河南工业大学生物化学考研-第01章-绪论第02章蛋白质的构件----氨基酸 (2).ppt
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1、河南工河南工业大学生物化学考研大学生物化学考研-第第01章章-绪论第第02章蛋白章蛋白质的构件的构件-氨氨基酸基酸蛋白质蛋白质-英文为英文为“Protein”“Protein”第一重要第一重要第一节第一节.蛋白质的组成与结构蛋白质的组成与结构1.1 蛋白质的元素组成蛋白质的元素组成l主要由主要由C、H、O、N四种元素组成。四种元素组成。l大多数蛋白质还含有大多数蛋白质还含有S,l有些结合蛋白质含有有些结合蛋白质含有 p、Fe、Cu、Mg、Zn等等l样品中蛋白质含量样品中蛋白质含量/含氮量称作含氮量称作蛋白质系数蛋白质系数。蛋白质的平均含氮量接近蛋白质的平均含氮量接近16%蛋白质含量蛋白质含量=
2、蛋白氮蛋白氮x 6.25动物蛋白质系数为动物蛋白质系数为6.25,植物在,植物在5.7左右左右1.2 蛋白质的分类蛋白质的分类一、依据蛋白质的外形分类一、依据蛋白质的外形分类球状蛋白质、纤维状蛋白质。球状蛋白质、纤维状蛋白质。球状蛋白质:球状蛋白质:globular protein外形接近球外形接近球形或椭圆形,溶解性较好,能形成结晶,形或椭圆形,溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白质属于这一类。大多数蛋白质属于这一类。纤维状蛋白质:纤维状蛋白质:fibrous protein分子类似纤分子类似纤维或细棒。又可分为可溶性纤维状蛋白质维或细棒。又可分为可溶性纤维状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质。和不溶
3、性纤维状蛋白质。二、依据蛋白质的组成分类二、依据蛋白质的组成分类按照蛋白质的组成,可以分为按照蛋白质的组成,可以分为简单蛋白简单蛋白(simple protein)和结和结(缀缀)合蛋白合蛋白(conjugated protein)。简单蛋白简单蛋白又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由-氨基酸组成氨基酸组成的肽链,不含其它成分。的肽链,不含其它成分。1,清蛋白和球蛋白清蛋白和球蛋白:albumin and globulin广泛存在于广泛存在于动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸中。于稀酸中。2,谷
4、蛋白谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白和醇溶谷蛋白(prolamin):植物蛋白,:植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于7080乙醇中。乙醇中。3,鱼精蛋白和组蛋白鱼精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。:碱性蛋白质,存在与细胞核中。4,硬蛋白硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。结合蛋白结合蛋白由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成,由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成,糖蛋白糖蛋白:由简单蛋白与糖类物质
5、组成。如细胞膜中:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中的糖蛋白等。的糖蛋白等。脂蛋白脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成:由简单蛋白与脂类结合而成 如血清脂蛋白如血清脂蛋白核蛋白核蛋白:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中的核糖核蛋白等。的核糖核蛋白等。磷蛋白磷蛋白:与磷酸基结合:与磷酸基结合金属蛋白金属蛋白:与此同时:与此同时Fe Cu Zn Mn 等结合等结合血红素蛋白血红素蛋白:亚铁原卟啉:亚铁原卟啉黄素蛋白黄素蛋白:黄素核苷酸(:黄素核苷酸(FMN、FAD)l三、按功能分类三、按功能分类 p721.酶类酶类 2.调节蛋白调节蛋白 3.转运蛋白转运蛋白
6、4.贮存蛋白贮存蛋白 5.收缩和游动蛋白收缩和游动蛋白6.结构蛋白结构蛋白7.支架蛋白支架蛋白(SH2组件组件)8.保护和开发蛋白保护和开发蛋白第二节第二节.氨基酸氨基酸2.1 2.1 氨基酸的种类与结构氨基酸的种类与结构l含有氨基的羧酸含有氨基的羧酸l l(一一)、化学结构化学结构lR-CH(NH2)-COOHlR 代代 表表 氨氨 基基 酸酸 之之 间间 相相 异异 的的 部部 分分,叫叫 R 基基(R group),又又 称称 为为 侧侧 链链(sidechain)。l无色晶体、溶于水无色晶体、溶于水 酪氨酸分子酪氨酸分子 l地地 球球 上上 天天 然然 形形 成成 的的 氨氨 基基 酸
7、酸 有有 300300 种种 以以 上上,但但 是是 构构 成成 蛋蛋 白白 质质 的的 氨氨 基基 酸酸 只只 有有 20 种种,且都是且都是-氨基酸(可能还存在更多的)氨基酸(可能还存在更多的)。l提问:提问:什么是什么是-氨基酸?氨基酸?l答案:答案:l-C-C-C-C-COOHl l-C-C-C-C(NH2)-COOH -氨基酸氨基酸 l-C-C-C(NH2)-C-COOH -氨基酸氨基酸 l-C-C(NH2)-C-C-COOH -氨基酸氨基酸旋光性:旋光性:可使偏振光平面发生旋转可使偏振光平面发生旋转 不对称碳原子:不对称碳原子:碳原子所连的碳原子所连的4个碳原子不相同个碳原子不相同
8、 构型构型:不对称碳原子周围的取代基在空间上的排列不对称碳原子周围的取代基在空间上的排列20种氨基酸除甘氨酸外都具有旋光性种氨基酸除甘氨酸外都具有旋光性除甘氨酸除甘氨酸(Gly)外,外,-C都是不对称碳原子,且都都是不对称碳原子,且都为为L-构型构型构型的改变需要共价键的的破坏与重新形成,与构型的改变需要共价键的的破坏与重新形成,与氢键无关,氨基酸的氢键无关,氨基酸的L-、D-型都是以甘油醛为标型都是以甘油醛为标准确定的。准确定的。2.1.1.氨基酸的旋光性与构型氨基酸的旋光性与构型甘甘油油醛醛投投影影式式和和透透视视式式L-氨基酸的结构通式碳原子碳原子碳原子碳原子,不对称碳原子不对称碳原子不
9、对称碳原子不对称碳原子侧链侧链侧链侧链二十种氨基酸二十种氨基酸二十种氨基酸二十种氨基酸除除除除GlyGlyGlyGly外全是外全是外全是外全是L-L-L-L-构型构型构型构型 -碳原子的四面体结构碳原子的四面体结构L-丝氨酸丝氨酸D-丝氨酸丝氨酸L构型与构型与D构型构型脯氨酸脯氨酸(Pro)不含游离的氨基,为不含游离的氨基,为亚氨基酸亚氨基酸半胱氨酸半胱氨酸(Cys)和蛋氨酸和蛋氨酸(Met)含有含有S元素元素2.1.2.常见的蛋白质氨基酸常见的蛋白质氨基酸alanine丙氨酸丙氨酸AlaAarginine 精氨酸精氨酸 ArgRasparagine天冬酰氨天冬酰氨 Asn AsxNaspar
10、tic acid天冬氨酸天冬氨酸Asp AsxDcystine半胱氨酸半胱氨酸CysCglutamine谷氨酰胺谷氨酰胺Gln GlxQglutamic acid谷氨酸谷氨酸Glu GlxEglycine甘氨酸甘氨酸GlyGHistidine组氨酸组氨酸HisHisoleucine异亮氨酸异亮氨酸IleIle I Ileucine亮氨酸亮氨酸LeuLlysine赖氨酸赖氨酸LysKmethionine甲硫氨酸甲硫氨酸MetMphenylalanine 苯丙氨酸苯丙氨酸PheFproline脯氨酸脯氨酸ProPserine丝氨酸丝氨酸SerSthreonine苏氨酸苏氨酸ThrTtryptoph
11、an色氨酸色氨酸TrpWtyrosine酪氨酸酪氨酸TyrYvaline缬氨酸缬氨酸ValV氨氨基基酸酸的的名名称称与与符符号号二二十十种种氨氨基基酸酸的的结结构构2.1.3.不常见的蛋白质氨基酸不常见的蛋白质氨基酸l由常见的蛋白质氨基酸经化学修饰而成由常见的蛋白质氨基酸经化学修饰而成l常见的是羟基氨基酸和甲基氨基酸常见的是羟基氨基酸和甲基氨基酸锁链素R-羟基谷氨酸羟基谷氨酸 存在于凝血酶原中存在于凝血酶原中存在于弹性蛋白中存在于弹性蛋白中4-羟脯氨酸羟脯氨酸 存在于胶原蛋白中存在于胶原蛋白中存在于肌球蛋白中存在于肌球蛋白中不常见的蛋白质氨基酸不常见的蛋白质氨基酸2.1.4.非蛋白质氨基酸非蛋
12、白质氨基酸l各种生物分离到的氨基酸已达各种生物分离到的氨基酸已达250250种以上种以上l激素、代谢中间产物、毒素、抗菌素等激素、代谢中间产物、毒素、抗菌素等鸟氨酸鸟氨酸瓜氨酸瓜氨酸2.1.5、蛋白质、蛋白质氨基酸的分类氨基酸的分类l按侧链按侧链(-R)的性质,的性质,常见的蛋白质常见的蛋白质氨基酸被氨基酸被分为四类:分为四类:1.1.非极性非极性R R基氨基酸(共基氨基酸(共8 8种):种):丙氨酸丙氨酸(Ala)(Ala)缬氨酸缬氨酸(Val)(Val)亮氨酸亮氨酸(Leu)(Leu)异亮氨酸异亮氨酸(Ile)(Ile)脯氨酸脯氨酸(Pro)(Pro)色氨酸色氨酸(Trp)(Trp)甲硫氨
13、酸甲硫氨酸(Met)(Met)苯丙氨酸苯丙氨酸(Phe)(Phe)2.2.无电荷的极性无电荷的极性R R基氨基酸(共基氨基酸(共7 7种):种):丝氨酸丝氨酸(Ser),(Ser),苏氨酸苏氨酸(Thr),(Thr),酪氨酸酪氨酸(Tyr),(Tyr),半胱氨酸半胱氨酸(Cys),(Cys),天冬酰胺天冬酰胺(Asn),(Asn),谷氨酰胺谷氨酰胺(Gln)(Gln)甘氨酸甘氨酸(Gly)3.3.带正电荷的极性带正电荷的极性R R基氨基酸(共基氨基酸(共3 3种):种):赖氨酸赖氨酸(Lys),(Lys),精氨酸精氨酸(Arg),(Arg),组氨酸组氨酸(His)(His)4.4.带负电荷的极
14、性带负电荷的极性R R基氨基酸(共基氨基酸(共2 2种):种):天冬氨酸天冬氨酸(Asp)(Asp)谷氨酸谷氨酸(Glu)(Glu)非非极极性性侧侧链链氨氨基基酸酸甘氨酸甘氨酸丙氨酸丙氨酸缬氨酸缬氨酸亮氨酸亮氨酸异亮氨酸异亮氨酸蛋氨酸蛋氨酸(甲硫氨酸甲硫氨酸)苯丙氨酸苯丙氨酸色氨酸色氨酸脯氨酸脯氨酸极极性性不不带带电电侧侧链链氨氨基基酸酸丝氨酸丝氨酸苏氨酸苏氨酸半胱氨酸半胱氨酸脯氨酸脯氨酸天冬酰胺天冬酰胺谷氨酰胺谷氨酰胺酪氨酸酪氨酸带正电荷侧链氨基酸带正电荷侧链氨基酸赖氨酸赖氨酸精氨酸精氨酸组氨酸组氨酸带负电荷侧链氨基酸带负电荷侧链氨基酸天冬氨酸天冬氨酸谷氨酸谷氨酸上节课总结l蛋白质的组成与结
15、构(三种分类方法)蛋白质的组成与结构(三种分类方法)l l氨基酸的种类与结构氨基酸的种类与结构2.1.6.必需氨基酸必需氨基酸l人和动物维持正常生理功能所必需,而又人和动物维持正常生理功能所必需,而又不能自身合成的氨基酸称为不能自身合成的氨基酸称为必需氨基酸必需氨基酸(essential amino acids)。)。l必需氨基酸包括必需氨基酸包括赖氨酸、苯丙氨酸、蛋氨赖氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、苏氨酸、酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、苏氨酸、色氨酸、组氨酸色氨酸、组氨酸和和精氨酸精氨酸,其中,其中组氨酸组氨酸和和精氨酸精氨酸,人虽然能合成,但效率低,尤其,人虽然能合成,
16、但效率低,尤其在婴幼儿时期,需要由外界供给。在婴幼儿时期,需要由外界供给。2.2 氨基酸的性质氨基酸的性质2.2.1.氨基酸的溶解性和光吸收氨基酸的溶解性和光吸收无色晶体,熔点较高(无色晶体,熔点较高(200200300300)溶于水而不溶于非极性的有机溶剂,但不同的溶于水而不溶于非极性的有机溶剂,但不同的氨基酸在水中的溶解度差别很大氨基酸在水中的溶解度差别很大 如亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸是疏水性的,其他氨基酸如赖氨酸、如亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸是疏水性的,其他氨基酸如赖氨酸、组氨酸、精氨酸是亲水性的。组氨酸、精氨酸是亲水性的。除除Gly外,都具有旋光性外,都具有旋光性在可见光区没有光吸收,三
17、种芳香族氨基酸在可见光区没有光吸收,三种芳香族氨基酸(色色氨酸氨酸Trp,酪氨酸酪氨酸Tyr,苯丙氨酸苯丙氨酸Phe)在紫外光区在紫外光区有光吸收,最大吸收峰在有光吸收,最大吸收峰在280nm处处。苯丙氨酸苯丙氨酸酪氨酸酪氨酸色氨酸色氨酸l2.2.2.氨基酸的两性解离氨基酸的两性解离氨基酸分子中既含有酸性的氨基酸分子中既含有酸性的-COOH,又含有又含有碱性的碱性的-NH2。属两性离子属两性离子(带相反电荷的极带相反电荷的极性分子叫做两性离子或偶极离子性分子叫做两性离子或偶极离子)-COOH的的 pK=2左右;左右;-NH2的的pKa=9左左右(右(pK 解离常数的负对数)解离常数的负对数)A
18、rg:pKa=12.5;Lys:pKa=10.5;His:pKa=6.0;Asp:pKa=3.9;Glu:pKa=4.3;Cys:pKa=8.3;Tyr:pKa=10.1;Ser:pKa=13;Thr:pKa=13H2N纯晶体状态COO-H3N+水溶后等电荷状态总电荷 0加 酸H总电荷“+”加 碱H2NCOO-H3N+OH-H2OH2N-总电荷“-”氨基酸的两性解离氨基酸的两性解离氨基酸的等电点氨基酸的等电点l当氨基酸所带正电荷与所带负电荷当氨基酸所带正电荷与所带负电荷相等时,溶液的相等时,溶液的PH值为这一种氨基值为这一种氨基酸的酸的等电点(等电点(PI)在酸性溶液中在酸性溶液中 在晶体状态
19、或水溶液中在晶体状态或水溶液中 在碱性溶液中在碱性溶液中 即即等电点(等电点(pI)“+”“+”“不带电不带电”“”“”pIpI等电点时的等电点时的pHpH+_ _K1 和K2分别代表碳原子上的-COOH和-NH3 的表观解离常数。共轭酸 共轭碱 共轭酸 共轭碱 Handerson-Hasselbalch公式公式pH=pKa+lgpH=pKa+lg(A A-/HA/HA)=pKa+lg=pKa+lg(碱碱/酸酸 )l可计算出在任一可计算出在任一pHpH条件下一种氨基酸的各种离子的比例。条件下一种氨基酸的各种离子的比例。l氨基酸的带电状况与溶液的氨基酸的带电状况与溶液的pHpH值有关。值有关。l
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