重组DNA技术和基因工程PPT课件.ppt
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1、关于重组关于重组关于重组关于重组DNADNA技术与基技术与基技术与基技术与基因工程因工程因工程因工程第一张,PPT共五十六页,创作于2022年6月A 酵母作为表达外源基因受体的特征6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达 酵母(酵母(YeastYeast)是一群以是一群以芽 殖芽 殖或或裂 殖裂 殖方式进行方式进行无性繁殖无性繁殖的单细胞的单细胞半知菌类半知菌类(半知酵母半知酵母),共由),共由5656个属、个属、500500多个种组成。如果说大肠多个种组成。如果说大肠杆 菌 是 外 源 基 因 最 成 熟 的 原 核 生 物 表 达 系 统,则 酵 母 菌 是 最 成 熟 的 真
2、杆 菌 是 外 源 基 因 最 成 熟 的 原 核 生 物 表 达 系 统,则 酵 母 菌 是 最 成 熟 的 真核生物表达系统。核生物表达系统。酵母的分类学特征酵母的分类学特征真 核 生 物真 核 生 物,分 属 于,分 属 于子 囊 菌 纲子 囊 菌 纲(子囊酵母)、(子囊酵母)、担 子 菌 纲担 子 菌 纲(担子酵母(担子酵母)、)、第二张,PPT共五十六页,创作于2022年6月A 酵母作为表达外源基因受体的特征6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达酵母表达外源基因的优势酵母表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便全基因组测序,基因表达调控机理
3、比较清楚,遗传操作简便能将外源基因表达产物分泌至培养基中能将外源基因表达产物分泌至培养基中具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDAFDA认定为安全的认定为安全的基因工程受体系统(基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRASGenerally Recognized As Safe GRAS)酵母菌是最简单的真核模式生物酵母菌是最简单的真核
4、模式生物第三张,PPT共五十六页,创作于2022年6月B 酵母的宿主系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达提高重组蛋白表达产率的突变宿主提高重组蛋白表达产率的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主第四张,PPT共五十六页,创作于2022年6月广泛用于外源基因表达的酵母宿主广泛用于外源基因表达的酵母宿主目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母包括:目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母包括:酵母属酵母属 如如酿酒酵母酿酒酵母(S
5、accharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiae)克鲁维酵母属克鲁维酵母属 如乳酸克鲁维酵母(如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactisKluyveromyces lactis)毕赤酵母属毕赤酵母属 如如巴斯德毕赤酵母巴斯德毕赤酵母(Pichia pastorisPichia pastoris)裂殖酵母属裂殖酵母属 如非洲酒裂殖酵母(如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombeSchizosaccharomyces pombe)汉逊酵母属汉逊酵母属 如多态汉逊酵母(如多态汉逊酵母(Hansenula poly
6、morphaHansenula polymorpha)其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母表达外源基因最理想。表达外源基因最理想。第五张,PPT共五十六页,创作于2022年6月提高重组蛋白表达产率的突变宿主提高重组蛋白表达产率的突变宿主能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型:能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型:sscssc1 1sscssc2 2rgrrgr1 1oseose1 1sscssc1111 rhorho-突变类型突变类型生物效应生物效应作用位点作用位点改善重组蛋白
7、分泌改善重组蛋白分泌钙离子依赖型的钙离子依赖型的ATPATP酶酶提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达转录后加工转录后加工转录水平转录水平提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达转录水平转录水平提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达改善重组蛋白分泌改善重组蛋白分泌羧肽酶羧肽酶YY转录水平转录水平提高重组蛋白表达提高重组蛋白表达第六张,PPT共五十六页,创作于2022年6月抑制超糖基化作用的突变宿主抑制超糖基化作用的突变宿主能抑制超糖基化的突变类型能抑制超糖基化的突变类型mnnmnnalgalgochoch突变类型突变类型生物效应生物效应 许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们许多真核生物的蛋白
8、质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由常常影响蛋白质的生物活性。整个糖单位由糖基核心糖基核心和和外侧糖链外侧糖链两部分两部分组成。组成。酵母菌普遍拥有蛋白酵母菌普遍拥有蛋白质的糖基化系统,但野生质的糖基化系统,但野生型酿酒酵母对异源蛋白的型酿酒酵母对异源蛋白的糖基化反应很难控制,呈糖基化反应很难控制,呈超糖基化倾向,因此超糖超糖基化倾向,因此超糖基化缺陷株非常重要。基化缺陷株非常重要。甘露糖生物合成缺陷型甘露糖生物合成缺陷型天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型外侧糖链添加缺陷型外侧糖链添加缺陷型第七张,PPT共五十六页,创作于2022年6
9、月减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主泛素介导的蛋白质降解作用泛素介导的蛋白质降解作用蛋白酶体蛋白酶体LysLysHOOCUbiquitin 76 aaUbiquitin 76 aa ubiquitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLysubiquitin ligase E3ubiquitin ligase E3 LysLys靶蛋白靶蛋白靶蛋白第八张,PPT共五十六页,创作于2022年6月减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌泛素依赖型蛋白降解系
10、统的编码基因酵母菌共有四个泛素编码基因:酵母菌共有四个泛素编码基因:UBI UBI 1 1 编码泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 2 2 编码泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白5252(CEP52CEP52)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 3 3 编码泛素编码泛素-羧基延伸蛋白羧基延伸蛋白7676(CEP76CEP76)对数生长期表达对数生长期表达 稳定期关闭稳定期关闭UBI UBI 4 4 编码泛素五聚体编码泛素五聚体 对数生长期关闭对数生长期关闭 稳定
11、期表达稳定期表达酵母菌共有七个泛素连接酶基因:酵母菌共有七个泛素连接酶基因:UBC UBC 11、UBC UBC 22、UBC UBC 33、UBC UBC 44、UBC UBC 55、UBC UBC 66、UBC UBC 77第九张,PPT共五十六页,创作于2022年6月减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主泛素降解途径衰减的酿酒酵母泛素降解途径衰减的酿酒酵母在酿酒酵母菌中,泛素主要由在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI UBI 4 4基因表达,基因表达,UBI UBI 4 4-突变株能突变株能UBI UBI 4 4缺陷型:缺陷型:正常生长,但细胞内游离泛素分子
12、的浓度比野生株要低得多,正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,因此因此UBI UBI 4 4缺陷突变株是外源基因表达理想的受体。缺陷突变株是外源基因表达理想的受体。UBA UBA 1 1缺陷型:缺陷型:UBAUBA1 1编码泛素激活酶编码泛素激活酶E1E1,UBAUBA1 1突变株是致死性的,但其等位突变株是致死性的,但其等位基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解。基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解。Ubc4 Ubc4-ubc5 ubc5 双突变型:双突变型:七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效。七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降
13、解作用同样有效。第十张,PPT共五十六页,创作于2022年6月C 酵母的载体系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建酵母中的野生型质粒酵母中的野生型质粒第十一张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母中的野生型质粒酵母中的野生型质粒酿酒酵母中的酿酒酵母中的2 2m m环状质粒环状质粒几乎所有的酿酒酵母中都含有几乎所有的酿酒酵母中都含有22mm双链双链同源重组同源重组REP1REP1RAFRAFSTBSTBorioriREP2REP2FLPFLPIRIRIRIRAABB环状质粒,拷贝数达环状质粒,拷贝数达5050至至100100个。
14、个。IRs IRs 反向重复序列,反向重复序列,600 600 bpbp,重组重组FLPFLP 编码产物驱动编码产物驱动IRsIRs的同源重组的同源重组REPREP 编码产物控制质粒的稳定性编码产物控制质粒的稳定性STBSTB REPREP的结合位点的结合位点接合酵母属中的接合酵母属中的pSR1pSR1和和pSB1pSB1,以及以及克鲁维酵母属中的克鲁维酵母属中的pKD1pKD1等均与等均与22mm质质粒类似。粒类似。第十二张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有含有ARSARS的的YRpYRp质粒的构建质粒的构建 ARSARS为酵母菌中的自主
15、复制序列,为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.50.8-1.5kbkb,染色体上每染色体上每30-4030-40kbkb就有一个就有一个ARSARS元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒DNADNA。以以ARSARS为复制子的质粒称为为复制子的质粒称为YRpYRp 上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达200200个,但培养几代个,但培养几代 以以2 2m m质粒上的复制元件为复制子的质粒称为质粒上的复制元件为复制子的质粒
16、称为YEpYEp后,质粒的丢失率高达后,质粒的丢失率高达50%-70%50%-70%,主要是由于分配不均匀所致。,主要是由于分配不均匀所致。第十三张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有含有CENCEN的的YCpYCp质粒的构建质粒的构建 CENCEN为酵母菌染色体为酵母菌染色体DNADNA上与染色体均匀分配有关的序列上与染色体均匀分配有关的序列 将将CEN CEN DNADNA插入含插入含ARSARS的质粒中,获得的新载体称为的质粒中,获得的新载体称为YCpYCp YCp YCp质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有质粒具有较高的有丝分裂
17、稳定性,但拷贝数只有1-51-5个个含有含有TELTEL的的YACYAC质粒的构建质粒的构建第十四张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母克隆表达质粒的构建酵母克隆表达质粒的构建含有酵母菌染色体含有酵母菌染色体DNADNA同源序列的同源序列的YIpYIp质粒的构建质粒的构建 在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体DNADNA特定序列和标记基因,构特定序列和标记基因,构建 出 来 的 质 粒 称 为建 出 来 的 质 粒 称 为YipYip。目 的 基 因 表 达 盒 通 常 插 在 染 色 体目 的 基 因 表 达 盒 通 常 插 在 染 色 体D N AD N
18、 A特 定 序 列特 定 序 列中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体DNADNA区域。区域。第十五张,PPT共五十六页,创作于2022年6月D 酵母的转化系统6 6 外源基因在酵母中的表达外源基因在酵母中的表达转化质粒在酵母细胞中的命运转化质粒在酵母细胞中的命运酵母菌的转化程序酵母菌的转化程序用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因第十六张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母的转化程序酵母的转化程序酵母原生质体转化法酵母原生质体转化法 早期酵母菌的转化都采用在等渗缓冲液中稳定的原生质体转化法早期酵母菌的转化都采用在等渗
19、缓冲液中稳定的原生质体转化法在在CaCa2+2+和和PEGPEG的存在下,转化细胞可达原生质体总数的的存在下,转化细胞可达原生质体总数的1-2%1-2%。但该程。但该程序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约。序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约。原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细胞可同时接纳多原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细胞可同时接纳多个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的25-33%25-33%。第十七张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母的转化程序酵母的转化程序碱金属离子
20、介导的酵母完整细胞的转化碱金属离子介导的酵母完整细胞的转化 酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如LiLi+等)、等)、PEGPEG、热 休 克 处热 休 克 处理后,也可高效吸收质粒理后,也可高效吸收质粒DNADNA,而且具有下列特性:而且具有下列特性:吸收线型吸收线型DNADNA的能力明显大于环状的能力明显大于环状DNADNA,两者相差两者相差8080倍倍共转化现象极为罕见共转化现象极为罕见第十八张,PPT共五十六页,创作于2022年6月酵母的转化程序酵母的转化程序酵母电击转化法酵母电击转化法 酵母菌原生质体和完整细胞均可在电击条件下吸收质粒酵母菌原生质体和完
21、整细胞均可在电击条件下吸收质粒DNADNA,但但在 此 过 程 中 应 避 免 使 用在 此 过 程 中 应 避 免 使 用P E GP E G,它 对 受 电 击 的 细 胞 具 有 较 很 大 的 负 作 用它 对 受 电 击 的 细 胞 具 有 较 很 大 的 负 作 用电 击 转 化 的 优 点 是 不 依 赖 于 受 体 细 胞 的 遗 传 特 征 及 培 养 条 件 适 用 范 围电 击 转 化 的 优 点 是 不 依 赖 于 受 体 细 胞 的 遗 传 特 征 及 培 养 条 件 适 用 范 围广,而且转化率可高达广,而且转化率可高达10105 5/m mg DNAg DNA。第
22、十九张,PPT共五十六页,创作于2022年6月转化质粒在酵母细胞中的命运转化质粒在酵母细胞中的命运单双链单双链DNADNA均可转化酵母菌,但单链的转化率是双链的均可转化酵母菌,但单链的转化率是双链的10-3010-30倍;倍;含有复制子的单链质粒进入细胞后,能准确地转化为双链并复制;含有复制子的单链质粒进入细胞后,能准确地转化为双链并复制;不 含 复 制 子 的 单 链 质 粒 进 入 细 胞 后,能 高 效 地 同 源 整 合 入 染 色 体不 含 复 制 子 的 单 链 质 粒 进 入 细 胞 后,能 高 效 地 同 源 整 合 入 染 色 体这对于体内定点突变酵母基因组极为有利;这对于体
23、内定点突变酵母基因组极为有利;克 隆 在克 隆 在YIpYIp整合型质粒上的外源基因,如果含有受体细胞的染色体整合型质粒上的外源基因,如果含有受体细胞的染色体D N AD N A的 同 源 序 列,会 发 生 高 频 同 源 整 合,整 合 子 占 转 化 子 总 数 的的 同 源 序 列,会 发 生 高 频 同 源 整 合,整 合 子 占 转 化 子 总 数 的50-80%50-80%。第二十张,PPT共五十六页,创作于2022年6月用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因 用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要有有营 养 缺 陷 型营 养 缺 陷 型互
24、 补 基 因 和互 补 基 因 和显性基因显性基因两大类:两大类:营养缺陷型互补基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如:营养缺陷型互补基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如:LEULEU、TRPTRP、HISHIS、LYSLYS、URAURA、ADEADE 但对于多倍体酵母来说,筛选营养缺陷型的受体非常困难。但对于多倍体酵母来说,筛选营养缺陷型的受体非常困难。营养缺陷型的互补基因营养缺陷型的互补基因第二十一张,PPT共五十六页,创作于2022年6月用于转化子筛选的标记基因用于转化子筛选的标记基因 显性标记基因显性标记基因 显性标记基因的编码产物大都是毒性物质的抗性蛋白显性标记基因的编码产物
25、大都是毒性物质的抗性蛋白 aph aph 氨基糖苷转移酶氨基糖苷转移酶 抗抗G418G418 cat cat 氯霉素乙酰转移酶氯霉素乙酰转移酶 抗氯霉素抗氯霉素 dhfr dhfr 二氢叶酸还原酶二氢叶酸还原酶 抗氨甲喋呤和磺胺抗氨甲喋呤和磺胺 cup1 cup1 铜离子螯合物铜离子螯合物 耐受铜离子耐受铜离子 suc2 suc2 蔗糖转化酶蔗糖转化酶 耐受高浓度蔗糖耐受高浓度蔗糖 ilv2 ilv2 乙酰乳糖合成酶乙酰乳糖合成酶 抗硫酰脲除草剂抗硫酰脲除草剂标记基因标记基因编码产物编码产物遗传表型遗传表型第二十二张,PPT共五十六页,创作于2022年6月E 酵母的表达系统6 6 外源基因在酵
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