细胞反应过程动力学课件.ppt
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1、细胞反应过程动力学2022/10/17第1页,此课件共88页哦第3章 细胞反应动力学概述何为细胞反应过程何为细胞反应过程?以细胞为反应主体的一类生化反应过程以细胞为反应主体的一类生化反应过程.包括微生物和动植物细胞培养过程包括微生物和动植物细胞培养过程微生物过程微生物过程:酒酒醋醋味精味精药物药物动植物细胞培养过程动植物细胞培养过程:如如:红豆杉细胞培养生产紫杉醇红豆杉细胞培养生产紫杉醇 功用:紫杉醇主要适用于卵巢癌和乳腺癌,对肺癌、大肠癌、黑色素瘤、头颈部癌、淋巴瘤、脑瘤也都有一定疗效。指动植物细胞在体外条件下的存活或生指动植物细胞在体外条件下的存活或生长长,此时细胞不再形成组织。此时细胞不
2、再形成组织。2022/10/17第2页,此课件共88页哦第3章 细胞反应过程动力学概述动、植物细胞培养与微生物培养区别动、植物细胞培养与微生物培养区别动物细胞无细胞壁,且大多数哺乳动物细胞动物细胞无细胞壁,且大多数哺乳动物细胞附着附着在固体或半固体的在固体或半固体的表面才能生长表面才能生长;对;对营养要求严格营养要求严格,除氨基酸、维生素、盐类、葡萄,除氨基酸、维生素、盐类、葡萄糖或半乳糖外,还需有糖或半乳糖外,还需有血清血清。动物细胞。动物细胞对环境敏感对环境敏感,包括,包括pH、溶、溶氧、温度、剪切应力都比微生物有更严的要求,一般须严格的监氧、温度、剪切应力都比微生物有更严的要求,一般须严
3、格的监测和控制。测和控制。植物细胞对营养要求植物细胞对营养要求较动物细胞简单较动物细胞简单。但由于植物细胞培养一般要。但由于植物细胞培养一般要求在求在高密度下高密度下才能得到一定才能得到一定浓度的培养产物浓度的培养产物,以及植物细胞生长,以及植物细胞生长较较微生物要缓慢微生物要缓慢,长时间的培养对无菌要求及反应器的设计也提出特,长时间的培养对无菌要求及反应器的设计也提出特殊的要求殊的要求。2022/10/17第3页,此课件共88页哦第3章 细胞反应过程动力学概述动植物、微生物细胞的培养比较动植物、微生物细胞的培养比较微生物动物细胞植物细胞 大 小悬浮生长营养要求生长速率代谢调节环境敏感细胞分化
4、剪切应力敏感细胞或产物浓度1-10可以简单快,倍增时间0.5-5小时内部不敏感无低较高10-100多数细胞需附着表面才能生长非常复杂慢,倍增时间15-100小时内部、激素非常敏感有非常高低10-100可以,但易结团,无单个细胞较复杂慢,倍增时间24-74小时内部、激素能忍受广泛范围有高低2022/10/17第4页,此课件共88页哦第3章 细胞反应过程动力学概述2022/10/17第5页,此课件共88页哦第3章 细胞反应过程动力学概述细胞反应过程的特征细胞反应过程的特征Cell is the key body of cell reaction:cell absorb the nourishmen
5、t of medium and form products.A cell is a micro-reactor;Cell reaction generally following the bio-reaction rule More component take part in reactionEssentials of cell reaction is a serial reaction catalyzed by enzymes system;metabolism;assimilation,dissimilationThe differences between cell reaction
6、and enzyme reaction is cell level&molecular level reaction2022/10/17第6页,此课件共88页哦第3章 3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学什么是反应过程计量学什么是反应过程计量学 Cell reaction metrology numerically study that products composition and relation between reactant and product,which together with reactions thermodynam
7、ics and reactions kinetics build the theoretical basis of reaction engineering.Theoretical basis thermodynamics of reactions reaction metrology reactions kinetics 2022/10/17第7页,此课件共88页哦第3章 3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学 由于参与反应组分多、代谢途径复杂、底物的消耗并非全部用于生成产由于参与反应组分多、代谢途径复杂、底物的消耗并非全部用于生成产物物(一
8、部分用于什么?)(一部分用于什么?)难以用系数确定由培养基组分到产物的方程式来表示。难以用系数确定由培养基组分到产物的方程式来表示。一、细胞反应的一、细胞反应的元素衡算元素衡算方程方程通常将细胞分子式定义为:通常将细胞分子式定义为:CH O N 而忽略微量元素而忽略微量元素细胞的元素组成包括:细胞的元素组成包括:?C,H,O,P,S,K,Na。2022/10/17第8页,此课件共88页哦第3章 3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学 细胞的元素组成受种类、生长阶段等因素影响。细胞的元素组成受种类、生长阶段等因素影响。一、细胞反应的元素衡算方程一、细胞反应的元素衡算方程典型的分子结构式典型
9、的分子结构式:CH1.8O0.5N0.2Example:Chemical composition of E.coli(dry basis%)elementcontentelementcontentCHONPSK 5020814311 NaCaMgClFeothers10.50.50.50.20.3 2022/10/17第9页,此课件共88页哦第3章 3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学CHmOn+aO2+bNH3cCH O N+dH2O+eCO2一、细胞反应的元素衡算方程一、细胞反应的元素衡算方程对无胞外产物的简单反应对无胞外产物的简单反应:式中式中 CHmOnelement comp
10、osition of carbon sourceCH O N celluar element composition 2022/10/17第10页,此课件共88页哦第3章 3.1 细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学(1)(2)(3)(4)C:H:O:N:对对 C,H,O,N 作元素衡算作元素衡算:CHmOn+aO2+bNH3cCH O N+dH2O+eCO2一、细胞反应的元素衡算方程一、细胞反应的元素衡算方程四个方程四个方程,五个未知数五个未知数?2022/10/17第11页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学一、细胞反应的元素衡算方程一、细胞反应的元素
11、衡算方程(5)引入呼吸商引入呼吸商,定义定义:引入还原度(引入还原度():元素的还原度等于该元素的元素的还原度等于该元素的化合价化合价。C=4C=4,H=1H=1,N=-3N=-3,O=-2O=-2,P=5P=5,S=6S=6化合物的还原度以化合物的还原度以一个碳原子一个碳原子计。见表计。见表2-12-1(6)2022/10/17第12页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数CHmOn+aO2+bNH3=cCH O N +dCHxOyNz+eH2O+f CO2 (1)(S)(O)(X)(P)A cell r
12、eaction with exo-product can be described as follow:1、得率系数的定义、得率系数的定义对底物的细胞得率对底物的细胞得率单位:单位:g/g 或或 g/mol2022/10/17第13页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数1 1、得率系数的定义、得率系数的定义 对氧的细胞得率对氧的细胞得率 对底物的产物得率对底物的产物得率2022/10/17第14页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学2、对碳的细胞得率系数、对碳的细胞得
13、率系数,YcThe Yc indicates that efficiency carbon source in substrate convert to cells ingredient.Where x,s=carbon content per mass cell or per mass sustrate Yc-(0.4-0.9)二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数(g/g)2022/10/17第15页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学3 3、宏观得率系数和理论得率系数、宏观得率系数和理论得率系数 消耗的总底物消耗的总底物mST,一部分用
14、于细胞生长,一部分用于细胞生长(mSG),一部分用于维持一部分用于维持能(能(mSM ),一部用于形成代谢产物,一部用于形成代谢产物(mSR).即即一种是定义:一种是定义:宏观得率宏观得率 另一种是:另一种是:理论得率理论得率,which is also called maximum potential yield 二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数此时计算基质的细胞得率有两种方法:此时计算基质的细胞得率有两种方法:2022/10/17第16页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学4 4、对能量的细胞得率、对能量的细胞得率 For cell
15、 reaction process,the main aim is to search the optimizing culture conditions.Where YATP/S 相对于基质的相对于基质的ATP生成得率,即消耗生成得率,即消耗1mol基质所生成的基质所生成的ATP的量的量;Ms substrate molecular weight二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数2022/10/17第17页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学5 5、得率系数与计量系数的关系、得率系数与计量系数的关系Where Mx,Ms,Mo,Mpmo
16、lecular weight of cell,substrate and oxygen,products,respectively;a,c,dstoischiometry二、细胞反应过程的得率系数二、细胞反应过程的得率系数CHmOn+aO2+bNH3=cCH O N +dCHxOyNz+eH2O+f CO2 (1)(S)(O)(X)(P)2022/10/17第18页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学三、三、exampleUse glucose as substrate to culture microbe.It is known that 2/3 of
17、carbon converted to microbe cell.The reaction is as follow:C6H12O6+aNH3+bO2=cC4.4H7.3O1.2N0.86+dH2O+eCO2(glucose)(microbe cell)Please give:(1)Determine the stoischiometric coefficient,a,b,c,d,e(2)Cell yield to substrate,YX/S (3)(3)respiratory quotient(RQ).2022/10/17第19页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物
18、反应过程计量学solution(1)The stoischiometric coefficient The quality of carbon in 1 mol glucose is 72(g),so the converted carbon to microbe cell in 1 mol glucose is Then The converted carbon to CO2 in 1 mol glucose is2022/10/17第20页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学C6H12O6+aNH3+bO2=cC4.4H7.3O1.2N0.86+dH2
19、O+eCO2From above equation:By the N element balance:By the H element balance:solution2022/10/17第21页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学By O element balancea=0.782,b=1.473,c=0.909,d=3.855,e=2So The reaction equation may be written as follow:2022/10/17第22页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学C6H12O6+0
20、.782NH3+1.473O2=0.909C4.4H7.3O1.2N0.86+3.855H2O+2CO2 (2)Cell yield to substrate,YX/S 2022/10/17第23页,此课件共88页哦第3章 3.1 微生物反应过程计量学微生物反应过程计量学(3)(3)respiratory quotient(RQ)2022/10/17第24页,此课件共88页哦第3 3章章 3.2 3.2 细胞反应动力学的非结构模型细胞反应动力学的非结构模型细胞反应动力学的非结构模型细胞反应动力学的非结构模型3.2.1 3.2.1 细胞反应动力学的描述方法细胞反应动力学的描述方法一、细胞反应过程
21、的复杂性一、细胞反应过程的复杂性1、细胞反应过程、细胞反应过程包括:包括:细胞生长(细胞生长(核心核心)、底物消耗、代谢产物生成。)、底物消耗、代谢产物生成。2、胞内外的物质交换过程、胞内外的物质交换过程多相多相气相气相液相液相固相固相多组分多组分底物多组分底物多组分代谢产物多组分代谢产物多组分(大、小分子)(大、小分子)细胞不同生长周期细胞不同生长周期(104-106个个/mL,生长、,生长、成熟、老化。)成熟、老化。)2022/10/17第25页,此课件共88页哦第3章 3.2.1 细胞反应动力学的描述方法细胞反应动力学的描述方法二、细胞反应动力学模型的简化二、细胞反应动力学模型的简化细胞
22、反应动力学是对反应体系中的细胞的群体行为的细胞反应动力学是对反应体系中的细胞的群体行为的描述,而非对单一细胞;描述,而非对单一细胞;不考虑细胞之间的差别,而取其性质上的平均值;不考虑细胞之间的差别,而取其性质上的平均值;微生物细胞反应是细胞的多种酶的协同反应的宏观结果,微生物细胞反应是细胞的多种酶的协同反应的宏观结果,且受到温度、且受到温度、pHpH值、培养基的组成等条件的影响值、培养基的组成等条件的影响;细胞成分复杂细胞成分复杂(蛋白、脂肪、碳水化合物、核酸、维生素等)(蛋白、脂肪、碳水化合物、核酸、维生素等)和变化性和变化性(上述因素影响)(上述因素影响);2022/10/17第26页,此
23、课件共88页哦第3章 3.2.1 细胞反应动力学的描述方法细胞反应动力学的描述方法二、细胞反应动力学模型的简化二、细胞反应动力学模型的简化因变量的选择和描述问题因变量的选择和描述问题动力学模型描述动力学模型描述?与与?的函数关系。的函数关系。因变量因变量自变量自变量因变量(细胞)因变量(细胞)考虑成分变化考虑成分变化结构模型结构模型不考虑成分变化不考虑成分变化非结构模型非结构模型均衡生长与非均衡生长均衡生长与非均衡生长(细胞各成分以相同比例增加)(细胞各成分以相同比例增加)均衡生长均衡生长 非均衡生长非均衡生长均均衡衡生生长长的的非非结结构构模模型型2022/10/17第27页,此课件共88页
24、哦第3章 3.2.1 细胞反应动力学的描述方法细胞反应动力学的描述方法二、细胞生长动力学模型的简化二、细胞生长动力学模型的简化非结构模型核心内容非结构模型核心内容:不考虑细胞内各组分差异;不考虑细胞内各组分差异;不考虑细胞之间的差异不考虑细胞之间的差异,各种细胞均一;各种细胞均一;细胞均衡生长;细胞均衡生长;各细胞性质相同各细胞性质相同,细胞群作为一种溶质。细胞群作为一种溶质。2022/10/17第28页,此课件共88页哦第3章 3.2.2分批培养时分批培养时 细胞反应动力学细胞反应动力学 单位反应体积、单位时间内的某一组分的量的变化。一、细胞反应的速率一、细胞反应的速率在细胞反应中主要的反应
25、的速率有:在细胞反应中主要的反应的速率有:在细胞反应动力学中用在细胞反应动力学中用细胞反应的速率细胞反应的速率、细胞反应的比速率细胞反应的比速率、细胞细胞反应的得率反应的得率等参数来描述细胞培养过程的等参数来描述细胞培养过程的细胞质量细胞质量、底物质量底物质量、产产物质量物质量的变化关系。的变化关系。1、细胞生长速率细胞生长速率式中式中 CX细胞浓度,(细胞浓度,(g/L)t时间,(时间,(h)细胞浓度通常用单位体积培养液中细胞细胞浓度通常用单位体积培养液中细胞(或菌体)干质量表示。(或菌体)干质量表示。2022/10/17第29页,此课件共88页哦第3章 3.2.2分批培养时分批培养时 细胞
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