基因工程菌生长代谢的特点.pptx
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1、第五节第五节 基因工程菌生长代谢的特点基因工程菌生长代谢的特点 菌体的生长通常用比生长速率来表示。菌体的生长通常用比生长速率来表示。菌体的生长通常用比生长速率来表示。菌体的生长通常用比生长速率来表示。工程菌培养可通过选用不同的碳源控工程菌培养可通过选用不同的碳源控工程菌培养可通过选用不同的碳源控工程菌培养可通过选用不同的碳源控制补料和稀释速率等方法来控制菌体的生制补料和稀释速率等方法来控制菌体的生制补料和稀释速率等方法来控制菌体的生制补料和稀释速率等方法来控制菌体的生长。长。长。长。控制菌体的生长对提高质粒的稳定性、控制菌体的生长对提高质粒的稳定性、控制菌体的生长对提高质粒的稳定性、控制菌体的
2、生长对提高质粒的稳定性、减少代谢副产物积累、提高外源蛋白产率减少代谢副产物积累、提高外源蛋白产率减少代谢副产物积累、提高外源蛋白产率减少代谢副产物积累、提高外源蛋白产率有重要意义。有重要意义。有重要意义。有重要意义。一、菌体的生长与能量的关系一、菌体的生长与能量的关系一、菌体的生长与能量的关系一、菌体的生长与能量的关系 碳源物质是组成培养基的主要成分。碳源物质是组成培养基的主要成分。碳源物质是组成培养基的主要成分。碳源物质是组成培养基的主要成分。碳源物质为细胞提供能量,当菌体生长碳源物质为细胞提供能量,当菌体生长碳源物质为细胞提供能量,当菌体生长碳源物质为细胞提供能量,当菌体生长所需能量大于菌
3、体有氧代谢提供的能量时,所需能量大于菌体有氧代谢提供的能量时,所需能量大于菌体有氧代谢提供的能量时,所需能量大于菌体有氧代谢提供的能量时,菌体会产生乙酸,导致培养基的菌体会产生乙酸,导致培养基的菌体会产生乙酸,导致培养基的菌体会产生乙酸,导致培养基的pHpHpHpH值下降,值下降,值下降,值下降,从而影响菌体的生长。适当提高从而影响菌体的生长。适当提高从而影响菌体的生长。适当提高从而影响菌体的生长。适当提高pHpHpHpH,可减少,可减少,可减少,可减少乙酸的抑制作用乙酸的抑制作用乙酸的抑制作用乙酸的抑制作用 分批培养中选择不同的碳源,连续培分批培养中选择不同的碳源,连续培分批培养中选择不同的
4、碳源,连续培分批培养中选择不同的碳源,连续培养中控制稀释速率等都能一定范围内控制养中控制稀释速率等都能一定范围内控制养中控制稀释速率等都能一定范围内控制养中控制稀释速率等都能一定范围内控制菌体的生长,从而控制乙酸的产生,减少菌体的生长,从而控制乙酸的产生,减少菌体的生长,从而控制乙酸的产生,减少菌体的生长,从而控制乙酸的产生,减少它的抑制作用。它的抑制作用。它的抑制作用。它的抑制作用。加入蛋氨酸和酵母提取物都能减少乙加入蛋氨酸和酵母提取物都能减少乙加入蛋氨酸和酵母提取物都能减少乙加入蛋氨酸和酵母提取物都能减少乙酸的产生。酸的产生。酸的产生。酸的产生。大肠杆菌中克隆携带氧能力的大肠杆菌中克隆携带
5、氧能力的大肠杆菌中克隆携带氧能力的大肠杆菌中克隆携带氧能力的VHBVHBVHBVHB蛋蛋蛋蛋白的基因可提高菌体生长速率。白的基因可提高菌体生长速率。白的基因可提高菌体生长速率。白的基因可提高菌体生长速率。采用磷酸乙酰化酶缺陷株作为宿组采用磷酸乙酰化酶缺陷株作为宿组采用磷酸乙酰化酶缺陷株作为宿组采用磷酸乙酰化酶缺陷株作为宿组主细胞,阻止乙酸产生,可提高产量。主细胞,阻止乙酸产生,可提高产量。主细胞,阻止乙酸产生,可提高产量。主细胞,阻止乙酸产生,可提高产量。二、菌体生长与前体供应的关系二、菌体生长与前体供应的关系 在基础培养基中加入氨基酸(小分在基础培养基中加入氨基酸(小分在基础培养基中加入氨基
6、酸(小分在基础培养基中加入氨基酸(小分子前体)能使菌体比生长率提高,蛋白合子前体)能使菌体比生长率提高,蛋白合子前体)能使菌体比生长率提高,蛋白合子前体)能使菌体比生长率提高,蛋白合成增加。成增加。成增加。成增加。基因工程菌质粒的表达需与宿主细基因工程菌质粒的表达需与宿主细基因工程菌质粒的表达需与宿主细基因工程菌质粒的表达需与宿主细胞竞争共同的前体和催化结构,致工程菌胞竞争共同的前体和催化结构,致工程菌胞竞争共同的前体和催化结构,致工程菌胞竞争共同的前体和催化结构,致工程菌生长速率降低。生长速率降低。生长速率降低。生长速率降低。质粒存在对菌体代谢的影响:中等拷质粒存在对菌体代谢的影响:中等拷质
7、粒存在对菌体代谢的影响:中等拷质粒存在对菌体代谢的影响:中等拷贝质粒(贝质粒(贝质粒(贝质粒(56565656拷贝)的工程菌中与前体合成拷贝)的工程菌中与前体合成拷贝)的工程菌中与前体合成拷贝)的工程菌中与前体合成有关的酶增加,这些酶的基因大多受终产有关的酶增加,这些酶的基因大多受终产有关的酶增加,这些酶的基因大多受终产有关的酶增加,这些酶的基因大多受终产物的反馈调节。物的反馈调节。物的反馈调节。物的反馈调节。高拷贝质粒的工程菌(高拷贝质粒的工程菌(高拷贝质粒的工程菌(高拷贝质粒的工程菌(240240240240拷贝)中,拷贝)中,拷贝)中,拷贝)中,生长速率和菌体总蛋白合成均减少。这与生长速
8、率和菌体总蛋白合成均减少。这与生长速率和菌体总蛋白合成均减少。这与生长速率和菌体总蛋白合成均减少。这与工程菌大量前体被利用引起前体不足,从工程菌大量前体被利用引起前体不足,从工程菌大量前体被利用引起前体不足,从工程菌大量前体被利用引起前体不足,从而产生而产生而产生而产生“严紧反应严紧反应严紧反应严紧反应”有关。有关。有关。有关。“严紧反应严紧反应严紧反应严紧反应”是当氨酰是当氨酰是当氨酰是当氨酰tRNAtRNAtRNAtRNA不足时不足时不足时不足时,核核核核糖体在密码子上停留糖体在密码子上停留糖体在密码子上停留糖体在密码子上停留,并合成被称为魔点并合成被称为魔点并合成被称为魔点并合成被称为魔
9、点的的的的ppGppppGppppGppppGpp的结果。的结果。的结果。的结果。ppGpp ppGpp ppGpp ppGpp是一个重要的调控分子。它通过是一个重要的调控分子。它通过是一个重要的调控分子。它通过是一个重要的调控分子。它通过影响影响影响影响RNARNARNARNA链的延深过程减少转录。链的延深过程减少转录。链的延深过程减少转录。链的延深过程减少转录。它的浓度增加会导致在合成它的浓度增加会导致在合成它的浓度增加会导致在合成它的浓度增加会导致在合成mRNAmRNAmRNAmRNA和和和和rRNArRNArRNArRNA时时时时RNARNARNARNA聚合酶在模板上的移动产生停顿,聚
10、合酶在模板上的移动产生停顿,聚合酶在模板上的移动产生停顿,聚合酶在模板上的移动产生停顿,RNARNARNARNA链延长速度减慢,使游离的链延长速度减慢,使游离的链延长速度减慢,使游离的链延长速度减慢,使游离的RNARNARNARNA聚合酶浓度降聚合酶浓度降聚合酶浓度降聚合酶浓度降低,严紧控制的启动子如低,严紧控制的启动子如低,严紧控制的启动子如低,严紧控制的启动子如rrnArrnArrnArrnA等的转录减少。等的转录减少。等的转录减少。等的转录减少。也可能也可能也可能也可能ppGppppGppppGppppGpp是通过干扰是通过干扰是通过干扰是通过干扰RNARNARNARNA聚合酶与聚合酶与
11、聚合酶与聚合酶与PLPLPLPL启动子专一识别反应。启动子专一识别反应。启动子专一识别反应。启动子专一识别反应。第六节第六节第六节第六节 基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性 基因工程菌在传代过程中常出现质粒基因工程菌在传代过程中常出现质粒基因工程菌在传代过程中常出现质粒基因工程菌在传代过程中常出现质粒不稳定的现象。不稳定的现象。不稳定的现象。不稳定的现象。质粒不稳定可分为:质粒不稳定可分为:质粒不稳定可分为:质粒不稳定可分为:分裂不稳定分裂不稳定分裂不稳定分裂不稳定 结构不稳定结构不稳定结构不稳定结构不稳定分裂不稳定:指工程菌分裂时出现一分裂不稳定
12、:指工程菌分裂时出现一分裂不稳定:指工程菌分裂时出现一分裂不稳定:指工程菌分裂时出现一 定定定定 比例不含质粒子代菌的现象。比例不含质粒子代菌的现象。比例不含质粒子代菌的现象。比例不含质粒子代菌的现象。结构不稳定:指外源基因从质粒上丢失或结构不稳定:指外源基因从质粒上丢失或结构不稳定:指外源基因从质粒上丢失或结构不稳定:指外源基因从质粒上丢失或碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变一、质粒不稳定产生的原因一、质粒不稳定产生的原因一、质粒不稳定产生的原因一、质粒不稳定产生的原因 常见分裂不稳定的两个
13、因素:常见分裂不稳定的两个因素:常见分裂不稳定的两个因素:常见分裂不稳定的两个因素:含质粒菌产生不含质粒子代菌的频率;含质粒菌产生不含质粒子代菌的频率;含质粒菌产生不含质粒子代菌的频率;含质粒菌产生不含质粒子代菌的频率;这两种菌比数率差异的大小。这两种菌比数率差异的大小。这两种菌比数率差异的大小。这两种菌比数率差异的大小。对同一工程菌控制不同的比生长数率对同一工程菌控制不同的比生长数率对同一工程菌控制不同的比生长数率对同一工程菌控制不同的比生长数率可改变质粒的拷贝数:可改变质粒的拷贝数:可改变质粒的拷贝数:可改变质粒的拷贝数:低拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代低拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代低拷
14、贝质粒工程菌产生不含质粒子代低拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代菌频率高如增加工程菌质粒拷贝数可提菌频率高如增加工程菌质粒拷贝数可提菌频率高如增加工程菌质粒拷贝数可提菌频率高如增加工程菌质粒拷贝数可提高稳定性;高稳定性;高稳定性;高稳定性;高拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代高拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代高拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代高拷贝质粒工程菌产生不含质粒子代菌频率低但对稳定性不利。菌频率低但对稳定性不利。菌频率低但对稳定性不利。菌频率低但对稳定性不利。质粒稳定性的分析方法质粒稳定性的分析方法质粒稳定性的分析方法质粒稳定性的分析方法样品样品样品样品不含抗性标记抗生素不含抗性标记抗生素不含抗性
15、标记抗生素不含抗性标记抗生素 平平平平 板板板板 培培培培 养基养基养基养基10-12h10-12h10-12h10-12h100100100100个菌落个菌落个菌落个菌落含抗性标记抗生素含抗性标记抗生素含抗性标记抗生素含抗性标记抗生素平平平平 板板板板 培培培培 养养养养 基基基基 10-12h10-12h10-12h10-12h统计生长菌落数统计生长菌落数重复三次重复三次重复三次重复三次,计算比值计算比值计算比值计算比值 (稳定性稳定性稳定性稳定性stability)stability)stability)stability)二、提高质粒稳定性的方法二、提高质粒稳定性的方法二、提高质粒稳定
16、性的方法二、提高质粒稳定性的方法 为了提高质粒稳定性,工程菌培养采用为了提高质粒稳定性,工程菌培养采用为了提高质粒稳定性,工程菌培养采用为了提高质粒稳定性,工程菌培养采用两阶段培养法:两阶段培养法:两阶段培养法:两阶段培养法:先使菌体生长至一定密度;先使菌体生长至一定密度;先使菌体生长至一定密度;先使菌体生长至一定密度;再诱导外源基因的表达再诱导外源基因的表达再诱导外源基因的表达再诱导外源基因的表达 由于第一阶段外源基因未表达,减小由于第一阶段外源基因未表达,减小了重组菌与质粒丢失菌的生长速率的差别,了重组菌与质粒丢失菌的生长速率的差别,增加了质粒稳定性。增加了质粒稳定性。在培养基中加入抗菌素
17、抑制质粒丢失在培养基中加入抗菌素抑制质粒丢失菌的生长,提高质粒稳定性。菌的生长,提高质粒稳定性。调控环境参数如温度、调控环境参数如温度、pHpH、培养基组、培养基组分和溶解氧浓度分和溶解氧浓度 有些含质粒菌对发酵环境的改变有些含质粒菌对发酵环境的改变有些含质粒菌对发酵环境的改变有些含质粒菌对发酵环境的改变比不含质粒菌反应慢,间歇改变培养条比不含质粒菌反应慢,间歇改变培养条比不含质粒菌反应慢,间歇改变培养条比不含质粒菌反应慢,间歇改变培养条件以改变两种菌比生长速率,可改善质件以改变两种菌比生长速率,可改善质件以改变两种菌比生长速率,可改善质件以改变两种菌比生长速率,可改善质粒稳定性。通过间歇供氧
18、和改变稀释数粒稳定性。通过间歇供氧和改变稀释数粒稳定性。通过间歇供氧和改变稀释数粒稳定性。通过间歇供氧和改变稀释数率,都可以提高质粒稳定性。率,都可以提高质粒稳定性。率,都可以提高质粒稳定性。率,都可以提高质粒稳定性。大肠杆菌的蛋白大肠杆菌的蛋白大肠杆菌的蛋白大肠杆菌的蛋白/菌体量的比值是基菌体量的比值是基菌体量的比值是基菌体量的比值是基本恒定的,因而菌体的生长速度反映了本恒定的,因而菌体的生长速度反映了本恒定的,因而菌体的生长速度反映了本恒定的,因而菌体的生长速度反映了蛋白质的合成速度。蛋白质的合成速度。蛋白质的合成速度。蛋白质的合成速度。培养条件的改变,都会改变菌体的能培养条件的改变,都会
19、改变菌体的能培养条件的改变,都会改变菌体的能培养条件的改变,都会改变菌体的能量代谢和小分子前体的供应,影响生物量代谢和小分子前体的供应,影响生物量代谢和小分子前体的供应,影响生物量代谢和小分子前体的供应,影响生物大分子的和成和菌体的生长。大分子的和成和菌体的生长。大分子的和成和菌体的生长。大分子的和成和菌体的生长。第七节第七节 基因工程菌中试基因工程菌中试基因工程菌中试应考虑的问题:适宜商品化生基因工程菌中试应考虑的问题:适宜商品化生产的工程菌,设计发酵反应器,选择反应过产的工程菌,设计发酵反应器,选择反应过程,发酵培养基组分,维持生产工艺最佳化程,发酵培养基组分,维持生产工艺最佳化的方法,工
20、艺监测方法,工艺控制方法,工的方法,工艺监测方法,工艺控制方法,工艺自动化使用方法,生物催化剂使用,产品艺自动化使用方法,生物催化剂使用,产品提取方法的选择,分离精制技术的选择。提取方法的选择,分离精制技术的选择。一一 工程菌选择工程菌选择 用于中试的工程菌需具备的条件试能用一般用于中试的工程菌需具备的条件试能用一般基因重组技术获得,有高产潜力,能有工基因重组技术获得,有高产潜力,能有工业原料薇培养基,生产工期能采用一般工业原料薇培养基,生产工期能采用一般工业生产经验,能产生和分泌蛋白质,不致业生产经验,能产生和分泌蛋白质,不致病,无毒性,能安全生产,符合国家卫生病,无毒性,能安全生产,符合国
21、家卫生部门有关规定,产品有特异性,发酵液粘部门有关规定,产品有特异性,发酵液粘度小。度小。二二 反应器设计反应器设计三三 发酵培养基组成发酵培养基组成培养基组成及作用:培养基组成及作用:提供化学元素提供化学元素提供特殊营养源提供特殊营养源提供能源提供能源控制代谢控制代谢四四 工艺最佳化与参数监测控制工艺最佳化与参数监测控制1.1.工艺最佳化工艺最佳化 是指最快周期,最高产量,最好质量,最低消耗,是指最快周期,最高产量,最好质量,最低消耗,最大安全性,最周全的服务处理效果,最佳化速最大安全性,最周全的服务处理效果,最佳化速度与最低失败率等的综合指标度与最低失败率等的综合指标2.2.参数监测控制参
22、数监测控制 需监测与控制的需监测与控制的4 4种参数:种参数:A A,主要参数:,主要参数:pH,pH,温度,温度,溶氧。溶氧。B B,生物量:浑浊度,细胞组分,总氮量及,生物量:浑浊度,细胞组分,总氮量及菌丝干重。菌丝干重。C C,碳源:糖,有机酸,淀粉。,碳源:糖,有机酸,淀粉。D D,产,产品。品。五 计算机的应用第八节 重组工程菌的培养 基因工程菌的培养过程包括:通过摇瓶操作基因工程菌生长的基础条件,如温度、pH、培养基各种组分、碳氧比,分析表达产物的合成、积累对受体细胞的影响;通过培养罐操作确定培养参数和控制方案以及顺序。菌种菌种菌种菌种 一级种子摇瓶一级种子摇瓶一级种子摇瓶一级种子
23、摇瓶 二级种子罐培养二级种子罐培养二级种子罐培养二级种子罐培养 扩大培养扩大培养扩大培养扩大培养 原料原料原料原料 发酵培养发酵培养发酵培养发酵培养 灭菌灭菌灭菌灭菌 发酵生产发酵生产发酵生产发酵生产 代谢产物分离代谢产物分离代谢产物分离代谢产物分离 基配制基配制基配制基配制 微生物工业发酵过程简图微生物工业发酵过程简图微生物工业发酵过程简图微生物工业发酵过程简图 一 基因工程菌的培养方式1.分批培养2.补料分批培养3.连续培养4.透析培养5.固定化培养 2.2.2.2.补料分批培养补料分批培养补料分批培养补料分批培养 补料分批培养是将种子接入发酵补料分批培养是将种子接入发酵补料分批培养是将种
24、子接入发酵补料分批培养是将种子接入发酵反应器中进行培养反应器中进行培养反应器中进行培养反应器中进行培养,经过一段时间后间经过一段时间后间经过一段时间后间经过一段时间后间歇或连续地补加新鲜培养基,使菌体歇或连续地补加新鲜培养基,使菌体歇或连续地补加新鲜培养基,使菌体歇或连续地补加新鲜培养基,使菌体进一步生长的方法。进一步生长的方法。进一步生长的方法。进一步生长的方法。二、基因工程菌的培养工艺二、基因工程菌的培养工艺二、基因工程菌的培养工艺二、基因工程菌的培养工艺 基因工程菌的发酵与传统的微生基因工程菌的发酵与传统的微生基因工程菌的发酵与传统的微生基因工程菌的发酵与传统的微生物发酵不同物发酵不同物
25、发酵不同物发酵不同,基因工程菌带外源基因基因工程菌带外源基因基因工程菌带外源基因基因工程菌带外源基因,发酵的目的是使外源基因高效表达。发酵的目的是使外源基因高效表达。发酵的目的是使外源基因高效表达。发酵的目的是使外源基因高效表达。它不仅涉及宿主载体和克隆基因之它不仅涉及宿主载体和克隆基因之它不仅涉及宿主载体和克隆基因之它不仅涉及宿主载体和克隆基因之间的相互关系还和环境有关。间的相互关系还和环境有关。间的相互关系还和环境有关。间的相互关系还和环境有关。工艺要求:外源基因既高效表达,工艺要求:外源基因既高效表达,又有利于产品分离纯化。对发酵影又有利于产品分离纯化。对发酵影响较大的几个因素有:响较大
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