《动物数量遗传学》PPT课件.ppt

《《动物数量遗传学》PPT课件.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《《动物数量遗传学》PPT课件.ppt（20页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、第十一章第十一章 多性状选择原理和方法概述多性状选择原理和方法概述 重点提示：重点提示：本章重点论述了个体育种本章重点论述了个体育种值估计原理和方法，多性状选择的基值估计原理和方法，多性状选择的基本方法，综合选择指数的应用前提和本方法，综合选择指数的应用前提和局限以及相对效率比较。局限以及相对效率比较。第一节 个体育种值估计 估计育种值估计育种值 （estimated breeding valueestimated breeding value，EBVEBV）：利用统计分析方法，通过表型值和个体）：利用统计分析方法，通过表型值和个体间的亲缘关系来对育种值进行估计，由此得到间的亲缘关系来对育种值

2、进行估计，由此得到的估计值。的估计值。估计传递力估计传递力 （estimated transmitting estimated transmitting abilityability，ETAETA）：估计育种值的一）：估计育种值的一 半。半。相对育种值相对育种值 （relative breeding valuerelative breeding value，RBVRBV）：个体育种值相对与所在群体均值的百分）：个体育种值相对与所在群体均值的百分数数 。综合育种值综合育种值 （total breeding valuetotal breeding value）：考：考虑不同性状在育种上和经济上的重

3、要性差异，虑不同性状在育种上和经济上的重要性差异，一般将这些差异用性状的经济加权值表示。一般将这些差异用性状的经济加权值表示。单项资料估计个体育种值（1 1）个体本身信息估计个体育种值）个体本身信息估计个体育种值（2 2）系谱信息估计个体育种值）系谱信息估计个体育种值（3 3）同胞信息估计个体育种值）同胞信息估计个体育种值（4 4）后裔信息估计个体育种值）后裔信息估计个体育种值 （5 5）各种个体育种值估计方法的相对效率）各种个体育种值估计方法的相对效率单项资料估计个体育种值的方法一览表，单项资料（15种）估计个体育种值的方法1.个体本身资料(1)个体本身单次表型值P(2)个体本身k次表型值的

4、均值2.亲本资料(3)一个亲本单次表型值PP(4)一个亲本k次表型值的均值(5)双亲单次表型值的均值(6)双亲各自度量kS，kD次的均值 ，3.同胞资料（包括全同胞Fs和半同胞Hs）(7)一个同胞单次表型值PFS或PHS(8)一个同胞k次度量表型值的均值 或(9)n个同胞单次度量均值 或(10)n个同胞各有k次记录均值4.后裔资料（包括Fs子女和Hs子女资料）(11)混合家系(12)一个子女单次度量表型值PO(13)一个子女k次度量表型均值(14)n个子女单次度量均值 或(15)n个子女各有k次记录均值 或个体本身单次表型值个体本身单次表型值P来估计个体育种值来估计个体育种值个体本身个体本身k

5、次表型值的均值次表型值的均值 来估计个体育种来估计个体育种值值系谱信息估计个体育种值一个亲本单次表型值一个亲本单次表型值PP来估计个体育种值来估计个体育种值一个亲本一个亲本k次表型值的均值次表型值的均值 来估计个体育种来估计个体育种值值双亲单次表型值的均值双亲单次表型值的均值 来估计个体育种值来估计个体育种值双亲各自度量双亲各自度量kS、kD次的均值次的均值 、来估计来估计个体育种值个体育种值同胞信息估计个体育种值 一个同胞单次表型值一个同胞单次表型值PFS或或PHS来估计个体育来估计个体育种值种值一个同胞一个同胞k次度量表型值的均值次度量表型值的均值 或或 来估计来估计个体育种值个体育种值n

6、个同胞单次度量均值个同胞单次度量均值 或或 来估计个体育来估计个体育种值种值n个同胞各有个同胞各有k次记录均值、来估计个体育种次记录均值、来估计个体育种值值后裔信息估计个体育种值 一个子女单次度量表型值一个子女单次度量表型值PO来估计个体育种来估计个体育种值值一个子女一个子女k次度量均值来估计个体育种值次度量均值来估计个体育种值n个子女单次度量均值个子女单次度量均值 或或 来估计个体育来估计个体育种值种值n个子女各有个子女各有k次记录均值次记录均值 或或 来估计个体来估计个体育种值育种值各单项资料不同信息估计个体育种值的bAP和rAP 信息资料类型一个个体单次度量值一个个体k次度量均值N个同类

7、个体单次度量均值n个同类个体k次度量均值个体bAPh2rAPh亲本bAP0.5h2h2 1)2)rAP0.5h 1)2)同胞bAPrAh2rAPrAh后裔bAP0.5h2rAP0.5h多项资料合并估计个体育种值遵循的步骤 1)1)计算出各项资料的方差及相互间的协方差；计算出各项资料的方差及相互间的协方差；2)2)计算出各项资料间的相关系数；计算出各项资料间的相关系数；3)3)计算出以这些相关系数表示的各项资料对被计算出以这些相关系数表示的各项资料对被估计育种值的标准化偏回归系数；估计育种值的标准化偏回归系数；4)4)将这些标准化偏回归系数转化为偏回归系数，将这些标准化偏回归系数转化为偏回归系数

8、，即得到各项资料的加权系数；即得到各项资料的加权系数；5)5)计算合并指数与各项资料间的复相关系数，计算合并指数与各项资料间的复相关系数，并与其它育种值估计方法的复相关系数相比计并与其它育种值估计方法的复相关系数相比计算相对效率。算相对效率。随机交配群体中常用的亲属间亲缘相关系数 RASDSSSDDSDDFSHSFOHORHV个体I0.50.50.250.250.250.250.50.250.50.51父亲S00.50.5000.50.50.250.250.5母亲D000.50.50.500.250.250.5祖父SS0000.250.250.1250.1250.25祖母SD000.250.2

9、50.1250.1250.25外祖父DS00.2500.1250.1250.25外祖母DD0.2500.1250.1250.25全同胞FS0.250.250.250.5父系半同胞HS0.1250.1250.25全同胞子女FO0.250.5半同胞子女HO0.5第二节 多性状选择的基本方法1 1、顺序选择法（、顺序选择法（tandem selectiontandem selection）/单项选单项选择法（择法（single trait selectionsingle trait selection）：对计划选）：对计划选择的多个性状逐一选择和改进，每个性状选择择的多个性状逐一选择和改进，每个性状

10、选择一个或数个世代，待这个性状得到满意的选择一个或数个世代，待这个性状得到满意的选择效果后，就停止对这个性状的选择，再选择第效果后，就停止对这个性状的选择，再选择第二个性状，然后再选择第三个性状等等，顺序二个性状，然后再选择第三个性状等等，顺序递选。递选。2 2、独立淘汰法（、独立淘汰法（independent cullingindependent culling）/独立独立水平法：将所要选择的家畜生产性状各确定一水平法：将所要选择的家畜生产性状各确定一个选择界限，凡是要留种的家畜个体，必须同个选择界限，凡是要留种的家畜个体，必须同时超过各性状的选择标准。时超过各性状的选择标准。3 3、综合指

11、数法（、综合指数法（index selectionindex selection）：利用对）：利用对个体综合育种值的估计值进行选择。个体综合育种值的估计值进行选择。制定选择计划的步骤制定选择计划的步骤 性状各种表型参数和遗传参数的估计；性状经济加权值的确定；选择强度估计；选择指数制订和选择效果估计；计算个体指数值，确定选择决策。第三节第三节 综合选择指数的应用前提和局综合选择指数的应用前提和局 限以及相对效率比较限以及相对效率比较应用选择指数法需要满足的条件应用选择指数法需要满足的条件：1、用于用于计算指数算指数值的所有的所有观测值不存在系不存在系统环境效境效应，或者在使用前剔除了系，或者在使

12、用前剔除了系统环境效境效应进行校正；行校正；2、候候选个体个体间不存在固定不存在固定遗传差异，差异，换言之，言之，这些个体源于同一均数的群体；些个体源于同一均数的群体；3、所涉及到的各种群体参数，如所涉及到的各种群体参数，如误差方差差方差协方方差、育种差、育种值方差方差协方差等是已知的。方差等是已知的。制定选择指数时应注意的事项：制定选择指数时应注意的事项：（1）突出育种目标性状。）突出育种目标性状。（2）用于遗传评定的信息性状应该是容易度量的）用于遗传评定的信息性状应该是容易度量的性状。性状。（3）信息性状尽可能是家畜早期性状。）信息性状尽可能是家畜早期性状。（4）目标性状中尽量避免有高的负

13、遗传相关性状。）目标性状中尽量避免有高的负遗传相关性状。小小 结结在任何情况下，指数选择法的效率不低于独立淘在任何情况下，指数选择法的效率不低于独立淘汰法，独立淘汰法的效率不低于顺序选择法；汰法，独立淘汰法的效率不低于顺序选择法；指数选择法优于其他方法的相对效率随性状增加指数选择法优于其他方法的相对效率随性状增加而提高，但是随各性状的经济加权值差异增加而而提高，但是随各性状的经济加权值差异增加而下降，在经济加权值相同时，其优越性最大。下降，在经济加权值相同时，其优越性最大。独立淘汰法优于顺序选择法的相对效率随性状数独立淘汰法优于顺序选择法的相对效率随性状数和选择强度增加而提高，但是随经济加权值

14、差异和选择强度增加而提高，但是随经济加权值差异增加而下降；增加而下降；当各性状的经济加权值相同时，指数选择法优于当各性状的经济加权值相同时，指数选择法优于其他方法的相对效率还受其表型相关的影响较大，其他方法的相对效率还受其表型相关的影响较大，当当r rP P很低或为负值时，其相对效率较高。很低或为负值时，其相对效率较高。思思 考考 题题1.什么是育种值，估计育种值的基本原理什么是育种值，估计育种值的基本原理是什么？是什么？2.根据不同亲属资料估计育种值时的回归根据不同亲属资料估计育种值时的回归系数系数bAP的计算公式是什么？的计算公式是什么？3.解释顺序选择，独立淘汰和选择指数这解释顺序选择，独立淘汰和选择指数这三种选择方法的关系？三种选择方法的关系？4.深入理解以下选择指数的概念：深入理解以下选择指数的概念：约束选择指数；约束选择指数；最宜选择指数；最宜选择指数；通通用选择指数；用选择指数；保种选择指数。保种选择指数。