酵母基因工程精选课件.ppt
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1、关于酵母基因工程关于酵母基因工程关于酵母基因工程关于酵母基因工程第一页,本课件共有40页A 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征酵母菌的分类学特征酵母菌的分类学特征 酵母菌(酵母菌(YeastYeast)是一群以是一群以芽殖芽殖或或裂殖裂殖方式进行方式进行无性繁殖无性繁殖的单细的单细胞胞真核生物真核生物,分属于,分属于子囊菌纲子囊菌纲(子囊酵母菌)、(子囊酵母菌)、担子菌纲担子菌纲(担子酵母(担子酵母菌)、菌)、半知菌类半知菌类(半知酵母菌半知酵母菌),共由),共由5656个属和个属和500500多个种组成。如多个种组成。如果说大肠杆菌是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最果说大肠杆菌
2、是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真核生物表达系统。成熟的真核生物表达系统。第二页,本课件共有40页A 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征酵母菌表达外源基因的优势酵母菌表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便能将外源基因表达产物分泌至培养基中能将外源基因表达产物分泌至培养基中具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国不
3、含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDAFDA认定为安全的认定为安全的基因工程受体系统(基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRASGenerally Recognized As Safe GRAS)酵母菌是最简单的真核模式生物酵母菌是最简单的真核模式生物第三页,本课件共有40页B 酵母菌的宿主系统提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌抑制超糖基化作用的突变宿主菌抑制超糖基化作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
4、第四页,本课件共有40页广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:酵母属酵母属 如如酿酒酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiae)克鲁维酵母属克鲁维酵母属 如如乳酸克鲁维酵母乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactisKluyveromyces lactis)毕赤酵母属毕赤酵母属 如如巴斯德毕赤酵母巴斯德毕赤酵母(Pichia pastorisPichia pastoris)裂殖酵母属裂殖酵母属 如如
5、非洲酒裂殖酵母非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombeSchizosaccharomyces pombe)汉逊酵母属汉逊酵母属 如如多态汉逊酵母多态汉逊酵母(Hansenula polymorphaHansenula polymorpha)其中其中酿酒酵母酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母巴斯德毕赤酵母表达外源基因最理想。表达外源基因最理想。第五页,本课件共有40页提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提
6、高或质量改善的突变类型sscssc1 1 改善重组蛋白分泌改善重组蛋白分泌 钙离子依赖型的钙离子依赖型的ATPATP酶酶sscssc2 2 提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达 转录后加工转录后加工rgrrgr1 1 提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达 转录水平转录水平oseose1 1 提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达 转录水平转录水平sscssc1111 改善重组蛋白分泌改善重组蛋白分泌 羧肽酶羧肽酶YYrhorho-提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达 转录水平转录水平突变类型突变类型生物效应生物效应作用位点作用位点第六页,本课件共有40页抑制超糖基化作用的突变宿主菌抑制超糖基化作用的突变宿主菌能
7、抑制超糖基化的突变类型能抑制超糖基化的突变类型mnn mnn 甘露糖生物合成缺陷型甘露糖生物合成缺陷型alg alg 天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型och och 外侧糖链添加缺陷型外侧糖链添加缺陷型突变类型突变类型生物效应生物效应 许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由它们常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由糖基核心糖基核心和和外侧糖外侧糖链链两部分组成。两部分组成。酵母菌普遍拥有蛋白酵母菌普遍拥有蛋白质的糖基化系统,但野生质的糖基化系统,但野生型酿酒酵母对
8、异源蛋白的型酿酒酵母对异源蛋白的糖基化反应很难控制,呈糖基化反应很难控制,呈超糖基化倾向,因此超糖超糖基化倾向,因此超糖基化缺陷株非常重要。基化缺陷株非常重要。第七页,本课件共有40页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌泛素介导的蛋白质降解作用泛素介导的蛋白质降解作用蛋白酶体蛋白酶体LysLysHOOCUbiquitin 76 aaUbiquitin 76 aa ubiquitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLysubiquitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLys靶蛋白靶蛋白靶
9、蛋白第八页,本课件共有40页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌共有四个泛素编码基因:酵母菌共有四个泛素编码基因:UBI UBI 11 编码编码泛素泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 2 2 编码编码泛素泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 33 编码编码泛素泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白767
10、6(CEP76CEP76)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 4 4 编码编码泛素五聚体泛素五聚体 对数生长期关闭对数生长期关闭 稳定期表达稳定期表达酵母菌共有七个泛素连接酶基因:酵母菌共有七个泛素连接酶基因:UBC UBC 1 1、UBC UBC 22、UBC UBC 33、UBC UBC 44、UBC UBC 55、UBC UBC 66、UBC UBC 77第九页,本课件共有40页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌泛素降解途径衰减的酿酒酵母泛素降解途径衰减的酿酒酵母在酿酒酵母菌中,泛素主要由在酿酒酵母菌中,泛素主要由U
11、BI UBI 4 4基因表达,基因表达,UBI UBI 4 4-突变株能突变株能UBI UBI 4 4缺陷型:缺陷型:正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,因此因此UBI UBI 4 4缺陷突变株是外源基因表达理想的受体缺陷突变株是外源基因表达理想的受体UBA UBA 1 1缺陷型:缺陷型:UBAUBA1 1编码编码泛素激活酶泛素激活酶E1E1,UBAUBA1 1突变株是致死性的,但其等位突变株是致死性的,但其等位基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解Ubc4
12、 Ubc4-ubc5 ubc5 双突变型:双突变型:七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效第十页,本课件共有40页C 酵母菌的载体系统酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌中的野生型质粒酵母菌中的野生型质粒第十一页,本课件共有40页酵母菌中的野生型质粒酵母菌中的野生型质粒酿酒酵母中的酿酒酵母中的2 2m m环状质粒环状质粒几乎所有的酿酒酵母中都含有几乎所有的酿酒酵母中都含有2 2mm双链双链同源重组同源重组REP1REP1RAFRAFSTBSTBorioriREP2REP2FLPFLPIRIRIRIRAABB环状质粒
13、,拷贝数达环状质粒,拷贝数达5050至至100100个。个。IRs IRs 反向重复序列,反向重复序列,600 600 bpbp,重组重组FLPFLP 编码产物驱动编码产物驱动IRsIRs的同源重组的同源重组REPREP 编码产物控制质粒的稳定性编码产物控制质粒的稳定性STBSTB REPREP的结合位点的结合位点接合酵母属中的接合酵母属中的pSR1pSR1和和pSB1pSB1,以及以及克鲁维酵母属中的克鲁维酵母属中的pKD1pKD1等均与等均与22mm质质粒类似。粒类似。第十二页,本课件共有40页酵母菌中的野生型质粒酵母菌中的野生型质粒乳酸克鲁维酵母中的线乳酸克鲁维酵母中的线状质粒状质粒乳酸
14、克鲁维酵母中含有两种不同乳酸克鲁维酵母中含有两种不同pGKL1 8.9 kbpGKL1 8.9 kbDNADNA聚合酶聚合酶 毒素蛋白毒素蛋白ab ab 免疫蛋白免疫蛋白 g g 亚基亚基的双链线状质粒的双链线状质粒pGKL1pGKL1和和pGKL2pGKL2拷贝数为拷贝数为50-10050-100个,分别携带个,分别携带K1K1K2K2两种能使多种酵母菌致死的毒两种能使多种酵母菌致死的毒反向重复序列反向重复序列素蛋白编码基因(素蛋白编码基因(a b ga b g),),同时含有毒素蛋白抗性基因。同时含有毒素蛋白抗性基因。第十三页,本课件共有40页酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌克隆表达质粒的构
15、建含有含有ARSARS的的YRpYRp质粒的构建质粒的构建 ARS ARS为酵母菌中的自主复制序列,为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.50.8-1.5kbkb,染色体上每染色体上每30-4030-40kbkb就有一个就有一个ARSARS元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子复制子、标标记基因记基因、提供克隆位点的大肠杆菌、提供克隆位点的大肠杆菌质粒质粒DNADNA。以以ARSARS为复制子的质粒称为为复制子的质粒称为YRpYRp 上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达200200个,但培养几代个,但培
16、养几代 以以2 2m m质粒上的复制元件为复制子的质粒称为质粒上的复制元件为复制子的质粒称为YEpYEp后,质粒的丢失率高达后,质粒的丢失率高达50%-70%50%-70%,主要是由于分配不均匀所致。,主要是由于分配不均匀所致。第十四页,本课件共有40页酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌克隆表达质粒的构建含有含有CENCEN的的YCpYCp质粒的构建质粒的构建 CEN CEN为酵母菌染色体为酵母菌染色体DNADNA上与染色体均匀分配有关的序列上与染色体均匀分配有关的序列 将将CEN CEN DNADNA插入含插入含ARSARS的质粒中,获得的新载体称为的质粒中,获得的新载体称为YCpYCp YCp
17、 YCp质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有1-51-5个个第十五页,本课件共有40页利用酵母菌的端粒利用酵母菌的端粒TEL、CEN和和ARS等等DNA元件构建人工酵母元件构建人工酵母染色体,可以克隆扩增大片段的外源染色体,可以克隆扩增大片段的外源DNA,这是,这是YAC载体构载体构建的基本思路。这类载体一个典型的例子是建的基本思路。这类载体一个典型的例子是pYAC2,它除了,它除了装有两个方向相反的装有两个方向相反的TEL DNA片段外,还包括片段外,还包括SUP4、TRP1和和URA3等酵母菌选择基因以及大肠杆菌的复制子和选择基因等酵母菌选择
18、基因以及大肠杆菌的复制子和选择基因Ap 。SUP4编码编码tRNATyr的赭石抑制的赭石抑制tRNA,在,在ade2基因赭石突变株中,基因赭石突变株中,SUP4基因的表达使转化子呈白色,而非转化子或基因的表达使转化子呈白色,而非转化子或SUP4基因不表达基因不表达时呈红色,因此将外源时呈红色,因此将外源DNA克隆在克隆在YAC载体的载体的SmaI位点上,便位点上,便可灭活可灭活SUP4基因,获得红色的重组克隆。基因,获得红色的重组克隆。pYAC2上的大肠杆菌元上的大肠杆菌元件主要是为了载体质粒在大肠杆菌中的扩增与制备。件主要是为了载体质粒在大肠杆菌中的扩增与制备。YAC载体的载体的装载量可高达
19、装载量可高达800Kb,因而非常适用于构建人的基因文库。,因而非常适用于构建人的基因文库。nn含有含有TELTEL的的YACYAC质粒的构建质粒的构建r第十六页,本课件共有40页酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌克隆表达质粒的构建含有酵母菌染色体含有酵母菌染色体DNADNA同源序列的同源序列的YIpYIp质粒的构建质粒的构建 在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体DNADNA特定序列和标记基因,特定序列和标记基因,构建出来的质粒称为构建出来的质粒称为YipYip。目的基因表达盒通常插在染色体目的基因表达盒通常插在染色体DNADNA特定特定序列中,这样目的基因就能高效整合入
20、酵母菌特定的染色体序列中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体DNADNA区域区域第十七页,本课件共有40页D 酵母菌的转化系统转化质粒在酵母细胞中的命运转化质粒在酵母细胞中的命运酵母菌的转化程序酵母菌的转化程序用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因第十八页,本课件共有40页酵母菌的转化程序酵母菌的转化程序酵母菌原生质体转化法酵母菌原生质体转化法 早期酵母菌的转化都采用在等渗缓冲液中稳定的原生质体转化早期酵母菌的转化都采用在等渗缓冲液中稳定的原生质体转化法,在法,在CaCa2+2+和和PEGPEG的存在下,转化细胞可达原生质体总数的的存在下,转化细胞可达原生质体总数的1-2%
21、1-2%。但该程序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约但该程序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约 原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细胞可同时接纳原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细胞可同时接纳多个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的多个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的25-33%25-33%第十九页,本课件共有40页酵母菌的转化程序酵母菌的转化程序碱金属离子介导的酵母菌完整细胞的转化碱金属离子介导的酵母菌完整细胞的转化 酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如LiLi+等)、等)、PEGPEG、
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