蛋白质的结构与功能的关系 (2)精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的结构与功能的关系(2)第1页,讲稿共71张,创作于星期三一、蛋白质结构与功能的关系一、蛋白质结构与功能的关系蛋白质一级结构与功能的关系蛋白质一级结构与功能的关系前体与活性蛋白质前体与活性蛋白质分子病分子病蛋白质空间结构与功能的关系蛋白质空间结构与功能的关系肌红蛋白的结构与功能肌红蛋白的结构与功能血红蛋白的结构与功能血红蛋白的结构与功能第2页,讲稿共71张,创作于星期三(一一)蛋白质一级结构与功能的关系蛋白质一级结构与功能的关系1.一级结构一级结构是空间构象的基础是空间构象的基础 在在生生物物体体内内,蛋蛋白白质质的的多多肽肽链链一一旦旦被被合合成成后后,即即可可根根 据据一一级级结
2、结构构 的的特特点点自自然然折折叠叠和和盘盘曲曲,形形成成一一定定的的空空间间构构象象,特特定定的的空空间间构构象象主主要要是是由由蛋蛋白白质质分分子子中中多多肽肽链链和和侧侧链链 R R基基团团形形成成的的次次级级键键来来维维持持的的。蛋蛋白白质质的的一一级级结结构构决决定定了了它它的的二二级级、三三级级结结构构,即即由由一一级级结结构构可可以以自自动动地地发发展展到到二二、三三级级结结构构。、第3页,讲稿共71张,创作于星期三ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY一一 级级 结结 构构二级结构二级结构蛋白质的结构基础蛋白质的结构基础三三 级级 结结 构构四四 级级 结结 构构第4页,讲稿
3、共71张,创作于星期三一级结构是空间构象的基础一级结构是空间构象的基础 牛核糖核酸酶的结牛核糖核酸酶的结构构二二硫硫键键第5页,讲稿共71张,创作于星期三 天然状态,天然状态,有催化活性有催化活性 尿素、尿素、-巯基乙醇巯基乙醇 去除尿素、去除尿素、-巯基乙醇巯基乙醇非折叠状态,无活性非折叠状态,无活性牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶核糖核酸酶核糖核酸酶A变性,酶的三级结构和变性,酶的三级结构和活性完全丧失,生成含有活性完全丧失,生成含有8个巯基的个巯基的多肽链。多肽链。加脲和巯加脲和巯基乙醇基乙醇去除脲和巯基乙醇,又去除脲和巯基乙醇,又恢复到天然状态恢复到天然状态核糖核酸酶核糖核酸酶A变性和复性变性
4、和复性第6页,讲稿共71张,创作于星期三 胰岛素(胰岛素(Insulin)首先合成)首先合成108个氨基酸的个氨基酸的前胰岛素原前胰岛素原(pre-proinsulin),),随即切去随即切去N-端的端的24个氨基酸信号肽,个氨基酸信号肽,形成形成84个氨基酸的个氨基酸的胰岛素原胰岛素原(proinsulin),),形成正确的二形成正确的二硫键,硫键,在包装分泌时,在包装分泌时,A、B链之间的链之间的33个氨基酸个氨基酸C肽肽残基被残基被切除,才形成切除,才形成胰岛素。胰岛素。人工合成的胰岛素,人工合成的胰岛素,A、B链分别合成后,链分别合成后,等比例混合后就有活性。等比例混合后就有活性。2.
5、前体前体与与活性蛋白质活性蛋白质一级结构的关系一级结构的关系第7页,讲稿共71张,创作于星期三胰岛素的体内合成胰岛素的体内合成胰岛素基因胰岛素基因mRNA核糖体核糖体SSSSSSB chainSSSSSSA chain胰岛素原胰岛素原 9kDa胰岛素胰岛素 5.5 5.5kDakDaC 肽肽GOLGI分泌颗粒分泌颗粒 血血 液液Zn2+MICROCRYSTALS切割位点切割位点A肽肽B肽肽30 aa33 aa21 aa前胰岛素原前胰岛素原 11.5 kDaRER600600核苷酸核苷酸C肽肽24 aa信号肽信号肽第8页,讲稿共71张,创作于星期三3.蛋白质一级结构的蛋白质一级结构的种属差异种属
6、差异与与分子进化分子进化对于对于不同种属来源不同种属来源的的同种蛋白质同种蛋白质进行一级结构测定和比较,发进行一级结构测定和比较,发现存在种属差异,这种差异可能是分子进化的结果,但现存在种属差异,这种差异可能是分子进化的结果,但与功能相与功能相关的结构总是有高度的保守性关的结构总是有高度的保守性。以细胞色素以细胞色素C C为例为例:细胞色素:细胞色素C C广泛存在于真核生物细胞的线粒体中,广泛存在于真核生物细胞的线粒体中,是一种含有血红素辅基的单链蛋白质。在生物氧化时,细胞色素是一种含有血红素辅基的单链蛋白质。在生物氧化时,细胞色素C C在呼吸在呼吸链的电子传递系统中起传递电子的作用,使血红素
7、上铁原子的价链的电子传递系统中起传递电子的作用,使血红素上铁原子的价数发生变化。数发生变化。第9页,讲稿共71张,创作于星期三细胞色素细胞色素c c的一级结构与生物进化的关系的一级结构与生物进化的关系第10页,讲稿共71张,创作于星期三n脊椎动物的细胞色素脊椎动物的细胞色素C C由由l04l04个氨基酸残基组成;昆虫有个氨基酸残基组成;昆虫有108108个氨基个氨基酸残基组成;植物则有酸残基组成;植物则有112112个氨基酸残基组成。个氨基酸残基组成。n对不同生物的细胞色素对不同生物的细胞色素C C的一级结构分析表明,大约有的一级结构分析表明,大约有2828个氨基酸残个氨基酸残基是各种生物共有
8、的,表明这些氨基酸残基是规定细胞色素基是各种生物共有的,表明这些氨基酸残基是规定细胞色素C C的生物功的生物功能所必需的。其中包括能所必需的。其中包括第第1414和和1717位上两个半胱氨酸残基位上两个半胱氨酸残基是细胞色是细胞色素素C C与辅基血红素共价相连的位置;与辅基血红素共价相连的位置;第第70-8070-80位上成串的不变氨基位上成串的不变氨基酸残基酸残基可能是细胞色素可能是细胞色素C C与酶结合的部位。与酶结合的部位。在分子进化过程中,细胞色素在分子进化过程中,细胞色素C C分子中保持氨基酸残基不分子中保持氨基酸残基不变的区域称为变的区域称为保守部位保守部位。保守部位的氨基酸都是细
9、胞色保守部位的氨基酸都是细胞色素素C C完成其生物学功能所必需的完成其生物学功能所必需的。第11页,讲稿共71张,创作于星期三同源蛋白质的物种差异与生物进化同源蛋白质的物种差异与生物进化同源蛋白质同源蛋白质:在生物体中行使相同或相似功能的蛋在生物体中行使相同或相似功能的蛋白质。白质。不变残基不变残基 可变残基可变残基来自两个物种的同源蛋白质,其序列之间的氨基酸来自两个物种的同源蛋白质,其序列之间的氨基酸差异数目与这些物种间的系统差异成比例。即在进差异数目与这些物种间的系统差异成比例。即在进化位置上相差愈远,其氨基酸序列差别愈大。化位置上相差愈远,其氨基酸序列差别愈大。第12页,讲稿共71张,创
10、作于星期三4.蛋白质的一级结构与蛋白质的一级结构与分子病分子病 几乎所有遗传病都与蛋白质几乎所有遗传病都与蛋白质分子结构改变分子结构改变有关,称之为有关,称之为分子病分子病。在蛋白在蛋白质的一级结构中,参与质的一级结构中,参与功能活性部位的残基功能活性部位的残基或或处于特定构象关键部位的处于特定构象关键部位的残基残基,即使在整个分子中发生,即使在整个分子中发生一个残基的异常一个残基的异常,那么该蛋白质的功能也会,那么该蛋白质的功能也会受到明显的影响,导致疾病的发生。受到明显的影响,导致疾病的发生。这种变异来源于基因上遗传信息的突这种变异来源于基因上遗传信息的突变,所以是可变,所以是可遗传遗传的
11、的。与血红蛋白相关与血红蛋白相关与血红蛋白相关与血红蛋白相关的分子病的分子病的分子病的分子病镰刀状细胞贫血病镰刀状细胞贫血病-血红蛋白血红蛋白 或或 链突变链突变地中海贫血地中海贫血-血红蛋白血红蛋白 或或 链缺失链缺失第13页,讲稿共71张,创作于星期三 被称之为被称之为“分子病分子病”的的镰刀状细胞贫血镰刀状细胞贫血仅仅是血红蛋白(仅仅是血红蛋白(HbHb)亚亚基基574574个氨基酸残基中,一个氨基酸残基即个氨基酸残基中,一个氨基酸残基即N N端的第端的第6 6位的谷氨酸被缬位的谷氨酸被缬氨酸取代,发生了变异所造成的。突变导致本是可溶性的血红蛋白聚氨酸取代,发生了变异所造成的。突变导致本
12、是可溶性的血红蛋白聚集成丝,相互粘着,导致红细胞变形而成镰刀状,极易破碎导致贫血。集成丝,相互粘着,导致红细胞变形而成镰刀状,极易破碎导致贫血。镰刀状细胞贫血病镰刀状细胞贫血病血红蛋白分子病血红蛋白分子病第14页,讲稿共71张,创作于星期三地中海贫血地中海贫血产生原因:产生原因:n缺失一个或多个编码血红蛋白链的基因;缺失一个或多个编码血红蛋白链的基因;n一个或多个基因无义突变缩短的蛋白链;发生移码突变不能合一个或多个基因无义突变缩短的蛋白链;发生移码突变不能合成正确的多肽链;成正确的多肽链;n编码区外突变转录阻断或编码区外突变转录阻断或mRNA不能正确加工。不能正确加工。类型:类型:-地中海贫
13、血地中海贫血-地中海贫血地中海贫血第15页,讲稿共71张,创作于星期三(二二)蛋白质空间结构与功能的关系蛋白质空间结构与功能的关系 蛋白质多种多样的蛋白质多种多样的功能功能与各种蛋白质特定的与各种蛋白质特定的空间构象空间构象密切相密切相关,蛋白质的关,蛋白质的空间构象是其功能活性的基础空间构象是其功能活性的基础,构象发生变化,其功,构象发生变化,其功能活性也随之改变。蛋白质变性时,由于其空间构象被破坏,故引能活性也随之改变。蛋白质变性时,由于其空间构象被破坏,故引起功能活性丧失,变性蛋白质在复性后,构象复原,活性即能恢复。起功能活性丧失,变性蛋白质在复性后,构象复原,活性即能恢复。在生物体内,
14、当某种物质特异地与蛋白质分子的某个部位结合,触在生物体内,当某种物质特异地与蛋白质分子的某个部位结合,触发该蛋白质的构象发生一定变化,从而导致其功能活性的变化,这种发该蛋白质的构象发生一定变化,从而导致其功能活性的变化,这种现象称为蛋白质的现象称为蛋白质的别构效应别构效应(allostery)allostery)。蛋白质蛋白质(或酶或酶)的别构效的别构效应,在生物体内普遍存在,这对物质代谢的调节和某些生理功能应,在生物体内普遍存在,这对物质代谢的调节和某些生理功能的变化都是十分重要的。的变化都是十分重要的。第16页,讲稿共71张,创作于星期三1、肌红蛋白、肌红蛋白MyoglobinMyoglo
15、bin(Mb)结构与功能结构与功能肌红蛋白:主要肌红蛋白:主要肌细胞肌细胞贮存和分配贮存和分配氧氧的蛋白质。肌红蛋白是由一的蛋白质。肌红蛋白是由一条多肽条多肽链链和和一个辅基血红素(原卟啉一个辅基血红素(原卟啉IX和和Fe的络合物)的络合物)组成,除去血红素组成,除去血红素的脱辅基肌红蛋白称珠蛋白的脱辅基肌红蛋白称珠蛋白(globin),),它和血红蛋白的亚它和血红蛋白的亚基在氨基酸序列上有明显的同源性,基在氨基酸序列上有明显的同源性,构象和功能也相似,由构象和功能也相似,由8个个-螺旋组螺旋组成。成。第17页,讲稿共71张,创作于星期三氧气与肌红蛋白的结合氧气与肌红蛋白的结合第18页,讲稿共
16、71张,创作于星期三nO2与与CO竞争结合血红蛋白和肌红蛋白;竞争结合血红蛋白和肌红蛋白;n空气中空气中CO的含量达到的含量达到0.06-0.08%即有中毒即有中毒的危险,达到的危险,达到0.1%时则能窒息死亡;时则能窒息死亡;nO2的结合改变肌红蛋白的构象,但对肌红的结合改变肌红蛋白的构象,但对肌红蛋白的功能影响不大。蛋白的功能影响不大。构型(构型(configurationconfiguration):):分分L L、D D型,改变时有共价键的断型,改变时有共价键的断裂。裂。构象(构象(conformationconformation):):改变无须有共价键的断裂,只是改变无须有共价键的断
17、裂,只是次级键断裂。次级键断裂。第19页,讲稿共71张,创作于星期三2、血红蛋白、血红蛋白(hemoglobin,Hb)结构结构与功能与功能 4 4个亚基个亚基组成,两组成,两两相同,每个亚基两相同,每个亚基都有一个血红素基都有一个血红素基和一个氧结合部位。和一个氧结合部位。Hb Hb分子分子近似球形近似球形,4 4个亚基占据相当于个亚基占据相当于四面体的四个顶角。四面体的四个顶角。第20页,讲稿共71张,创作于星期三辅基血红素(辅基血红素(heme)n氧与蛋白不能直接结合;氧与蛋白不能直接结合;n借助过渡金属的低氧态(借助过渡金属的低氧态(Fe2)和有机分子原卟啉)和有机分子原卟啉IX;n卟
18、啉化合物着色力强,血红蛋白的铁卟啉使血液呈红色;卟啉化合物着色力强,血红蛋白的铁卟啉使血液呈红色;n原卟啉原卟啉IX和和Fe的络合物成为血红素(的络合物成为血红素(heme)。)。第21页,讲稿共71张,创作于星期三O2 血血红红素素与与氧氧结结合合后后,铁铁原原子子半半径径变变小小,就就能能进进入入卟卟啉啉环环的的小小孔孔中中,继继而而引引起起肽肽链链位位置的变动。置的变动。卟啉平面卟啉平面卟啉平面卟啉平面FeFe第22页,讲稿共71张,创作于星期三nHbHb与与MbMb一一样样能能可可逆逆地地与与O O2 2结结合合,HbHb与与O O2 2结结合合后后称称为为氧氧合合HbHb。氧氧合合H
19、bHb占总占总HbHb的百分数(称的百分数(称百分饱和度百分饱和度)随)随O O2 2浓度变化而改变。浓度变化而改变。n血血红红蛋蛋白白存存在在两两种种主主要要构构象象态态:T T态态(tense tense statestate)和和R R态态(relaxed relaxed statestate),T T态态和和R R态态之之间间能能互互换换,而而且且均均能能结结合合氧氧,但但R R态的结合能力要强。态的结合能力要强。n作作为为T T态态的的去去氧氧血血红红蛋蛋白白有有专专一一性性的的氢氢键键和和盐盐桥桥起起着着稳稳定定作作用用,4 4个个亚基的亚基的C C末端处于受束缚的状态。末端处于受
20、束缚的状态。n血红蛋白除运输氧外,还运输血红蛋白除运输氧外,还运输H和和CO2。血红蛋白的构象变化与结合氧血红蛋白的构象变化与结合氧第23页,讲稿共71张,创作于星期三肌红蛋白与血红蛋白结构和功能的比较肌红蛋白与血红蛋白结构和功能的比较结构 共同点 差异:肌红蛋白只有三级结构,具有一条多肽链,血红蛋白具有四 级结构,含有四个亚基功能共同点:均可与氧可逆结合差异:肌红蛋白只能贮备氧,而血红蛋白可以运输氧,此外也可运输H+和CO2球状蛋白质球状蛋白质肌红蛋白的一级结构与血红蛋白的肌红蛋白的一级结构与血红蛋白的 亚基或亚基或 亚基极为相似亚基极为相似第24页,讲稿共71张,创作于星期三肌红蛋白肌红蛋
21、白(Mb)和血红蛋白和血红蛋白(Hb)的氧解离曲线的氧解离曲线肌红蛋白肌红蛋白肌红蛋白肌红蛋白血红蛋白血红蛋白血红蛋白血红蛋白 血红蛋白氧合曲血红蛋白氧合曲线为线为 S 形形 肌红蛋白氧合肌红蛋白氧合曲线为曲线为双曲线形双曲线形第25页,讲稿共71张,创作于星期三Hb THb T态和态和R R态互变态互变HbHb氧合与脱氧构象转换示意氧合与脱氧构象转换示意第26页,讲稿共71张,创作于星期三Hb与与O2的结合或解离曲线呈的结合或解离曲线呈S型与型与Hb的的变构效应有关。变构效应有关。nHb与与O2结合盐键断裂,结合盐键断裂,R型型nHb与与O2解离盐键形成,解离盐键形成,T型型nT型对型对O2
22、亲和力小。亲和力小。nR型对型对O2亲和力大。亲和力大。第27页,讲稿共71张,创作于星期三协同效应协同效应(cooperativity)(cooperativity)u一个一个寡聚体蛋白质寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应协同效应。如果是促进作用则称为如果是促进作用则称为正协同效应正协同效应(positive cooperativity)(positive cooperativity)如果是抑制作用则称为如果是抑制作用则称为负协同效应负协同效应(neg
23、ative cooperativity)(negative cooperativity)u血红蛋白的氧合具有血红蛋白的氧合具有正协同性同促效应正协同性同促效应,也即一个,也即一个O2的结合增加同的结合增加同一一Hb分子中其余空的氧结合部位对分子中其余空的氧结合部位对O2的亲和力。的亲和力。第28页,讲稿共71张,创作于星期三变构效应变构效应(allosteric effect)蛋蛋白白质质空空间间结结构构的的改改变变伴伴随随其其功功能能的的变变化化,称称为为变变构构效应效应。HbHb与与O O2 2结结合合后后,HbHb的的构构象象发发生生变变化化,这这类类变变化化称称为为变变构构效效应应,即
24、即通通过过构构象象变变化化影影响响蛋蛋白白质质的的功功能能,HbHb称称为为变变构蛋白构蛋白(allosteric proteinallosteric protein)。)。第29页,讲稿共71张,创作于星期三(R)relaxed state(T)tense state 血液中血液中O2的的运输运输 (Hb R/T(Hb R/T态的互换态的互换)Lung氧氧分分子子HemoglobinMyoglobinMuscle静脉静脉动脉动脉环境氧浓度高时环境氧浓度高时Hb 快速吸收氧分子快速吸收氧分子环境氧浓度低时环境氧浓度低时Hb 迅速释放氧气迅速释放氧气任何一个亚基接受任何一个亚基接受O O2 2后
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