Chapter 10 复制-精品文档资料整理.ppt
《Chapter 10 复制-精品文档资料整理.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《Chapter 10 复制-精品文档资料整理.ppt(137页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、基因信息的传递第第 十十 章章 DNADNA 的生物合成的生物合成生物化学生物化学 Biochemistry第一节第一节 DNADNA的生物合成(复制)的生物合成(复制)第二节第二节 DNADNA损伤与修复损伤与修复内容提要:内容提要:基基 因因 (gene):为蛋白质或为蛋白质或RNARNA编码的编码的DNADNA功能片段功能片段,是是以碱基排列顺序的方式储存的遗传信以碱基排列顺序的方式储存的遗传信息息。基基 因因 组组(genome):某一物种拥有的全部遗传物质,从某一物种拥有的全部遗传物质,从分子意义上说,是指分子意义上说,是指全部全部DNADNA序列序列。生物化学生物化学 Bioche
2、mistry 转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录*中心法则中心法则(the central dogma)转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录 转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录 转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录 转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录 转录转录 翻译翻译 复制复制 DNA RNA 蛋白质蛋白质 逆转录逆转录 生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 BiochemistryDN
3、A的生物合成(复制)DNA Biosynthesis(Replication)第第 一一 节节生物化学生物化学 Biochemistry DNA的生物合成的生物合成复制复制(replication):以以亲代亲代DNADNA为模板为模板,按照,按照碱基互补配对碱基互补配对规律规律合成子代合成子代DNADNA的过程的过程。复制复制逆转录逆转录复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA生物化学生物化学 Biochemistry一、半保留复制一、半保留复制 DNADNA生生物物合合成成时时,亲亲代代DNADNA解解开开为为两两股股单单链链,各各自自作作为为模模板板(template)(template)按
4、按碱碱基基配配对对规规律律,合合成成与与模模板板互互补补的的新新链链。在在子子代代DNADNA分分子子的的两两条条链链中中,一一条条来来自自亲亲代代,另另一一条条是是新新合合成成的的,这种复制方式称为这种复制方式称为半保留复制。半保留复制。(一)半保留复制的概念(一)半保留复制的概念生物化学生物化学 Biochemistry 全保留式全保留式 半保留式半保留式 混合式混合式 DNA复制的三种可能方式复制的三种可能方式(二)(二)DNA半保留复制的实验依据半保留复制的实验依据 含含N15-DNA的细菌的细菌培养于普培养于普通培养液通培养液 第一代第一代继续培养于继续培养于普通培养液普通培养液 第
5、二代第二代生物化学生物化学 Biochemistry按按半半保保留留复复制制方方式式,子子代代DNADNA与与亲亲代代DNADNA的的碱碱基基序序列列一一致致,即即子子代代保保留留了了亲亲代代的的全部遗传信息,体现了遗传的全部遗传信息,体现了遗传的保守性保守性。(三)半保留复制的意义(三)半保留复制的意义遗传的保守性,是物种稳定性的分子遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但基础,但不是绝对的不是绝对的。生物化学生物化学 Biochemistry二、复制的方向二、复制的方向双向复制双向复制复制原点复制原点(origins of replication):):又又叫复制的起始点,是指叫复制的起始
6、点,是指DNADNA复制开始的特定复制开始的特定的位点的位点。这个区域通常由。这个区域通常由富含富含A/TA/T碱基对碱基对的的特殊碱基序列组成,能特殊碱基序列组成,能结合各种蛋白结合各种蛋白,有,有助于解开螺旋,启动复制。助于解开螺旋,启动复制。生物化学生物化学 Biochemistry 复复制制时时双双链链打打开开,分分开开成成两两股股,各各自自作作为为模模板板,子子链链沿沿模模板板延延长长所所形形成成的的Y Y字字形形 的的 结结 构构 称称 为为 复复 制制 叉叉(replication(replication fork)fork)。生物化学生物化学 Biochemistry原核生物:
7、原核生物:基因组是环状基因组是环状DNADNA 只有一只有一个复制起始点个复制起始点 复制时,复制时,DNADNA从复制原点向两个方向解链,从复制原点向两个方向解链,形成两个延伸相反的复制叉,两个叉均参与形成两个延伸相反的复制叉,两个叉均参与DNADNA的复制,并以几乎相等的速率移动,称为的复制,并以几乎相等的速率移动,称为双向双向复制(复制(bidirectional replicationbidirectional replication)。生物化学生物化学 Biochemistry 在在原原核核生生物物双双向向复复制制中中,DNADNA被被描描述述为为眼睛眼睛状,称为状,称为复制。复制。
8、oriCoriC生物化学生物化学 Biochemistry真核生物:真核生物:染色体染色体DNADNA有有多个复制起始点多个复制起始点。两两个个起起始始点点之之间间的的DNADNA片片段段称称为为复复制制子子(repliconreplicon)。复制子是独立完成复制的功能单位。复制子是独立完成复制的功能单位。真核生物多个复制起始点、复制子与复制叉真核生物多个复制起始点、复制子与复制叉生物化学生物化学 Biochemistry3 5 3 5 3535解链方向解链方向前导链前导链(leading strand)后随链后随链(lagging strand)复制的半不连续性复制的半不连续性35生物化学
9、生物化学 Biochemistry顺顺着着解解链链方方向向生生成成的的子子链链,复复制制是是连连续续进进行行的的这这股链称为股链称为前导链或领头链前导链或领头链(leading strand)。另另一一股股链链因因为为复复制制的的方方向向与与解解链链方方向向相相反反,不不能能顺顺着着解解链链方方向向连连续续延延长长,这这股股不不连连续续复复制制的的链链称称为为后随链或随从链后随链或随从链(lagging strand)。前前导导链链连连续续复复制制而而后后随随链链不不连连续续复复制制,就就是是复复制制的的半不连续性半不连续性。生物化学生物化学 Biochemistry 冈崎片段:冈崎片段:19
10、681968年年日日本本生生化化学学者者冈冈崎崎用用电电镜镜及及放放射射自自显显影影技技术术,观观察察到到DNADNA复复制制中中出出现现一一些些不不连连续续的的片片段段,将将这这些些不不连连续续的的片片段段称称为为冈冈崎崎片片段段。冈冈崎崎片片段段再再由由DNADNA连连接接酶酶连连成一条完整的新链。成一条完整的新链。原核生物原核生物:1000-20001000-2000个核苷酸个核苷酸 真核生物真核生物:100-200100-200个核苷酸个核苷酸生物化学生物化学 Biochemistry3 5 3 5 3535解链方向解链方向前导链前导链(leading strand)后随链后随链(la
11、gging strand)35冈崎冈崎片段片段半不连续复制半不连续复制生物化学生物化学 Biochemistry半不连续复制动画半不连续复制动画生物化学生物化学 Biochemistry DNA复制的化学反应复制的化学反应The chemistry reaction of DNA Replication 三、三、(一)(一)DNA复制的体系复制的体系 底物底物:dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)聚合酶聚合酶:依赖依赖DNADNA的的DNADNA聚合酶聚合酶(DNA-(DNA-polpol)模板模板:解开成单链的解开成单链的DNADNA母链母链 引物引物:提供提供3-OH3-OH
12、末端的一段末端的一段RNARNA 其他酶和蛋白质因子其他酶和蛋白质因子:拓扑异构酶、解螺旋酶、拓扑异构酶、解螺旋酶、单链单链DNADNA结合蛋白结合蛋白、引物酶、连接酶引物酶、连接酶生物化学生物化学 Biochemistry(二)复制的化学反应(二)复制的化学反应 (dNMP)n+dNTP (dNMP)n+1+PPi 生物化学生物化学 Biochemistry聚合反应的特点聚合反应的特点DNADNA新链生成需要以单链新链生成需要以单链DNADNA为为模板模板需要需要RNARNA引物引物提供提供3 3-OH-OH,以,以dNTPdNTP为原为原料料新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 5 3 3
13、方向进行方向进行 聚合反应机理聚合反应机理3 5 3 5 5 A G C T T C A G G A T A 3|3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性 5 3 外切酶活性外切酶活性?能切除引物和突变的能切除引物和突变的DNADNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。核酸外切酶活性核酸外切酶活性 生物化学生物化学 Biochemistry生物化学生物化学 Biochemistry四、参与复制的主要酶类四、参与复制的主要酶类全称:全称:依赖依赖DNADNA的的DNADNA聚合酶聚合酶(DNA-d
14、ependent DNA polymerase)简称:简称:DNA-pol活性:活性:1 1.5 53 3 的聚合活性的聚合活性 2.2.核酸外切酶活性核酸外切酶活性(一)(一)DNA聚合酶聚合酶生物化学生物化学 Biochemistry1959 1959 年获诺贝尔生理学或医学奖年获诺贝尔生理学或医学奖 奥乔亚奥乔亚 科恩伯格科恩伯格 Severo Ochoa Arthur Kornberg生物化学生物化学 Biochemistry1.原核生物的原核生物的DNA聚合酶聚合酶 DNA-pol DNA-pol DNA-pol 生物化学生物化学 Biochemistry(1)DNA-pol 多功能
15、酶:多功能酶:5 5聚合酶活性聚合酶活性,对复制和修复中出现的,对复制和修复中出现的空隙进行填补;空隙进行填补;5 5 外切酶活性外切酶活性,对复制中的错误进行校对,对复制中的错误进行校对,保证复制准确性;保证复制准确性;5 5外切酶活性外切酶活性,去除,去除RNARNA引物和突变碱基。引物和突变碱基。生物化学生物化学 BiochemistryDNA聚合酶聚合酶I的的5 外切酶活性:外切酶活性:识别切除生长链识别切除生长链3 3 端的错配核苷酸,每次切除端的错配核苷酸,每次切除1 1个核苷酸,个核苷酸,该活性对双链该活性对双链DNADNA不起作用不起作用;正常聚合条件下,活性很低正常聚合条件下
16、,活性很低,一旦出现碱基错,一旦出现碱基错配,配,DNADNA聚合酶聚合酶I I的聚合活性被抑制,聚合反应停的聚合活性被抑制,聚合反应停止,止,5 5 外切酶活性切除错配核苷酸,再继续聚外切酶活性切除错配核苷酸,再继续聚合;合;有效的保证有效的保证DNADNA复制的高度忠实性复制的高度忠实性。323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 605个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol 928 AaKlenowKlenow片段是实验室合成片段是实验室合成
17、DNADNA,进行分子生物学进行分子生物学研究中常用的工具酶。研究中常用的工具酶。(2)DNA聚合酶聚合酶II(DNA-pol II)具有具有5 5聚合酶活性聚合酶活性和和5 5 外外切酶活性,没有切酶活性,没有5 5外切酶活性外切酶活性。只是在无只是在无polpol及及polpol的情况下暂的情况下暂时起作用。时起作用。对模板的特异性不高对模板的特异性不高,参与参与DNADNA损损伤伤 的应急状态修复的应急状态修复。生物化学生物化学 Biochemistry(3)DNA聚合酶聚合酶III (DNA-pol III)是复制延长中是复制延长中真正起催化作用的酶真正起催化作用的酶。由由1010种亚
18、基组成不对称的聚合体。种亚基组成不对称的聚合体。,/ksi/ksi/,/it/it/亚亚基基组组成成核核心心酶酶,亚亚基基具具有有5 533的的聚聚合合活活性性,亚亚基基具具有有3535外外切切酶酶活活性性和和碱碱基基选选择择功功能能,亚基可能起组装作用亚基可能起组装作用。生物化学生物化学 Biochemistry亚亚基基(DNA(DNA夹夹子子)能能夹夹稳稳模模板板链链,负负责责酶酶沿沿DNADNA模板滑动的作用。模板滑动的作用。其其余余亚亚基基统统称称为为-复复合合物物,促促进进全全酶酶的的组装及增强核心酶活性。组装及增强核心酶活性。DNA-pol 53聚聚合活性合活性35外切外切组装组装
19、核心酶核心酶DNA夹子夹子-复合复合物物大肠杆菌每个细胞中只有大肠杆菌每个细胞中只有10102020个个DNA DNA polpol-III-III酶分子,但催化脱氧核苷酶分子,但催化脱氧核苷酸掺入酸掺入DNADNA链的速率分别是链的速率分别是DNADNA聚合酶聚合酶I I和和IIII的的1515倍和倍和3030倍,可达倍,可达150150个核苷个核苷酸酸/秒。并且它可连续催化多达秒。并且它可连续催化多达50005000个核苷酸的加入,因此是真正意义上个核苷酸的加入,因此是真正意义上的的DNADNA复制酶。复制酶。生物化学生物化学 Biochemistry催化催化DNA聚合聚合参与参与DNAD
20、NA损伤损伤的应急状态修的应急状态修复复校读、修复合校读、修复合成、成、切除引物切除引物填补空隙填补空隙功能功能2040400分子数分子数/细胞细胞+5 外切酶活性外切酶活性+5 外切酶活性外切酶活性+5 聚合酶活性聚合酶活性pol IIIpol IIpol IE.Coli中的中的DNA聚合酶聚合酶生物化学生物化学 Biochemistry2.真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶起始引发,催化起始引发,催化后随链的不连续合成后随链的不连续合成。复制的主要酶复制的主要酶,参与,参与前导链前导链的合成。的合成。参与参与DNADNA的的修复修复。在复制过程中起在复制过程中起校读、修复和填补缺校读、
21、修复和填补缺口口的作用。的作用。在在线粒体线粒体DNADNA复制中起催化作用。复制中起催化作用。DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol (二)(二)DNA拓扑异构酶拓扑异构酶(DNA topoisomerase)1010 8 8 局部解链后局部解链后拓扑是指物体或图像作弹性位移而又保持不变的性质。拓扑是指物体或图像作弹性位移而又保持不变的性质。生物化学生物化学 Biochemistry解解链链过过程程中中,DNADNA分分子子会会过过度度拧拧紧紧、打打结结、缠缠绕绕、连连环环等等现现象象,DNADNA拓拓扑扑异异构构酶酶催催化化DNADNA链链的的瞬瞬时
22、时断断裂裂和和闭闭合合释放长螺旋产生的扭转张力,使复制顺利进行。释放长螺旋产生的扭转张力,使复制顺利进行。生物化学生物化学 Biochemistry拓扑异构酶作用特点拓扑异构酶作用特点兼有兼有内切酶活性内切酶活性和和连接酶活性连接酶活性克服解链过程中的打结、缠绕现象克服解链过程中的打结、缠绕现象 拓扑异构酶拓扑异构酶 拓扑异构酶拓扑异构酶分分 类类拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNADNA双链中双链中一股一股链,使链,使DNADNA解解链旋转不致打结;适当时候封闭链旋转不致打结;适当时候封闭切口,切口,DNADNA变为松弛状态变为松弛状态。反应反应不需不需ATPATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切
23、断DNADNA分子分子两股两股链,断端通过切口链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。旋转使超螺旋松弛。利用利用ATPATP供能,连接断端,供能,连接断端,DNADNA分子分子进入负超螺旋状态。(主要)进入负超螺旋状态。(主要)作用机制作用机制 生物化学生物化学 Biochemistry拓扑异构酶拓扑异构酶的作用的作用拓扑异构酶拓扑异构酶的作用的作用(三)解螺旋酶(三)解螺旋酶(helicase)位于复制叉前,位于复制叉前,利用利用ATPATP供能供能,作用于氢键作用于氢键,使,使DNADNA双链双链解开成为两条解开成为两条单链单链,便于,便于DNA DNA polpol III III和和引物酶作
24、用。引物酶作用。每解开一对碱基,需消耗每解开一对碱基,需消耗2 2分子分子ATPATP。Dna BDna C解链方向解链方向(四)引物酶(四)引物酶(primase)依赖依赖DNADNA的的RNARNA聚合酶聚合酶。可以催化游离可以催化游离NTPNTP聚合形成聚合形成小段小段RNARNA。催化催化RNARNA引物的生成,对于引物的生成,对于DNADNA合成是必需的。合成是必需的。在大肠杆菌,是在大肠杆菌,是dnadna G G基因的表达产物。基因的表达产物。引物(引物(primer):):是是一一小小段段单单链链DNADNA或或RNARNA,作作为为DNADNA复复制制的的起起始始点点,在在核
25、核酸酸合合成成反反应应时时,作作为为每每个个多多核核苷苷酸酸链链进进行行延延伸伸的的出出发发点点而而起作用的多核苷酸链,引物的起作用的多核苷酸链,引物的3-OH3-OH,必须是游离的。,必须是游离的。生物化学生物化学 Biochemistry(五)(五)DNA连接酶连接酶连连接接DNADNA链链3 3-OH-OH末末端端和和相相邻邻DNADNA链链5 5-P-P末末端端,使使二二者者生生成成磷磷酸酸二二酯酯键键,从从而而把两段相邻的把两段相邻的DNADNA链连接成一条完整的链。链连接成一条完整的链。生物化学生物化学 BiochemistryHO5335DNA连接酶连接酶ATP(NAD+)AMP
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- Chapter 10 复制-精品文档资料整理 复制 精品 文档 资料 整理
限制150内