原核基因的表达调控.ppt
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1、原核基因的表达调控 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望(二)色氨酸操纵子(trp operon)内容提要:内容提要:色氨酸操纵子的结构色氨酸操纵子的结构色氨酸操纵子的色氨酸操纵子的阻遏系统色氨酸操纵子的弱化机制1.色氨酸操纵子结构色氨酸操纵子结构(1)结构基因)结构基因E E D D 编码编码5 5种酶,在催化分支酸转变为种酶,在催化分支酸转变为 C C B L-B L-色氨酸的过程中发挥作用色氨酸的过程中发挥作用 A A L L 转录产物是先导转录产
2、物是先导mRNA mRNA (2 2)调控元件)调控元件 启动子(启动子(P P)操纵基因(操纵基因(O O)调控基因调控基因 结构基因结构基因 催化分枝酸转变为色氨酸催化分枝酸转变为色氨酸 的酶的酶trpRtrp trpR和trpABCDE不连锁;操纵基因在启动子内 有衰减子(attenuator)/弱化子trpa 启动子和结构基因不直接相连,二者被 前导序列(Leader)trpL所隔开 (3)结构特点色氨酸操纵子表达的调控色氨酸操纵子表达的调控1.阻遏系统阻遏系统 粗开关粗开关 主管转录是否启动主管转录是否启动2.弱化作用(弱化作用(attenuation)3.4.细调开关细调开关5.主
3、管已经启动的转录是否继续下去。主管已经启动的转录是否继续下去。2.阻遏物对色氨酸操纵子的负调控阻遏物对色氨酸操纵子的负调控(1)阻遏物阻遏物(辅阻遏蛋白)辅阻遏蛋白):同二聚体蛋白质同二聚体蛋白质(2)阻遏物本身不能与操纵基因阻遏物本身不能与操纵基因O结合,必须和结合,必须和色氨酸结合才能与色氨酸结合才能与O结合,而阻遏结构基因的结合,而阻遏结构基因的表达表达(3)色氨酸是一种共阻遏物色氨酸是一种共阻遏物trp 操纵子的阻遏系统低低TrpTrp时:时:阻遏物不结合阻遏物不结合操纵基因操纵基因;高高TrpTrp时:时:阻遏物阻遏物+Trp +Trp 结合操纵基因结合操纵基因3、衰减作用对色氨酸操
4、纵子的调控衰减作用对色氨酸操纵子的调控u 高浓度色氨酸使trp操纵子的表达水平降低600倍,而阻遏作用仅使转录降低70倍?u 阻遏物失活突变不能完全消除色氨酸对trp操纵子表达的影响?(1 1)前导序列:)前导序列:在trp mRNA5端trpE基因的起始密码前一个长162bp的mRNA片段。该序列中含有4个能以两种不同的方式进行碱基配对的片段,分别以1、2、3、4表示。前导肽:前导肽:前导序列中,发现有起始密码子前导序列中,发现有起始密码子AUGAUG和终止密码子和终止密码子UGAUGA。如果翻译起始于如果翻译起始于AUGAUG,应该产生一个含有应该产生一个含有1414个氨基酸的多肽。个氨基
5、酸的多肽。特点:前导肽中在其第特点:前导肽中在其第1010和和1111位上位上有相邻的两个色氨酸密码子。有相邻的两个色氨酸密码子。前导序列的特点:某些区段富含GC,GC之间容易形成茎环二级结构,接着有8个U构成一个不依赖于因子的终止信号;由(1)和(2)区序列构成第二个发夹结构,其中(1)区处于14个氨基酸的前导肽序列中;(2)和(3)区互补,可以形成发夹结构,与(3)和(4)形成发夹结构竞争;14个氨基酸前导肽中有5个核糖体强结合位点,之后还有一个UGA;前导序列中并列2个色氨酸密码(2 2)衰减子)衰减子衰减子衰减子(attenuator):原核生物操纵子中能显:原核生物操纵子中能显著减弱
6、甚至过早终止转录作用的一段核苷酸序著减弱甚至过早终止转录作用的一段核苷酸序列(列(123-150123-150区)。区)。衰减子区衰减子区mRNAmRNA通过自我配对可以形成通过自我配对可以形成茎茎-环环结结构,有典型的构,有典型的终止子终止子特点。特点。在trp mRNA 5端trpE基因的起始密码前有一个长162bp的mRNA片段被称为前导区,研究发现,当trp mRNA合成起始以后,除非培养基中完全没有色氨酸,转录总是在前导区123-150区域终止,产生一个仅有140个核苷酸的RNA分子,终止trp基因转录。研究引起终止的研究引起终止的mRNAmRNA碱基序列碱基序列,发现该区发现该区m
7、RNAmRNA通过自通过自我配对可以形成我配对可以形成茎茎-环环结构,有典型的结构,有典型的终止子终止子特点。特点。123150(3 3)衰减作用的调控机制)衰减作用的调控机制-其实质是以翻译手段来控制基因的转录在原核生物中转录和翻译是同时进行的,一旦RNA聚合酶刚转录出trp mRNA中的前导肽编码区,核糖体便立即结合上去翻译这一序列。当培养基中色氨酸不足时,Trp-tRNATrp数目有限,核糖体在两个色氨酸密码子处(1区)停顿。这时核糖体只占据l区,前面由RNA聚合酶转录所产生的2区和3区便可配对,而4区以单链形式存在,不能形成发夹状终止结构。RNA聚合酶可以越过弱化子转录至结构基因区,得
8、到完整的mRNA分子。当培养基中色氨酸浓度较高时,Trp-tRNATrp充足,核糖体能顺利翻译出整个前导肽至终止密码子UGA处停止。此时,核糖体占据了 l区和2区(UGA位于1区和2区之间),其结果是3区和4区配对,形成转录终止子结构,于是转录在弱化子处终止。弱化作用的特点是外部事件控制内部终止所需要的发夹结构的形成。另外很重要的一个方面是转录和翻译过程是前后相连(closely coupled)的。弱化子的弱化作用与阻抑作用无关,缺失弱化子后,基础水平转录和去阻抑转录都增强。为什么要有弱化系统?为什么要有弱化系统?细菌通过弱化作用弥补阻遏作用的不足,因为阻遏作用只能使细菌通过弱化作用弥补阻遏
9、作用的不足,因为阻遏作用只能使转录不转录不起始起始,对于已经起始的转录,只能通过弱化作用使之中途停下来。,对于已经起始的转录,只能通过弱化作用使之中途停下来。为为什么要有弱化系统?什么要有弱化系统?是在有大量外源色氨酸存在时,阻止非必需的先导是在有大量外源色氨酸存在时,阻止非必需的先导mRNAmRNA的合成,它的合成,它使这个系统更加经济。使这个系统更加经济。阻遏作用的信号是阻遏作用的信号是细胞内色氨酸的多少细胞内色氨酸的多少;弱化作用的信号则是;弱化作用的信号则是细胞内细胞内载有色氨酸的载有色氨酸的tRNAtRNA的多少的多少。它通过前导肽的翻译来控制转录的进行,在。它通过前导肽的翻译来控制
10、转录的进行,在细菌细胞内这两种作用相辅相成,体现着生物体内周密的调控作用。细菌细胞内这两种作用相辅相成,体现着生物体内周密的调控作用。(四)阿拉伯糖操纵子 (arabinose operon)araB基因、araA基因和araD,形成一个基因簇,简写为araBAD 磷磷酸酸戊戊糖糖途途径径第一阶段第一阶段第第二二阶阶段段5-磷酸木酮糖磷酸木酮糖C55-磷酸木酮糖磷酸木酮糖C57-磷酸景天糖磷酸景天糖C73-磷酸甘油醛磷酸甘油醛C34-磷酸赤藓糖磷酸赤藓糖C46-磷酸果糖磷酸果糖C66-磷酸果糖磷酸果糖C63-磷酸甘油醛磷酸甘油醛C36-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖(C6)36-磷酸葡萄糖酸内酯磷酸葡萄
11、糖酸内酯(C6)36-磷酸葡萄糖酸磷酸葡萄糖酸(C6)35-磷酸核酮糖磷酸核酮糖(C5)35-磷酸核糖磷酸核糖C53NADP+3NADP+3H+6-磷酸葡萄糖脱氢酶磷酸葡萄糖脱氢酶3NADP+3NADP+3H+6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶磷酸葡萄糖酸脱氢酶CO2ara操纵子的调控有两个特点:第一,araC表达受到AraC的自身调控。第二,AraC既是ara操纵子的正调节蛋白(需cAMP-CRP的共同参与,起始转录),又是其负调节蛋白。这种双重功能是通过AraC蛋白的两种异构体来实现的(Pi和Pr)。体系中葡萄糖水平较高,阿拉伯糖水平较低时:体系中葡萄糖水平较高,阿拉伯糖水平较低时:体系中有阿拉伯糖但
12、无葡萄糖存在时:体系中有阿拉伯糖但无葡萄糖存在时:转录调控是基因表达最经济的调控方式,但仍需要在翻译或翻译后水平进行微调,包括:阻断其翻译及时去除已合成的mRNA使已合成的蛋白质失活二、二、转录后水平上的调控转录后水平上的调控 RBS(核糖体结合位点):mRNA链上起始密码子AUG上游的一段非翻译区。RBS的结合强度取决于SD序列的结构及其与起始密码子AUG之间的距离。SD-4-10(9)-AUG1、mRNA自身结构元件对翻译起始的调控Shine-Dalgarno sequence(SD序列序列)RBS,是指起始密码子AUG上游的一段能被核糖体识别和结合的非翻译区,其中含有SD序列。SD序列:
13、原核生物mRNA翻译起点上游与核糖体小亚基上16SrRNA互补的序列。mRNA 5端二级结构的细微改变即可影响30S亚基与mRNA的结合,造成蛋白质合成的差异。翻译一个顺反子需要二级结构的改变。mRNA上有多个核糖体存在时,第一个顺反子的翻译会破坏mRNA原有的二级结构,使核糖体能够与下一个顺反子的翻译起始区域结合。E.coli的RNA噬菌体MS2,R17,f2和Q都非常小(直径约为250),是最简单的病毒。基因组长36004200nt,只含4个基因:A、cp、Rep和Lys。CP(coat protein)编码外壳蛋白 多A(atachment)编码附着蛋白 少Rep(replicase)编
14、码复制酶 中lys(lysis)编码裂解蛋白mRNA的二级结构的二级结构-Q噬菌体噬菌体一个一个RNA噬菌体基因组进入宿主细胞噬菌体基因组进入宿主细胞后,核糖体仅附着到后,核糖体仅附着到cp基因开始的核糖体基因开始的核糖体结合位点上,而不附着到结合位点上,而不附着到A蛋白基因或蛋白基因或rep基因的开始处,因为它们的核糖体结合位基因的开始处,因为它们的核糖体结合位点被病毒点被病毒RNA的二级结构所保护。相比之的二级结构所保护。相比之下,下,CP蛋白的起始密码子蛋白的起始密码子AUG处被核糖处被核糖体所附着,因它曝露在二级结构的未端体所附着,因它曝露在二级结构的未端由于由于A和和rep两个位点被
15、封闭在二级结两个位点被封闭在二级结构中,首先打开的是构中,首先打开的是cp位点。位点。当核糖体阅读到当核糖体阅读到cp位点时,使形成位点时,使形成二级结构的氢链断裂。二级结构的氢链断裂。随着翻译的进行,随着翻译的进行,将其下游的将其下游的rep位点也冲开了。这样位点也冲开了。这样rep基因总是依赖于位于前面的基因总是依赖于位于前面的cp位点和核位点和核糖体的结合。糖体的结合。虽然虽然rep的核糖体结合位点每次都被的核糖体结合位点每次都被cp基基因的翻译所打开,但是因的翻译所打开,但是RNA噬菌体的噬菌体的cp蛋白蛋白多肽链产生的量要比复制酶多得多,为什么多肽链产生的量要比复制酶多得多,为什么?
16、新产生的外壳蛋白的亚基可以特异地附新产生的外壳蛋白的亚基可以特异地附着到着到rep基因的核糖体结合位点,阻止了核基因的核糖体结合位点,阻止了核糖体的附着。这样外壳蛋白就成了复制酶基糖体的附着。这样外壳蛋白就成了复制酶基因翻译的特异阻遏物。因翻译的特异阻遏物。在感染在感染10分钟后,外壳蛋白足以阻断复制分钟后,外壳蛋白足以阻断复制酶的进一步合成。酶的进一步合成。A蛋白的翻译正是趁以负链为模板蛋白的翻译正是趁以负链为模板开始复制时,新合成的开始复制时,新合成的“”链在链在尚尚未形成二级结构之前未形成二级结构之前核糖体结合到其核糖体结合到其A位点上,进行翻译,产生位点上,进行翻译,产生A蛋白。蛋白。
17、2、mRNA自身稳定性对转录水平的影响 mRNA是否被核酸酶降解取决于它们的二级结构反向重复序列(inverted repeat,IR)能够促进茎环结构的形成,防止核酸外切酶的降解作用在E.coli的麦芽糖操纵子中的malE和malF基因之间存在2个IR顺序。由于在malE 3端有2个IR存在,可以形成茎环保护其不被外切酶所降解,从而使得malE的产物要比malF的产物的含量高20-40倍。若IR区缺失,那么malE产物的量就会减少到原来的1/9。RNA结合蛋白能够促进mRNA的降解静止期细菌以糖原形式储藏糖,静止期细菌以糖原形式储藏糖,快速生长周期则通过糖酵解途径快速生长周期则通过糖酵解途径
18、消耗糖,这两个过程的平衡由消耗糖,这两个过程的平衡由CsrABCsrAB调节系统调节系统完成。完成。CsrACsrA蛋白可激活糖酵解过程并抑蛋白可激活糖酵解过程并抑制葡萄糖和糖原的合成。在糖原制葡萄糖和糖原的合成。在糖原合成途径中,如果合成途径中,如果CsrACsrA蛋白结合蛋白结合到到glgglg基因的基因的mRNAmRNA分子上,该分子上,该mRNAmRNA分子就易于受核酸酶攻击,分子就易于受核酸酶攻击,加速降解,作为蛋白质合成模板加速降解,作为蛋白质合成模板的功能就受到抑制。的功能就受到抑制。CsrA蛋白调控蛋白调控glgmRNA的稳定性的稳定性3.3.调节蛋白的调控作用调节蛋白的调控作
19、用细菌中有些mRNA结合蛋白可激活靶基因的翻译,如BidA蛋白对转录调控蛋白fis mRNA翻译的激活。mRNA特异性抑制蛋白则通过与核糖体竞争性结合mRNA抑制翻译的起始,如核糖体蛋白。蛋白质合成的自体调控蛋白质合成的自体调控(autogenousregulation)操纵子的表达都受操操纵子的表达都受操纵子自身的一些基因产物纵子自身的一些基因产物的调控。的调控。当一个当一个蛋白质调控自蛋白质调控自身的产量时身的产量时,就发生了,就发生了自自体调控。体调控。核糖体蛋白质是每个核糖体蛋白质是每个操纵子的调控蛋白质。操纵子的调控蛋白质。核糖体蛋白对自身核糖体蛋白对自身mRNAmRNA翻译的抑制翻
20、译的抑制rRNArRNA基因正常转录和翻基因正常转录和翻译,产生核糖体蛋白。译,产生核糖体蛋白。由于这些蛋白与由于这些蛋白与rRNArRNA亲亲和力较强,只要细胞中和力较强,只要细胞中有足够的有足够的rRNArRNA,核糖体,核糖体蛋白就不会结合到自身蛋白就不会结合到自身mRNAmRNA上。上。当细胞中缺乏足够当细胞中缺乏足够rRNArRNA时,核糖体蛋白只能结时,核糖体蛋白只能结合到自身合到自身mRNAmRNA上,导致上,导致该该mRNAmRNA的的RBSRBS位点被封闭,位点被封闭,蛋白质合成停止。蛋白质合成停止。这种这种机制保证了机制保证了rRNArRNA和核糖和核糖体蛋白在数量上的平衡
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- 关 键 词:
- 基因 表达 调控
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