分子生物学优秀PPT.ppt
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1、分子生物学第1页,本讲稿共158页第六章第六章 基因表达的调控(上)基因表达的调控(上)1原核生物基因表达调控原理原核生物基因表达调控原理 1.1 启动子与转录起始启动子与转录起始 1.1.1 启动子的基本结构启动子的基本结构1.1.2 启动子对转录起始的调节启动子对转录起始的调节1.1.3 增强子对转录起始的调节增强子对转录起始的调节1.1.4 因子对转录起始的调控因子对转录起始的调控1.1.5 环状腺苷酸受体蛋白对转录的调控环状腺苷酸受体蛋白对转录的调控第2页,本讲稿共158页1.2 操纵子调控模型操纵子调控模型1.2.1 操纵子基因表达调控的基本原理操纵子基因表达调控的基本原理1.2.1
2、.1 操纵子学说操纵子学说1.2.1.2 正调控与负调控正调控与负调控1.2.2 乳糖操纵子乳糖操纵子1.2.2.1 lac基因的诱导表达基因的诱导表达1.2.2.2 lac操纵子模型操纵子模型1.2.2.3 lac操纵子的正调控操纵子的正调控第3页,本讲稿共158页1.2.3 半乳糖操纵子半乳糖操纵子1.2.3.1 cAMP-CAP对对gal启动子的作用启动子的作用1.2.3.2 双启动子的生理功能双启动子的生理功能1.2.3.3 gal阻遏蛋白的作用阻遏蛋白的作用1.2.4 阿拉伯糖操纵子阿拉伯糖操纵子1.2.5 色氨酸操纵子色氨酸操纵子1.2.5.1 trp操纵子的阻遏系统操纵子的阻遏系
3、统1.2.5.2 弱化子的调控系统弱化子的调控系统第4页,本讲稿共158页1.2.6 噬菌体操纵子噬菌体操纵子 1.2.6.1 噬菌体的溶原和溶菌途径噬菌体的溶原和溶菌途径1.2.6.2 噬菌体的基因组及调控蛋白噬菌体的基因组及调控蛋白1.2.6.3 溶菌途径的建立溶菌途径的建立1.2.6.4 溶原途径的建立溶原途径的建立1.3 翻译水平的调控翻译水平的调控 1.3.1 稀有密码子对翻译的影响稀有密码子对翻译的影响 1.3.2 重叠基因对翻译的影响重叠基因对翻译的影响第5页,本讲稿共158页1.3.3 终止子对翻译的影响终止子对翻译的影响1.3.4 翻译的阻遏翻译的阻遏1.3.5 RNA高级结
4、构对翻译的影响高级结构对翻译的影响1.3.6 反义反义RNA对翻译的影响对翻译的影响1.3.7 魔斑核苷酸水平对翻译的影响魔斑核苷酸水平对翻译的影响第6页,本讲稿共158页第六章第六章 基因表达的调控基因表达的调控 n我我们们知知道道,所所有有生生物物的的遗遗传传信信息息都都是是以以基基因因的的形形式式储储藏藏在在DNA(或或RNA)分分子子中中的的。随随着着个个体体的的发发育育,DNA分分子子能能有有序序地地将将其其所所承承载载的的遗遗传传信信息息通通过过密密码码子子与与反反密密码码子子系系统统转转变变成成蛋蛋白白质质分分子子,执执行行各各种种生生理生化功能,完成生命的全过程。理生化功能,完
5、成生命的全过程。第7页,本讲稿共158页n我我们们把把从从DNA到到蛋蛋白白质质的的过过程程称称为为基基因因表表达达,对对这个过程的调节就称为基因表达调控。这个过程的调节就称为基因表达调控。n基基因因表表达达的的调调控控是是现现阶阶段段分分子子生生物物学学研研究究的的中中心心课课题题。要要了了解解动动、植植物物生生长长发发育育的的规规律律、形形态态结结构构特特征征和和生生物物学学功功能能,就就必必须须弄弄清清楚楚基基因因表表达达调调控控的的时时间和空间概念,掌握基因表达调控的秘密。间和空间概念,掌握基因表达调控的秘密。第8页,本讲稿共158页n原原核核生生物物和和单单细细胞胞真真核核生生物物直
6、直接接暴暴露露在在变变幻幻莫莫测测的的环环境境中中,食食物物供供应应毫毫无无保保障障,只只有有根根据据环环境境条条件件的的改改变变合合成成不不同同的的蛋蛋白白质质,使使代代谢谢过过程程适适应应环环境境的的变变化化,才才能能维维持持自自身身的的生生存存和和繁繁衍衍。高高等等真真核核生生物物代代谢谢途途经经和和食食物物来来源源比比较较稳稳定定,但但由由于于它它们们是是多多细细胞胞有有机机体体,在在个个体体发发育育过过程程中中出出现现细细胞胞分分化化,形形成成各各种种组组织织和和器器官官,而而不不同同的的细细胞胞所所合合成成的的蛋蛋白白质质在在质质和和量量上上是是不不同同的的,而而且且在在不不同同的
7、的发发育育过程中表达不同的基因,合成不同的蛋白质。过程中表达不同的基因,合成不同的蛋白质。第9页,本讲稿共158页n因因此此,不不论论是是原原核核生生物物还还是是真真核核生生物物都都有有一一套套准准确确的的调调节基因表达和蛋白质合成的机制。节基因表达和蛋白质合成的机制。n基基因因表表达达的的调调控控主主要要表表现现为为:转转录录水水平平上上的的调调控控;mRNA加加工工成成熟熟水水平平上上的的调调控控;翻翻译译水水平平上上的的调控等等。调控等等。第10页,本讲稿共158页n基基因因调调控控的的指指挥挥系系统统也也是是多多样样的的,不不同同的的生生物物使使用用不不同的信号来指挥基因调控。同的信号
8、来指挥基因调控。n原原核核生生物物中中,营营养养状状况况和和环环境境因因素素对对基基因因表表达达的的调调控控有着举足轻重的影响。有着举足轻重的影响。n真真核核生生物物尤尤其其是是高高等等真真核核生生物物中中,激激素素水水平平和和发发育育阶阶段段是是基基因因表表达达调调控控的的最最主主要要手手段段,营营养养和和环环境境因因素的影响力大为下降。素的影响力大为下降。第11页,本讲稿共158页n到到目目前前为为止止,原原核核生生物物基基因因表表达达调调控控的的研研究究已已经经相相当当彻彻底底,许许多多问问题题已已经经解解决决,而而对对真真核核生生物物基基因因表表达达调调控控的的研研究究还还刚刚刚刚开开
9、始始,不不少少情情况况下下人人们们只只能能以以原原核核生生物物中中学学到到的的知知识识来来推推测测真真核核生生物物的的机机理理。其其次次,为为了了更更好好地地了了解解真真核核生生物物基基因因调调控控机机理理的的复复杂杂性性,也也很很有有必必要要看看看看原原核核生生物物的的情情况况。所所以以在在这这一一章章中中我我们们先先介介绍绍原原核核生生物物基基因因表表达达的的调控。调控。第12页,本讲稿共158页1 1原核生物基因表达调控原理原核生物基因表达调控原理 n原原核核生生物物细细胞胞的的基基因因和和蛋蛋白白质质种种类类较较少少,如如大大肠肠杆杆菌菌基基因因组组约约为为4106bp,假假如如平平均
10、均每每个个基基因因长长1000bp,一一个个细细胞胞就就有有4000个个左左右右的的基基因因,能能合合成成4000种种左左右右的的蛋蛋白白质质。据据估估计计,一一个个细细胞胞中中总总共共含含有有107个个蛋蛋白白质质分分子子,如如果果每每个个基基因因都都等等同同翻翻译译的的话话,任任何何一一个个多多肽肽应应有有2500个个拷拷贝贝,但但是是这些蛋白质并不是以相同拷贝数存在于细胞中的。这些蛋白质并不是以相同拷贝数存在于细胞中的。第13页,本讲稿共158页n有有些些蛋蛋白白质质的的数数目目相相当当固固定定。例例如如,每每个个大大肠肠杆杆菌菌细细胞胞可可以以有有约约15000个个核核糖糖体体,与与其
11、其结结合合的的约约50种种核核糖糖体体蛋蛋白白质质数数量量是是十十分分稳稳定定的的。糖糖分分解解体体系系的的酶酶含含量量很很大大,其其数数目目也也极极恒恒定定。此此外外,DNA聚聚合合酶酶、RNA聚聚合合酶酶等等都都有有是是代代谢谢过过程程中中十十分分必必需需的的酶酶或或蛋蛋白白质质,其其合合成成速速率不受环境变化或代谢状态的影响。率不受环境变化或代谢状态的影响。l在正常情况下经常合成的蛋白质称为永久型蛋白质。在正常情况下经常合成的蛋白质称为永久型蛋白质。第14页,本讲稿共158页n另另一一类类蛋蛋白白质质的的合合成成速速率率明明显显受受环环境境的的影影响响。例例如如,一一般般情情况况下下,一
12、一个个大大肠肠杆杆菌菌中中只只有有15个个分分子子的的-半半乳乳糖糖苷苷酶酶,但但若若将将细细胞胞培培养养在在只只含含乳乳糖糖的的培培养养基基中中,每每个个细细胞胞中中这这种种酶酶的的数数量量可可高高达达几几万万个个分分子子。其其他他糖糖代代谢谢的的酶酶、氨氨基基酸酸、核核苷苷酸酸合合成成系系统统的的酶酶类类,其其合合成成速速度度和和总总量量也也都随培养条件的变化而改变。都随培养条件的变化而改变。l合合成成速速率率明明显显受受环环境境的的影影响响蛋蛋白白质质称称为为适适应应型型或或调调节节型蛋白质。型蛋白质。第15页,本讲稿共158页n细细菌菌所所利利用用的的调调节节机机制制主主要要是是转转录
13、录水水平平的的调调控控,即即一一个个体体系系的的基基因因在在需需要要时时被被打打开开,大大量量合合成成mRNA,从从而而合合成大量的蛋白质;不需要时被关闭。成大量的蛋白质;不需要时被关闭。n所所谓谓关关闭闭并并不不是是说说干干脆脆不不合合成成mRNA,而而是是只只合合成成极极少少量量的的mRNA,常常常常是是每每个个世世代代每每个个细细胞胞只只合合成成12个个mRNA分子,因而可合成少量的蛋白质。分子,因而可合成少量的蛋白质。第16页,本讲稿共158页u 1.1 启动子与转录起始启动子与转录起始 n转转录录是是基基因因表表达达的的关关键键性性步步骤骤。在在RNA聚聚合合酶酶作作用用下下,转转录
14、录从从一一个个特特异异的的起起点点开开始始,按按照照碱碱基基配配对对原原则则准准确确地地转转录录DNA序列,到特异的终止部位结束,合成出一条序列,到特异的终止部位结束,合成出一条RNA链。链。n为为RNA聚聚合合酶酶提提供供识识别别、结结合合和和开开始始转转录录信信号号的的一一段段DNA序序列列称称为为启启动动子子(promoter)。提提供供转转录录终终止止信信号号的的一一段段DNA序序列列称称为为终终止止子子(terminator)。从从启启动动子子开开始始到到终终止子结束的止子结束的DNA序列称为转录单元。序列称为转录单元。n在细菌中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。在细菌
15、中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。第17页,本讲稿共158页n转转录录是是由由RNA聚聚合合酶酶催催化化完完成成的的。原原核核生生物物的的RNA聚聚合合酶酶全全酶酶由由五五个个亚亚基基组组成成,可可表表示示为为“2”。没没有有因因子子的的酶酶叫叫做做核核心心酶酶,可可表表示示为为“2”。因因子子(亚亚基基)的的功功能能在在于于识识别别启启动动子子,并并使使RNA聚聚合合酶酶全全酶酶能能稳稳定定地地结结合合到到DNA的的启启动动子子上上。单单独独的的核核心心酶酶也也能能与与DNA结结合合,但但不不能能找找到到模模板板DNA上上的的起起始始位位点点,因因为为没没有有固固定定的的起起
16、始始位位点点,而而且且两两条条链链都都可可以以作作为为模模板板,所所以以合合成成的的产产物物是是不均一的。不均一的。第18页,本讲稿共158页n因因子子能能够够改改变变RNA聚聚合合酶酶与与DNA之之间间的的亲亲合合力力,它它极极大大地地减减少少了了酶酶与与一一般般序序列列的的结结合合常常数数和和停停留留时时间间,同同时时又又极极大大地地增增加加了了酶酶与与DNA启启动动子子的的结结合合常常数数和和停停留留时时间间。这这样样就就使使得得全全酶酶能能迅迅速速地地找找到到启启动动子子并并与与之之相相结结合合。所所以以,只只有有带带有有因因子子的的全全酶酶才才能能专专一一地地与与DNA上上的的启启动
17、动子子结结合合,选选择择其其中中一一条条链链作作模模板板,合合成成均均一一的的产产物物。因因子子的的作作用用也也只只是是起起始始而而已已,一一旦旦转转录录开开始始,它它就就离离开开了了起起始复合物,而由核心酶负责始复合物,而由核心酶负责RNA链的延伸。链的延伸。n因因此此,全全酶酶的的作作用用是是选选择择和和起起始始,核核心心酶酶的的作作用用是是链链的的延延长。长。第19页,本讲稿共158页n转转录录的的起起始始是是基基因因表表达达的的关关键键阶阶段段,这这一一阶阶段段的的重重要要问问题是题是RNA聚合酶与启动子的相互作用。聚合酶与启动子的相互作用。n启启动动子子的的结结构构影影响响了了它它与
18、与RNA聚聚合合酶酶的的亲亲合合力力,从从而而影影响基因的表达水平。响基因的表达水平。n许许多多调调控控因因素素也也正正是是通通过过改改变变启启动动子子与与RNA聚聚合合酶酶的亲合力来调控基因表达的的亲合力来调控基因表达的。第20页,本讲稿共158页u 1.1.1 启动子的基本结构启动子的基本结构 n启启动动子子是是RNA聚聚合合酶酶的的识识别别和和结结合合区区,其其结结构构直直接接关关系系到到转录的效率。转录的效率。nPribnow设设计计的的实实验验证证明明了了启启动动子子的的结结构构特特征征:让让RNA聚聚合合酶酶全全酶酶与与DNA结结合合后后,用用DNase水水解解DNA,然然后后用用
19、苯苯酚酚抽抽提提,沉沉淀淀纯纯化化后后得得到到一一段段被被RNA聚聚合合酶酶保保护护下下来来的的DNA片片段段,再再对对此此片片段段进进行行序序列列分分析析和和比比较较。Pribnow以以及及其其他他一一些些科科学学家家经经过过多多年年的的努努力力,分分析析比比较较了了几几十十种种大大杆杆肠肠启启动动子子和和多多种种噬噬菌菌体体的的启启动动子子序序列列,证证实实原原核核生生物物的的所有启动子都有两段共同序列,即所有启动子都有两段共同序列,即-10序列和序列和-35序列。序列。第21页,本讲稿共158页n通通常常将将转转录录起起点点的的第第一一个个核核苷苷酸酸以以+1来来表表示示,从从近近到到远
20、远以以正正数数计计,称称为为下下游游;起起点点前前一一个个核核苷苷酸酸以以-1来来表表示示,从从近近到远以负数计,称为上游。到远以负数计,称为上游。n大大肠肠杆杆菌菌的的-10处处有有一一个个6bp的的保保守守序序列列TATAAT,称称为为Pribnow框框或或-10序序列列,-35处处又又有有一一个个6bp的的保保守守序序列列TTGACA,称为识别区域或,称为识别区域或-35序列。序列。第22页,本讲稿共158页n实实验验证证明明,-35序序列列的的突突变变将将降降低低RNA聚聚合合酶酶与与启启动动子子结结合合的的速速度度,但但不不影影响响转转录录起起点点附附近近DNA的的解解链链速速度度;
21、而而-10序序列列的的突突变变不不影影响响RNA聚聚合合酶酶与与启启动动子子结结合合的的速速度度,可是会降低可是会降低DNA的解链速度。的解链速度。n因因此此认认为为:-35-35序序列列是是RNARNA聚聚合合酶酶的的结结合合部部位位,RNARNA聚聚合合酶酶与与启启动动子子结结合合的的强强弱弱程程度度就就取取决决于于该该序序列列的的变变化化。而而-10-10序序列列是是DNADNA的的解解链链部部位位,-10-10序序列列含含有有较较多多的的A A、T T碱碱基基对对,因而从此位置解链所需要的能量比较低。因而从此位置解链所需要的能量比较低。第23页,本讲稿共158页u 1.1.2 启动子对
22、转录起始的调节启动子对转录起始的调节 n启启动动子子的的核核苷苷酸酸序序列列影影响响着着RNARNA聚聚合合酶酶与与启启动动子子的的亲亲合合力,从而直接影响着转录的起始频率。力,从而直接影响着转录的起始频率。l例例如如,在在大大肠肠杆杆菌菌中中,有有些些基基因因每每秒秒钟钟可可转转录录1次次,而而另另一一些些基基因因每每代代才才转转录录1次次。这这种种转转录录起起始始频频率率的的不不同同,归归因因于于启启动动子子序序列列的的差差异异,在在没没有有调调节节蛋蛋白白的的情情况况下下,不不同同核核苷苷酸酸序序列列的的启启动动子子启启动动转转录录的的频频率相差率相差1 000倍以上。倍以上。第24页,
23、本讲稿共158页n这这样样就就存存在在着着强强弱弱启启动动子子之之分分,在在基基因因工工程程操操作作中中,为为了了提提高高外外源源基基因因在在宿宿主主细细胞胞中中的的表表达达水水平平,一一般般采采用用强强启启动动子子,如如一一些些原原核核表表达达载载体体中中的的T7启启动动子子、Lac启动子等都是较强的启动子。启动子等都是较强的启动子。n此此外外,启启动动子子的的核核苷苷酸酸序序列列还还影影响响转转录录起起始始的的准准确确性性。启启动动子子突突变变不不仅仅影影响响转转录录效效率率,某某些些突突变变还还可可能使正确转录本的得率大大降低。能使正确转录本的得率大大降低。第25页,本讲稿共158页u在
24、细菌中常见两种启动子突变。在细菌中常见两种启动子突变。n一一种种叫叫下下降降突突变变,可可降降低低转转录录水水平平,甚甚至至丧丧失失转转录录功能。功能。n例例如如把把-10序序列列从从TATAAT变变成成AATAAT就就会会大大大大降降低低其其结构基因的转录水平。结构基因的转录水平。n另另一一种种叫叫上上升升突突变变,这这种种突突变变是是增增加加-10序序列列的的同同源源性。性。n例例如如,在在乳乳糖糖操操纵纵子子中中,将将其其-10序序列列从从TATGTT变变成成TATAAT,就就会会提提高高启启动动子子的的效效率率,提提高高乳乳糖糖操操纵纵子子的的转录水平。转录水平。第26页,本讲稿共15
25、8页n启动子保守序列之间的距离也影响着转录的起始频率。启动子保守序列之间的距离也影响着转录的起始频率。n原原核核生生物物强强启启动动子子的的-10和和-35区区域域之之间间的的间间隔隔为为171bp,增增大大或或减减小小明明显显影影响响启启动动子子的的强强度度。这这可可以以解解释释为为-35区区相相对对-10区区旋旋转转所所产产生生的的超超螺螺旋旋发发生生了了改改变变,增增减减一一个个bp会会使使两两者者之之间间的的夹夹角角发发生生36的的改改变变。在在这这情情况况下下,要要使使酶酶与与DNA在在这这个个区区域域内内具具有有正正确确的的取取向向,则则必必须须使使二二者者之之一一发发生扭曲,这就
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