生物化学蛋白质精选课件.ppt
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1、关于生物化学蛋白质第一页,本课件共有72页一一.蛋白质的酸碱性质蛋白质的酸碱性质 各个解离基团的各个解离基团的pKpK值与游离氨基酸的值与游离氨基酸的不完全相同。短肽的等电点和净电荷量可不完全相同。短肽的等电点和净电荷量可以根据以根据pKpK值计算,值计算,蛋白质的等电点蛋白质的等电点要用等要用等电聚焦等方法测定。电聚焦等方法测定。第二页,本课件共有72页二二.蛋白质分子的大小与形状蛋白质分子的大小与形状 (一)根据化学组成测定最低相对分子质量(一)根据化学组成测定最低相对分子质量 假定某种微量成分只有一个,测出其百分假定某种微量成分只有一个,测出其百分含量后,可用比例式算出最低相对分子质量。
2、含量后,可用比例式算出最低相对分子质量。若测出两种微量成分的百分含量,分别用比若测出两种微量成分的百分含量,分别用比例式算出的最低相对分子质量不相同时,可计算例式算出的最低相对分子质量不相同时,可计算两个最低相对分子质量近似的最小公倍数。两个最低相对分子质量近似的最小公倍数。第三页,本课件共有72页 例题:一种纯酶含亮氨酸(例题:一种纯酶含亮氨酸(Mr 131Mr 131)1.65%1.65%,含异亮氨酸,含异亮氨酸(Mr131Mr131)2.48%2.48%,求最低相对分子质量。,求最低相对分子质量。解:按照解:按照LeuLeu的百分含量计算,最低的百分含量计算,最低Mr XMr X1 1:
3、X X1 1=(100=(100 131)/1.65=7939.4131)/1.65=7939.4 按照按照IleIle的百分含量计算最低的百分含量计算最低Mr XMr X2 2:X X2 2=(100=(100 131)/2.48=5282.3131)/2.48=5282.3 由于由于X X1 1和和X X2 2数字差异较大,提示这种酶含数字差异较大,提示这种酶含LeuLeu和和IleIle不止不止1 1个,个,为了估算为了估算LeuLeu和和IleIle的个数,首先计算:的个数,首先计算:X X1 1/X/X2 2=7939.4/5282.31.5=7939.4/5282.31.5 这种酶
4、含任何氨基酸的个数均应是整数,说明该酶至少这种酶含任何氨基酸的个数均应是整数,说明该酶至少含有含有2 2个个LeuLeu,3 3个个IleIle,其最低相对分子质量为:,其最低相对分子质量为:7939.4 7939.4 2 2=15878.8 =15878.8 或或 5282.35282.33=15846.93=15846.9第四页,本课件共有72页(二)渗(二)渗透压法测透压法测定相对分定相对分子质量子质量 第五页,本课件共有72页(三(三 )沉降)沉降分析法分析法测定相测定相对分子对分子质量质量 第六页,本课件共有72页基本原理:基本原理:离心力离心力(centrifugal forcec
5、entrifugal force,FcFc):):当一个粒子(生物大分子或细胞器)在高速当一个粒子(生物大分子或细胞器)在高速旋转下受到离心力作用时,此离心力旋转下受到离心力作用时,此离心力“Fc”Fc”由下由下式定义:式定义:F=m*a=m*2 r F=m*a=m*2 r a a 粒子旋转的加速度,粒子旋转的加速度,m m 沉降粒子沉降粒子的有效质量,的有效质量,粒子旋转的角速度,粒子旋转的角速度,rr粒粒子的旋转半径子的旋转半径(cm)(cm)。第七页,本课件共有72页 相对离心力(相对离心力(relative centrifugal relative centrifugal forcef
6、orce,RCFRCF):由于各种离心机转子的半径或者离心由于各种离心机转子的半径或者离心管至旋转轴中心的距离不同,离心力而受变化,管至旋转轴中心的距离不同,离心力而受变化,因此在文献中常用因此在文献中常用“相对离心力相对离心力”或或“数字数字g”g”表示离心力表示离心力,只要,只要RCFRCF值不变,一个样值不变,一个样品可以在不同的离心机上获得相同的结果。品可以在不同的离心机上获得相同的结果。第八页,本课件共有72页G G1.11(101.11(10-5-5)Rrpm)Rrpm离心半径为离心半径为1010厘米,转速为厘米,转速为80008000,其离心力为:,其离心力为:G G1.111.
7、11*1010-5-5*1010*(80008000)7104 7104 即离心力为即离心力为7104g.7104g.而当离心力为而当离心力为8000g 8000g 时,其转速应为:时,其转速应为:84898489即约为即约为8500rpm8500rpm第九页,本课件共有72页 沉降系数(沉降系数(sedimentation coefficientsedimentation coefficient,s s):):1924 1924年年SvedbergSvedberg对沉降系数下的定义为颗粒在单位对沉降系数下的定义为颗粒在单位离心力场中移动的速度。离心力场中移动的速度。S S:沉降系数,时常在:
8、沉降系数,时常在1010-13-13秒左右,故把沉降系数秒左右,故把沉降系数1010-13-13秒秒称为一个称为一个SvedbergSvedberg单位,简写单位,简写S S,量纲为秒。,量纲为秒。例如,动物原生质核糖体的沉降系数等于例如,动物原生质核糖体的沉降系数等于80S80S,它的,它的含义就是:含义就是:80801010-13-13s s。细胞及细胞的各组分的沉降系。细胞及细胞的各组分的沉降系数有很大的差异,所以可以利用生物样品沉降系数的差数有很大的差异,所以可以利用生物样品沉降系数的差异采用离心技术将他们彼此分开。异采用离心技术将他们彼此分开。第十页,本课件共有72页第十一页,本课件
9、共有72页沉降法沉降法:又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液中又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液中受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。在沉受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。在沉降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同的速度沉降,降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同的速度沉降,在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学仪器扫描在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学仪器扫描记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降速度。物质记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降速度。物质颗粒在单位离心力场中的沉降速度为恒定值,称沉降系数,颗粒在单位离心力场中的沉降速度为恒定
10、值,称沉降系数,用用S S表示,一个表示,一个S S S S单位为单位为单位为单位为11011013s13s。蛋白质的沉降系数蛋白质的沉降系数S S(2020水中)大约为水中)大约为11011013-13-200102001013s13s13s13s即即1S-200S1S-200S。用沉降法求出。用沉降法求出S S值并计算出分值并计算出分值并计算出分值并计算出分子量。注意。文献中经常出现以子量。注意。文献中经常出现以子量。注意。文献中经常出现以子量。注意。文献中经常出现以S S S S为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。第十二页,本课件共有72页(四)凝胶过
11、滤法测定相对分子质量(四)凝胶过滤法测定相对分子质量 当含有各种组分的样品流经凝胶层析柱时,当含有各种组分的样品流经凝胶层析柱时,大分子物质由于分子直径大,不易进入凝胶颗粒大分子物质由于分子直径大,不易进入凝胶颗粒的微孔,沿凝胶颗粒的间隙以较快的速度流过凝的微孔,沿凝胶颗粒的间隙以较快的速度流过凝胶柱。而小分子物质能够进入凝胶颗粒的微孔中,胶柱。而小分子物质能够进入凝胶颗粒的微孔中,向下移动的速度较慢,从而使样品中各组分按相向下移动的速度较慢,从而使样品中各组分按相对分子质量从大到小的顺序先后流出层析柱,而对分子质量从大到小的顺序先后流出层析柱,而达到分离的目的。达到分离的目的。第十三页,本课
12、件共有72页第十四页,本课件共有72页n n 若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积(Ve)(Ve)对组分相对分子质量的对数对组分相对分子质量的对数(lgMr)(lgMr)作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗脱以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗脱体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。n n在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积Kav(Kav=Ve
13、/Vt)Kav(Kav=Ve/Vt)对对对对lgMrlgMr作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的特性。每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、特性。每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、酶与清蛋白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,酶与清蛋白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,未知相对分子质量的组分应位于直线部分为宜。若不未知相对分子质量的组分应位于直线部分为宜。若不在直线部分,可选用另一种凝胶重新试验。在直线部分,可选用另一种凝胶重新试验。第十五页,本课件共有72页第十六页,本课件共有72页(五)五)SDSSDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定相
14、对分子质聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定相对分子质量量 SDSSDS即十二烷基硫酸钠是阴离子去污剂即十二烷基硫酸钠是阴离子去污剂,在水溶,在水溶液中,以单体和分子团的混合形式存在,单体和分子液中,以单体和分子团的混合形式存在,单体和分子团的浓度与团的浓度与SDSSDS总浓度、离子强度及温度有关,为了使总浓度、离子强度及温度有关,为了使单体和蛋白质结合生成单体和蛋白质结合生成蛋白质蛋白质-SDS-SDS复合物复合物,需要采,需要采取低离子强度,使单体浓度有所升高。在单体浓度为取低离子强度,使单体浓度有所升高。在单体浓度为0.5m mol/L0.5m mol/L以上时,蛋白质和以上时,蛋白质和SDSSDS
15、就能结合成复合物;当就能结合成复合物;当SDSSDS单体浓度大于单体浓度大于1m mol/L1m mol/L时,与大多数蛋白质平均结合比时,与大多数蛋白质平均结合比为为1.4g SDS/g1.4g SDS/g蛋白质;在低于蛋白质;在低于0.5m mol/L0.5m mol/L浓度时,其结浓度时,其结合比一般为合比一般为0.4gSDS/g0.4gSDS/g蛋白质。蛋白质。第十七页,本课件共有72页n n由于由于SDSSDS带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的带的负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而消除或
16、掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用MrMr差差异将各种蛋白质分开。异将各种蛋白质分开。n n在蛋白质溶解液中,加入在蛋白质溶解液中,加入SDSSDSSDSSDS和疏基乙醇,和疏基乙醇,和疏基乙醇,和疏基乙醇,巯基乙醇巯基乙醇可可使蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚使蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚单位。单位。SDSSDS可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋可使蛋白质的
17、氢键、疏水键打开,还引起蛋白质构象的改变。白质构象的改变。白质构象的改变。白质构象的改变。n n此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的长椭圆棒长椭圆棒长椭圆棒长椭圆棒。不同蛋白质。不同蛋白质-SDS-SDS-SDS-SDS复复合物的短轴相同,约合物的短轴相同,约1.8nm1.8nm1.8nm1.8nm,而长轴则与蛋白质的,而长轴则与蛋白质的MrMr成正比。成正比。
18、第十八页,本课件共有72页 测定未知蛋白质测定未知蛋白质MrMr时,可选用相应的一组标准蛋时,可选用相应的一组标准蛋白及适宜的凝胶浓度,同时进行白及适宜的凝胶浓度,同时进行SDS-PAGESDS-PAGE,则可根据,则可根据已知已知MrMr蛋白质的蛋白质的电泳迁移率电泳迁移率和和MrMr的对数的对数作出标准曲线,作出标准曲线,再根据未知蛋白质的电泳迁移率求得再根据未知蛋白质的电泳迁移率求得MrMr。它不仅用于蛋白质它不仅用于蛋白质MrMr测定,还可用于测定,还可用于蛋白混合组蛋白混合组分的分离和亚组分的分析分的分离和亚组分的分析,当蛋白质经,当蛋白质经SDS-PAGESDS-PAGE分离分离后
19、,设法将各种蛋白质从凝胶上洗脱下来,除去后,设法将各种蛋白质从凝胶上洗脱下来,除去SDSSDS,还可进行氨基酸顺序、酶解图谱及抗原性质等方面的研,还可进行氨基酸顺序、酶解图谱及抗原性质等方面的研究。究。第十九页,本课件共有72页第二十页,本课件共有72页第二十一页,本课件共有72页第二十二页,本课件共有72页三、蛋白质的胶体性质与蛋白质的沉淀三、蛋白质的胶体性质与蛋白质的沉淀 (一)(一)蛋白质的胶体性质蛋白质的胶体性质 大小在大小在1-1001-100nmnm范围内;范围内;同种电荷互相排斥;同种电荷互相排斥;质点外围有水化层。质点外围有水化层。(二)(二)蛋白质的沉淀蛋白质的沉淀 1.1.
20、盐析法盐析法 2.2.有机溶剂沉淀法有机溶剂沉淀法 3.3.重金属盐沉淀法重金属盐沉淀法 4.4.生物碱试剂和某些酸类沉淀法生物碱试剂和某些酸类沉淀法 5.5.加热变性沉淀法加热变性沉淀法第二十三页,本课件共有72页四、蛋白质分离纯化的一般原则四、蛋白质分离纯化的一般原则 1.1.前处理前处理 要选择合适的材料要选择合适的材料;合适的破碎方法合适的破碎方法;合适的合适的提取液。提取液。2.2.粗分级分离粗分级分离 要方法简便,处理量大。常用盐析、等电点沉淀要方法简便,处理量大。常用盐析、等电点沉淀和有机溶剂分级分离等方法,有时可用超过滤或凝胶和有机溶剂分级分离等方法,有时可用超过滤或凝胶过滤等
21、方法。过滤等方法。3.3.细分级分离细分级分离 主要使用各种层析、电泳,方法要精心选择,巧主要使用各种层析、电泳,方法要精心选择,巧妙配合。后期可用结晶法。妙配合。后期可用结晶法。第二十四页,本课件共有72页五、蛋白质的分离纯化方法五、蛋白质的分离纯化方法(一)根据分子大小不同的纯化方法(一)根据分子大小不同的纯化方法1.1.透析和超滤透析和超滤(1)(1)透析透析 透析是把待纯化的蛋白质溶液装在透析是把待纯化的蛋白质溶液装在半透膜半透膜的透的透析袋里,放入透析液(蒸馏水或缓冲液)中进行的,析袋里,放入透析液(蒸馏水或缓冲液)中进行的,透析液可以更换,直至透析袋内无机盐等小分子物透析液可以更换
22、,直至透析袋内无机盐等小分子物质降到最小值为止。质降到最小值为止。原理:利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,原理:利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开。使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开。第二十五页,本课件共有72页第二十六页,本课件共有72页(2).(2).超滤:超滤:利用压力或离心力,强行使水和其他利用压力或离心力,强行使水和其他小分子溶质通过半透膜,而蛋白质被截留小分子溶质通过半透膜,而蛋白质被截留在膜上,以达到浓缩和脱盐的目的。在膜上,以达到浓缩和脱盐的目的。超滤是一种膜分离技术超滤是一种膜分离技术第二十七页,本课件共有72页第二十
23、八页,本课件共有72页2 2.密度梯度离密度梯度离心心第二十九页,本课件共有72页第三十页,本课件共有72页3.3.凝胶过滤凝胶过滤 第三十一页,本课件共有72页(二二)利用溶解度差别的纯化方法利用溶解度差别的纯化方法1.1.等电点沉淀和等电点沉淀和pHpH控制控制 利用蛋白质在等电点时溶解度最低利用蛋白质在等电点时溶解度最低以及不同的蛋白质具有不同等电点一这以及不同的蛋白质具有不同等电点一这特性,对蛋白质进行分离纯化的方法称特性,对蛋白质进行分离纯化的方法称为为等电点沉淀法等电点沉淀法。第三十二页,本课件共有72页n n在等电点时,蛋白质分子的净电荷为零,在等电点时,蛋白质分子的净电荷为零,
24、消除了分子间的静电斥力,但由于水膜的消除了分子间的静电斥力,但由于水膜的存在,蛋白质仍有一定的溶解度而沉淀不存在,蛋白质仍有一定的溶解度而沉淀不完全,所以完全,所以等电沉淀法经常与盐析法或等电沉淀法经常与盐析法或有机溶剂沉淀法联合使用有机溶剂沉淀法联合使用。n n 单独使用等电点法主要是用于去除单独使用等电点法主要是用于去除等电点相距较大的杂蛋白。在加酸或加等电点相距较大的杂蛋白。在加酸或加碱调节碱调节pHpH的过程中,要的过程中,要一边搅拌一边慢一边搅拌一边慢慢加入慢加入,以防止局部过酸或过碱,以防止局部过酸或过碱 。第三十三页,本课件共有72页2.2.蛋白质的盐溶和盐析蛋白质的盐溶和盐析
25、定义:一般在低盐浓度的情况下,蛋白质的溶解定义:一般在低盐浓度的情况下,蛋白质的溶解度随盐浓度的升高而增加,这种现象称为度随盐浓度的升高而增加,这种现象称为盐溶盐溶;而当;而当盐浓度升高到一定程度后,蛋白质的溶解度又随着盐浓度升高到一定程度后,蛋白质的溶解度又随着盐浓度的升高而降低,结果使蛋白质沉淀析出,这盐浓度的升高而降低,结果使蛋白质沉淀析出,这种现象称为种现象称为盐析盐析作用。在同一浓度的盐溶液中,不同作用。在同一浓度的盐溶液中,不同蛋白质的溶解度不同,借此可达到彼此分离的目的。蛋白质的溶解度不同,借此可达到彼此分离的目的。原理:盐浓度增高到一定数值后,水活性降低,原理:盐浓度增高到一定
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