白质;3.3.根据其所在位置还能够测定蛋白质的分子量;根据其所在位置还能够测定蛋白质的分子量;4.4.对很稀的样品,最后达到高度的浓缩。对很稀的样品,最后达到高度的浓缩。第三十一页,本课件共有121页双向电泳双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis)第一向采用聚丙烯酸胺凝胶等电聚焦电泳第一向采用聚丙烯酸胺凝胶等电聚焦电泳-PIPI第二向采用第二向采用SDSSDS一凝胶电泳一凝胶电泳-
21、分子量分子量由于结合了蛋白质的等电点和分子量两种完全不由于结合了蛋白质的等电点和分子量两种完全不同的特一性来进行分离,因此具有非常高的分辨率同的特一性来进行分离,因此具有非常高的分辨率可同时分析几千上万个蛋白,分辨率高,分离度好。可同时分析几千上万个蛋白,分辨率高,分离度好。是蛋白质组学研究的核心技术。是蛋白质组学研究的核心技术。第三十二页,本课件共有121页双向双向PAGE第三十三页,本课件共有121页具有以下特征的蛋白质在二维电泳中还很难被具有以下特征的蛋白质在二维电泳中还很难被检测到:检测到:等电点(等电点(pl)pl)值很大或很小的,比如大于值很大或很小的,比如大于8 8和小于和小于4
22、 4的那些蛋白质;的那些蛋白质;分子质量很大的蛋白质,比如大于分子质量很大的蛋白质,比如大于l00kDal00kDa的蛋白的蛋白质就比实际的少了,而大于质就比实际的少了,而大于150kDa150kDa的蛋白质就几的蛋白质就几乎完全探测不到了(尽管在一维电泳凝胶上这些乎完全探测不到了(尽管在一维电泳凝胶上这些大蛋白质都能清楚地被观察到;大蛋白质都能清楚地被观察到;疏水性蛋白质。疏水性蛋白质。双向电泳技术缺点双向电泳技术缺点第三十四页,本课件共有121页高效毛细管电泳高效毛细管电泳第三十五页,本课件共有121页1.1.毛细管区带电泳(毛细管区带电泳(CZECZE)毛细管区带电泳也称为自由溶液溶液区
23、带电泳毛细管区带电泳也称为自由溶液溶液区带电泳,这种电泳模式的特征是整个系统都用同一种缓冲溶液这种电泳模式的特征是整个系统都用同一种缓冲溶液充满,带电粒子的迁移速度依赖物质的荷充满,带电粒子的迁移速度依赖物质的荷/质比差异。质比差异。荷荷/质比越大,泳动越快。质比越大,泳动越快。第三十六页,本课件共有121页2.2.毛细管凝胶电泳(毛细管凝胶电泳(capillary gel electrophoresis,CGE)将聚丙烯酰胺等在毛细管柱内交联生成凝胶。将聚丙烯酰胺等在毛细管柱内交联生成凝胶。其具有多孔性,类似分子筛的作用,试样分子按大小分离。能其具有多孔性,类似分子筛的作用,试样分子按大小分
24、离。能够有效减小组分扩散,所得峰型尖锐,分离效率高。够有效减小组分扩散,所得峰型尖锐,分离效率高。特点:抗对流性好,散热性好,分离度极高。特点:抗对流性好,散热性好,分离度极高。第三十七页,本课件共有121页3.3.胶束电动毛细管色谱胶束电动毛细管色谱(Micellar electrokinetic capillary chromatography,MEKC)缓冲溶液中加入离子型表面活性剂,其浓度达到临界浓度,缓冲溶液中加入离子型表面活性剂,其浓度达到临界浓度,形成一疏水内核、外部带负电的胶束。中性分子在胶束相和溶形成一疏水内核、外部带负电的胶束。中性分子在胶束相和溶液(水相)间分配,疏水性强
25、的组分与胶束结合的较牢,流出液(水相)间分配,疏水性强的组分与胶束结合的较牢,流出时间长;可用来分离中性物质,扩展了高效毛细管电泳的应用时间长;可用来分离中性物质,扩展了高效毛细管电泳的应用范围。范围。在电场力的作用下,在电场力的作用下,胶束在柱中移动。胶束在柱中移动。第三十八页,本课件共有121页4.4.毛细管等电聚焦电泳(毛细管等电聚焦电泳(Capillary isoelectric focusing,CIEF)是根据等电点差别分离生物大分子的高分辨率电泳技术;是根据等电点差别分离生物大分子的高分辨率电泳技术;CIEF是在毛细管内充有两性电解质,当施加直流电压(是在毛细管内充有两性电解质,
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