第九章微生物的遗传与变异.ppt
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1、第九章微生物的遗传与变异现在学习的是第1页,共87页第九章 微生物遗传课程标准 了解微生物的遗传物质及基因组存在方式,理解基因突变的特点,掌握微生物的基因重组方式。Back现在学习的是第2页,共87页本章要点一 微生物遗传的物质基础二 微生物的基因突变三 微生物的基因重组四 微生物的遗传育种现在学习的是第3页,共87页遗传遗传:亲代与子代相似变异变异:亲代与子代、子代间不同个体不完全相同遗传(inheritance)和变异(variation)是生命的最本质特性之一生物的全部遗传因子及基因具有一定遗传型的个体,在特定环境条件下通过生长发育所表现出来的形态等生物学特征的总和。表型是由遗传型所决定
2、,但也和环境有关。表型是由遗传型所决定,但也和环境有关。遗传型遗传型(genotype):表型(表现型)表型(表现型)(phenotype):现在学习的是第4页,共87页饰变(modification):指生物体由于非遗传因素引起的表型改变,变化发生在转录、转译水平,特点是几乎整个群体中的每一个个体都发生同样的变化,性状变化的幅度小,不遗传,引起饰变的因素消失后,表型即可恢复。现在学习的是第5页,共87页表型饰变:表型饰变:表型的差异只与环境有关特点:暂时性、不可遗传性、表现为全部个体的行为橘生淮南则为橘,生于淮北则为枳。遗传型变异(基因变异、基因突变)遗传型变异(基因变异、基因突变):遗传物
3、质改变,导致表型改变特点:遗传性、群体中极少数个体的行为 (自发突变频率通常为10-6-10-9)现在学习的是第6页,共87页微生物是遗传学研究中的明星:t 微生物细胞结构简单,营养体一般为单倍体,方便建立纯系。微生物细胞结构简单,营养体一般为单倍体,方便建立纯系。t 很多常见微生物都易于人工培养,快速、大量生长繁殖很多常见微生物都易于人工培养,快速、大量生长繁殖。t 对环境因素的作用敏感,易于获得各类突变株,操作性强。对环境因素的作用敏感,易于获得各类突变株,操作性强。现在学习的是第7页,共87页第一节 遗传的物质基础一、DNA作为遗传物质二、RNA作为遗传物质三、朊病毒的发现与思考现在学习
4、的是第8页,共87页1928年,Griffith进行了以下几组实验:(1)动物实验对小鼠注射活R菌或死S菌 小鼠存活对小鼠注射活S菌小鼠死亡对小鼠注射活R菌和热死S菌 小鼠死亡 抽取心血分离活的S菌v(一(一 )转化实验转化实验(transformation):vF.Griffith,v研究对象:Streptococcus pneumoniae(肺炎双球菌)vS型菌株:有致病性,菌落表面光滑,有荚膜vR型菌株:无致病性,菌落表面粗糙,无荚膜一 DNA作为遗传物质现在学习的是第9页,共87页(2)细菌培养实验热死S菌不生长活R 菌长出R菌热死S菌+活R 菌长出大量R菌和10-6S菌(3)S型菌的
5、无细胞抽提液试验活R菌+S菌无细胞抽提液长出大量R菌和少量S菌以上实验说明:加热杀死的以上实验说明:加热杀死的S S型细菌细胞内可能存在一种型细菌细胞内可能存在一种转化物质,它能通过某种方式进入转化物质,它能通过某种方式进入R R型细胞并使型细胞并使R R型细胞获型细胞获得稳定的遗传性状得稳定的遗传性状现在学习的是第10页,共87页一、DNA作为遗传物质第一节 遗传的物质基础现在学习的是第11页,共87页v加S菌DNAv加S菌DNA及DNA酶以 外的酶v加S菌的DNA和DNA酶v加S菌的RNAv加S菌的蛋白质v加S菌的荚膜多糖活R菌长出S菌只有R菌1944年O.T.Avery、C.M.MacL
6、eod和M.McCarty从热死S型S.pneumoniae中提纯了可能作为转化因子的各种成分,在离体条件下进行了转化试验:Avery等在四十年代以更精密的实验设计重复了以上实验分别用降解DNA、RNA、蛋白质的酶作用于有毒的S型菌细胞抽提物只有DNA被酶降解破坏的抽提物无转化活性DNA是转化所必需的转化因子现在学习的是第12页,共87页(二)(二)噬菌体感染实验噬菌体感染实验A.D.Hershey和M.Chase,1952年(1)含32P-DNA的一组:放射性85%在沉淀中(2)含35S-蛋白质的一组:放射性75%在上清液中所以,进入细胞的是噬菌体的核酸而不是蛋白质。现在学习的是第13页,共
7、87页第一节 遗传的物质基础T2噬菌体感染实验(1952年)现在学习的是第14页,共87页TMVHR第一节 遗传的物质基础二、RNA作为遗传物质生化提取分别获得含RNA的烟草花叶病毒蛋白质外壳(病毒1)和核酸(病毒2)抗血清处理,证明杂种病毒的蛋白质外壳来自病毒1,而非病毒2杂种病毒的后代的蛋白质外壳表现为病毒2,而非病毒1遗传物质是核酸(RNA)而非蛋白质病毒拆开重建实验现在学习的是第15页,共87页第一节 遗传的物质基础三、朊病毒的发现与思考亚病毒的一种:具有传染性的蛋白质致病因子,迄今为止尚为 发现该蛋白内含有核酸。其致病作用是由于动物体内正常的蛋白质PrP c改变折叠状态为PrP sc
8、所致,而这二种蛋白质的一级结构并没有改变。现在学习的是第16页,共87页人的库鲁病(kuru)、克雅氏病(Creutzfeldt Jakob disease,CJD)等羊搔痒症(scrapie)牛海绵状脑病(spongiform encephalopathy)现在学习的是第17页,共87页引起人与动物的致死性中枢神经系统疾病现在学习的是第18页,共87页Prusiner(1982)提出羊搔痒病因子是一种蛋白质侵染颗粒(proteinaceous infectious particle),并将之称做Prion或Virino。-朊病毒1997年,Stanley B.Prusiner荣获诺贝尔奖现在
9、学习的是第19页,共87页第一节 遗传的物质基础三、朊病毒的发现与思考1)蛋白质是否可以作为遗传物质?prion是生命的一个特例?还是仅仅为表达调控的一种形式?2)蛋白质折叠与功能的关系,是否存在折叠密码?DNARNARNA肽链肽链蛋白质蛋白质现在学习的是第20页,共87页第二节第二节 微生物的基因组结构微生物的基因组结构一、概念基因组(genome):一个物种的单倍体的所有染色体及其所包含的遗传信息的总称原核生物(如细菌),多为单倍体(在一般情况下只有一条染色体)真核微生物,多条染色体,例如啤酒酵母有16条染色体。有时为双倍体现在学习的是第21页,共87页第二节第二节 微生物的基因组结构微生
10、物的基因组结构二、微生物与人类基因组计划人类基因组计划(Human Genome Project)1985年提出;1990年正式开始实施;2001年2月,测序工作完成;后基因组时代(Postgenome Era)现在学习的是第22页,共87页第二节 微生物的基因组结构二、微生物与人类基因组计划微生物基因组测序工作是在人类基因组计划的促进下开始的,最开始是作为模式生物,后来不断发展,已成为研究微生物学的最有力的手段。http:/www.tigr.org/tdb/mdb/mdb.html截止到2001年4月:43种微生物完成了全基因组测序;100多个正在进行之中;现在学习的是第23页,共87页第二
11、节 微生物的基因组结构二、微生物与人类基因组计划被选择进行全基因组测序的微生物:1、人类基因组计划中的模式生物a)从技术上从低等入手,建立技术、积累经验。通过对基因 组结构相对简单生物,特别是微生物基因组的测序,对大规模测序的策略及技术进行检验,积累经验;b)理论上利用基因组在进化上的连续性进行比较研究通过对不同进化程度的基因组的分析、比较揭示更多的基本生物学信息。通过研究较为简单的基因组而解答复杂的人类基因组问题,现在学习的是第24页,共87页第二节 微生物的基因组结构二、微生物与人类基因组计划被选择进行全基因组测序的微生物:1、人类基因组计划中的模式生物2、与人类生活关系密切的微生物重要的
12、致病菌及一些工业生产菌3、对阐明生物学基本问题有价值的微生物例如一些古生菌:如Methanococcus jannaschii(詹氏甲烷球菌)等,它们是微生物世界多样性的代表,它们的序列比较有助于找出其进化关系。现在学习的是第25页,共87页第二节 微生物的基因组结构三、微生物基因组结构的特点1、原核生物(细菌、古生菌)的基因组1)染色体为双链环状的DNA分子(单倍体);链环状的染色体在细胞中以紧密缠绕成的较致密的不规则小体形式存在于细胞中,该小体称为拟核(nucliod),其上结合有类组蛋白蛋白质和少量RNA分子,使其压缩成一种手脚架形的致密结构。例外:布氏疏螺旋体(Borrelia bur
13、gdorferi)的染色体是线状的现在学习的是第26页,共87页第二节第二节 微生物的基因组结构微生物的基因组结构三、微生物基因组结构的特点1、原核生物(细菌、古生菌)的基因组1)染色体为双链环状的DNA分子(单倍体);2)基因组上遗传信息具有连续性;基因数基本接近由它的基因组大小所估计的基因数参见表8-1(通常以1000bp1500bp为一个基因进行计算)微生物基因组DNA绝大部分用来编码蛋白质、RNA;用作为复制起点、启动子、终止子和一些由调节蛋白识别和结合的位点等信号序列。一般不含内含子,遗传信息是连续的而不是中断的。真核生物基因组的一个重要特点就是含有内含子个别细菌(鼠伤寒沙门氏菌和犬
14、螺杆菌)和古生菌的rRNA和tRNA中也发现有内含子或间插序列现在学习的是第27页,共87页第二节第二节 微生物的基因组结构微生物的基因组结构三、微生物基因组结构的特点1、原核生物(细菌、古生菌)的基因组1)染色体为双链环状的DNA分子(单倍体);2)基因组上遗传信息具有连续性;3)功能相关的结构基因组成操纵子结构;4)结构基因的单拷贝及rRNA基因的多拷贝;5)基因组的重复序列少而短;古生菌的基因组在结构上类似于细菌。但是信息传递系统(复制、转录和翻译)则与细菌不同而类似于真核生物。操纵子(operon):功能相关的几个基因前后相连,再加上一个共同的调节基因和一组共同的控制位点(启动子、操作
15、子等)在基因转录时协同动作。操纵子(operon):功能相关的几个基因前后相连,再加上一个共同的调节基因和一组共同的控制位点(启动子、操作子等)在基因转录时协同动作。现在学习的是第28页,共87页第二节第二节 微生物的基因组结构微生物的基因组结构三、微生物基因组结构的特点2、真核微生物(啤酒酵母)的基因组1)典型的真核染色体结构;2)没有明显的操纵子结构;啤酒酵母基因组大小为13.5106bp,分布在16条染色体中。3)有间隔区(即非编码区)和内含子序列;4)重复序列多;现在学习的是第29页,共87页第三节第三节 质粒和转座因子质粒和转座因子质粒(plasmid):一种独立于染色体外,能进行自
16、主复制的细胞质遗传因子,主要存在于各种微生物细胞中。转座因子(transposable element):位于染色体或质粒上的一段能改变自身位置的DNA序列,广泛分布于原核和真核细胞中。质粒和转座因子是细胞中除染色体以外的另外二类遗传因子现在学习的是第30页,共87页第三节 质粒和转座因子一、质粒的分子结构1、结构通常以共价闭合环状(covalently closed circle,简称CCC)的超螺旋双链DNA分子存在于细胞中;也发现有线型双链DNA质粒和RNA质粒;质粒分子的大小范围从1kb左右到1000kb;(细菌质粒多在10kb以内)现在学习的是第31页,共87页第三节 质粒和转座因子
17、一、质粒的分子结构2、质粒的检测t 提取所有胞内DNA后电镜观察;t 超速离心或琼脂糖凝胶电泳后观察;t 对于实验室常用菌,可用质粒所带的某些特点,如抗药性初步判断。对于由于三种构型同时存在时造成的多带现象(提取质粒时造成对于由于三种构型同时存在时造成的多带现象(提取质粒时造成或自然存在),可以进行特异性单酶切,使其成为一条带。或自然存在),可以进行特异性单酶切,使其成为一条带。特定的质粒提取方法和后处理使染色体和RNA均被除掉。现在学习的是第32页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型在某些特殊条件下,质粒有时能赋予宿主细胞以特殊的机能,从而使宿主得到生长优势。质粒所含的基因对宿
18、主细胞一般是非必需的;现在学习的是第33页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型质粒所编码的功能和赋予宿主的表型效应致育因子(Fertility factor,F因子)抗性因子(Resistance factor,R因子)产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid)毒性质粒(virulence plasmid)代谢质粒(Metabolic plasmid)隐秘质粒(cryptic plasmid)现在学习的是第34页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型1、致育因子(Fertility factor,F因子)又称F质粒,其大小约100k
19、b,这是最早发现的一种与大肠杆菌的有性生殖现象(接合作用)有关的质粒。携带F质粒的菌株称为F+菌株(相当于雄性),无F质粒的菌株称为F-菌株(相当于雌性)。F因子能以游离状态(F+)和以与染色体相结合的状态(Hfr)存在于细胞中,所以又称之为附加体(episome)。有关内容在讲细菌的接合作用(conjugation)时具体介绍现在学习的是第35页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型2、抗性因子(Resistance factor,R因子)包括抗药性和抗重金属二大类,简称R质粒。R100质粒(89kb)可使宿主对下列药物及重金属具有抗性:汞(mercuric ion,mer)四环
20、素(tetracycline,tet)链霉素(Streptomycin,Str)、磺胺(Sulfonamide,Su)、氯霉素(Chlorampenicol,Cm)夫西地酸(fusidic acid,fus)并且负责这些抗性的基因是成簇地存在于抗性质粒上。抗性质粒在细菌间的传递是细菌产生抗药性的重要原因之一。现在学习的是第36页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型3、产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid)细菌素结构基因、涉及细菌素运输及发挥作用(processing)的蛋白质的基因、赋予宿主对该细菌素具有“免疫力”的相关产物的基因一般都位于
21、质粒或转座子上,因此,细菌素可以杀死同种但不携带该质粒的菌株。现在学习的是第37页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型3、产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid)细菌素一般根据产生菌的种类进行命名:大肠杆菌(E.coli)产生的细菌素为colicins(大肠杆菌素),而质粒被称为Col质粒。由G+细菌产生的细菌素或与细菌素类似的因子与colicins有所不同,但通常也是由质粒基因编码,有些甚至有商业价值,例如一种乳酸细菌产生的细菌素NisinA能强烈抑制某些G+细菌的生长,而被用于食品工业的保藏。现在学习的是第38页,共87页第三节 质粒和转
22、座因子二、质粒的主要类型4、毒性质粒(virulence plasmid)许多致病菌的致病性是由其所携带的质粒引起的,这些质粒具有编码毒素的基因,其产物对宿主(动物、植物)造成伤害。产毒素大肠杆菌是引起人类和动物腹泻的主要病原菌之一,其中许多菌株含有为一种或多种肠毒素编码的质粒。苏云金杆菌含有编码内毒素(伴孢晶体中)的质粒根癌土壤杆菌所含Ti质粒是引起双子叶植物冠瘿瘤的致病因子现在学习的是第39页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型5、代谢质粒(Metabolic plasmid)质粒上携带有有利于微生物生存的基因,如能降解某些基质的酶,进行共生固氮,或产生抗生素(某些放线菌)等
23、。将复杂的有机化合物降解成能被其作为碳源和能源利用的简单形式,环境保护方面具有重要的意义。假单胞菌:具有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、农药(2,4dichlorophenoxyacetic acid)、辛烷和樟脑等的能力。降解质粒:现在学习的是第40页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型6、隐秘质粒(cryptic plasmid)隐秘质粒不显示任何表型效应,它们的存在只有通过物理的方法,例如用凝胶电泳检测细胞抽提液等方法才能发现。它们存在的生物学意义,目前几乎不了解。在应用上,很多隐秘质粒被加以改造作为基因工程的载体在应用上,很多隐秘质粒被加以改造作为基因工程的载体
24、(一般加上抗性基因)(一般加上抗性基因)现在学习的是第41页,共87页第三节 质粒和转座因子二、质粒的主要类型高拷贝数(high copy number)质粒(每个宿主细胞中可以有10-100个拷贝)松弛型质粒(relaxed plasmid)低拷贝数(low copy number)质粒(每个宿主细胞中可以有1-4个拷贝)严谨型质粒(stringent plasmid)窄宿主范围质粒(narrow host range plasmid)(只能在一种特定的宿主细胞中复制)广宿主范围质粒(broad host range plasmid)(可以在许多种细菌中复制)现在学习的是第42页,共87页第
25、三节 质粒和转座因子三、质粒的不亲和性质粒之间的不亲和性、以及质粒拷贝数的多少、能适应的宿主范围的宽窄等特性均与质粒的复制控制类型有关。现在学习的是第43页,共87页第三节 质粒和转座因子四、转座因子的类型和分子结构五、转座的遗传学效应现在学习的是第44页,共87页第四节 基因突变及修复一个基因内部遗传结构或DNA序列的任何改变基因突变:现在学习的是第45页,共87页第四节第四节 基因突变及修复基因突变及修复一个基因内部遗传结构或DNA序列的任何改变基因突变:基因突变是重要的生物学现象,它是一切生物变化的根源,连同基因转移、重组基因转移、重组一起提供了推动生物进化的遗传多变性。基因突变DNA损
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- 第九 微生物 遗传 变异
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