重组体克隆的筛选和鉴定.ppt
《重组体克隆的筛选和鉴定.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《重组体克隆的筛选和鉴定.ppt(70页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、一、抗药性标记及其插入失活选择法一、抗药性标记及其插入失活选择法pBR322质粒上有两个抗菌素抗性基因质粒上有两个抗菌素抗性基因:Tetr和和Ampr。Tetr上有插入位点上有插入位点BamH I;Ampr上有插入位点上有插入位点Pst I。第一节第一节 载体表型选择法载体表型选择法1.原理:原理:(1)四环素:)四环素:(2)氨苄青霉素抗性基因:)氨苄青霉素抗性基因:2.pBR322抗菌素标记选择抗菌素标记选择产生产生-内酰胺酶,使氨苄青霉素转变为青内酰胺酶,使氨苄青霉素转变为青霉酮酸,使碘霉酮酸,使碘-青霉素指示液(青霉素指示液(I2-KI-Aampicillin)(蓝灰色)褪色。)(蓝灰
2、色)褪色。抑制细菌生长,但不杀死细菌。抑制细菌生长,但不杀死细菌。杀死生长的细菌,但不杀死停止生长的细菌。杀死生长的细菌,但不杀死停止生长的细菌。(3)环丝氨酸:)环丝氨酸:转化处转化处理受体理受体菌菌Amp AmpTcBamH I在在Tc抗性基因上抗性基因上负选择负选择3.选择过程:选择过程:如果在如果在Tetr上插入外源上插入外源DNA,导致四,导致四环素抗性基因失活,可用环素抗性基因失活,可用四环素加环四环素加环丝氨酸丝氨酸培养液选择重组克隆。培养液选择重组克隆。Tetr失活的菌生长被四环素抑制,不被环失活的菌生长被四环素抑制,不被环丝氨酸杀死,保留下来;丝氨酸杀死,保留下来;Tetr不
3、失活的菌抗四环素,能分裂生长,不失活的菌抗四环素,能分裂生长,反而被环丝氨酸杀死。反而被环丝氨酸杀死。(1)四环素抗性插入失活)四环素抗性插入失活无环丝氨酸培养基无环丝氨酸培养基(2)氨苄青霉素抗性插入失活选择过程)氨苄青霉素抗性插入失活选择过程如果如果Ampr上插入外源上插入外源DNA,导致氨苄,导致氨苄青霉素抗性基因失活,可用碘青霉素抗性基因失活,可用碘-青霉素青霉素指示液选择。指示液选择。二、二、-半乳糖苷酶显色反应选择法半乳糖苷酶显色反应选择法-半乳糖苷酶半乳糖苷酶乳糖乳糖半乳糖半乳糖葡萄糖葡萄糖Xgal半乳糖半乳糖5-溴溴-4-氯靛蓝氯靛蓝+深蓝色深蓝色1.原理:原理:载体载体上有一
4、段上有一段 -半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(Lac ZLac Z)的)的)的)的 片段片段片段片段(氨基端),其上有外源(氨基端),其上有外源(氨基端),其上有外源(氨基端),其上有外源DNADNA的插入位点。的插入位点。的插入位点。的插入位点。受体菌基因组受体菌基因组受体菌基因组受体菌基因组中有突变的中有突变的中有突变的中有突变的 -半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(片片片片段缺失)。可以被段缺失)。可以被段缺失)。可以被段缺失)。可以被IPTGIPTG诱导表达。诱导表达。诱导表达。诱导表达。载体和受体菌基因组可以载体和受体菌基
5、因组可以载体和受体菌基因组可以载体和受体菌基因组可以互补互补互补互补形成完整有功能的形成完整有功能的形成完整有功能的形成完整有功能的 -半乳糖苷酶。半乳糖苷酶。半乳糖苷酶。半乳糖苷酶。2.选择过程选择过程-半乳糖苷酶使半乳糖苷酶使Xgal分解成兰色产物。分解成兰色产物。利用插入的外源基因的利用插入的外源基因的表达产物表达产物特性进行直特性进行直接选择。(只在特定条件下)。接选择。(只在特定条件下)。转化进来的外源基因产物能够弥补受转化进来的外源基因产物能够弥补受体菌株的突变型缺陷。体菌株的突变型缺陷。一、原理:一、原理:第二节第二节 根据插入基因的表型选择根据插入基因的表型选择1.弥补缺陷弥补
6、缺陷his-his+受体菌:受体菌:外源基因:外源基因:在不含组氨酸的在不含组氨酸的培养基中生长培养基中生长二氢叶酸还原酶(二氢叶酸还原酶(DHFR)对三甲氧苄二氨)对三甲氧苄二氨嘧啶有抗性。嘧啶有抗性。DHFR载体载体连接连接转化受转化受体菌体菌三甲氧苄二氨嘧三甲氧苄二氨嘧啶培养基平板啶培养基平板含含DHFR的克隆才能生长的克隆才能生长例:例:使被转化的受体菌表现出外源基因的表型。使被转化的受体菌表现出外源基因的表型。2.增加新性状增加新性状利用有插入片段的重组载体的分子量比利用有插入片段的重组载体的分子量比野生型载体分子量大。野生型载体分子量大。一、直接电泳检测法一、直接电泳检测法从转化后
7、的菌体克隆从转化后的菌体克隆中分离质粒,电泳、中分离质粒,电泳、比较其分子量。比较其分子量。第三节第三节 DNA电泳检测法电泳检测法 分子量分子量Marker载体载体重重组组克克隆隆二、酶切电泳筛选法二、酶切电泳筛选法1.原理:原理:根据已知的外源根据已知的外源DNA序列的限制性酶切序列的限制性酶切图谱,选择一两种内切酶切割质粒,电图谱,选择一两种内切酶切割质粒,电泳后比较电泳结果(泳后比较电泳结果(DNA带数和长度)。带数和长度)。或用合适的内切酶切下插入片断,再用或用合适的内切酶切下插入片断,再用其它酶切这个片断,电泳后比较结果是其它酶切这个片断,电泳后比较结果是否符合预计的结果。否符合预
8、计的结果。筛选过程筛选过程三、三、PCR扩增检测法扩增检测法1.原理原理PCR能在模板序列上扩增出预期能在模板序列上扩增出预期DNA片断。片断。2.过程过程(1)从重组克隆中提取质粒(或)从重组克隆中提取质粒(或DNA)。)。(2)用外源)用外源DNA插入片断引物作插入片断引物作PCR。(3)电泳)电泳PCR产物。产物。(4)检查是否有)检查是否有PCR产物。产物。(5)PCR产物的长度是否与外源基因一致。产物的长度是否与外源基因一致。1.核酸核酸杂交杂交第四节第四节 核酸杂交检测法核酸杂交检测法 一、原一、原理:理:重组克隆与探针杂交。重组克隆与探针杂交。3.识别标记识别标记32P 或或 1
9、25I。(1)放射性同位素)放射性同位素2.检测用的探针检测用的探针与外源与外源DNA插入片断互补的序列。插入片断互补的序列。(2)非放射性标记)非放射性标记荧光素荧光素二、核酸杂交检测方法二、核酸杂交检测方法P107用用DNA(或(或RNA)探针检测)探针检测DNA样品。样品。1.Southern blotting从宿主细胞中提取从宿主细胞中提取DNA(或质粒载(或质粒载体),再用探针杂交。体),再用探针杂交。只有带有插入片断的重组载体才能只有带有插入片断的重组载体才能与探针杂交,在底片上曝光显示。与探针杂交,在底片上曝光显示。Southern blot 筛选筛选结果结果(1)原位杂交筛选)
10、原位杂交筛选P109特点:特点:对应的菌斑或噬菌斑位置不变,对应的菌斑或噬菌斑位置不变,可以直接找出阳性菌落。可以直接找出阳性菌落。(2)R-环检测法环检测法DNA-RNA杂交。杂交。1)原理:)原理:2)选择过程)选择过程在在70%甲酰胺中,把甲酰胺中,把DNA双链变性,复双链变性,复性的时候,性的时候,DNA-RNA杂交分子比杂交分子比DNA-DNA双链更稳定。电镜下可见一种双链更稳定。电镜下可见一种R-环环形结构。形结构。用外源基因的用外源基因的mRNA与重组载体杂交。与重组载体杂交。缺点:需要电镜!缺点:需要电镜!2.Northern blotting用用DNA(或(或RNA)探针检测
11、)探针检测RNA样品。样品。主要检测插入片主要检测插入片断是否被转录。断是否被转录。从宿主细胞中提从宿主细胞中提取取RNA,再用探,再用探针杂交。针杂交。利用抗体作为利用抗体作为“探针探针”来检测转入受体菌并来检测转入受体菌并且表达出相应的蛋白质的外源基因。且表达出相应的蛋白质的外源基因。一、放射性抗体检测法一、放射性抗体检测法第五节第五节 免疫化学检测法免疫化学检测法 P206对表达产物的检测。对表达产物的检测。蛋白蛋白蛋白蛋白“杂交杂交”二、免疫沉淀检测法二、免疫沉淀检测法三、酶联免疫吸附测定(三、酶联免疫吸附测定(ELISA)四、免疫印迹(四、免疫印迹(western blotting)
12、法)法四、免疫印迹(四、免疫印迹(western blotting)法)法P1091.1.原理:原理:在蛋白质凝胶电泳以后,用在蛋白质凝胶电泳以后,用转膜和免疫转膜和免疫的方的方法检测胶上的蛋白质泳带。法检测胶上的蛋白质泳带。(1)SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳 是蛋白质的变性剂,使煮沸变性的是蛋白质的变性剂,使煮沸变性的蛋白质蛋白质维持线性状态维持线性状态,并与蛋白质,并与蛋白质结合,使蛋白质结合,使蛋白质带上负电荷带上负电荷。SDS:(SDS-PAGE):):聚丙烯酰胺凝胶电泳(聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE):):(Polyacrylamide gel electrophore
13、sis)在电场的作用下线性在电场的作用下线性蛋白质链在聚丙烯酰蛋白质链在聚丙烯酰胺凝胶介质中向正极胺凝胶介质中向正极移动,移动,移动的速率主移动的速率主要取决于其分子量大要取决于其分子量大小(链的长短)小(链的长短),从,从而把不同分子量的肽而把不同分子量的肽链分开。链分开。电泳电泳buffer电泳电泳buffer点样点样电泳方向电泳方向蛋白质电泳的分子蛋白质电泳的分子量标准量标准已知分子量的蛋白质已知分子量的蛋白质混合液,与待测样品混合液,与待测样品一起电泳,为样品蛋一起电泳,为样品蛋白质提供分子量估计。白质提供分子量估计。商品化供应商品化供应Da道尔顿道尔顿(质量单位质量单位,等于等于一氧
14、原子质量的十六分一氧原子质量的十六分之一。之一。一克约为一克约为6106102323道尔顿道尔顿DaltonSDS PAGE凝胶中的蛋白质染色:凝胶中的蛋白质染色:考马斯亮蓝:考马斯亮蓝:灵敏度底、只能检出灵敏度底、只能检出g/带带,但可褪色回,但可褪色回收。收。硝酸银:硝酸银:灵敏度高、可检出灵敏度高、可检出2-5ng/带。带。2)转到膜上进行染色。)转到膜上进行染色。1)直接染色)直接染色直接染色电泳结果直接染色电泳结果(2)Western blotting电泳胶里的蛋白质带可以用电转的方法,电泳胶里的蛋白质带可以用电转的方法,转到膜上(硝酸纤维素膜、转到膜上(硝酸纤维素膜、PVDF膜、膜
15、、中性尼龙膜等)。中性尼龙膜等)。Western(转膜)(转膜)胶里的蛋白质带在电胶里的蛋白质带在电场的作用下场的作用下横向横向转移转移到正极一侧的膜上。到正极一侧的膜上。膜膜胶胶蛋白蛋白Western装置装置 Blotting原理与原理与ELISA相同。相同。待测蛋白待测蛋白硝酸纤硝酸纤维素膜维素膜一抗一抗 二抗二抗辣根过氧辣根过氧化物酶化物酶底物底物产物产物PAGE胶胶待测蛋白待测蛋白显色显色辣根过氧化物酶:辣根过氧化物酶:HRPO1)先用一抗(待测蛋白的单克隆抗体)与)先用一抗(待测蛋白的单克隆抗体)与 膜上的蛋白结合。膜上的蛋白结合。2)洗去未结合的一抗。)洗去未结合的一抗。3)用二抗
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 重组 克隆 筛选 鉴定
限制150内