DNA的粗提取与鉴定PCR蛋白质的提取与分离.pptx
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1、二、方法与过程 1.1.制鸡血细胞液(活鸡鲜血经分离或沉淀获得)0.1g/mL柠檬酸钠柠檬酸钠100mL活鸡鲜血活鸡鲜血180mL500mL烧杯中,玻棒烧杯中,玻棒搅拌搅拌,离心、分离或静置沉淀。离心、分离或静置沉淀。2.提取提取DNA。取血细胞取血细胞5-10mL20mL蒸馏水蒸馏水,用玻棒沿一个方向,用玻棒沿一个方向快速搅拌快速搅拌。纱布纱布过滤过滤:滤液中含:滤液中含DNA和其他核物质,如蛋白质。和其他核物质,如蛋白质。原理:血细胞的细胞膜、核膜吸水胀破,玻璃棒原理:血细胞的细胞膜、核膜吸水胀破,玻璃棒快速快速搅拌搅拌,机械加速血细胞破裂。,机械加速血细胞破裂。.提取提取血血细胞核物质:
2、细胞核物质:.溶解核内的溶解核内的DNA:滤液滤液2mol/L的的NaCl溶液溶液40mL,玻棒沿一个方向,玻棒沿一个方向轻缓搅拌轻缓搅拌。第1页/共51页.析出析出含含DNA的粘稠物:的粘稠物:.滤取含滤取含DNA的粘稠物:的粘稠物:.DNA粘稠物的再溶解:粘稠物的再溶解:在上述溶液中缓缓加入在上述溶液中缓缓加入蒸馏水蒸馏水,并沿一个方向,并沿一个方向轻轻轻搅拌轻搅拌,出现丝状物;当丝状物不在增加时,停止加,出现丝状物;当丝状物不在增加时,停止加水(此时水(此时NaCl溶液的浓度相当于溶液的浓度相当于0.14mol/L)。)。用多层纱布用多层纱布过滤过滤,含,含DNA的粘稠物留在纱布上。的粘
3、稠物留在纱布上。20mL2mol/L的的NaCl溶液溶液步骤步骤含含DNA的粘稠物的粘稠物在20mL烧杯中烧杯中轻缓搅拌轻缓搅拌3min,使尽可能多的,使尽可能多的DNA溶解在溶解在NaCl溶液溶液。.过滤含有过滤含有DNA的的NaCl溶液:溶液:用放有两层纱布的漏斗用放有两层纱布的漏斗过滤过滤步骤步骤所得的溶液,所得的溶液,滤液中含有滤液中含有DNA。第2页/共51页.提取含有杂质较少的提取含有杂质较少的DNA:步骤步骤所得的滤液体积分数为所得的滤液体积分数为95%的冷却酒精的冷却酒精50mL,用玻棒沿一个方向,用玻棒沿一个方向轻缓搅拌轻缓搅拌,溶液中(,溶液中(析出析出)出现乳白色丝状物,
4、用玻棒将丝状物卷起,并用滤纸吸出现乳白色丝状物,用玻棒将丝状物卷起,并用滤纸吸取上面的水分。取上面的水分。3.DNA的鉴定:的鉴定:加入二苯胺试剂加入二苯胺试剂4mL,用玻棒,用玻棒搅拌搅拌使使DNA溶解,溶解,沸水浴沸水浴5min,观察溶液是否出现浅蓝色。,观察溶液是否出现浅蓝色。1.共有共有“三次过滤,两次析出,七次搅拌三次过滤,两次析出,七次搅拌”2.加加入入“两两次次蒸蒸馏馏水水,三三次次NaCl溶液,一一次次酒酒精精”三、实验小结三、实验小结第3页/共51页四、实验原理拓展介绍。1.DNA的释放。的释放。DNA主要在鸡血细胞的细胞核内,正常情况下不会主要在鸡血细胞的细胞核内,正常情况
5、下不会释放出来,蒸馏水对于鸡血细胞是一种低渗液,水分可释放出来,蒸馏水对于鸡血细胞是一种低渗液,水分可以大量进入血细胞,使之胀破,同时加上玻璃棒快速搅以大量进入血细胞,使之胀破,同时加上玻璃棒快速搅拌的机械作用,加速血细胞的细胞膜和核膜的破裂。但拌的机械作用,加速血细胞的细胞膜和核膜的破裂。但释放出来的大量释放出来的大量DNA与与RNA、蛋白质结合在一起,即释、蛋白质结合在一起,即释放的不是纯净的放的不是纯净的DNA,常称为,常称为DNA核蛋白核蛋白。2.DNA与蛋白质分离。与蛋白质分离。在高浓度(在高浓度(2mol/L)的氯化钠溶液中,核蛋白易溶)的氯化钠溶液中,核蛋白易溶解,析出解,析出D
6、NA并溶解在高浓度的氯化钠溶液中并溶解在高浓度的氯化钠溶液中3.DNA的析出与获取。的析出与获取。因为因为DNA在低浓度(在低浓度(0.14mol/L)的氯化钠溶液中)的氯化钠溶液中溶解度小,而蛋白质的在其中的溶解度大溶解度小,而蛋白质的在其中的溶解度大。所以在向含。所以在向含DNA的高浓度的氯化钠溶液中加入大量蒸馏水稀释氯化的高浓度的氯化钠溶液中加入大量蒸馏水稀释氯化钠溶液,从而使钠溶液,从而使DNA溶解度下降,蛋白质溶解度增高。溶解度下降,蛋白质溶解度增高。第4页/共51页4.DNA的再溶解。的再溶解。用高浓度(用高浓度(2mol/L)的氯化钠溶液再溶解)的氯化钠溶液再溶解DNA粘稠物。粘
7、稠物。5.DNA的沉淀和浓缩。的沉淀和浓缩。对于除去了蛋白质的对于除去了蛋白质的DNADNA的氯化钠溶液,必须再进的氯化钠溶液,必须再进一步沉淀和浓缩,常用一步沉淀和浓缩,常用酒精沉淀法酒精沉淀法。即往。即往含有含有NaNa的的DNADNA溶液,加入体积分数为溶液,加入体积分数为95%95%的冷却酒精,混匀后可以的冷却酒精,混匀后可以使使DNADNA沉淀、浓缩,形成含杂质较少的沉淀、浓缩,形成含杂质较少的DNADNA丝状物丝状物,悬浮,悬浮于溶液中。若丝状物较少,可将混合液再放入冰箱中冷于溶液中。若丝状物较少,可将混合液再放入冰箱中冷却几分钟即可。浓缩后的却几分钟即可。浓缩后的DNADNA丝状
8、物可以用玻棒(玻棒丝状物可以用玻棒(玻棒有吸附有吸附DNADNA的作用)缓缓旋转的方法卷起。的作用)缓缓旋转的方法卷起。6.DNA的鉴定。的鉴定。100DNA二苯胺二苯胺 蓝色物蓝色物鉴定时蓝色的深浅与溶液中鉴定时蓝色的深浅与溶液中DNA的含量多少有关。的含量多少有关。第5页/共51页方法步骤 加入物质 目的 1.制备鸡血细胞液 柠檬酸钠溶液 2.提取鸡血细胞细胞核物质 20 m1蒸馏水 3.溶解细胞核内的DNA 2 m1L 的NaCI溶液40mL 4.析出含DNA的黏稠物 蒸馏水 5.滤取含DNA的黏稠物 6.将DNA的黏稠物再溶解 2 molL 的NaCl溶液20 mL 7.过滤含DNA的
9、NaCl 溶液 8.提取含有杂质较少的 DNA 冷却的95的酒精50 mL A:(1)向试管中加入0.015 molL 的NaCl溶液5mL(2)加入DNA(3)4 mL二苯胺试剂 9.DNA的鉴定 B:(1)向试管中加入0.015molL 的NaCl溶液5mL(2)4 mL 二苯胺试剂 第6页/共51页加入柠檬酸钠溶液的目的是防止血凝固加速血细胞破裂 溶解DNA 使2mol/L的NaCl溶液稀释至0.14mol/L使得DNA最大限度地释出 使含DNA的黏稠物被留在纱布上使含DNA的黏稠物尽可能多的溶解于溶液中除去含DNA的滤液中的杂质提取DNA A出现蓝色 B无变化第7页/共51页2.实验中
10、NaCl的物质的量浓度为2 molL和0.14 molL对DNA有何影响?1.在DNA的粗提取实验过程中,两次向烧杯中加入蒸馏水的作用是()。A.稀释血液、冲洗样品B.使血细胞破裂、降低NaCl浓度使DNA析出C.使血细胞破裂、增大DNA溶解量 D.使血细胞破裂、提取含杂质较少的DNA答:B答:前者是溶解DNA,后者是使DNA析出第8页/共51页3.DNA3.DNA遇二苯胺(沸水浴)会染成()()A.A.砖红色 B.B.橘黄色 C.C.紫色 D.D.蓝色4.提取鸡血中的DNA时,为什么要除去血液中的上清液?答:DNA的提取,关键是对杂质的去除,由于上清液是血液中的血浆部分,不含DNA,所以要除
11、去上清液(含有蛋白质)。答:D第9页/共51页(一)PCR原理体内DNA复制:模板DNA原料:dNTP酶:解旋酶、DNA pol.起始引物、合成方向合成环境第10页/共51页解链模板变性引物-起始引物-模板复性子链延伸子链延伸(一)PCR原理第11页/共51页结果分析与评价此为紫外光吸收检测的结果检验法,实践中很少用;普遍采用琼脂糖凝胶电泳法检验PCR结果第12页/共51页Fig.7.23DenatureAnneal PCR PrimersExtend PCR Primersw/TaqRepeat第13页/共51页多聚酶链式反应(PCR)扩增DNA片段 第14页/共51页一、实验目的 了解PC
12、R的基本原理,学习PCR的基本操作技术。第15页/共51页二、实验原理 多聚酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法。典型的PCR由高温变性、低温退火和适温延伸三步反应组成一个循环周期,通过多次循环反应,使目的DNA得以迅速扩增。其原理如下:将待扩增的DNA置于高温下使之解链,人工合成的两个寡核苷酸引物在低温下分别与目的片段两侧的两条链互补结合;DNA聚合酶在72将单核苷酸从引物的3端开始掺入,沿模板53端方向延伸,合成DNA的新互补链。反复进行这种变性、退火和延伸反应循环,可使两引物限定范围内的DNA序列以指数形式扩增
13、。循环的次数主要取决于模板的浓度,从理论上讲一个模板DNA分子经20次循环扩增后可达106。第16页/共51页PCRPCR的基本原理的基本原理 变性、复性、半保留复制变性、复性、半保留复制一生二,二生四,四生万物一生二,二生四,四生万物 PCR PCR三步曲三步曲变性变性 90909797退火退火 45456565延伸延伸 7272左右左右PCRPCR过程过程第17页/共51页(二)PCR的反应过程变性-复性-延伸多重循环(n)模板以2En扩增短片段以指数式扩增长片段以线性式扩增最终主产物片段长度在P1-P2之间第18页/共51页PCR技术广泛应用于分子生物学等各个领域。它既可用于基因的分离、
14、克隆和核苷酸序列分析,又可用于突变体和重组体的构建、基因表达调控和研究、基因多态性的分析、遗传病和传染病的诊断、肿瘤机制的探索及医学鉴定等多方面,也被广泛运用于刑侦物证鉴定、亲子鉴定及古分子系统学研究等其他领域。第19页/共51页第20页/共51页 本课题学习目标 体验从复杂体系中提取生物大分子的基本过程和方法,并了解色谱法、电泳法等分离生物大分子的基本原理。1 1、主要概念:、主要概念:凝胶色谱法 电泳法 缓冲溶液 它们在血红蛋白的提取中分别起到什么作用。2.2.主要原理:主要原理:凝胶色谱法分离蛋白质的原理 电泳法分离样品的原理 缓冲溶液的组成和作用机理3 3、课题重点:、课题重点:凝胶色
15、谱法的原理和方法 4 4、课题难点:、课题难点:样品的预处理 色谱柱填料的处理和色谱柱的装填。第21页/共51页 20032003年年4 4月月1414日宣布人类基因组序列图完成,这标志着进入了后基因组和蛋白日宣布人类基因组序列图完成,这标志着进入了后基因组和蛋白质组时代质组时代人类基因组:人类基因组:指指DNADNA分子所携带的全部遗传信息分子所携带的全部遗传信息 蛋白质组:蛋白质组:生物个体表达的蛋白质分子的总和。主要是对蛋白质功能的研究生物个体表达的蛋白质分子的总和。主要是对蛋白质功能的研究第22页/共51页血液血液血浆血浆水水 分分固体物质:固体物质:血浆蛋白、无机盐、磷脂、葡萄糖等血
16、浆蛋白、无机盐、磷脂、葡萄糖等血细血细 胞胞白细胞白细胞血小板血小板红细胞红细胞(最多)(最多)血红蛋白血红蛋白(9090)两个两个肽链肽链两个两个一肽链一肽链四个亚铁红素基团四个亚铁红素基团2.2.提问:提问:血液有哪些成分?血液有哪些成分?1.1.提问:提问:用鸡的红细胞提取用鸡的红细胞提取DNADNA,用人的红细胞提取血红蛋白的原因是什么?,用人的红细胞提取血红蛋白的原因是什么?鸡的红细胞具有细胞核,含有鸡的红细胞具有细胞核,含有DNADNA,便于进行,便于进行DNADNA的提取;人的红细胞无细的提取;人的红细胞无细胞核,结构简单,血红蛋白含量丰富,便于提取血红蛋白。胞核,结构简单,血红
17、蛋白含量丰富,便于提取血红蛋白。血红蛋白血红蛋白第23页/共51页血红蛋白血红蛋白两个两个肽链肽链两个两个一肽链一肽链四个亚铁红素基团四个亚铁红素基团每个肽链环绕一个亚铁血红素基团,此基团可携带一分子氧或一分子二氧化碳,血红蛋白因含有血红素而呈红色。血红蛋白的特点:血红蛋白的特点:第24页/共51页1.分离生物大分子的基本思路:选用一定的物理或化学的方法分离具有不同物理或化学性质的生物大分子。2.蛋白质分离和提取的原理:根据蛋白质各种特性的差异,如分子的形状和大小、所带电荷的性质和多少、溶解度、吸附性质和对其他分子的亲和力等等,可以用来分离不同种类的蛋白质。一、血红蛋白的提取和分离3.高温灭菌
18、和酒精灭菌的结果:使微生物的蛋白质发生变性、蛋白质的空间结构被破坏。第25页/共51页(一)凝胶色谱法(分配色谱法)2.凝胶:大多数凝胶是由多糖类化合物(如葡聚糖或琼脂糖)构成的多孔小球体,内部有许多贯穿的通道。根据被分离物质的蛋白质相对分子质量的大 小,利用具有网状结构的凝胶的分子筛作用,来进行分离。1.概念:3.凝胶色谱法的原理分子筛效应:当相对分子量不同的蛋白质通过凝胶时,相对分子量较小的蛋白质容易进入凝胶内部的通道,路程较长,移动速度较慢;而相对分子量较大的蛋白质无法进入凝胶内部的通道,只能在凝胶外部移动,路程较短,移动速度较快。相对分子质量不同的蛋白质分子因此得以分离。依据的特性是:
19、依据的特性是:蛋白质分子量的大小。蛋白质分子量的大小。第26页/共51页4.凝胶色谱法分离蛋白质的原理和具体过程第27页/共51页 (二)缓冲溶液 1.概念:在一定的范围内,凡是能够抵制外加少量强酸或强碱的影响使原来溶液PH值基本保持不变的混合溶液。能够抵制外界的酸和碱对溶液PH值的影响,维持PH基本不变。2.作用:3.缓冲溶液的配制:通常由12 种缓冲剂溶解于水中配制而成。调节缓冲剂的使用比例就可以制得在不同PH范围内使用的缓冲液。4.4.提问:在本课题中使用的缓冲液是提问:在本课题中使用的缓冲液是:_:_,其目的是其目的是:利用缓冲液模拟细胞内的PH环境,保证 血红蛋白的正常结构和功能,便
20、于观察(红色红色)和科 学研究(活性活性)磷酸缓冲液第28页/共51页 缓冲溶液的组成及分类弱酸及其对应的盐:弱碱及其对应的盐:多元弱酸的酸式盐及其对应的次级盐:H H2 2COCO3 3NaHCONaHCO3 3;CHCH3 3COOHCHCOOHCH3 3COONaCOONaNHNH3 3HH2 2ONHONH4 4CL;NHCL;NH4 4OHNHOHNH4 4CLCLNaHCONaHCO3 3NaNa2 2COCO3 3 ;NaHNaH2 2POPO4 4NaNa2 2HPOHPO4 4 缓冲溶液由足够浓度的共轭酸碱对组成。其中,能对抗外来强碱的称为共轭酸;能对抗外来强酸的称为共轭碱。
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- DNA 提取 鉴定 PCR 蛋白质 分离
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