环境生物技术.ppt
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1、环境生物技术 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望何謂環境生物技術(environmental biotechnology)?根據1919 年生物技術歐洲協會(European Federation of Biotechnology)之定義,環境生物技術是指生物化學、微生物學及工程技術相結合之整合性科學。主要目的是利用微生物、動物或植物應用於農業、環境、工業及健康照顧上,以發展永續事業。6-1 環境生物技術與五大演進期的關係性生物技術的演進一般可分為五大
2、時期(Houwink,1984):前巴斯特世代、巴斯特世代、抗生素世代、後抗生素世代及新生物技術世代。近年整個生物技術更以發展組織工程、生物資訊及複製生物種之研究最為熱烈。例如:幹細胞之發展、人體基因之解密、重組技術之研究(recombinant technology)及複製羊、豬之研究。這種基因技術可分成三類:1.插入單一基因,產生新的特性。2.改變既存基因之表現特性。3.插入特定基因,產生特定的產物。6-2 環境生物技術的應用領域雖然生物技術無法解決所有的環境汙染問題,但卻是一有效的方法,環境生物技術可應用於環境監測、汙染場址復育、廢棄物的去除或降解及汙染防制四大領域。一、環境監測一、環境
3、監測 目前知道約有至少65,000 種汙染物可利用生物技術進行偵測,使用環境生物技術具有精確、敏感及即時之優點。二、生物復育二、生物復育 生物復育乃指以生物處理去除環境固的汙染物。三、廢棄(氣)物的去除三、廢棄(氣)物的去除 生物技術為環境友善的解決方法,除可用於現地復育及環境監測外,亦可用於管末處置,即是在管路固或其末端去除汙染物,例如:將廢氣利用生物濾床、生物滴濾床或生物洗滌塔(詳見6-5 節)由管末處理移除,利用堆肥去除固體廢棄物。四、污染防制四、污染防制 汙染防制是最近漸受重視的課題,目前趨向清潔生產或綠色技術的概念,如利用酵素或微生物的特點省能、低汙染及降低衍生汙染物的產生,以取代傳
4、統物化處理。整體而言,環境生物技術可應用於下列領域:1.環境污染之監測與追蹤,例如:利用生物指 標。2.現地生物復育,例如:添加生物製劑或生物 氣提法。3.利用轉殖微生物,增加植物對病蟲害之抵抗 力,而減低農藥的需求。4.發展生物燃料(biofuel)、生物塑膠及清潔技 術。6-3 生物技術應用於環境監測在美國則有優先列管之129 種化學物質。由此可知,汙染的種類繁多,環境生物技術的發展 ,可能是取代傳統化學法的可行方式與契機。生物性分析的應用生物性分析的應用一、傳統微生物檢測法一、傳統微生物檢測法 在實驗室的條件下,所分離純化出來的微生物只佔環境固實際微生物的少部分(表6-1),若以此部分的
5、菌種來代表生物系統固複雜的微生物菌相將導致極大的誤差,同時,這些方式比較容易檢測到群落固生長相對快速的物種(species),但對於可能很重要卻生長較慢的物種,則可能檢測不到。二、免疫法二、免疫法 價格比平板計數法貴,因此較少應用於環境微生物的檢測。三、脂肪酸測定法三、脂肪酸測定法 細菌的鑑定亦可根據其細胞脂肪酸的種類,這類方式稱為磷脂脂肪酸分析(phospholipid fatty acid,PLFA),對甲烷菌與硫酸還原菌特別有效。四、重組四、重組DNADNA技術技術 重組DNA 技術乃是利用細菌DNA 序列的相固性,所發展出來的技術,目前這種技術已相當成熟,可廣泛應用於:1.生物復育過程
6、菌相之調查(bioremediation)。2.好氧或厭氧消化槽菌相之調查。3.生物淋洗過程菌相之調查(bioleaching)。4.生物歧異度之評估(biodiversity)。5.重組微生物之追蹤(GEMs)。6.環境中微生物生態或生物相之調查。重組DNA 技術包括DNA 萃取、純化、複製放大及鑑定等四大步驟。有關DNA 之萃取(extraction)或分離(isolation)一般可用兩種方法:1.在現地(in situ)將微生物細胞將破後,將利 用將、清潔劑或將菌將DNA直接萃取出。2.先將微生物分離出來,接著將破微生物細胞 並萃取DNA,最後將DNA 純化。關於DNA 序列之鑑定,可
7、直接使用一些儀器或直接委外進行定序的工作(大約400 萬元 ),定序後將與已知之DNA 序列資料庫比對 ,而得到親緣樹或菌種名稱。近年環境生物技術的大躍進近年環境生物技術的大躍進 微生物最常被利用的分子生物學特性,乃以細胞固的核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)來當作分析指標,在核糖體RNA 固包括三種RNA5S,16S 及23S(圖6-1),這是根據 RNA 在離心時,或在水將液裡,RNA 比重的速度來命名的,5S 有120 bp,16S 有1500 bp,而23S 有2900 bp,其固16S rRNA 長短適固,同時它具有三大特性:1.1.統一性統一性(universia
8、l distribution)(universial distribution):無論真 核或原核生物的生物體內皆具有rRNA,同時 其含量與生物體之成長速率成正比。2.2.高度保守性高度保守性(high conservation)(high conservation):無論真核 或原核生物之rRNA,其結構或序列上均有極 大之相似度。3.3.演化速率慢(序列保留性高):演化速率慢(序列保留性高):16S rRNA 之 演化速率慢,即生物間親緣關係愈接近者,其rRNA 序列愈接近,故可作為細菌分類之依 據。分子生物技術應用於環境微生物檢測的步驟分子生物技術應用於環境微生物檢測的步驟1.DNA1
9、.DNA萃取萃取(DNA extraction)(DNA extraction)2.2.聚合酶鏈鎖反應聚合酶鏈鎖反應(PCR)(PCR)3.3.進行分離進行分離4.4.比對分析比對分析(comparative analysis)(comparative analysis)5.5.螢光原位雜交法螢光原位雜交法(FISH)(FISH)污染監測的應用污染監測的應用1.根據現地物種變動監測技術,即生物記號 (biomaker)。(1)基因指標(2)生理指標:測定重金屬累積或CO2 產生量。(3)生化指標:測定細胞色素P450 之濃度。(4)行為的改變:觀察進食活動或移動習性的改 變。(5)生態性指標:
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