突变修复和重组.ppt
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1、突变修复与重组第一张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第一节 突变第二节 修复第三节 重组本章要点:突变的概念、类型DNA修复的主要方式了解重组的分子基础第二张,PPT共九十三页,创作于2022年6月一、突变的主要类型 突变是突变是DNADNA碱基序列水平上的永久的、可遗传的改变。碱基序列水平上的永久的、可遗传的改变。广义的突变包括广义的突变包括染色体畸变染色体畸变和和基因突变基因突变狭义的突变通常指基因突变狭义的突变通常指基因突变 第一节:突变第一节:突变(mutation)mutation)根据突变发生的细胞类型:体细胞突变(Somatic mutation)生殖细胞突变(Germ-
2、line mutation)根据突变发生的细胞类型、对基因功能的影响、突变的方式、发生的原因等可对突变进行不同的分类可遗传给后代仅表现于当代,癌症第三张,PPT共九十三页,创作于2022年6月根据对基因功能的影响功能获得突变(gain of function mutation):使基因功能增强或不受抑制的突变。功能失活突变(loss of function mutation):使基因功能失活或显著下降的突变。根据突变的表达类型非条件型突变:在任何条件下均可表现的突变在任何条件下均可表现的突变条件型突变:突变的表现突变的表现=突变基因型突变基因型+诱导条件诱导条件 第四张,PPT共九十三页,创作
3、于2022年6月根据突变的方式:缺失(deletion),DNA序列上缺失一个或多个碱基碱基替换(base substitution),DNA分子中一个碱 基被另一个碱基替代 倒位(inversion),一段碱基序列发生倒转,但仍 保留在原来的位置上又称点突变插入(insertion),DNA序列中插入一个或多个碱基重复(duplication),一段碱基序列发生一次重复易位(translocation),一段碱基序列从原来的位 置移出,并插入到基因组的另一位置第五张,PPT共九十三页,创作于2022年6月碱基替换:根据碱基变化的不同,可以分为:转换(transition):嘌呤与嘌呤之间,或
4、嘧啶与嘧啶之间的替换颠换(transversion):嘌呤与嘧啶之间的替换。第六张,PPT共九十三页,创作于2022年6月缺失、插入 缺缺失失和和插插入入常常导导致致移移码码突突变变(frameshift frameshift mutationsmutations),结果产生截短的或异常的多肽链。结果产生截短的或异常的多肽链。第七张,PPT共九十三页,创作于2022年6月根据对遗传信息的影响1同义突变(samesense mutation):碱基替换改变密码子但并不改变氨基酸 如如GAUGAC,但仍是天冬氨酸,但仍是天冬氨酸DNA的容错机制。2错义突变(missense mutation):指
5、碱基替换改变密码子并改变氨基酸。错义突变使蛋白质一级结构改变,导致蛋白质活性和功能不同程度的改变。一般性质相似的氨基酸替换对蛋白质的影响小,而性质不同的氨基酸的替换可能强烈的影响蛋白质的功能。例如人的镰刀性贫血症(HbS)。密码子的简并性第八张,PPT共九十三页,创作于2022年6月正常人红细胞镰刀状贫血病人的红细胞第九张,PPT共九十三页,创作于2022年6月 CTTCAT谷氨酸谷氨酸缬氨酸缬氨酸第十张,PPT共九十三页,创作于2022年6月3 无义突变(nonsense mutation):碱基替换使编 码氨基酸的密码子突变为终止密码子,mRNA在翻译时提前终止,形成的肽链不完全,一般没有
6、活性。中性突变(neural mutation):不影响蛋白质正常功能的错义突变同义突变与中性突变又称为:无声突变或沉默突变(silentmutation)4 通读(reading through):碱基替换使终止密码子突 变为编码氨基酸的密码子,转录出的mRNA在翻译时不能适时终止。第十一张,PPT共九十三页,创作于2022年6月按突变发生的原因分类自发突变自发突变(spontaneous mutation):(spontaneous mutation):在自然状况下在自然状况下发生的突变。发生的突变。诱发突变诱发突变(induced mutation):(induced mutation)
7、:外界因素诱发外界因素诱发引起引起的突变。的突变。自发突变的分子基础DNA复制错误自发损伤转座因子第十二张,PPT共九十三页,创作于2022年6月DNA复制错误遗传物质是DNA,DNA复制是半保留复制,如果发生错误,引起碱基替换(base substitution),造成DNA遗传信息的改变。从而导致基因突变。正常情况下,A-T配对,氨基态的腺嘌呤(A)只与胸腺嘧啶(T)配对,但有时可转变成稀有的亚氨基形式,可以与胞嘧啶配对,形成A-C,再经一次复制,DNA分子中的A-T对变成了G-C对.第十三张,PPT共九十三页,创作于2022年6月自发损伤自发损伤(spontaneous lesions)
8、(spontaneous lesions)自然产生的自然产生的DNA损伤引起突变损伤引起突变1.脱嘌呤脱嘌呤:最为常见,:最为常见,DNA分子中碱基和脱氧核糖间的糖苷键受到分子中碱基和脱氧核糖间的糖苷键受到破坏,从而引起鸟嘌呤破坏,从而引起鸟嘌呤(G)或腺嘌呤或腺嘌呤(A)从从DNA分子上脱落下来。分子上脱落下来。常引起缺失或插入突变2.氧化性损伤氧化性损伤:个体自然产生的氧化基,氧化物如超氧自由基:个体自然产生的氧化基,氧化物如超氧自由基,氢氧自由基及过氧化基等,能对氢氧自由基及过氧化基等,能对DNA造成氧化性损伤,引起突变。造成氧化性损伤,引起突变。第十四张,PPT共九十三页,创作于202
9、2年6月3.脱氨基脱氨基:腺嘌呤(腺嘌呤(A)脱氨基变为次黄嘌呤(脱氨基变为次黄嘌呤(H)ATGC胞嘧啶(胞嘧啶(C)脱氨基变为尿嘧啶()脱氨基变为尿嘧啶(U)GCAT第十五张,PPT共九十三页,创作于2022年6月诱发突变的分子基础诱发突变的分子基础 诱变剂可以取代碱基,改变碱基或破坏碱基,使DNA发生错配,而引起基因突变。生物因素(黄曲霉素等)诱变剂的分类:诱变剂的分类:物理诱变剂(电离辐射等)化学诱变剂(碱基类似物、脱氨剂、烷化剂、嵌入剂等)第十六张,PPT共九十三页,创作于2022年6月(1)(1)物理诱变剂物理诱变剂 紫外线 X射线和射线嘧啶二聚体嘧啶二聚体胸腺嘧啶胸腺嘧啶紫紫外外线
10、线:波波长长为为100400 nm的的电电磁磁辐辐射射,非非电电离离辐辐射射,直直接接作用于作用于DNA。X-射线和射线和-射线:射线:电离辐射电离辐射直接作用于直接作用于DNA,对,对DNA产生损伤产生损伤产生多种突变,产生多种突变,并且常常造成并且常常造成DNA重排,例如缺失、倒转和移位。重排,例如缺失、倒转和移位。作用于水分子以及其他分子产生离子和自由基,自由基作用于水分子以及其他分子产生离子和自由基,自由基对对DNA分子产生广泛损伤。分子产生广泛损伤。第十七张,PPT共九十三页,创作于2022年6月(2)(2)化学诱变剂化学诱变剂 1 1碱基类似物:碱基类似物:与碱基结构类似,可替代正
11、常碱基掺入与碱基结构类似,可替代正常碱基掺入DNADNA分子,分子,引起碱基替换。引起碱基替换。如如5-5-溴尿嘧啶(溴尿嘧啶(BUBU)是胸腺嘧啶)是胸腺嘧啶T T的类似物,可掺的类似物,可掺入入DNADNA分子中。分子中。酮式酮式BUBU与与A A配对,而烯醇式与配对,而烯醇式与G G配对配对容易引起容易引起G-CG-C对与对与A-TA-T对的互相转换。对的互相转换。碱基类似物还有碱基类似物还有5-溴脱氧尿苷(溴脱氧尿苷(BrdU),),5-尿嘧啶尿嘧啶,5-氯尿嘧啶及氯尿嘧啶及其脱氧核苷其脱氧核苷,2-氨基嘌呤(氨基嘌呤(2-AP)等等第十八张,PPT共九十三页,创作于2022年6月AG
12、CTTCCTATCGAAGGATAGCTBCCTATCGAAGGAT1.Base analog incorporationAGCTBCCTATCGAGGGATAGCTTCCTATCGAAGGAT2.1st round 3.of replicationAGCTBCCTATCGAAGGATAGCTCCCTATCGAGGGAT3.2nd round 4.of replicationATGC transition第十九张,PPT共九十三页,创作于2022年6月2.2.脱氨剂脱氨剂(Deamination agents(Deamination agents)除去碱基上的氨基,改变其配对性质第二十张,PP
13、T共九十三页,创作于2022年6月3.3.烷化剂烷化剂(Alkylating (Alkylating)使使DNADNA中的碱基发生烷化作用,引起特异性错配,或脱嘌呤。中的碱基发生烷化作用,引起特异性错配,或脱嘌呤。包包括括芥芥子子气气,甲甲磺磺酸酸已已酯酯(EMSEMS),亚亚硝硝基基胍胍(NG)(NG)等等。如如EMS,EMS,使使G G的的N N位位置置带带有有已已基基(已已烷烷化化),成成为为7-7-已已基基鸟鸟嘌嘌呤呤,不不与与C C配配对对而而与与T T配配对对,使使G-CG-C转换成转换成A-TA-T。第二十一张,PPT共九十三页,创作于2022年6月4.4.嵌入剂(嵌入剂(int
14、ercalating agentsintercalating agents)吖吖啶啶类类化化合合物物是是一一种种平平面面三三环环分分子子,其其大大小小和和形形状状与与一一个个碱碱基基对对相相似似,插插入入DNADNA分分子子中中两两个个相相邻邻的的碱碱基基之之间间,使使得得原原来来相相邻邻的的碱碱基基对对分分开开一一定定的的距距离离,致致使使DNADNA在在复复制制时时增增加加或或缺缺失失一个碱基,造成移码突变。一个碱基,造成移码突变。吖啶橙(acridine orange)、原黄素(proflavine)和溴化乙啶(ethidium bromide)第二十二张,PPT共九十三页,创作于202
15、2年6月黄曲霉素黄曲霉素B1(AFB1)B1(AFB1):霉变的花生等食物霉变的花生等食物中含有大量的中含有大量的AFB1 AFB1,AFB1AFB1是一种强致癌剂。是一种强致癌剂。可在可在G G的的N-TN-T位形成一个加成复合物即产生位形成一个加成复合物即产生无嘌呤位点,使无嘌呤位点,使GCGC颠换为颠换为T-AT-A,引起基因突,引起基因突变。可导致肝癌。变。可导致肝癌。第二十三张,PPT共九十三页,创作于2022年6月二、正向突变、回复突变与突变的校正二、正向突变、回复突变与突变的校正正向突变(正向突变(forward mutationforward mutation):):改变了野生
16、型性状的突变,使性状由野生型变为突变型。回复突变(回复突变(reverse mutationreverse mutation):):使突变型性状恢复到野生型性状的突变。大多数回复突变都发生在另一位点。因此,这样的突变并未大多数回复突变都发生在另一位点。因此,这样的突变并未恢复野生型的序列,只是其表型被抑制了。第二点突变可以恢复野生型的序列,只是其表型被抑制了。第二点突变可以发生在同一基因上,也可以发生在不同的基因上,前者称为发生在同一基因上,也可以发生在不同的基因上,前者称为基因内抑制基因内抑制,后者称为,后者称为基因间抑制。基因间抑制。第二十四张,PPT共九十三页,创作于2022年6月1.1
17、.基因内抑制基因内抑制氨基酸上所带的电荷影响蛋白质构象第二十五张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第二十六张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第二十七张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第二十八张,PPT共九十三页,创作于2022年6月氨基酸侧链的大小影响构象氨基酸侧链的大小影响构象第二十九张,PPT共九十三页,创作于2022年6月2基因间抑制如:无义突变的表型可如:无义突变的表型可被被tRNAtRNA基因的突变所抑基因的突变所抑制制基因间抑制常发生在tRNA或tRNA功能相关基因上。第三十张,PPT共九十三页,创作于2022年6月AGAUCUArgGlyGGACCUUCUG
18、lyCCUGly错义抑制突变错义抑制突变(Missense suppressor)Gly第三十一张,PPT共九十三页,创作于2022年6月基因间移码抑制突变基因内和基因间的错义(无义)、移码抑制突变均基因内和基因间的错义(无义)、移码抑制突变均 由相应的错义(无义)、移码突变抑制由相应的错义(无义)、移码突变抑制第三十二张,PPT共九十三页,创作于2022年6月突变热点突变热点(hot spot),突变可以发生在基因组中的任一位点。但是在基因组中,也存在一些位突变可以发生在基因组中的任一位点。但是在基因组中,也存在一些位点,这些位点发生突变的几率比随机分布所估计的要高出许多,可能是预点,这些位
19、点发生突变的几率比随机分布所估计的要高出许多,可能是预期的期的1010倍或倍或100100倍,这些位点被称为突变热点,发生在热点上的突变常常倍,这些位点被称为突变热点,发生在热点上的突变常常是相同的。是相同的。大多数突变热点是大多数突变热点是DNA分子中的分子中的5甲基胞嘧啶位点。甲基胞嘧啶位点。第三十三张,PPT共九十三页,创作于2022年6月5mC处的突变率明显高于其它碱基处第三十四张,PPT共九十三页,创作于2022年6月增变基因(mutator gene):突变后可使整个基因组中的突变率明显上升的基因。增变基因大多与DNA复制或修复有关。第三十五张,PPT共九十三页,创作于2022年6
20、月一系列物理或化学因素可以对一系列物理或化学因素可以对DNADNA造成化学损伤。这些因素造成化学损伤。这些因素包括化学诱变剂、辐射以及包括化学诱变剂、辐射以及DNADNA分子自发的化学反应等。有分子自发的化学反应等。有些类型的些类型的DNADNA损伤,如胸腺嘧啶二聚体或损伤,如胸腺嘧啶二聚体或DNADNA骨架的断裂,骨架的断裂,使得使得DNADNA不能再作为复制和转录的模板。不能再作为复制和转录的模板。第二节第二节 DNA DNA的修复的修复第三十六张,PPT共九十三页,创作于2022年6月另一些损伤产生了改变了的碱基,它们不会阻止复制和另一些损伤产生了改变了的碱基,它们不会阻止复制和转录的进
21、行,但是可引起错配,在下一轮复制之后导致转录的进行,但是可引起错配,在下一轮复制之后导致DNADNA序列的永久改变。例如,胞嘧啶通过脱氨作用转化序列的永久改变。例如,胞嘧啶通过脱氨作用转化为尿嘧啶,产生为尿嘧啶,产生UGUG错配,在下一轮复制之后,一条子错配,在下一轮复制之后,一条子代代DNADNA分子上的分子上的C C G G被被 T T A A所取代。细胞在进化过程中,所取代。细胞在进化过程中,形成了多种修复机制,以保证在损伤阻遏复制或者产生突形成了多种修复机制,以保证在损伤阻遏复制或者产生突变之前就识别并修复损伤。变之前就识别并修复损伤。第三十七张,PPT共九十三页,创作于2022年6月
22、一、光一、光 复复 活(活(Photoreactivation Photoreactivation)在可见光存在的情况下,在可见光存在的情况下,DNADNA光解酶(光解酶(DNA photolyaseDNA photolyase)把环)把环丁烷嘧啶二聚体分解为单体。丁烷嘧啶二聚体分解为单体。DNADNA光解酶光解酶,又称光复活酶又称光复活酶(photoreactivating enzymephotoreactivating enzyme)。光解酶在暗中结合到环丁烷)。光解酶在暗中结合到环丁烷二聚体上,吸收二聚体上,吸收300300350 nm350 nm的光后被激活,裂解二聚体后与的光后被激活
23、,裂解二聚体后与DNADNA分子脱离。从光复活修复过程可以看出,光解酶不是将嘧分子脱离。从光复活修复过程可以看出,光解酶不是将嘧啶二聚体替换掉,而是将两个嘧啶环之间的非正常化学键切开,啶二聚体替换掉,而是将两个嘧啶环之间的非正常化学键切开,恢复到原来的形式。由于这种修复作用只在可见光下才可发生,恢复到原来的形式。由于这种修复作用只在可见光下才可发生,所以这种修复机制称为光复活。所以这种修复机制称为光复活。第三十八张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第三十九张,PPT共九十三页,创作于2022年6月二、烷基的转移二、烷基的转移 一一些些酶酶可可将将烷烷基基从从核核苷苷酸酸转转移移到到自自身
24、身的的多多肽肽链链上上,例例如如,在在人人类类细细胞胞中中发发现现有有一一种种 O O6 6-甲甲基基鸟鸟嘌嘌呤呤甲甲基基转转移移酶酶,能能直直接接 将将 D DN NA A 链链鸟鸟嘌嘌呤呤 O O6 6 位位上上的的甲甲基基移移到到蛋蛋白白质质的的半半胱胱氨氨酸酸残残基基上上而而修修复复损损伤伤的的 D DN NA A。第四十张,PPT共九十三页,创作于2022年6月第四十一张,PPT共九十三页,创作于2022年6月 核苷酸切除修复需要移去一段包括损伤在内的核苷核苷酸切除修复需要移去一段包括损伤在内的核苷酸序列,然后再通过酸序列,然后再通过DNADNA合成把余下的单链缺口填补合成把余下的单
25、链缺口填补上。它可以修复一系列损伤,包括环丁烷二聚体、上。它可以修复一系列损伤,包括环丁烷二聚体、6 64 4光产物和链间交联等引起的光产物和链间交联等引起的DNADNA变形(变形(major major distortiondistortion)。尽管这些损伤也可以通过途径进行修)。尽管这些损伤也可以通过途径进行修复,但复,但NERNER是它们的主要修复手段。其他能够引起是它们的主要修复手段。其他能够引起DNADNA产生显著变形的损伤也可以通过该途径进行修复。但产生显著变形的损伤也可以通过该途径进行修复。但是,这种机制不能修复是,这种机制不能修复DNADNA上的错配碱基,以及仅造上的错配碱基
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- 突变 修复 重组
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