第二章 核酸的生物合成优秀PPT.ppt
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1、第二章 核酸的生物合成第一页,本课件共有72页 DNADNA是生物遗传的主要物质基础,生物机体的遗传信息以密是生物遗传的主要物质基础,生物机体的遗传信息以密码的形式编码在码的形式编码在DNADNA分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序,分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序,并通过并通过DNADNA的复制由亲代传递给子代。在后代的生长发育过程的复制由亲代传递给子代。在后代的生长发育过程中,遗传信息自中,遗传信息自DNADNA转录给转录给RNA,RNA,然后翻译成特异的蛋白质,然后翻译成特异的蛋白质,以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。
2、状。中中 心心 法法 则则1964-1970 劳氏肉瘤病毒的遗传方式致癌RNA病毒病毒(复制)病毒(复制)复制复制转录DNA RNA 蛋白质翻译逆转录逆转录1958年,遗传信息的单向第二页,本课件共有72页Reverse transcription第三页,本课件共有72页中心法则的遗传流向有中心法则的遗传流向有5条途径条途径 1、DNADNA:DNA复制复制 (以(以DNA为模板合成为模板合成DNA)2、RNA RNA:RNA复制复制 (以(以RNA为模板合成为模板合成RNA)3、DNA RNA:DNA转录转录 (以(以DNA为模板合成为模板合成RNA)4、RNA DNA:反反(逆逆)转录转录
3、 (以(以RNA为模板合成为模板合成DNA)5、RNA Protein:翻译翻译第四页,本课件共有72页 复制复制:亲代:亲代DNA或或RNA在一系列酶的作用在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代下,生成与亲代相同的子代DNA或或RNA的的过程。过程。转录转录:以:以DNA为模板,按照碱基配对原则将为模板,按照碱基配对原则将其所其所含的遗传信息传给含的遗传信息传给RNA,形成一条与,形成一条与DNA链互补的链互补的RNA的过程。的过程。翻译翻译:亦叫转译,以:亦叫转译,以mRNA为模板,将为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的的密码解读成蛋白质的AA顺序的过顺序的过程。程。逆转录逆转录:以:
4、以RNA为模板,在逆转录酶的作用为模板,在逆转录酶的作用下,生成下,生成DNA的过程。的过程。第五页,本课件共有72页第一节第一节 DNADNA的生物合成的生物合成一、一、DNADNA的半保留复制的半保留复制二、与二、与DNADNA复制有关的酶和蛋白质复制有关的酶和蛋白质三、三、DNADNA的复制过程的复制过程四、逆转录四、逆转录五、五、DNADNA的损伤修复的损伤修复第六页,本课件共有72页一、一、DNADNA的半保留复制的半保留复制定义:定义:由亲代由亲代DNADNA生成子代生成子代DNADNA时,每个新形成时,每个新形成的子代的子代DNADNA中,一条链来自亲代中,一条链来自亲代DNAD
5、NA,而另一条,而另一条链则是新合成的,这种复制方式叫链则是新合成的,这种复制方式叫半保留复制半保留复制半保留复制的实验证据半保留复制的实验证据:19581958年年MeselsonMeselson和和StahlStahl用同位素用同位素1515N N标记大肠杆菌标记大肠杆菌DNA,DNA,首先证明了首先证明了DNADNA的半保留复制。的半保留复制。第七页,本课件共有72页1515N-DNAN-DNA的密度大于的密度大于1414N-DNAN-DNA的密度的密度第八页,本课件共有72页DNADNA的半保留复制的生物学意义:的半保留复制的生物学意义:DNADNA的半保留复制表明的半保留复制表明DN
6、ADNA在代谢上的稳在代谢上的稳定性,定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。给后代。DNADNA在代谢上的稳定性并非指在代谢上的稳定性并非指DNADNA是一种惰性物质。是一种惰性物质。第九页,本课件共有72页二、与二、与DNADNA复制有关的酶和蛋白质复制有关的酶和蛋白质 原料原料:四种脱氧核苷三磷酸(四种脱氧核苷三磷酸(dATPdATP、dGTPdGTP、dCTPdCTP、dTTP)dTTP)模板模板:以:以DNADNA的两条链为模板链,合成子代的两条链为模板链,合成子代DNADNA。引物引物:一小段:一小段RNA(RNA(或或DNADNA)为引物,在大肠杆菌
7、)为引物,在大肠杆菌 中,中,DNADNA的合成需要一段的合成需要一段RNARNA链作为链作为引物。引物。第十页,本课件共有72页催化因子1.1.引物合成酶(引发酶):引物合成酶(引发酶):此酶以此酶以DNADNA为模板合成一段为模板合成一段RNA,RNA,这段这段RNARNA作为合成作为合成DNADNA的引物(的引物(Primer)Primer)。实质是以。实质是以DNADNA为模板的为模板的RNARNA聚合酶聚合酶。2.DNA2.DNA聚合酶聚合酶:以以DNADNA为模板的为模板的DNADNA合成酶,其催化反应的特合成酶,其催化反应的特点点 (1 1)以四种脱氧核苷酸三磷酸为底物;()以四
8、种脱氧核苷酸三磷酸为底物;(2 2)反)反应需要有模板的指导;(应需要有模板的指导;(3 3)反应需要有)反应需要有3 3-OH-OH存在;存在;(4 4)DNADNA链的合成方向为链的合成方向为5 5 3 3 N3 5 5 OOH OH PPP-O-CH2OH 生物大分子合成:生物大分子合成:底物、酶、能量、模板第十一页,本课件共有72页(5 5)DNADNA聚合酶的反应可以利用聚合酶的反应可以利用DNADNA双链作双链作为模板和引物,亦可以单链为模板和引物,亦可以单链DNADNA作为模板和引作为模板和引物物(6 6)DNADNA的体外聚合必须加入少量的的体外聚合必须加入少量的DNADNA才
9、才能进行。能进行。DNADNA在提取过程中易形成切口在提取过程中易形成切口(nicknick)或缺口()或缺口(gapgap).则加入的则加入的DNADNA一一条链作为模板而另一条链可作为引物。条链作为模板而另一条链可作为引物。第十二页,本课件共有72页原核生物中的原核生物中的DNADNA聚合酶聚合酶在大肠杆菌中发现有三种在大肠杆菌中发现有三种DNADNA聚合酶(聚合酶(用突变株研究其功能用突变株研究其功能):):DNADNA聚合酶聚合酶:单体酶单体酶,多肽链内含一个锌原子(其鳌合剂是多肽链内含一个锌原子(其鳌合剂是O-O-二氮杂菲),多功能酶。二氮杂菲),多功能酶。它具有它具有5 5 3 3
10、 聚合酶功能(对脱氧核聚合酶功能(对脱氧核苷酸的选择);苷酸的选择);3 3 5 5外切酶活性(对双链无作用,校对功能。但外切酶活性(对双链无作用,校对功能。但在正常聚合条件下,此活性不能作用于生长链)在正常聚合条件下,此活性不能作用于生长链)及及5 5 3 3外切酶外切酶活性(双链有效,主要是对活性(双链有效,主要是对DNADNA损伤的修复,以及在损伤的修复,以及在DNADNA复制时复制时RNARNA引物切除及其空隙的填补)引物切除及其空隙的填补);在;在DNADNA链的链的3 3 形成焦磷酸键(生理形成焦磷酸键(生理意义不大);无机焦磷酸盐与意义不大);无机焦磷酸盐与dNTPdNTP之间的
11、焦磷酸基交换。之间的焦磷酸基交换。DNADNA聚合酶聚合酶:多亚基酶,多亚基酶,聚合作用,但聚合活力很低;具聚合作用,但聚合活力很低;具有有3 3 5 5外切酶活性。其它生理功能尚不清楚,可能在修复紫外切酶活性。其它生理功能尚不清楚,可能在修复紫外光引起的外光引起的DNADNA损伤中起作用。损伤中起作用。第十三页,本课件共有72页 DNADNA聚合酶聚合酶:是原核生物是原核生物DNADNA复制的主要聚合复制的主要聚合酶酶,该酶由,该酶由1010种亚基组成,其中种亚基组成,其中、形成全酶的形成全酶的核心酶核心酶。具有具有5 53 3DNADNA聚合酶活性(聚合酶活性(亚基,亚基,速率速率高);高
12、);具有具有3 3 5 5外切酶(外切酶(亚基)亚基)的校对功能,的校对功能,提高提高DNADNA复制的保真性;还具有复制的保真性;还具有5 5 3 3外切酶活外切酶活性(单链有效,其意义未知)性(单链有效,其意义未知)。(4 4)DNADNA聚合酶聚合酶IVIV和和V V:19991999年发现,当年发现,当DNADNA严重损严重损伤时,诱导产生。伤时,诱导产生。第十四页,本课件共有72页 DNADNA聚合酶聚合酶 DNA DNA聚合酶聚合酶 DNA DNA聚合酶聚合酶 亚基数目亚基数目 1 1(单体酶)(单体酶)1 1(多亚基酶(多亚基酶 )1 1(多亚基酶)(多亚基酶)5 5 3 3聚合
13、活性聚合活性 +中中 +很低很低 +很高很高3 3 5 5外切活性外切活性 +(保护(保护DNADNA复制的复制的忠实性)忠实性)5 5 3 3外切活性外切活性 +-+-主要是对主要是对DNADNA损伤的修复损伤的修复;以及在;以及在DNADNA复制时切除复制时切除RNARNA引物并填补其留下的引物并填补其留下的空隙。空隙。修复紫外光引起的修复紫外光引起的DNADNA损伤损伤DNA DNA 复制的主要复制的主要聚合酶,还具有聚合酶,还具有3 3-5-5 外切酶的外切酶的校对功能,提高校对功能,提高DNADNA复制的保真性复制的保真性第十五页,本课件共有72页 在真核细胞内有五种在真核细胞内有五
14、种DNADNA聚合酶聚合酶 (与细菌(与细菌DNADNA聚聚合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向)合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向)定位定位 细胞核细胞核 细胞核细胞核 线粒体线粒体 细胞核细胞核 细胞核细胞核3 3-5-5外切外切 -+-+酶活性酶活性功能功能引物引物 合成合成修复修复作用作用线粒体线粒体DNADNA的复制的复制核核DNADNA的复制的复制修复修复作用作用第十六页,本课件共有72页 3.DNA3.DNA连接酶(连接酶(19671967年发现)年发现):若双链若双链DNADNA中一条链有切口,一中一条链有切口,一端是端是3 3-OH-OH,另一端是,另一端是5
15、5-磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。酸二酯键,而使切口连接。但是它不能将两条游离的但是它不能将两条游离的DNADNA单链连接起来。单链连接起来。大肠杆菌和其它细菌的大肠杆菌和其它细菌的DNADNA连接酶要求连接酶要求NADNAD+提供能量,在高等生物和提供能量,在高等生物和噬菌体中,则要求噬菌体中,则要求ATPATP提供能量。提供能量。T4T4噬菌体的噬菌体的DNADNA连接酶连接酶不仅能在模板链不仅能在模板链上连接上连接DNADNA和和DNADNA链之间的切口,而且能连接无单链粘性末端的平链之间的切口,而且能连接无单链粘性末端的平头双链
16、头双链DNADNA。3535OHOHP P第十七页,本课件共有72页连接酶的反应机制连接酶的反应机制:酶酶 +NAD+NAD+(ATP)(ATP)酶酶-AMP+-AMP+烟酰胺单核苷烟酰胺单核苷酸酸(PPiPPi)酶酶-AMP+P-5-AMP+P-5-DNA -DNA 酶酶 +AMP-P-5+AMP-P-5-DNA-DNADNA-3DNA-3-OH+AMP-P-5-OH+AMP-P-5-DNA DNA-3-DNA DNA-3-O-P-O-P-5 5-DNA+AMP-DNA+AMPvDNADNA连接酶连接酶在在DNADNA复制、损伤修复、重组等过程复制、损伤修复、重组等过程中起重要作用作用中起重
17、要作用作用第十八页,本课件共有72页拓扑异构酶拓扑异构酶:使使DNADNA一条链发生断裂和再连接一条链发生断裂和再连接。作用是松解负作用是松解负超螺旋超螺旋,反应不需要能量。主要集中在活性转录区,同转,反应不需要能量。主要集中在活性转录区,同转录有关。录有关。拓扑异构酶拓扑异构酶:使使DNADNA两条链发生断裂和再连接。两条链发生断裂和再连接。当引入负超当引入负超螺旋螺旋时需要由时需要由ATPATP提供能量,同复制有关。提供能量,同复制有关。二者共同控制二者共同控制DNADNA的拓扑结构。的拓扑结构。5 5、解螺旋酶、解螺旋酶 (解链酶)(解链酶):通过水解:通过水解ATPATP将将DNADN
18、A两条链打开。两条链打开。E.coliE.coli中的中的reprep蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶I I、IIII、IIIIII。每解开一对碱基需要水解。每解开一对碱基需要水解2 2个个ATPATP分子。分子。4.4.拓扑异构酶拓扑异构酶:催化催化DNADNA的拓扑连环数发生变化的酶,在的拓扑连环数发生变化的酶,在DNADNA重组重组修复和其他转变方面起重要作用。修复和其他转变方面起重要作用。除连环数不同外其它性质均相同的除连环数不同外其它性质均相同的DNADNA分子称为拓扑异构体,引起拓分子称为拓扑异构体,引起拓扑异构体反应的酶称为扑异构体反应的酶称为拓扑异构
19、酶拓扑异构酶第十九页,本课件共有72页6.6.其它蛋白因子其它蛋白因子:单链结合蛋白单链结合蛋白(SSB-single-strand binding SSB-single-strand binding protein)protein):稳定已被解开的稳定已被解开的DNADNA单链,阻止复性和保护单链不单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。被核酸酶降解。引发前体引发前体:它由多种蛋白质它由多种蛋白质dnaAdnaA、dnaBdnaB、dnaCdnaC、n n、n n、n n 和和i i组成。组成。引发前体再与引发酶结合组装成引发体引发前体再与引发酶结合组装成引发体。引发体可以沿模板链引发体可以
20、沿模板链5 5 3 3方向移动方向移动,具有识别合成起始具有识别合成起始 位点的功能,移动到一定位置上即可引发位点的功能,移动到一定位置上即可引发RNARNA引物的合成。引物的合成。移动和引发均需要移动和引发均需要ATPATP提供能量,提供能量,n n蛋白具有蛋白具有ATPATP酶的活力。酶的活力。引发体的移动与引发体的移动与复制叉复制叉移动的方向相同,与移动的方向相同,与冈崎片段冈崎片段的合成方的合成方向相反。向相反。reprep蛋白沿蛋白沿3 3 5 5移动,而解螺旋酶移动,而解螺旋酶I I、IIII、IIIIII沿沿5 5 3 3移动移动。第二十页,本课件共有72页三、三、DNADNA的
21、复制过程的复制过程:(以大肠杆菌为例)(以大肠杆菌为例)双链的解开双链的解开 RNARNA引物的合成引物的合成 DNADNA链的延伸链的延伸 切除切除RNARNA引物,填补缺口,连接相邻的引物,填补缺口,连接相邻的DNADNA片片段段第二十一页,本课件共有72页1 1、双链的解开、双链的解开一些概念:一些概念:v DNADNA的复制有特定的起始位点,叫做的复制有特定的起始位点,叫做复制原点。复制原点。常用常用ori(ori(或或o o)表示。许多生物的复制原点都是富含)表示。许多生物的复制原点都是富含A A、T T的区段。的区段。v大肠杆菌染色体大肠杆菌染色体DNADNA以及真核生物的细胞器以
22、及真核生物的细胞器DNADNA为双为双链环状,只有链环状,只有一个一个复制原点,而真核生物染色体复制原点,而真核生物染色体DNADNA是线性双链分子,含有是线性双链分子,含有许多许多复制起点。复制起点。v从复制原点到终点,组成一个复制单位,叫从复制原点到终点,组成一个复制单位,叫复制子复制子(基因组独立进行复制的单位)。(基因组独立进行复制的单位)。第二十二页,本课件共有72页v复制原点复制原点由由DnaADnaA蛋白识别,蛋白识别,在原点由在原点由DnaBDnaB蛋白(解蛋白(解螺旋酶)将双螺旋解开成单链状态,分别作为模板,合螺旋酶)将双螺旋解开成单链状态,分别作为模板,合成其互补链成其互补
23、链(DNADNA双链的解开还需双链的解开还需DNADNA拓扑异构酶拓扑异构酶 、SSB)SSB),在原点处形成一个眼状结构,叫复制眼。在原点处形成一个眼状结构,叫复制眼。v DNADNA复制复制进行时,在眼的两侧出现两个叉子状的生长进行时,在眼的两侧出现两个叉子状的生长点点(growth point)growth point),叫,叫复制叉复制叉。在复制叉上分布着各。在复制叉上分布着各种与复制有关的酶和蛋白因子,它们构成的复合物种与复制有关的酶和蛋白因子,它们构成的复合物称为称为复制体(复制体(replisomereplisome)复制叉复制叉复制叉复制叉第二十三页,本课件共有72页复制叉起点
24、复制叉延伸延伸起点领头链领头链随后链随后链3535DNA的双向复制的双向复制第二十四页,本课件共有72页(1)复制的起始复制的起始 互相缠绕的双链母本互相缠绕的双链母本DNA,复制从特定的,复制从特定的位置位置(复制原点复制原点Ori or O)开始,该位置常是开始,该位置常是富含富含A、T区段。区段。第二十五页,本课件共有72页第二十六页,本课件共有72页第二十七页,本课件共有72页首先首先DNA解螺旋酶解螺旋酶(DnaB)打开局部双链,打开局部双链,SSB与每条与每条单链结合单链结合,稳定单链并防止稳定单链并防止DNA复性复性;然后在然后在DNA旋转旋转酶酶(TOP)的作用下,使螺旋的作用
25、下,使螺旋DNA局部变成松弛态。局部变成松弛态。第二十八页,本课件共有72页第二十九页,本课件共有72页起始因子、引物酶、起始因子、引物酶、DNA聚合酶聚合酶等随后结合,复制开始。第三十页,本课件共有72页第三十一页,本课件共有72页 引发体在复制叉上移动,沿模板链引发体在复制叉上移动,沿模板链5 5 3 3的的方向移动,与复制叉移动的方向相同,识别合成的起始方向移动,与复制叉移动的方向相同,识别合成的起始位点,位点,DnaBDnaB蛋白活化引物合成酶。引发蛋白活化引物合成酶。引发RNARNA引物的合成。引物的合成。领头链领头链先引发开始合成,以原来一条先引发开始合成,以原来一条DNADNA单
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