生物化学课件 复制.ppt
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1、生物化学课件 复制 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望遗传信息传递的中心法则遗传信息传递的中心法则DNA复制复制RNA转录转录蛋白质蛋白质翻译翻译RNA逆转录逆转录复制复制蛋白质蛋白质翻译翻译*DNADNA通过基因表达,决定了蛋白质的结构、通过基因表达,决定了蛋白质的结构、功能功能 *DNADNA通过复制,将基因信息代代相传通过复制,将基因信息代代相传 *RNARNA参与参与DNADNA遗传信息的表达遗传信息的表达*RNARNA也可作为某些病毒遗传信息
2、的载体也可作为某些病毒遗传信息的载体本本 章章 主主 要要 内内 容容1、复制(、复制(replicationreplication)2、基因表达、基因表达转录(转录(transcriptiontranscription)翻译(翻译(translationtranslation)(gene expression)gene expression)第第一节一节 DNA的生物合成的生物合成 本本节主要内容节主要内容:1 1、DNADNA复制的特征复制的特征2 2、参与参与DNADNA复制的物质复制的物质3 3、DNADNA生物合成过程生物合成过程5 5、逆转录和其他复制方式、逆转录和其他复制方式4
3、4、DNADNA损伤与修复损伤与修复一、一、DNADNA的的复制复制 (replication)(replication)由亲代由亲代DNADNA合成两个相同的子代合成两个相同的子代 DNADNA的过程。的过程。复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA(一)(一)DNA复制的复制的特征特征n 半保留复制半保留复制 (semi-conservative replication)n 半不连续复制半不连续复制 (semi-discontinuous replication)n 双向复制双向复制 (bidirectional replication)n 有特定的起点有特定的起点子链继承母链遗传信息的几种可
4、能方式子链继承母链遗传信息的几种可能方式 全保留式全保留式 半保留式半保留式 混合式混合式 一、半保留复制一、半保留复制(一)半保留复制的定义(一)半保留复制的定义 复制时,母链的双链复制时,母链的双链DNA解开成两股单链,各解开成两股单链,各自作为模板指导子代合成新的互补链。子代细胞的自作为模板指导子代合成新的互补链。子代细胞的DNA双链,其中一股单链从亲代完整地接受过来,双链,其中一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全重新合成。由于碱基互补,两个另一股单链则完全重新合成。由于碱基互补,两个子细胞的子细胞的DNA双链,都和亲代母链双链,都和亲代母链DNA碱基序列一碱基序列一致。这种复
5、制方式称为致。这种复制方式称为半保留复制半保留复制。AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA (二)半保留复制的实验依据(二)半保留复制的实验依据(三)半保留复制的意义(三)半保留复制的意义 使亲代使亲代DNA所含的信息以极高的准确度所含的信息以极高的准确度传递给子代传递给子代DNA分子。分
6、子。3 5 3 5 解链方向解链方向35335领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)二二、复制的半不连续性、复制的半不连续性DNA双螺旋的两条链是反平行的,而双螺旋的两条链是反平行的,而DNA合成的合成的方向只能是方向只能是53。在在DNA复制时,复制时,1条链的合成方向和复制叉的前条链的合成方向和复制叉的前进方向相同,可以连续复制,叫作进方向相同,可以连续复制,叫作前导链前导链(leading strand);而另一条链的合成方向和);而另一条链的合成方向和复制叉的前进方向正好相反,不能连续复制,只复制叉的前进方向正好相反,不能连续复制,只能
7、分成几个片段(能分成几个片段(冈崎片段)冈崎片段)合成,称之为合成,称之为滞后滞后链链(lagging strand)。)。领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的的半不连续复制半不连续复制。三三、双向复制、双向复制 双向复制的定义双向复制的定义 复制时,复制时,DNA从从起始点(起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为反的复制叉,称为双向复制双向复制。53oriorioriori535533553复制子复制子3真核生物的双向复制真核生物的双向复制四、四、有特定的起始点有特定的起始点
8、u原核生物只有一个复制起始点原核生物只有一个复制起始点u真核生物有多个复制起始点真核生物有多个复制起始点(二)(二)参与参与DNA复制的复制的物质物质1底物:四种底物:四种 dNTP:dATP、dTTP、dGTP、dCTP2聚合酶:依赖聚合酶:依赖DNA的的DNA聚合酶,聚合酶,DNA-pol;3模板:指解开成单链的模板:指解开成单链的DNA母链;母链;4引物:提供引物:提供3OH末端,使末端,使dNP可以依可以依 次聚合;次聚合;5其他酶和蛋白质因子。其他酶和蛋白质因子。参与复制的主要酶类参与复制的主要酶类(一)(一)DNA聚合酶聚合酶(二)解链解旋酶(二)解链解旋酶(三)引物酶(三)引物酶
9、(四)(四)DNA连接酶连接酶u DNA聚合酶聚合酶全称:依赖全称:依赖DNA的的DNA聚合酶(聚合酶(DDDP)缩写:缩写:DNApol活性:活性:1.53 的聚合活性的聚合活性 2.核酸外切酶核酸外切酶活性活性复制的化学反应复制的化学反应在聚合酶的作用下,一个核苷酸在聚合酶的作用下,一个核苷酸 5 5-P和和相邻的核苷酸上核糖的相邻的核苷酸上核糖的3-OH生成磷酸二生成磷酸二酯键而逐一聚合的形成多核苷酸链。酯键而逐一聚合的形成多核苷酸链。(dNMP)ndNTP(dNMP)n+l ppi5 A G C T T C A G G A T A 3|3 T C G A A G T C C T A G
10、 C G A C 5 3 5 外切酶活外切酶活性性 5 3 外切酶活性外切酶活性?能切除能切除RNA引物和突变的引物和突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。核酸外切酶活性核酸外切酶活性 1原核生物的原核生物的DNA聚合酶聚合酶DNA-pol IDNA-pol IIDNA-pol(1)DNA聚合酶聚合酶:结构特点结构特点单一多肽链,从单一多肽链,从N端到端到C端有端有3个酶促活个酶促活性结构域依次排列:性结构域依次排列:53外切酶、外切酶、35外切酶和外切酶和DNA聚合酶。聚合酶。DNA Pol I在蛋白酶的作用下,可分为大、在蛋白酶的作用下,
11、可分为大、小两个片段。小片段具有小两个片段。小片段具有53外切外切酶活性。大片段(又称为酶活性。大片段(又称为Klenow片段)片段)具有聚合酶活性及具有聚合酶活性及35 外切酶活性,外切酶活性,它对核酸技术十分有用。它对核酸技术十分有用。323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外核酸外切酶活性切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活核酸外切酶活性性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究中常用的工具酶。分子生物学研究中常用的工具酶。
12、DNA-pol I在活细胞内的功能在活细胞内的功能1)53聚合酶的活性:对复制和修复聚合酶的活性:对复制和修复中出现的空隙进行填补。中出现的空隙进行填补。2)35外切酶活性:对复制中错误进外切酶活性:对复制中错误进行即时校读,保证复制的准确性。行即时校读,保证复制的准确性。3)53外切酶活性:可去除外切酶活性:可去除RNA引物引物和突变碱基。和突变碱基。(2)DNA-pol II 53聚合酶活性聚合酶活性35外切酶活性外切酶活性无无53外切酶活性外切酶活性它只是在无它只是在无pol I及及pol 的情况下才起作用,的情况下才起作用,其真正的功能也未完全清楚,可能在其真正的功能也未完全清楚,可能
13、在损伤修损伤修复中有特殊作用。复中有特殊作用。(3)DNA pol-结构特点结构特点由由1010种亚基组成不对称异源二聚体。种亚基组成不对称异源二聚体。核心酶(核心酶()亚基:亚基:53 聚合酶活性聚合酶活性 亚基:亚基:3 5外切酶活性和碱基选择功能外切酶活性和碱基选择功能 亚基亚基:可能起组装作用可能起组装作用亚基:夹稳模板链并使酶沿模板链滑动亚基:夹稳模板链并使酶沿模板链滑动复合物:促进全酶组装至模板及增强核心复合物:促进全酶组装至模板及增强核心 酶活性酶活性DNA-pol (250kD)DNA-pol 在活细胞内的功能在活细胞内的功能53聚合酶的活性:聚合酶的活性:是在复制延长中真正催
14、化新链核苷酸聚合的是在复制延长中真正催化新链核苷酸聚合的酶。酶。35外切酶活性:外切酶活性:对复制中错误进行即时校对复制中错误进行即时校读,保证复制的准确性。读,保证复制的准确性。催化催化DNA聚合聚合参与参与DNA损损伤的应急状态伤的应急状态修复修复修复合成、修复合成、切除引物、切除引物、填补空隙填补空隙功能功能2040400分子数分子数/细胞细胞1011亚基数亚基数+5 外切酶活性外切酶活性+5 外切酶活性外切酶活性+5 聚合酶活性聚合酶活性pol IIIpol IIpol IE.Coli中的中的DNA聚合酶聚合酶2真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶DNApol,。DNApo1:延长领
15、头链和随从链;:延长领头链和随从链;DNApoI:合成:合成RNA引物;引物;DNApol:校读、修复和填补缺口。:校读、修复和填补缺口。DNApol:在没有其他:在没有其他DNApol时时 发挥催化功能。发挥催化功能。DNApo1:催化线粒体:催化线粒体DNA的合成的合成真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶(二)与复制起始及解链解旋相关的酶类(二)与复制起始及解链解旋相关的酶类在复制起始时需要多种酶和蛋白因子,共同在复制起始时需要多种酶和蛋白因子,共同起解开、理顺起解开、理顺DNA链,维持链,维持DNA在一段时间在一段时间内处于单链状态的作用。内处于单链状态的作用。1.与复制起始及解链相关
16、的酶类及蛋白与复制起始及解链相关的酶类及蛋白(1)DnaA蛋白蛋白(2)DnaB蛋白(解螺旋酶)蛋白(解螺旋酶)(3)DnaC蛋白蛋白(1)DnaA蛋白蛋白DnaA蛋白是由相同亚基组成的四聚体。蛋白是由相同亚基组成的四聚体。复制起始时,复制起始时,DnaA蛋白辨认并结合蛋白辨认并结合E.coli上上复制起始点复制起始点oriC,1020个DnaA蛋白相互靠近形成蛋白相互靠近形成DNA蛋白质复合蛋白质复合体结构,促使体结构,促使oriC局部解链。局部解链。E.Coli 基因图基因图复制起始点(复制起始点(E E.coli-oriC.coli-oriC)GATTNTTTATTT GATCTNTTN
17、TATT GATCCTTATTAG 1 13 17 29 32 44 1 13 17 29 32 44 TGTGGATTA-TTATTACACA-TTTGGATAA-TTATCCACA58 66 166 174 201 209 237 24558 66 166 174 201 209 237 245串联重复序列串联重复序列反向重复序列反向重复序列5 3 5 3 识别区识别区AT富含区富含区(2 2)DnaB蛋白蛋白解螺旋酶解螺旋酶、复制蛋白复制蛋白rep,利用利用ATPATP供能,作供能,作用于氢键,使用于氢键,使DNADNA双链解开成为两条单链。双链解开成为两条单链。Dna BDna C解链
18、方向解链方向(3)DnaC蛋白蛋白 Dna C蛋白的作用是将具有解链酶活性的蛋白的作用是将具有解链酶活性的Dna B蛋白运送到复制模板,并协同蛋白运送到复制模板,并协同Dna B 蛋蛋白的作用。白的作用。解解链链过过程程中中,DNADNA分分子子会会过过度度拧拧紧紧、打打结结、缠绕、连环等现象。缠绕、连环等现象。2DNA拓扑异构酶拓扑异构酶(DNA topoisomerase)DNADNA拓扑异构酶,改变拓扑异构酶,改变DNADNA分子构象,分子构象,理顺理顺DNADNA链,使复制能顺利进行。链,使复制能顺利进行。分类:拓扑酶分类:拓扑酶和拓扑酶和拓扑酶作用特点:对作用特点:对DNA分子的作用
19、是既能水分子的作用是既能水解,又能连接磷酸二酯键。解,又能连接磷酸二酯键。DNA分子一边解链,一边复制,拓扑酶分子一边解链,一边复制,拓扑酶是在复制全过程中都是有作用的。是在复制全过程中都是有作用的。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA双链中双链中一股一股链,使链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,闭切口,DNA变为松弛状态变为松弛状态。反应反应不需不需ATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA分子分子两股两股链,断端通过链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。切口旋转使超螺旋松弛。利用利用ATP供能,连接断端,供能,连接断端,DNA分子进入负超螺旋状态。分子进入
20、负超螺旋状态。作用机制作用机制 拓扑异构酶拓扑异构酶作用机制:作用机制:3单链单链DNA结合蛋白结合蛋白单链单链DNA结合蛋白(结合蛋白(single stranded DNA binding protein,SSB)的作用是在复制中的作用是在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整。维持模板处于单链状态并保护单链的完整。模板的模板的DNA总要处于单链状态,而总要处于单链状态,而DNA分子只分子只要符合碱要符合碱基基配对,又总会有形成双链的倾向,配对,又总会有形成双链的倾向,以使分子达到稳定状态和免受胞内广泛存在的以使分子达到稳定状态和免受胞内广泛存在的核酸酶降解。核酸酶降解。(三)引物酶(
21、三)引物酶DNA聚合酶不能从头合成聚合酶不能从头合成DNA链,只能延长已链,只能延长已有的有的DNA或或RNA引物链。引物链。引物酶引物酶(primase)在复制起始时催化)在复制起始时催化引物引物(primerprimer)合成,合成,提供提供3 3-OHOH末端,使末端,使DNA-polDNA-pol能够催化能够催化dNTPdNTP聚合。聚合。引物酶属引物酶属DNA指导的指导的RNA 聚合酶,但不同于聚合酶,但不同于催化转录过程的催化转录过程的RNA聚合酶。在聚合酶。在E.coli,引物,引物酶是酶是dnaG基因的产物基因的产物DnaG。(四)(四)DNA连接酶连接酶(DNA ligase
22、)连接连接DNA链链3-OH末端和相邻末端和相邻DNA链的链的5 P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的邻的DNA链连成完整的链。链连成完整的链。特点:连接酶连接碱基互补基础上的双链中的特点:连接酶连接碱基互补基础上的双链中的单链缺口,它并没有连接单独存在的单链缺口,它并没有连接单独存在的DNA单链单链或或RNA单链的作用。单链的作用。功能:在复制中起最后接合缺口的作用,在功能:在复制中起最后接合缺口的作用,在DNA修复、重组、剪接中也起缝合缺口作用,修复、重组、剪接中也起缝合缺口作用,也是也是基因工程的重要工具酶之一基因工程的重要工具酶之一。H
23、O5335DNA连接酶连接酶ATPADP5353三种酶催化生成磷酸二酯键的比较三种酶催化生成磷酸二酯键的比较三三、原核生物、原核生物DNA生物合成生物合成(一)复制的起始(一)复制的起始(二)复制的延长(二)复制的延长(三)复制的终止(三)复制的终止1、DNA解链解链2、引发体的形成并合成引物、引发体的形成并合成引物3、超螺旋的转型、超螺旋的转型(一)复制的起始(一)复制的起始DnaADnaA蛋白辨认起始点蛋白辨认起始点,形成起始复合物形成起始复合物DnaBDnaB蛋白解螺旋蛋白解螺旋DnaCDnaC蛋白协助蛋白协助DnaBDnaB在多种蛋白质参与下,在多种蛋白质参与下,DNADNA解开成单链
24、解开成单链SSBSSB维持单链稳定维持单链稳定 Dna A Dna B、Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶SSB3 5 3 5 引发体的形成引发体的形成含有解螺旋酶、含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和蛋白、引物酶和DNA复制起始区域的复合结构称为复制起始区域的复合结构称为引发体引发体。引物的合成引物的合成Dna ADna B、Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物酶引物酶OHSSB3 5 3 5 引物酶引物酶OH(三)超螺旋的转型(三)超螺旋的转型解链将导致下游发生打结现象或解链将导致下游发生打结现象或DNA超螺超螺旋的其他部分过度拧转。旋的其他部分过度拧转。拓扑酶通过切断、
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