遗传学课件真核生物基因的表达及其调控 (2).ppt
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1、遗传学课件真核生物基因的遗传学课件真核生物基因的表达及其调控表达及其调控现在学习的是第1页,共34页原核生物原核生物真核生物真核生物操纵元调控。操纵元调控。多样化调控,更为复杂。多样化调控,更为复杂。基因组小,大肠杆菌:总长基因组小,大肠杆菌:总长4.6106bp,编码编码4288个基因个基因,每每个基因约个基因约1100bp。基基因因组组大大,人人类类基基因因组组全全长长3109 bp,编码,编码10万个基因,其余为重复序列。万个基因,其余为重复序列。基基因因分分布布在在同同一一染染色色体体上上,操操纵元控制。纵元控制。DNA与与组组蛋蛋白白结结合合成成染染色色质质,染染色色质质的的变变化化
2、调调控控基基因因表表达达;基基因因分分布布在在不不同同的的染染色色体上,存在不同染色体间基因的调控问题。体上,存在不同染色体间基因的调控问题。适应外界环境,操纵元调控表达。适应外界环境,操纵元调控表达。基基因因差差别别表表达达是是细细胞胞分分化化和和功功能能的的核核心。心。转录和翻译同时进行,大部分转录和翻译同时进行,大部分为转录水平调控。为转录水平调控。转转录录和和翻翻译译在在时时间间和和空空间间上上均均不不同同,从从DNA到到蛋蛋白白质质的的各各层层次次上上都都有有调调控控,但多数为转录水平调控但多数为转录水平调控真核生物与原核生物的调控差异真核生物与原核生物的调控差异现在学习的是第2页,
3、共34页第一节第一节 真核生物中基因表达水平的分析真核生物中基因表达水平的分析真核生物基因表达分析表明:真核生物基因表达分析表明:真核生物基因表达分析表明:真核生物基因表达分析表明:真核生物细胞中含有的整套基因组相同,或染色体相同,真核生物细胞中含有的整套基因组相同,或染色体相同,真核生物细胞中含有的整套基因组相同,或染色体相同,真核生物细胞中含有的整套基因组相同,或染色体相同,但不同组织和细胞中表达的基因但不同组织和细胞中表达的基因但不同组织和细胞中表达的基因但不同组织和细胞中表达的基因处于工作状态的基因不处于工作状态的基因不处于工作状态的基因不处于工作状态的基因不同同同同整套基因组相同整套
4、基因组相同不同组织和细胞中表达的基因不同组织和细胞中表达的基因可以用组织中不同可以用组织中不同RNARNA的丰余度来表示的丰余度来表示现在学习的是第3页,共34页持家基因持家基因n n在一个组织中丰余的在一个组织中丰余的RNA,在另一个组在另一个组织中可能很少,或不存在,有的是某一织中可能很少,或不存在,有的是某一类型细胞中所特有的;类型细胞中所特有的;n n一般哺乳动物中只有一般哺乳动物中只有10mRNA是该是该类细胞所特有的,大多数类细胞所特有的,大多数mRNA90是某类细胞或所有细胞都有的,是维持是某类细胞或所有细胞都有的,是维持细胞正常结构,运动及新陈代谢等生命细胞正常结构,运动及新陈
5、代谢等生命活动所必须的,称之为活动所必须的,称之为“持家基因持家基因”现在学习的是第4页,共34页n n一、真核基因组的复杂性一、真核基因组的复杂性 与原核生物比较,真核生物的基因组更为复与原核生物比较,真核生物的基因组更为复杂,可列举如下杂,可列举如下:n n真核基因组比原核基因组大得多,真核基因组比原核基因组大得多,真核基因组比原核基因组大得多,真核基因组比原核基因组大得多,大肠杆菌基因组大肠杆菌基因组大肠杆菌基因组大肠杆菌基因组约约约约4104106 6bpbp,哺乳类基因组在哺乳类基因组在哺乳类基因组在哺乳类基因组在10109 9bpbp数量级,比数量级,比数量级,比数量级,比细菌大千
6、倍细菌大千倍细菌大千倍细菌大千倍;大肠杆菌约有;大肠杆菌约有;大肠杆菌约有;大肠杆菌约有40004000个基因,人则约个基因,人则约有有10万个基因。万个基因。万个基因。万个基因。n n真核生物主要的遗传物质与组蛋白等构成染色真核生物主要的遗传物质与组蛋白等构成染色质,被包裹在核膜内质,被包裹在核膜内,核外还有遗传成分核外还有遗传成分核外还有遗传成分核外还有遗传成分(如线如线如线如线粒体粒体粒体粒体DNADNA等等),这就增加了基因表达调控的层次和这就增加了基因表达调控的层次和这就增加了基因表达调控的层次和这就增加了基因表达调控的层次和复杂性。复杂性。复杂性。复杂性。现在学习的是第5页,共34
7、页vv原核生物的基因组基本上是单倍体原核生物的基因组基本上是单倍体原核生物的基因组基本上是单倍体原核生物的基因组基本上是单倍体,而真核基因而真核基因组是二倍体组是二倍体;vv细菌多数基因按功能相关成串排列细菌多数基因按功能相关成串排列细菌多数基因按功能相关成串排列细菌多数基因按功能相关成串排列,组成操纵元,组成操纵元,组成操纵元,组成操纵元的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出多顺反子多顺反子多顺反子多顺反子(polycistron)的的mRNAmRNA;真
8、核生物则是真核生物则是真核生物则是真核生物则是一个结构基因转录生成一条一个结构基因转录生成一条一个结构基因转录生成一条一个结构基因转录生成一条mRNAmRNA,即,即,即,即mRNAmRNA是是单顺反子单顺反子(monocistron)(monocistron),基本上没有操纵元基本上没有操纵元的结构的结构,而,而,而,而真核细胞的许多活性蛋白是由相同和真核细胞的许多活性蛋白是由相同和真核细胞的许多活性蛋白是由相同和真核细胞的许多活性蛋白是由相同和不同的多肽形成的亚基构成的不同的多肽形成的亚基构成的不同的多肽形成的亚基构成的不同的多肽形成的亚基构成的,这就涉及到多个基,这就涉及到多个基,这就涉
9、及到多个基,这就涉及到多个基因协调表达的问题,因协调表达的问题,因协调表达的问题,因协调表达的问题,真核生物基因协调表达要比真核生物基因协调表达要比原核生物复杂得多原核生物复杂得多。现在学习的是第6页,共34页vv原核基因组的大部分序列都为基因编码原核基因组的大部分序列都为基因编码,而核酸,而核酸杂交等实验表明:杂交等实验表明:哺乳类基因组中仅约哺乳类基因组中仅约10%10%的序的序列为蛋白质、列为蛋白质、rRNArRNA、tRNA等编码,等编码,其余约其余约90%90%的序列功能至今还不清楚。的序列功能至今还不清楚。的序列功能至今还不清楚。的序列功能至今还不清楚。vv原核生物的基因为蛋白质编
10、码的序列绝大多数是原核生物的基因为蛋白质编码的序列绝大多数是连续的连续的,而,而,而,而真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是不连续的,即有外显子不连续的,即有外显子不连续的,即有外显子不连续的,即有外显子(exon)(exon)和内含子和内含子(intron)(intron),转录后需经剪接转录后需经剪接转录后需经剪接转录后需经剪接(splicing)去除内含子,才能翻译去除内含子,才能翻译获得完整的蛋白质,获得完整的蛋白质,这就增加了基因表达调控的环这就增加了基因表达调控的环这就增加了
11、基因表达调控的环这就增加了基因表达调控的环节。节。节。节。vv原核基因组中除原核基因组中除rRNArRNA、tRNAtRNA基因有多个拷贝外,基因有多个拷贝外,基因有多个拷贝外,基因有多个拷贝外,重复序列不多重复序列不多重复序列不多重复序列不多。哺乳动物基因组中则存在大量重复哺乳动物基因组中则存在大量重复序列序列(repetitive sequences)(repetitive sequences)。现在学习的是第7页,共34页n n二、真核基因表达调控的特点二、真核基因表达调控的特点 n n与原核生物比较它具有一些明显的特点:与原核生物比较它具有一些明显的特点:与原核生物比较它具有一些明显的
12、特点:与原核生物比较它具有一些明显的特点:n n(一一一一)真核基因表达调控的环节更多真核基因表达调控的环节更多 基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性基因表达是基因经过转录、翻译、产生有生物活性的蛋白质的整个过程。同原核生物一样,的蛋白质的整个过程。同原核生物一样,的蛋白质的整个过程。同原核生物一样,的蛋白质的整个过程。同原核生物一样,转录依然转录依然是真核生物基因表达调控的主要环节是真核生物基因表达调控的主要环节。但真核基因。但真核基因。但真核基因。但真核基因转录发生在转录发生在转录发生在转录发生
13、在细胞核细胞核细胞核细胞核(线粒体基因的转录在线粒体内线粒体基因的转录在线粒体内),翻译则多,翻译则多,翻译则多,翻译则多在胞浆在胞浆在胞浆在胞浆,两个过程是分开的,因此其调控,两个过程是分开的,因此其调控,两个过程是分开的,因此其调控,两个过程是分开的,因此其调控增加了更多的环节和复杂性,增加了更多的环节和复杂性,增加了更多的环节和复杂性,增加了更多的环节和复杂性,转录后的调控占有了更转录后的调控占有了更转录后的调控占有了更转录后的调控占有了更多的分量。多的分量。多的分量。多的分量。现在学习的是第8页,共34页现在学习的是第9页,共34页n n(二二)真核基因的转录与染色质的结构变化真核基因
14、的转录与染色质的结构变化相关相关。n n真核基因组真核基因组真核基因组真核基因组DNADNA绝大部分都在细胞核内与组蛋白等绝大部分都在细胞核内与组蛋白等绝大部分都在细胞核内与组蛋白等绝大部分都在细胞核内与组蛋白等结合成染色质,结合成染色质,结合成染色质,结合成染色质,染色质的结构染色质的结构染色质的结构染色质的结构、染色质中染色质中DNA和和和和组蛋白的结构状态组蛋白的结构状态组蛋白的结构状态组蛋白的结构状态都影响转录都影响转录都影响转录都影响转录,至少有以下现象:,至少有以下现象:n n1.1.染色质结构影响基因转录染色质结构影响基因转录染色质结构影响基因转录染色质结构影响基因转录 n n2
15、.2.组蛋白的作用:组蛋白的作用:组蛋白的作用:组蛋白的作用:组蛋白与组蛋白与组蛋白与组蛋白与DNADNA结合阻止结合阻止结合阻止结合阻止DNADNA上基因的转上基因的转上基因的转上基因的转录,录,录,录,去除组蛋白基因又能够转录。组蛋白是碱性蛋白质,去除组蛋白基因又能够转录。组蛋白是碱性蛋白质,去除组蛋白基因又能够转录。组蛋白是碱性蛋白质,去除组蛋白基因又能够转录。组蛋白是碱性蛋白质,带正电荷带正电荷带正电荷带正电荷,可与,可与,可与,可与DNADNA链上带负电荷的磷酸链上带负电荷的磷酸链上带负电荷的磷酸链上带负电荷的磷酸基相结合,从基相结合,从基相结合,从基相结合,从而遮蔽了而遮蔽了而遮蔽
16、了而遮蔽了DNADNA分子,妨碍了转录,可能扮演了非特异性阻分子,妨碍了转录,可能扮演了非特异性阻分子,妨碍了转录,可能扮演了非特异性阻分子,妨碍了转录,可能扮演了非特异性阻遏蛋白的作用;遏蛋白的作用;遏蛋白的作用;遏蛋白的作用;染色质中的非组蛋白成分具有组织细胞特异性,染色质中的非组蛋白成分具有组织细胞特异性,染色质中的非组蛋白成分具有组织细胞特异性,染色质中的非组蛋白成分具有组织细胞特异性,可能消除组蛋白的阻遏可能消除组蛋白的阻遏可能消除组蛋白的阻遏可能消除组蛋白的阻遏,起到特异性的去阻遏促转录作用起到特异性的去阻遏促转录作用起到特异性的去阻遏促转录作用起到特异性的去阻遏促转录作用。现在学
17、习的是第10页,共34页vv3.3.转录活跃的区域也常缺乏核小体的结构。转录活跃的区域也常缺乏核小体的结构。这这这这些都表明核小体结构影响基因转录。些都表明核小体结构影响基因转录。些都表明核小体结构影响基因转录。些都表明核小体结构影响基因转录。vv4.转录活跃区域对核酸酶作用敏感度增加。转录活跃区域对核酸酶作用敏感度增加。转录活跃区域对核酸酶作用敏感度增加。转录活跃区域对核酸酶作用敏感度增加。活跃进活跃进活跃进活跃进行转录的染色质区域受行转录的染色质区域受行转录的染色质区域受行转录的染色质区域受DNase DNase 消化常出现消化常出现100100200bp200bp的的的的DNADNA片段
18、,且长短不均一,片段,且长短不均一,说明其说明其DNADNA受组蛋白掩盖的结构有变化,受组蛋白掩盖的结构有变化,受组蛋白掩盖的结构有变化,受组蛋白掩盖的结构有变化,出现了对出现了对出现了对出现了对DNase 高敏感点高敏感点高敏感点高敏感点(hypersensitive site)(hypersensitive site)。这。这种高敏感点常出现在转录基因的种高敏感点常出现在转录基因的55侧区侧区侧区侧区(5 flanking region)、33末端或在基因上,多在调末端或在基因上,多在调末端或在基因上,多在调末端或在基因上,多在调控蛋白结合位点的附近,分析控蛋白结合位点的附近,分析控蛋白结
19、合位点的附近,分析控蛋白结合位点的附近,分析该区域核小体的结构该区域核小体的结构该区域核小体的结构该区域核小体的结构发生变化,可能有利于调控蛋白发生变化,可能有利于调控蛋白发生变化,可能有利于调控蛋白发生变化,可能有利于调控蛋白 结合而促进转录。结合而促进转录。结合而促进转录。结合而促进转录。现在学习的是第11页,共34页n n5.DNA碱基修饰变化碱基修饰变化:真核真核DNA中的胞嘧中的胞嘧啶被甲基化为啶被甲基化为5-甲基胞嘧啶甲基胞嘧啶(5methylcytidine,m5C),而活跃转录而活跃转录的的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。这种甲基化最常发生在某
20、些基因这种甲基化最常发生在某些基因5侧区的侧区的CG序列中,实验表明这段序列序列中,实验表明这段序列甲基化可甲基化可使其后的基因不能转录使其后的基因不能转录,甲基化可能阻碍转,甲基化可能阻碍转录因子与录因子与DNA特定部位的结合从而影响转特定部位的结合从而影响转录。如果用基因打靶的方法除去主要的录。如果用基因打靶的方法除去主要的DNA甲基化酶,小鼠的胚胎就不能正常发育甲基化酶,小鼠的胚胎就不能正常发育而死亡,可见而死亡,可见DNA的的甲基化对基因表达调控甲基化对基因表达调控是重要的。是重要的。现在学习的是第12页,共34页n n甲基化抑制转录n n进化程度的关系现在学习的是第13页,共34页n
21、 n基因丢失(基因丢失(基因丢失(基因丢失(gene olimination),在发育过程中,),在发育过程中,),在发育过程中,),在发育过程中,许多细胞常丢掉整条或部分染色体,通过染色体的许多细胞常丢掉整条或部分染色体,通过染色体的许多细胞常丢掉整条或部分染色体,通过染色体的许多细胞常丢掉整条或部分染色体,通过染色体的丢失而除去某些基因的活性。丢失而除去某些基因的活性。丢失而除去某些基因的活性。丢失而除去某些基因的活性。n n基因扩增(基因扩增(基因扩增(基因扩增(gene amplificationgene amplification),基因组内某些基因组内某些基因组内某些基因组内某些基
22、因的拷贝数专一性大量增加。基因的拷贝数专一性大量增加。基因的拷贝数专一性大量增加。基因的拷贝数专一性大量增加。n n基因重排(基因重排(基因重排(基因重排(gene rearrangment),指指指指DNADNA分子分子分子分子核酸序列的重新排列,可以形成新基因,也可以调核酸序列的重新排列,可以形成新基因,也可以调核酸序列的重新排列,可以形成新基因,也可以调核酸序列的重新排列,可以形成新基因,也可以调节基因的表达。节基因的表达。节基因的表达。节基因的表达。6 基因丢失,重排,扩增基因丢失,重排,扩增现在学习的是第14页,共34页n n由此可见,染色质中的基因转录前先要有一个被激由此可见,染色
23、质中的基因转录前先要有一个被激由此可见,染色质中的基因转录前先要有一个被激由此可见,染色质中的基因转录前先要有一个被激活的过程,但目前对激活机制还缺乏认识。活的过程,但目前对激活机制还缺乏认识。活的过程,但目前对激活机制还缺乏认识。活的过程,但目前对激活机制还缺乏认识。n n(三三三三)真核基因表达以正性调控为主:真核基因表达以正性调控为主:真核基因表达以正性调控为主:真核基因表达以正性调控为主:真核真核真核真核RNARNA聚合聚合聚合聚合酶对启动子的亲和力很低酶对启动子的亲和力很低酶对启动子的亲和力很低酶对启动子的亲和力很低,基本上不依靠自身来起,基本上不依靠自身来起,基本上不依靠自身来起,
24、基本上不依靠自身来起始转录,始转录,始转录,始转录,需要依赖多种激活蛋白的协同作用。需要依赖多种激活蛋白的协同作用。真核基因调控中虽然也发现真核基因调控中虽然也发现真核基因调控中虽然也发现真核基因调控中虽然也发现有负性调控元件,但其有负性调控元件,但其有负性调控元件,但其有负性调控元件,但其存在并不普遍存在并不普遍存在并不普遍存在并不普遍;真核基因转录表达的调控蛋白;真核基因转录表达的调控蛋白;真核基因转录表达的调控蛋白;真核基因转录表达的调控蛋白也有也有也有也有起阻遏和激活作用或兼有两种作用者起阻遏和激活作用或兼有两种作用者起阻遏和激活作用或兼有两种作用者起阻遏和激活作用或兼有两种作用者,但
25、总的是但总的是以激活蛋白的作用为主。以激活蛋白的作用为主。即多数真核基因在没有即多数真核基因在没有即多数真核基因在没有即多数真核基因在没有调控蛋白作用时是不转录的,需要表达时就要有激调控蛋白作用时是不转录的,需要表达时就要有激调控蛋白作用时是不转录的,需要表达时就要有激调控蛋白作用时是不转录的,需要表达时就要有激活的蛋白质来促进转录。换言之:活的蛋白质来促进转录。换言之:活的蛋白质来促进转录。换言之:活的蛋白质来促进转录。换言之:真核基因表达以真核基因表达以正性调控为主导。正性调控为主导。现在学习的是第15页,共34页n n三、真核基因转录水平的调控三、真核基因转录水平的调控 真核细胞的三种真
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