Chapter 12 翻译-精品文档资料整理.ppt
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1、生物化学生物化学 BiochemistryProtein Biosynthesis(Translation)蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成(翻译)第第 十十 二二 章章生物化学生物化学 Biochemistry内容提要:内容提要:第一节第一节 蛋白质合成体系蛋白质合成体系第二节第二节 蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成过程第三节第三节 蛋白质合成后加工和输送蛋白质合成后加工和输送第四节第四节 蛋白质生物合成的干扰和抑制(自学)蛋白质生物合成的干扰和抑制(自学)生物化学生物化学 Biochemistry蛋白质的生物合成过程就是将蛋白质的生物合成过程就是将mRNAmRNA分子中由分子中由碱基序列碱
2、基序列组成的遗传信组成的遗传信息,通过息,通过遗传密码遗传密码破译的方式转变成破译的方式转变成为蛋白质中的为蛋白质中的氨基酸排列顺序氨基酸排列顺序,因而,因而称为翻译(称为翻译(translation)translation)。生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 Biochemistry 第第 一一 节节蛋白质合成体系蛋白质合成体系Protein Biosynthesis Systeml 20种氨基酸作为原料种氨基酸作为原料l 酶及蛋白因子,如酶及蛋白因子,如IF、eIF等等l ATP、GTP、无机离子无机离子参与蛋白质生物合成的物质包括:参与蛋白质生物合成的物质包括:
3、l 三种三种RNA mRNA rRNA tRNA生物化学生物化学 Biochemistry 1961年,年,Nirenberg 证明了证明了mRNA的模板作用。的模板作用。一、翻译模板一、翻译模板mRNA及遗传密码及遗传密码生物化学生物化学 Biochemistry细菌矾土颗粒细菌矾土颗粒轻轻研磨轻轻研磨细菌液细菌液离心,去除细胞壁和膜离心,去除细胞壁和膜提取液(提取液(DNA、mRNA、tRNA、核糖体、酶、离子)核糖体、酶、离子)DNA水解酶,水解酶,20种氨基酸等种氨基酸等蛋白质蛋白质生物化学生物化学 Biochemistry mRNAmRNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者遗遗传传
4、学学将将编编码码一一个个多多肽肽的的遗遗传传单单位位称称为为顺顺反反子子(cistroncistron)。)。原原核核生生物物中中数数个个结结构构基基因因常常串串联联为为一一个个转转录录单单位位,转转录录生生成成的的mRNAmRNA可可编编码码几几种种功功能能相相关关的的蛋蛋白质,为白质,为多顺反子多顺反子(polycistronpolycistron)。)。真真核核生生物物一一个个mRNAmRNA只只编编码码一一种种蛋蛋白白质质,为为单单顺顺反子反子(single single cistroncistron)。)。生物化学生物化学 Biochemistryl mRNA上存在遗传密码上存在遗传
5、密码mRNAmRNA分分子子上上从从5 5 至至3 3 方方向向,由由AUGAUG开开始始,每每3 3个个核核苷苷酸酸为为一一组组,决决定定肽肽链链上上某某一一个个氨氨基基酸酸或或蛋蛋白白质质合合成成的的起起始始、终终止止信信号号,称为称为三联体密码(三联体密码(triplet triplet codoncodon)。)。遗遗传传密密码码表表生物化学生物化学 BiochemistryORF从从mRNA mRNA 5 5 端端起起始始密密码码子子AUGAUG到到3 3 端端终终止止密密码码子子之之间间的的核核苷苷酸酸序序列列,各各个个三三联联体体密密码码连连续续排排列列编编码码一一条条多多肽肽链
6、链,称称为为开开放放阅阅读读框架框架(open reading frame,ORF)(open reading frame,ORF)。1.通用性通用性(universal)蛋白质生物合成的整套密码,从原核生蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。物到人类都通用。有少数例外,如动物细胞的线粒体、植有少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。物细胞的叶绿体。密码的通用性进一步证明各种生物进化密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。自同一祖先。l遗传密码的特点遗传密码的特点生物化学生物化学 Biochemistry2.连续性(连续性(commaless)编码蛋白质氨基酸序列的三
7、联体编码蛋白质氨基酸序列的三联体密码连续阅读,密码连续阅读,密码间既无间隔也无密码间既无间隔也无重叠重叠,3个一组进行翻译。个一组进行翻译。mRNAmRNA链上的链上的碱基插入或缺失碱基插入或缺失可能可能导致导致框移突变框移突变,造成翻译出的,造成翻译出的蛋白序蛋白序列完全改变列完全改变。重叠密码重叠密码非重叠非重叠连续的连续的密码密码不连续的密码不连续的密码生物化学生物化学 Biochemistry基因损伤引起基因损伤引起mRNAmRNA阅读框架内的阅读框架内的碱基发生碱基发生插入或缺失插入或缺失,可能导致,可能导致框移突变框移突变(frameshiftframeshift mutation
8、)mutation)。生物化学生物化学 Biochemistry3.方向性方向性起始密码子起始密码子AUGAUG总是在总是在mRNAmRNA的的5 5 端;端;终止密码子总是在终止密码子总是在mRNAmRNA的3 3 端;端;读密码子总是从读密码子总是从mRNAmRNA的5 5 3 3 方向读方向读。4.简并性简并性(degeneracy)遗传密码中,除遗传密码中,除色氨色氨酸酸和和甲硫氨酸甲硫氨酸仅有一个密仅有一个密码子外,其余氨基酸有码子外,其余氨基酸有2 24 4个或多至个或多至6 6个密码子为之个密码子为之编码。编码。多种密码子编码一种多种密码子编码一种AaAa的现象称为的现象称为遗传
9、密码的遗传密码的简并性简并性。生物化学生物化学 Biochemistry遗传密码的简并性遗传密码的简并性生物化学生物化学 Biochemistry密码子简并性的生物学意义:减少有密码子简并性的生物学意义:减少有害突变。害突变。遗传密码的特异性主要取决于前两位遗传密码的特异性主要取决于前两位碱基。碱基。GCU ACUGCC ACCGCA ACAGCG ACGAla(丙)(丙)Thr(苏)(苏)生物化学生物化学 Biochemistry5.摆动性摆动性(wobble)tRNAtRNA上反密码子的上反密码子的第第1 1位位碱基与碱基与mRNAmRNA密码子的密码子的第第3 3位位碱基配对时,可以在一
10、定范碱基配对时,可以在一定范围内变动,即并不严格遵循碱基配对规律,围内变动,即并不严格遵循碱基配对规律,这一现象称为这一现象称为摆动性摆动性。生物化学生物化学 Biochemistry摆动配对摆动配对U生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 Biochemistry二、核蛋白体是多肽链合成的场所二、核蛋白体是多肽链合成的场所生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 Biochemistry核蛋白体的组成核蛋白体的组成生物化学生物化学 Biochemistry30S小亚基:小亚基:有有mRNAmRNA结合位点结合位点50S大亚基:大亚基:E E位:排出位(位
11、:排出位(Exit Exit sitesite)转肽酶活性转肽酶活性大小亚基共同组成:大小亚基共同组成:A位:位:氨基酰氨基酰-tRNAtRNA位位(aminoacylaminoacyl site)site)P位:位:肽酰肽酰-tRNAtRNA位位(peptidylpeptidyl site)site)原核生物核蛋白体结构模式原核生物核蛋白体结构模式生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 Biochemistry三、三、tRNA与氨基酸的活化与氨基酸的活化反反密码环密码环氨基酸臂氨基酸臂PrPr合成过程中合成过程中AaAa供供体是氨基酰体是氨基酰-tRNAtRNA,而,而不
12、是游离的氨基酸。不是游离的氨基酸。tRNAtRNA在翻译过程中在翻译过程中起起接合体接合体(adaptoradaptor)作用,与专一的作用,与专一的AaAa结合,结合,是是氨基酸的运载体氨基酸的运载体。生物化学生物化学 Biochemistry氨基酸氨基酸+tRNA氨基酰氨基酰-tRNAATP AMPPPi氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶(一)氨基酰(一)氨基酰-tRNA合成酶合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)l 氨基酸的活化氨基酸的活化第一步反应第一步反应氨基酸氨基酸ATPE 氨基酰氨基酰-AMP-EPPi 第二步反应第二步反应氨基酰氨基酰-AMP-E tRNA
13、 氨基酰氨基酰-tRNA AMP E酯键酯键生物化学生物化学 Biochemistry氨基酰氨基酰-tRNA-tRNA合成酶对氨基酸和合成酶对氨基酸和tRNAtRNA都有高度特都有高度特异性。异性。氨基酰氨基酰-tRNA-tRNA合成酶具有校正活性合成酶具有校正活性(proof-(proof-reading activity)reading activity)。氨基酰氨基酰-tRNA-tRNA的表示方法:的表示方法:Ala-Ala-tRNAtRNAAlaAla Ser-Ser-tRNAtRNASerSerMet-Met-tRNAtRNAMetMet 生物化学生物化学 Biochemistry氨
14、基酸的活化形式:氨基酸的活化形式:氨基酰氨基酰tRNAtRNA氨基酸的活化部位:氨基酸的活化部位:羧基羧基氨基酸与氨基酸与tRNAtRNA连接方式:连接方式:酯键酯键氨基酸活化耗能:氨基酸活化耗能:2 2个个P P生物化学生物化学 Biochemistry真核生物真核生物:Met-tRNAiMet原核生物原核生物:fMet-tRNAifMet(二)起始肽链合成的氨基酰(二)起始肽链合成的氨基酰-tRNA生物化学生物化学 Biochemistry fMet-tRNAifMet的生成的生成:生物化学生物化学 Biochemistry 第第 二二 节节蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成过程The Pr
15、ocess of Protein Biosynthesis生物化学生物化学 Biochemistry蛋白质合成中蛋白质合成中mRNAmRNA模板的方向:模板的方向:5 35 3;蛋白质的合成方向:蛋白质的合成方向:N N端端C C端。端。蛋白质合成过程:蛋白质合成过程:翻译的起始(翻译的起始(initiation)翻译的延长(翻译的延长(elongation)翻译的终止(翻译的终止(termination)生物化学生物化学 Biochemistry一、原核生物蛋白质的合成一、原核生物蛋白质的合成(一)蛋白质合成的起始(一)蛋白质合成的起始指指mRNAmRNA和起始氨基酰和起始氨基酰-tRNA-
16、tRNA分别与核蛋白体分别与核蛋白体结合而形成结合而形成翻译起始复合物翻译起始复合物 (translational(translational initiation complex)initiation complex)。参与起始过程的蛋白质因子称参与起始过程的蛋白质因子称起始因子起始因子(initiation factorinitiation factor,IFIF)。)。生物化学生物化学 Biochemistry参与起始过程的蛋白质因子称起始因参与起始过程的蛋白质因子称起始因子(子(initiation factorinitiation factor,IFIF)。原核生物)。原核生物起始因
17、子有三种:起始因子有三种:IF-1IF-1:占据:占据A A位防止结合其他位防止结合其他tRNAtRNA。IF-2IF-2:促进起始:促进起始tRNAtRNA与小亚基结合。与小亚基结合。IF-3IF-3:促进大小亚基分离,提高:促进大小亚基分离,提高P P位对位对结合起始结合起始tRNAtRNA敏感性。敏感性。生物化学生物化学 Biochemistry原核生物翻译起始复合物形成原核生物翻译起始复合物形成 核糖体大、小亚基分离核糖体大、小亚基分离 mRNAmRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合 起始氨基酰起始氨基酰tRNAtRNA与小亚基结合与小亚基结合 核糖体大亚基结合核糖体大亚基结合生物化
18、学生物化学 BiochemistryIF-3IF-11.核蛋白体大小亚基分离核蛋白体大小亚基分离生物化学生物化学 BiochemistryA U G53IF-3IF-12.mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合生物化学生物化学 BiochemistryS-D序列:序列:在在原核生物原核生物mRNAmRNA起始密码起始密码AUGAUG上游约上游约1010个核苷酸处,存在个核苷酸处,存在4 49 9个富含嘌呤碱的一致个富含嘌呤碱的一致性序列,性序列,如如-AGGAGG-AGGAGG-,称为称为S-DS-D序列序列。又称又称为核蛋白体结合位点(为核蛋白体结合位点(ribosomal binding
19、 ribosomal binding sitesite,RBS)RBS)。可与小亚基。可与小亚基16S 16S rRNArRNA 3 3端富端富含嘧啶的段序列互补结合。含嘧啶的段序列互补结合。生物化学生物化学 BiochemistryS-D序列序列 生物化学生物化学 Biochemistry翻译起始信号.生物化学生物化学 BiochemistryIF-3IF-1IF-2GTPA U G533.起始氨基酰起始氨基酰tRNA与小亚基结合与小亚基结合形成形成30S起始复合物:起始复合物:30S-IF1-IF2-GTP-fMet-tRNAifmet-mRNA生物化学生物化学 BiochemistryI
20、F-1IF-2GTPGDPPiA U G534.核蛋白体大亚基结合核蛋白体大亚基结合形成形成70S70S翻译起始复合物:翻译起始复合物:70S-fMet-tRNA70S-fMet-tRNAi ifMetfMet-mRNA-mRNA生物化学生物化学 BiochemistryIF-3IF-1A U G53IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi起始过程消耗起始过程消耗1个个GTP。蛋白质合成的起始蛋白质合成的起始生物化学生物化学 Biochemistry(二)(二)肽链的延长肽链的延长指指按按照照mRNAmRNA密密码码序序列列的的指指导导,依依次次添添加加氨氨基基酸酸从从N N端端向向C C端端
21、延延伸伸肽肽链链,直直到到合合成终止的过程。成终止的过程。生物化学生物化学 Biochemistry肽链的延长是在核蛋白体上连续性循环式肽链的延长是在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核蛋白体循环(进行,又称为核蛋白体循环(ribosomal ribosomal cycle)cycle),每次循环增加一个氨基酸,分为,每次循环增加一个氨基酸,分为以下三步:以下三步:进位进位(entranceentrance)转肽转肽(peptide bond formationpeptide bond formation)移位移位(translocationtranslocation)生物化学生物化学 Bio
22、chemistry原核延原核延长因子长因子生物功能生物功能对应真核对应真核延长因子延长因子EF-Tu促进氨基酰促进氨基酰-tRNA进入进入A位,位,结合分解结合分解GTPEF-1-EF-Ts调节亚基调节亚基EF-1-EFG有转位酶活性,促进有转位酶活性,促进mRNA-肽酰肽酰-tRNA由由A位前移到位前移到P位,位,促进卸载促进卸载tRNA释放释放EF-2肽链合成的延长因子肽链合成的延长因子 生物化学生物化学 Biochemistry1.进位进位指根据指根据mRNAmRNA下一下一组遗传密码指导,组遗传密码指导,使相应氨基酰使相应氨基酰-tRNA-tRNA进入核蛋白体进入核蛋白体A A位。位。
23、分解开看:分解开看:生物化学生物化学 BiochemistryTu TsGTPGDPA U G53TuTsGTP2.2.转肽转肽是由是由肽酰转移酶肽酰转移酶(peptidylpeptidyl transferasetransferase)催化的肽键形成过程。催化的肽键形成过程。生物化学生物化学 Biochemistry3.3.移位移位延长因子延长因子EF-GEF-G有有转位酶转位酶(translocasetranslocase)活性)活性,可结合并水解,可结合并水解1 1分子分子GTPGTP,促进核蛋白体向促进核蛋白体向mRNAmRNA的的33侧移动。侧移动。生物化学生物化学 Biochemi
24、stryfMetA U G53fMetTuGTP进进位位移移位位转肽转肽肽链的延长:肽链的延长:生物化学生物化学 Biochemistry (三)肽链合成的终止(三)肽链合成的终止当当mRNAmRNA上终止密码出现后,多肽链合上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰成停止,肽链从肽酰-tRNA-tRNA中释出,中释出,mRNAmRNA、核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。成终止。生物化学生物化学 Biochemistry终止相关的蛋白因子称为释放因子终止相关的蛋白因子称为释放因子(release factor,RF)识识别别终终止止密密码码,如如RF
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