生物化学-第七章-酶学.ppt
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1、四川省精品课程 生物化学第七章第七章 酶酶第一节第一节 概述概述第二节第二节 酶的命名与分类酶的命名与分类第三节第三节 酶分子的组成与结构酶分子的组成与结构第四节第四节 酶催化作用的机制酶催化作用的机制第五节第五节 酶促反应动力学酶促反应动力学第六节第六节 酶工程简介酶工程简介四川省精品课程 生物化学第一节第一节 概概 述述一、酶是生物催化剂一、酶是生物催化剂二、酶的化学本质二、酶的化学本质三、酶的作用特点三、酶的作用特点继续继续四川省精品课程 生物化学v 酶酶(Enzyme):是生物活细胞产生的,以蛋白是生物活细胞产生的,以蛋白质为主要成分的质为主要成分的生物催化剂生物催化剂。一、酶是生物催
2、化剂一、酶是生物催化剂v 生物催化剂生物催化剂(Biocatalyst)蛋白质类蛋白质类核酸类核酸类模拟生物催化剂模拟生物催化剂v 胞外酶与胞内酶胞外酶与胞内酶 酶虽是由细胞产生的酶虽是由细胞产生的,但并非必须在细胞内才能起但并非必须在细胞内才能起作用作用,有些酶被分泌到细胞外才发生作用。这类酶称有些酶被分泌到细胞外才发生作用。这类酶称“胞外酶胞外酶”。大部分酶在细胞内起催化作用称为。大部分酶在细胞内起催化作用称为“胞胞内酶内酶”。四川省精品课程 生物化学二、酶的化学本质二、酶的化学本质1.1.酶是蛋白质酶是蛋白质u 1926 1926年年SumnerSumner第一次从刀豆种子中提取了第一次
3、从刀豆种子中提取了脲酶结晶,证明其具有蛋白质性质。脲酶结晶,证明其具有蛋白质性质。u 30 30年代,年代,NorthropNorthrop又分离出结晶的胃蛋白又分离出结晶的胃蛋白酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白酶,证明酶的化学酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白酶,证明酶的化学本质是蛋白质。本质是蛋白质。u 酶具有蛋白质的特性如:两性解离、胶体性酶具有蛋白质的特性如:两性解离、胶体性质、加热使酶变性、颜色反应等;质、加热使酶变性、颜色反应等;u 酶可以被蛋白酶水解而丧失活性;酶可以被蛋白酶水解而丧失活性;u 许多酶的氨基酸顺序已被测定;许多酶的氨基酸顺序已被测定;u 1969 1969年人工合成牛胰核糖核酸酶。
4、年人工合成牛胰核糖核酸酶。四川省精品课程 生物化学u 在已鉴定过的数千种酶中,绝大多数酶的化在已鉴定过的数千种酶中,绝大多数酶的化学本质是蛋白质。但在学本质是蛋白质。但在19821982年,美国科学家年,美国科学家T.CechT.Cech发现原生动物四膜虫的发现原生动物四膜虫的2626S S rRNArRNA前体具前体具有自我拼接的催化活性。有自我拼接的催化活性。T.CechT.Cech将这种将这种RNARNA命名命名为为“RibozymeRibozyme”。u 核酶(核酶(RibozymeRibozyme):):指具有催化活性的指具有催化活性的RNA RNA。2 2、RibozymeRibo
5、zyme的化学本质是的化学本质是RNARNA二、酶的化学本质二、酶的化学本质四川省精品课程 生物化学三、酶的作用特点三、酶的作用特点与无机催化剂相比,有如下共同点:与无机催化剂相比,有如下共同点:v 反应前后都不发生数量和质量变化;反应前后都不发生数量和质量变化;v 能加快反应速度能加快反应速度,但不改变反应的平衡点;但不改变反应的平衡点;v 从热力学上看从热力学上看,只能催化热力学上允许进行的只能催化热力学上允许进行的反应;反应;v 都能降低反应所需的都能降低反应所需的活化能活化能。四川省精品课程 生物化学 极高的催化效率极高的催化效率 高度的专一性高度的专一性 易失活(蛋白质变性)易失活(
6、蛋白质变性)活性可调控(激活、抑制)活性可调控(激活、抑制)常需辅助因子(辅酶、辅基等)常需辅助因子(辅酶、辅基等)三、酶的作用特点三、酶的作用特点与无机催化剂相比,有如下不同点:与无机催化剂相比,有如下不同点:四川省精品课程 生物化学 反应速度与不加催化剂相比可提高反应速度与不加催化剂相比可提高10108 810102020,与加普通催化剂相比可提高,与加普通催化剂相比可提高10107 710101313.1.1.极高的催化效率极高的催化效率NH2COH2ONH2CO2+2NH3脲酶脲酶FeFe粉粉脲酶的催化效率比脲酶的催化效率比FeFe粉高粉高10101515倍。倍。四川省精品课程 生物化
7、学2.2.高度的专一性高度的专一性一种酶只能作用于某一类或某种特定的物质,一种酶只能作用于某一类或某种特定的物质,这种性质称为这种性质称为酶的专一性酶的专一性。(1 1)结构专一性:结构专一性:酶对所催化的分子化学结构的特殊酶对所催化的分子化学结构的特殊要求和选择。要求和选择。类别:类别:绝对专一性和相对专一性绝对专一性和相对专一性(2 2)立体异构专一性:立体异构专一性:酶除了对底物分子的化学结构酶除了对底物分子的化学结构有要求外,对其立体异构也有一定的要求。有要求外,对其立体异构也有一定的要求。类别:类别:旋光异构专一性和几何异构专一性旋光异构专一性和几何异构专一性四川省精品课程 生物化学
8、绝对专一性:绝对专一性:有些酶只作用于一种底物,催有些酶只作用于一种底物,催化一个反应,化一个反应,而不作用于任何其它物质。而不作用于任何其它物质。egeg:过氧化氢酶底物:过氧化氢:过氧化氢酶底物:过氧化氢 琥珀酸脱氢酶底物:琥珀酸琥珀酸脱氢酶底物:琥珀酸四川省精品课程 生物化学相对专一性:相对专一性:这类酶对结构相近的一类底物都这类酶对结构相近的一类底物都有作用。有作用。a.a.键专一性:键专一性:只要求作用于一定的化学键,而对键只要求作用于一定的化学键,而对键两端的基团无严格的要求。两端的基团无严格的要求。b.b.基团专一性:基团专一性:作用于一定的化学键,并对键两端的作用于一定的化学键
9、,并对键两端的基团有要求。基团有要求。a-a-葡萄糖苷酶:葡萄糖苷酶:化学键:化学键:a-a-糖苷键糖苷键 糖苷键的一端是葡萄糖糖苷键的一端是葡萄糖 底物:麦芽糖、蔗糖底物:麦芽糖、蔗糖四川省精品课程 生物化学旋光异构专一性:旋光异构专一性:当底物具有旋光异构体时一当底物具有旋光异构体时一酶只能作用于其中的一种。酶只能作用于其中的一种。如:如:L-AAL-AA氧化酶只能催化氧化酶只能催化L-AAL-AA氧化,而对氧化,而对D-AAD-AA无作用。无作用。L-氨基酸氨基酸+H2O+O2-酮酸酮酸+H2O2+NH3L-氨基酸氧化酶氨基酸氧化酶四川省精品课程 生物化学顺反异构专一性:顺反异构专一性:
10、对具有顺式和反式异构的底对具有顺式和反式异构的底物具严格的选择性。物具严格的选择性。四川省精品课程 生物化学第二节第二节 酶的命名与分类酶的命名与分类一、酶的分类一、酶的分类二、酶的命名二、酶的命名继续继续四川省精品课程 生物化学一一、酶的分类酶的分类1.氧化还原酶类氧化还原酶类2.转移酶类转移酶类3.水解酶类水解酶类4.裂解酶类裂解酶类5.异构酶类异构酶类6.合成酶类合成酶类四川省精品课程 生物化学1.1.氧化还原酶类:氧化还原酶类:催化氧化还原反应的酶,催化氧化还原反应的酶,2.2.如琥珀酸脱氢酶:如琥珀酸脱氢酶:四川省精品课程 生物化学2.2.转移酶:转移酶:催化基团转移反应,即将一个底
11、物催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。例如,例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应:谷丙转氨酶催化的氨基转移反应:四川省精品课程 生物化学3.3.水解酶:水解酶:催化催化底物的加水分解反应。催化催化底物的加水分解反应。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。例如,脂肪酶催化的脂的水解反应:例如,脂肪酶催化的脂的水解反应:四川省精品课程 生物化学4.4.裂合酶:裂合酶:催化从底物上移去某些基团而形成催化从底物上移去某些基团而形成双键的非水解性反应及其逆反应的酶。双键的非水解性反应及其
12、逆反应的酶。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。例如,延胡索酸水合酶催化的反应。例如,延胡索酸水合酶催化的反应。四川省精品课程 生物化学5.5.异构酶:异构酶:催化同分异构体的相互转变,即底催化同分异构体的相互转变,即底物分子内基团或原子的重排过程的酶。物分子内基团或原子的重排过程的酶。例如,例如,6-6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。6-6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖6-6-磷酸果糖磷酸果糖四川省精品课程 生物化学6.6.合成酶:合成酶:又称为连接酶,能够催化又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S
13、C-S 键的形成反应。这类反应必须与键的形成反应。这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶联。分解反应相互偶联。如:如:GlnGln合成酶合成酶,丙酮酸羧化酶。丙酮酸羧化酶。A+B+ATP AB+ADP+PiA+B+ATP AB+ADP+Pi四川省精品课程 生物化学二、二、酶的命名酶的命名 1.1.习惯命名法习惯命名法底物名称:底物名称:脲酶、淀粉酶、蛋白酶脲酶、淀粉酶、蛋白酶反应性质:反应性质:脱氢酶、加氧酶、转氨酶脱氢酶、加氧酶、转氨酶两者结合:两者结合:琥珀酸脱氢酶、谷丙转氨酶琥珀酸脱氢酶、谷丙转氨酶酶的来源:酶的来源:胃蛋白酶、木瓜蛋白酶胃蛋白酶、木瓜蛋白酶 2.2.国际系统命名法国际
14、系统命名法 底物底物1 1:底物:底物2 2 反应类型反应类型 如:琥珀酸:如:琥珀酸:FADFAD氧化还原酶氧化还原酶四川省精品课程 生物化学酶的编号:酶的编号:ECEC、类、亚类、亚亚类、顺序号类、亚类、亚亚类、顺序号类:表示反应性质,前面所述的六大类;类:表示反应性质,前面所述的六大类;亚类:表示反应性质:如第一类中的氧化、脱氢;亚类:表示反应性质:如第一类中的氧化、脱氢;亚亚类:表示作用键的类型或受体;亚亚类:表示作用键的类型或受体;顺序号:表示底物。顺序号:表示底物。国际酶学委员会标志国际酶学委员会标志四川省精品课程 生物化学如:如:1 1大类大类1 1亚类中的亚亚类表示受体的类型亚
15、类中的亚亚类表示受体的类型1.11.1.1.1 表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于=CHOHCHOH基团,受体是基团,受体是NAD+NAD+,NADP+NADP+,1.1.2 1.1.2 表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于=CHOHCHOH基团,受体是细基团,受体是细胞色素胞色素 ,1.11.1.3.3 表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于=CHOHCHOH基团,受体是分基团,受体是分子氧子氧 。当酶的编号仅有前三个数字时,就已清楚地表明了当酶的编号仅有前三个数字时,就已清楚地表明了这个酶的特性:反应性质、反应物这个酶的特性:反应性质、反应物(或底物或底物)性质、键
16、的性质、键的类型。类型。四川省精品课程 生物化学关于编号第四个则没有什么特殊规定,只表示底物关于编号第四个则没有什么特殊规定,只表示底物不同。例如:不同。例如:EC1.1.1.27 EC1.1.1.27 为乳酸:为乳酸:NADNAD+氧化还原酶。氧化还原酶。EC1.1.1.37 EC1.1.1.37 为苹果酸:为苹果酸:NADNAD+氧化还原酶。氧化还原酶。EC1.1.1.1 EC1.1.1.1 为乙醇为乙醇 :NADNAD+氧化还原酶。氧化还原酶。EC6.1.1.1 EC6.1.1.1 为为L-L-酪氨酸:酪氨酸:tRNAtRNA-连接酶连接酶(AMP)AMP)第三个第三个1 1表示作用在表
17、示作用在-CHOHCHOH基团上,受体基团上,受体NADNAD+,第第4 4个数字表示底物不同。个数字表示底物不同。四川省精品课程 生物化学第三节第三节 酶的组成与结构酶的组成与结构一、酶的组成一、酶的组成二、酶的结构二、酶的结构三、酶的活性中心三、酶的活性中心四、酶原四、酶原继续继续四川省精品课程 生物化学按化学成分酶分为:单纯酶和结合酶按化学成分酶分为:单纯酶和结合酶1.1.单纯酶:单纯酶:只由蛋白质组成,如脲酶、淀粉酶、蛋白只由蛋白质组成,如脲酶、淀粉酶、蛋白酶。酶。2.2.结合酶:结合酶:除蛋白质外,还有对热稳定的非蛋白小分除蛋白质外,还有对热稳定的非蛋白小分子物质,称子物质,称辅因子
18、辅因子。一、酶的组成一、酶的组成四川省精品课程 生物化学辅因子辅因子l 辅酶:辅酶:与酶蛋白结合疏松,用透析法可以除去与酶蛋白结合疏松,用透析法可以除去l 辅基:辅基:与酶蛋白结合紧密,不能用透析法除去与酶蛋白结合紧密,不能用透析法除去l 小分子有机化合物:小分子有机化合物:往往是由维生素参与形往往是由维生素参与形成的小分子有机物。成的小分子有机物。l 金属离子:金属离子:与酶蛋白结合,有的紧,有的松与酶蛋白结合,有的紧,有的松四川省精品课程 生物化学二、酶的结构二、酶的结构(一)酶的结构与蛋白质的结构相同,是具有(一)酶的结构与蛋白质的结构相同,是具有一定空间结构的蛋白质。一定空间结构的蛋白
19、质。(二)根据酶蛋白的结构特点,酶可分为:(二)根据酶蛋白的结构特点,酶可分为:1.1.单体酶单体酶:只有一条多肽链只有一条多肽链,分子量在分子量在13,000-13,000-35,00035,000之间,一般是水解酶之间,一般是水解酶,如蛋白酶、羧肽酶。如蛋白酶、羧肽酶。2.2.寡聚酶:寡聚酶:由两个或两个以上的亚基组成由两个或两个以上的亚基组成,亚基之间亚基之间由非共价键相连,亚基可以是相同的由非共价键相连,亚基可以是相同的,也可以是不同也可以是不同的,分子量在的,分子量在35,000-35,000-几百万,如丙酮酸激酶、乳酸几百万,如丙酮酸激酶、乳酸脱氢酶。脱氢酶。3.3.多酶复合体:多
20、酶复合体:由几个酶有组织的聚集在一起由几个酶有组织的聚集在一起,功能功能上相互配合,第一个酶的产物是第二个酶的底物,如上相互配合,第一个酶的产物是第二个酶的底物,如丙酮酸脱氢酶、脂肪酸合成酶。丙酮酸脱氢酶、脂肪酸合成酶。四川省精品课程 生物化学酶蛋白酶蛋白必需基团必需基团其它部分(非必需基团)其它部分(非必需基团)活性中心活性中心维持活性中心高级结构的基团维持活性中心高级结构的基团结合部位结合部位催化部位催化部位三、酶的活性中心三、酶的活性中心四川省精品课程 生物化学活性中心活性中心结合部位:结合部位:与底物结合,决定酶的专一性与底物结合,决定酶的专一性催化部位:催化部位:底物的敏感键在此处断
21、裂而形成新键,底物的敏感键在此处断裂而形成新键,决定酶的高效性决定酶的高效性返返 回回怎怎么么形形成成的的呢呢?怎怎样样的的结结构构特特征征?四川省精品课程 生物化学AspHisSer胰凝乳蛋白酶的活性中心活性中心重要基团活性中心重要基团:His57,Asp102,Ser195酶蛋白多肽链经过盘绕折叠形成特定的空间结酶蛋白多肽链经过盘绕折叠形成特定的空间结构,使相关的构,使相关的AAAA形成微区。形成微区。四川省精品课程 生物化学为为Tyr 248为为Arg 145为为Glu 270为底物为底物羧肽羧肽酶活酶活性中性中心示心示意图意图返返 回回四川省精品课程 生物化学酶活性中心的结构特征:酶活
22、性中心的结构特征:1.1.活性中心是酶分子表面的一个活性中心是酶分子表面的一个凹穴凹穴,一定的,一定的大小和特殊的构象,在与底物接触时表现一定大小和特殊的构象,在与底物接触时表现一定的柔性。的柔性。X-Y四川省精品课程 生物化学2.2.构成活性中心的大多数构成活性中心的大多数AAAA残基为残基为疏水性的疏水性的,使此小区形成一个使此小区形成一个非极性的微环境非极性的微环境,有利于与,有利于与底物作用。在活性中心内底物作用。在活性中心内仅有少数极性仅有少数极性AAAA残基残基以其功能基团直接与底物作用以其功能基团直接与底物作用。酶活性中心的结构特征:酶活性中心的结构特征:3.3.活性中心的活性中
23、心的AAAA在一级结构上相距很远,甚在一级结构上相距很远,甚至不在一条肽链上,但在至不在一条肽链上,但在三级结构上比较靠近三级结构上比较靠近。4.4.在活性中心,底物以在活性中心,底物以弱键弱键与酶结合(有利于与酶结合(有利于产物形成)。产物形成)。四川省精品课程 生物化学胰凝乳蛋白酶的活性中心胰凝乳蛋白酶的活性中心四川省精品课程 生物化学1.1.酶原:酶原:某些酶在细胞内合成或初分泌时没有某些酶在细胞内合成或初分泌时没有催化活性,这种无活性状态的酶前身物称为酶催化活性,这种无活性状态的酶前身物称为酶原。原。2.2.酶原激活:酶原激活:酶原变成酶的过程(切去几个酶原变成酶的过程(切去几个AAA
24、A的肽段)。的肽段)。实质:酶活性中心的形成或暴露过程。实质:酶活性中心的形成或暴露过程。返返 回回(四)酶原(四)酶原四川省精品课程 生物化学第四节第四节 酶的作用机制酶的作用机制一、酶促反应的本质一、酶促反应的本质二、酶与底物的结合二、酶与底物的结合三、酶反应的高效性机制三、酶反应的高效性机制四、酶催化机理的实例四、酶催化机理的实例继续继续四川省精品课程 生物化学一一.酶促反应的本质:酶促反应的本质:降低反应活化能降低反应活化能。E+SP+EES G E1 E2S能能量量水水平平反应过程反应过程四川省精品课程 生物化学中间产物学说中间产物学说酶降低活化能的原因酶降低活化能的原因l 酶(酶(
25、E E)与底物(与底物(S S)结合生成不稳定的中间物结合生成不稳定的中间物(ESES),),再分解成产物(再分解成产物(P P)并释放出酶,使反应并释放出酶,使反应沿一个低活化能的途径进行,降低反应所需活化能,沿一个低活化能的途径进行,降低反应所需活化能,所以能加快反应速度。所以能加快反应速度。l 许多实验事实证明了许多实验事实证明了E ES S复合物复合物的存在。的存在。E ES S复复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。合物形成的速率与酶和底物的性质有关。四川省精品课程 生物化学二、酶与底物的结合二、酶与底物的结合1.1.锁钥学说锁钥学说 认为底物分子或底物分子的一部分象钥匙那样,认为底
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