重组dna技术与基因工程.ppt
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1、关于重组关于重组关于重组关于重组DNADNA技术与基技术与基技术与基技术与基因工程因工程因工程因工程现在学习的是第1页,共56页A 酵母作为表达外源基因受体的特征6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达 酵 母(酵 母(YeastYeast)是 一 群 以是 一 群 以芽 殖芽 殖或或裂 殖裂 殖方 式 进 行方 式 进 行无 性 繁 殖无 性 繁 殖的 单 细 胞的 单 细 胞半知菌类半知菌类(半知酵母半知酵母),共由),共由5656个属、个属、500500多个种组成。如果说大肠多个种组成。如果说大肠杆菌是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真杆菌是外源基因最成熟
2、的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真核生物表达系统。核生物表达系统。酵母的分类学特征酵母的分类学特征真核生物真核生物,分属于,分属于子囊菌纲子囊菌纲(子囊酵母)、(子囊酵母)、担子菌纲担子菌纲(担子酵母(担子酵母)、)、现在学习的是第2页,共56页A 酵母作为表达外源基因受体的特征6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达酵母表达外源基因的优势酵母表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便能将外源基因表达产物分泌至培养基中能将外源基因表达产物分泌至培养基中具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统具
3、有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDAFDA认定为安全的认定为安全的基因工程受体系统(基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRASGenerally Recognized As Safe GRAS)酵母菌是最简单的真核模式生物酵母菌是最简单的真核模式生物现在学习的是第3页,共56页B 酵母的宿主系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达提高重组蛋白表达产率的突变宿主
4、提高重组蛋白表达产率的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主现在学习的是第4页,共56页广泛用于外源基因表达的酵母宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母包括:目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母包括:酵母属酵母属 如如酿酒酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiae)克鲁维酵母属克鲁维酵母属 如乳酸克鲁维酵母(如乳酸克鲁维酵母(Kluyver
5、omyces lactisKluyveromyces lactis)毕赤酵母属毕赤酵母属 如如巴斯德毕赤酵母巴斯德毕赤酵母(Pichia pastorisPichia pastoris)裂殖酵母属裂殖酵母属 如非洲酒裂殖酵母(如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombeSchizosaccharomyces pombe)汉逊酵母属汉逊酵母属 如多态汉逊酵母(如多态汉逊酵母(Hansenula polymorphaHansenula polymorpha)其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕
6、赤酵母表达外源基因最理想。表达外源基因最理想。现在学习的是第5页,共56页提高重组蛋白表达产率的突变宿主提高重组蛋白表达产率的突变宿主能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型:能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型:sscssc1 1sscssc2 2rgrrgr1 1oseose1 1sscssc1111 rhorho-突变类型突变类型生物效应生物效应作用位点作用位点改善重组蛋白分泌改善重组蛋白分泌钙离子依赖型的钙离子依赖型的ATPATP酶酶提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达转录后加工转录后加工转录水平转录水平提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达转录水平转录水平提高重组蛋
7、白表达提高重组蛋白表达改善重组蛋白分泌改善重组蛋白分泌羧肽酶羧肽酶YY转录水平转录水平提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达现在学习的是第6页,共56页抑制超糖基化作用的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主能抑制超糖基化的突变类型能抑制超糖基化的突变类型mnnmnnalgalgochoch突变类型突变类型生物效应生物效应 许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由糖基核心糖基核心和和外侧糖链外侧糖链两部分两部分组成。组成。酵母菌普遍拥有蛋白酵母菌普遍拥有
8、蛋白质的糖基化系统,但野生质的糖基化系统,但野生型酿酒酵母对异源蛋白的型酿酒酵母对异源蛋白的糖基化反应很难控制,呈糖基化反应很难控制,呈超糖基化倾向,因此超糖超糖基化倾向,因此超糖基化缺陷株非常重要。基化缺陷株非常重要。甘露糖生物合成缺陷型甘露糖生物合成缺陷型天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型外侧糖链添加缺陷型外侧糖链添加缺陷型现在学习的是第7页,共56页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主泛素介导的蛋白质降解作用泛素介导的蛋白质降解作用蛋白酶体蛋白酶体LysLysHOOCUbiquitin 76 aaUbiquitin 76 aa ubi
9、quitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLysubiquitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLys靶蛋白靶蛋白靶蛋白现在学习的是第8页,共56页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌共有四个泛素编码基因:酵母菌共有四个泛素编码基因:UBI UBI 1 1 编码泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 2 2 编码
10、泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 3 3 编码泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白7676(CEP76CEP76)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 4 4 编码泛素五聚体编码泛素五聚体 对数生长期关闭对数生长期关闭 稳定期表达稳定期表达酵母菌共有七个泛素连接酶基因:酵母菌共有七个泛素连接酶基因:UBC UBC 11、UBC UBC 22、UBC UBC 33、UBC UBC 44、UBC UBC 55、UBC UBC 66、UBC UBC 77现在学习的是第9
11、页,共56页减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主泛素降解途径衰减的酿酒酵母泛素降解途径衰减的酿酒酵母在酿酒酵母菌中,泛素主要由在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI UBI 4 4基因表达,基因表达,UBI UBI 4 4-突变株能突变株能UBI UBI 4 4缺陷型:缺陷型:正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,因此因此UBI UBI 4 4缺陷突变株是外源基因表达理想的受体。缺陷突变株是外源基因表达理想的受体。UBA UBA 1 1缺陷型:缺陷型:UBAUBA1 1编码泛素激活酶编码泛素激活
12、酶E1E1,UBAUBA1 1突变株是致死性的,但其等位突变株是致死性的,但其等位基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解。基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解。Ubc4 Ubc4-ubc5 ubc5 双突变型:双突变型:七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效。七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效。现在学习的是第10页,共56页C 酵母的载体系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建酵母中的野生型质粒酵母中的野生型质粒现在学习的是第11页,共56页酵母中的野生型质粒酵母中的野生型质粒
13、酿酒酵母中的酿酒酵母中的2 2m m环状质粒环状质粒几乎所有的酿酒酵母中都含有几乎所有的酿酒酵母中都含有22mm双链双链同源重组同源重组REP1REP1RAFRAFSTBSTBorioriREP2REP2FLPFLPIRIRIRIRAABB环状质粒,拷贝数达环状质粒,拷贝数达5050至至100100个。个。IRs IRs 反向重复序列,反向重复序列,600 600 bpbp,重组重组FLPFLP 编码产物驱动编码产物驱动IRsIRs的同源重组的同源重组REPREP 编码产物控制质粒的稳定性编码产物控制质粒的稳定性STBSTB REPREP的结合位点的结合位点接合酵母属中的接合酵母属中的pSR1
14、pSR1和和pSB1pSB1,以及以及克鲁维酵母属中的克鲁维酵母属中的pKD1pKD1等均与等均与22mm质质粒类似。粒类似。现在学习的是第12页,共56页酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有含有ARSARS的的YRpYRp质粒的构建质粒的构建 ARSARS为酵母菌中的自主复制序列,为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.50.8-1.5kbkb,染色体上每染色体上每30-4030-40kbkb就 有 一 个就 有 一 个ARSARS元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒记基因、提供克隆位
15、点的大肠杆菌质粒DNADNA。以以ARSARS为复制子的质粒称为为复制子的质粒称为YRpYRp 上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达200200个,但培养几代个,但培养几代 以以2 2m m质粒上的复制元件为复制子的质粒称为质粒上的复制元件为复制子的质粒称为YEpYEp后,质粒的丢失率高达后,质粒的丢失率高达50%-70%50%-70%,主要是由于分配不均匀所致。,主要是由于分配不均匀所致。现在学习的是第13页,共56页酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有含有CENCEN的的YCpYCp质粒的构建质粒的构建 CENCEN为酵母菌染色体为酵
16、母菌染色体DNADNA上与染色体均匀分配有关的序列上与染色体均匀分配有关的序列 将将CEN CEN DNADNA插入含插入含ARSARS的质粒中,获得的新载体称为的质粒中,获得的新载体称为YCpYCp YCp YCp质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有1-51-5个个含有含有TELTEL的的YACYAC质粒的构建质粒的构建现在学习的是第14页,共56页酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有酵母菌染色体含有酵母菌染色体DNADNA同源序列的同源序列的YIpYIp质粒的构建质粒的构建 在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体在大肠杆菌质粒上组装酵母
17、菌染色体DNADNA特定序列和标记基因,构特定序列和标记基因,构建出来的质粒称为建出来的质粒称为YipYip。目的基因表达盒通常插在染色体目的基因表达盒通常插在染色体DNADNA特定序列特定序列中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体DNADNA区域。区域。现在学习的是第15页,共56页D 酵母的转化系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达转化质粒在酵母细胞中的命运转化质粒在酵母细胞中的命运酵母菌的转化程序酵母菌的转化程序用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因现在学习的是第16页,共56页酵母的转化程序酵母的转化
18、程序酵母原生质体转化法酵母原生质体转化法 早 期 酵 母 菌 的 转 化 都 采 用 在 等 渗 缓 冲 液 中 稳 定 的 原 生 质 体 转 化 法早 期 酵 母 菌 的 转 化 都 采 用 在 等 渗 缓 冲 液 中 稳 定 的 原 生 质 体 转 化 法在在C aC a2+2+和和PEGPEG的存在下,转化细胞可达原生质体总数的的存在下,转化细胞可达原生质体总数的1-2%1-2%。但 该 程。但 该 程序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约。序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约。原 生 质 体 转 化 法 的 一 个 显 著 特 点 是,一 个 受 体 细
19、 胞 可 同 时 接 纳 多原 生 质 体 转 化 法 的 一 个 显 著 特 点 是,一 个 受 体 细 胞 可 同 时 接 纳 多个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的25-33%25-33%。现在学习的是第17页,共56页酵母的转化程序酵母的转化程序碱金属离子介导的酵母完整细胞的转化碱金属离子介导的酵母完整细胞的转化 酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如LiLi+等)、等)、PEGPEG、热 休 克 处热 休 克 处理后,也可高效吸收质粒理后,也可高效吸收质粒DNADNA,而且具有下列特性:而且
20、具有下列特性:吸收线型吸收线型DNADNA的能力明显大于环状的能力明显大于环状DNADNA,两者相差两者相差8080倍倍共转化现象极为罕见共转化现象极为罕见现在学习的是第18页,共56页酵母的转化程序酵母的转化程序酵母电击转化法酵母电击转化法 酵母菌原生质体和完整细胞均可在电击条件下吸收质粒酵母菌原生质体和完整细胞均可在电击条件下吸收质粒DNADNA,但但在此过程中应避免使用在此过程中应避免使用PEGPEG,它对受电击的细胞具有较很大的负作用它对受电击的细胞具有较很大的负作用电击转化的优点是不依赖于受体细胞的遗传特征及培养条件适用范围电击转化的优点是不依赖于受体细胞的遗传特征及培养条件适用范围
21、广,而且转化率可高达广,而且转化率可高达10105 5/m mg DNAg DNA。现在学习的是第19页,共56页转化质粒在酵母细胞中的命运转化质粒在酵母细胞中的命运单双链单双链DNADNA均可转化酵母菌,但单链的转化率是双链的均可转化酵母菌,但单链的转化率是双链的10-3010-30倍;倍;含有复制子的单链质粒进入细胞后,能准确地转化为双链并复制;含有复制子的单链质粒进入细胞后,能准确地转化为双链并复制;不含复制子的单链质粒进入细胞后,能高效地同源整合入染色体不含复制子的单链质粒进入细胞后,能高效地同源整合入染色体这对于体内定点突变酵母基因组极为有利;这对于体内定点突变酵母基因组极为有利;克
22、隆在克隆在YIpYIp整合型质粒上的外源基因,如果含有受体细胞的染色体整合型质粒上的外源基因,如果含有受体细胞的染色体DNADNA的同源序列,会发生高频同源整合,整合子占转化子总数的的同源序列,会发生高频同源整合,整合子占转化子总数的50-80%50-80%。现在学习的是第20页,共56页用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因 用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要有有营养缺陷型营养缺陷型互补基因和互补基因和显性基因显性基因两大类:两大类:营养缺陷型互补基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如:营养缺陷型互补基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如:LE
23、ULEU、TRPTRP、HISHIS、LYSLYS、URAURA、ADEADE 但对于多倍体酵母来说,筛选营养缺陷型的受体非常困难。但对于多倍体酵母来说,筛选营养缺陷型的受体非常困难。营养缺陷型的互补基因营养缺陷型的互补基因现在学习的是第21页,共56页用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因 显性标记基因显性标记基因 显性标记基因的编码产物大都是毒性物质的抗性蛋白显性标记基因的编码产物大都是毒性物质的抗性蛋白 aph aph 氨基糖苷转移酶氨基糖苷转移酶 抗抗G418G418 cat cat 氯霉素乙酰转移酶氯霉素乙酰转移酶 抗氯霉素抗氯霉素 dhfr dhfr 二氢叶酸还原酶二氢叶
24、酸还原酶 抗氨甲喋呤和磺胺抗氨甲喋呤和磺胺 cup1 cup1 铜离子螯合物铜离子螯合物 耐受铜离子耐受铜离子 suc2 suc2 蔗糖转化酶蔗糖转化酶 耐受高浓度蔗糖耐受高浓度蔗糖 ilv2 ilv2 乙酰乳糖合成酶乙酰乳糖合成酶 抗硫酰脲除草剂抗硫酰脲除草剂标记基因标记基因编码产物编码产物遗传表型遗传表型现在学习的是第22页,共56页E 酵母的表达系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母菌中表达的限制因素外源基因在酵母菌中表达的限制因素酵母菌启动子的可控性酵母菌启动子的可控性酵母菌表达系统的选择酵母菌表达系统的选择现在学习的是第23页,共56页酵母启动子的可控
25、性酵母启动子的可控性 温度控制型启动子温度控制型启动子a a-a a a a 型启动子:型启动子:酿酒酵母有酿酒酵母有aa和和a aa a两种单倍体,两种单倍体,分别由分别由M A TM A Taa和和M A TM A Ta aa aa a 型启动子型启动子hmlhmla aa a2-102 2-102 MATaMATaa1a1Sir3-8Sir3-8TSTS 型启动子型启动子 受体细胞基因组受体细胞基因组 重组质粒重组质粒a a 型启动子型启动子hmlhmla aa a2-102 2-102 MATaMATaa1a1Sir3-8Sir3-8TSTS 型启动子型启动子a aa a22a aa
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