分子克隆载体与宿主.ppt
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1、第二章第二章 分子克隆载体与宿主分子克隆载体与宿主 Vecotrs and Host Cells主要内容n第一节第一节 分子克隆载体的特点分子克隆载体的特点n第二节第二节 大肠杆菌克隆载体大肠杆菌克隆载体n第三节 真核细胞的克隆载体真核细胞的克隆载体n第四节第四节 宿主系统宿主系统第一节第一节 分子克隆载体的特点分子克隆载体的特点n1.载体的定义n2.分子克隆载体的功能n3.发展概况n4.载体的特点n5.遗传标记基因1.1.分子克隆载体的定义分子克隆载体的定义 分子克隆载体分子克隆载体(vector)是一类可供外是一类可供外源源DNA插入并携带重组插入并携带重组DNA分子进分子进入适当宿主细胞
2、的入适当宿主细胞的DNA分子分子2.分子克隆载体的功能分子克隆载体的功能:n为外源基因提供进入受体细胞的为外源基因提供进入受体细胞的转移转移能力能力n为外源基因提供在受体细胞的为外源基因提供在受体细胞的复制复制或或整合整合能力能力n为外源基因提供在受体细胞中的为外源基因提供在受体细胞中的扩增扩增和和表达表达能力能力3.发展概况发展概况n第第一一阶阶段段(19771977年年前前):天天然然质质粒粒和和重组质粒的利用重组质粒的利用 如如pSC101,ColE1,pCR,pBR313pSC101,ColE1,pCR,pBR313 n第第二二阶阶段段:增增大大载载体体容容量量,建建立立多多克克隆位点
3、区和新的遗传标记基因隆位点区和新的遗传标记基因 n第第三三阶阶段段:进进一一步步完完善善载载体体的的功功能能以以满足基因工程克隆中的不同要求满足基因工程克隆中的不同要求 4.载体的特点载体的特点n至少有一个至少有一个复制起点复制起点,因而至少可在一种生物,因而至少可在一种生物体中有效复制,稳定遗传体中有效复制,稳定遗传n至少应有一个至少应有一个遗传标记遗传标记基因,以指示载体或重基因,以指示载体或重组组DNA分子是否进入宿主细胞分子是否进入宿主细胞n至少应有一个至少应有一个限制酶识别限制酶识别位点,以供外源位点,以供外源DNA插入插入n具有较小的分子量和较高的拷贝数具有较小的分子量和较高的拷贝
4、数n具有对受体细胞的可转移性具有对受体细胞的可转移性,提高载体导入受提高载体导入受体细胞的效率体细胞的效率5.遗传标记基因遗传标记基因n标记基因的作用标记基因的作用n标记基因的种类标记基因的种类n常用的标记基因常用的标记基因 标记基因的作用:标记基因的作用:n指指示示外外源源DNA分分子子(载载体体或或重重组组分分子子)是否进入宿主细胞是否进入宿主细胞 n指指示示外外源源DNA分分子子是是否否插插入入载载体体分分子子形形成了重组子成了重组子 标记基因的种类:标记基因的种类:n抗性标记基因抗性标记基因 n营养标记基因营养标记基因 n生化标记基因生化标记基因 常用的遗传标记基因常用的遗传标记基因
5、n四环素抗性基因(四环素抗性基因(Tcr)抑抑菌菌剂剂,Tetracycline 可可结结合合在在核核糖糖体体30s亚亚基基中中的的一一种种蛋蛋白白质质分分子子上上,抑抑制制核核糖糖体体的的转转位位过过程程。抑抑制制细细胞胞蛋蛋白白质质合合成,细胞停止生长。成,细胞停止生长。四环素抗性基因编码一种四环素抗性基因编码一种399 AAs蛋蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素分子进入细菌细胞。分子进入细菌细胞。n氨苄青霉素抗性基因(氨苄青霉素抗性基因(Apr)杀杀菌菌剂剂,Ampicillin可可抑抑制制细细菌菌细细胞胞膜膜上上参参与与细细胞胞壁壁合合成成酶酶类类的
6、的活活性性,干干扰扰细胞分裂,杀死细胞。细胞分裂,杀死细胞。Apr抗性基因编码一种分泌到细菌细抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,催化胞周间质的酶,催化内酰胺环的水解,内酰胺环的水解,使氨苄青霉素失活。使氨苄青霉素失活。n氯霉素抗性基因(氯霉素抗性基因(Cmr)抑抑菌菌剂剂,Chlorophenicol可可结结合合在在核核糖糖体体50 S亚基上,阻止蛋白质合成。亚基上,阻止蛋白质合成。Cmr基因编码氯霉素乙酰转移酶,使基因编码氯霉素乙酰转移酶,使氯霉素乙酰化,导致乙酰化的氯霉素不氯霉素乙酰化,导致乙酰化的氯霉素不能结合在核糖体上。能结合在核糖体上。n卡那霉素卡那霉素(Kanr)、新霉素新
7、霉素(Neor)、G418抗性基因抗性基因(G418r)杀杀 菌菌 剂剂,Kanamycin,Neomycin和和G418均均属属脱脱氧氧链链霉霉胺胺氨氨基基葡葡萄萄糖糖苷苷类类抗抗生生素素,可可结结合合在在核核糖糖体体上上,导导致致mRNA发生错读。发生错读。来来自自转转座座子子Tn5和和Tn903的的Kanr抗抗性性基基因因均均可可使使这这类类抗抗生生素素磷磷酸酸化化,使使之之不不能能进入细胞内进入细胞内。n半乳糖苷酶基因(半乳糖苷酶基因(lacZ 和和lacZ)半乳糖苷酶基因编码半乳糖苷酶基因编码1021个个 氨基酸氨基酸 其氨基末端称为其氨基末端称为链,羧基末端称为链,羧基末端称为链链
8、 链负责将链负责将链装配为四聚体链装配为四聚体 单单独独的的链链不不具具酶酶活活性性,只只有有在在链链的的帮帮助助下下组组装成装成4才具有酶活性才具有酶活性-互补作用互补作用 为为链编码的基因称之为链编码的基因称之为lacZ(编码编码145 AAs)半乳糖苷酶基因的优点半乳糖苷酶基因的优点 酶催化酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观水解为兰色产物,检测直观 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactosideLacZ和和链基因的分别表达可使载体小而链基因的分别表达可使载体小而容量的大容量的大 通常以通常以 LacZ作为载体的遗传标记基因,而由作为载体的遗传标记基
9、因,而由 宿宿主细胞表达主细胞表达链链n葡萄糖苷酸酶基因(葡萄糖苷酸酶基因(GUS)-葡萄糖苷酸酶可将葡萄糖苷酸酶可将X-Gluc降解为降解为兰色产物兰色产物 适用范围十分广泛,因为许多生物适用范围十分广泛,因为许多生物中没有这种基因中没有这种基因n荧光素酶基因荧光素酶基因 荧荧光光素素酶酶或或由由萤萤火火虫虫产产生生,可可催催化化荧荧光光素氧化,并产生荧光素氧化,并产生荧光 或或 由由 发发 光光 细细 菌菌(Photobacterium fischeri)产生)产生n绿色荧光蛋白基因(绿色荧光蛋白基因(GFP)GFP是由水母产生的一种可发光的蛋白质是由水母产生的一种可发光的蛋白质 问题n1
10、.一个质粒含有四环素抗性基因(tetr)和LacZ基因,tetr内有一Hind III位点,LacZ中有一EcoR I位点。如用这两种限制性核酸内切酶切割载体一并连接入相应的外源片段,则带有该重组质粒的细胞将()。n A.有四环素抗性,在X-gal平板上呈现蓝色 n B.对四环素敏感,在X-gal平板上呈现蓝色 n C.有四环素抗性,在X-gal平板上呈现白色 n D.对四环素敏感,在X-gal平板上呈现白色n2.LacZ基因通常用于构建质粒载体的目的是什么?()n A.编码一种限制性内切核酸酶,在转化细胞时用于切割载体n B.编码蓝色色素产物,可用于示踪转化的细胞 n C.编码一种酶,将RN
11、A转化为DNA n D.编码一种抗生素抗性的酶 n E.编码一种可检测的酶,当基因内部的位点插入任何外源片段,ORF遭到破坏时,产物即不能表达。第二节第二节 大肠杆菌克隆载体大肠杆菌克隆载体主要内容n一一.质粒载体质粒载体n二.载体载体n三三.cos 质粒质粒n四四.细菌人工染色体细菌人工染色体质粒载体n1.质粒的基本特性n2.质粒的改造、构建与使用n3.质粒的分类及用途n4.常用的质粒载体1.质粒的基本特性质粒的基本特性质粒质粒是一类存在于细菌细胞中能独立于染是一类存在于细菌细胞中能独立于染色体色体DNA而自主复制的共价而自主复制的共价,闭合闭合,环状双环状双链链DNA分子分子(1500 k
12、b)(Covalently closed circular DNA,cccDNA)Plasmids:smaller cycles of double-strand DNA that do not carry essential genesn1).具有自己的具有自己的复制起始位点复制起始位点(Origing)(ori)和和控制复制频率的控制基因及编码基因,形成独立控制复制频率的控制基因及编码基因,形成独立复制子复制子(Replico)结构。结构。n2)可扩增性可扩增性。n严紧型复制质粒严紧型复制质粒(Stringent)n 每个细胞复制每个细胞复制1-5 个质粒拷贝。个质粒拷贝。n松弛型复制质粒
13、松弛型复制质粒(Relaxed)n 具有高拷贝数具有高拷贝数30-50个。个。n3)可转移性可转移性在天然条件下,野生型质粒通过细菌接在天然条件下,野生型质粒通过细菌接合作用从一个宿主细胞转移至另一个宿主细胞。合作用从一个宿主细胞转移至另一个宿主细胞。n4)选择标记的插入失活选择标记的插入失活F plasmidn5)不相容性不相容性n相同或相似复制子结构及特征的两种不同质粒不相同或相似复制子结构及特征的两种不同质粒不能稳定地存在于同一受体细胞内,这种现象称质能稳定地存在于同一受体细胞内,这种现象称质粒的不相容性。粒的不相容性。na)两种不同质粒同时进入受体细胞,两者复制的两种不同质粒同时进入受
14、体细胞,两者复制的起始频率随机起始频率随机.nb)分裂前夕的拷贝数不均等,经过若干次细胞分分裂前夕的拷贝数不均等,经过若干次细胞分裂后必然导致,两种不同质粒的独占性。裂后必然导致,两种不同质粒的独占性。2.质粒的改造、构建与使用质粒的改造、构建与使用n删除非必需区,减小质粒的分子量,提高外源删除非必需区,减小质粒的分子量,提高外源DNA的的装载量装载量(一般来说,大于一般来说,大于20kb的质粒很难导入受体细的质粒很难导入受体细胞胞)n加入遗传标记基因加入遗传标记基因n在标记基因内引入具有多种限制酶识别及切割位点的在标记基因内引入具有多种限制酶识别及切割位点的DNA序列,即多克隆位点序列,即多
15、克隆位点(multiple cloning sites,MCS)n根据不同要求,插入特殊的基因表达调控序列根据不同要求,插入特殊的基因表达调控序列n灭活某些质粒的编码基因灭活某些质粒的编码基因质质粒粒载载体体克克隆隆的的一一般般步步骤骤see movie3质粒的分类及用途n1)克隆质粒克隆质粒:用于克隆和扩增外源基因。n2)测序质粒测序质粒:na)高拷贝复制,便于DNA片段克隆和扩增。nb)含多酶切口的接头片段,在接头片段两端邻近区域,设有两个不同的引物序列,重组质粒变性后即可测序。n3)整合质粒整合质粒:n含有整合酶编码基因和特异性整合位点序列,克隆在整合质粒上的外源基因进入受体细胞后,准确
16、重组整合在染色体的特定位置上。n4)穿梭质粒穿梭质粒na)分子上含有两个亲缘关系不同的复制子结构及相应选择标记基因,因此能在两种不同种属的受体中复制并检测。n大肠杆菌-链酶素穿梭质粒,大肠杆菌-酵母菌穿梭质粒。nb)克隆在穿梭质粒上的外源基因不用更换载体直接从一个受体菌转移至另一个受体菌中复制并遗传。n5)探针质粒探针质粒na)设计用来筛选克隆基因的表达调控元件,如启动子,终止子。nb)装有定量检测表达程度的报告基因,(抗生素的抗性基因)nc)缺少启动子,终止子,载体本身不能表达报告基因nd)当含有启动子,终止子的DNA片段插入合适的位点,报告基因才能表达。ne)表达量的大小直接反应被克隆基因
17、的表达调控元件的强弱。n6)表达质粒表达质粒na)在多克隆位点的上游和下游分别装有两套转录效率较高的启动子,合适的核糖体结合位点(SD 序列),终止子结构。使得克隆在合适位点上的任何外源基因都可在受体细胞中,高效表达。nb)大肠杆菌常用启动子:Lac,Tac,Trp 和来自噬菌体强启动子 PL,PR。它们由大肠杆菌 RNA 聚合酶识别起始.nc)来自T7 噬菌体的T7 启动子。必须由T7 噬菌体来源 T7 RNA聚合酶识别起始转录。nd)表达载体用T7 启动子必须用能产生T7 RNA 聚合酶的受体菌株 JM109,DE3。问题:n4.关于穿梭质粒载体,下面哪种说法最正确()n A.在不同的宿主
18、中具有不同的复制机制 n B.在不同的宿主细胞中使用不同的复制起点 n C.在不同的宿主细胞中使用不同的复制酶 n D.在不同的宿主细胞中具有不同的复制速率4.常用的质粒载体常用的质粒载体npBR322筛筛选选重重组组子子的的示示意意图图npBR322质粒载体的优点质粒载体的优点:具有较小的分子量具有较小的分子量 (经验表明经验表明,为避免在为避免在DNA纯化过程中发生链的断裂纯化过程中发生链的断裂,克克隆载体的分子大小最好不要超过隆载体的分子大小最好不要超过10kb)具有两种抗生素的遗传标记基因具有两种抗生素的遗传标记基因,易于选择易于选择重组重组DNA分子分子 具较高的拷贝数,而且经过氯霉
19、素扩增之后,每个细胞中可累积10003000个拷贝 npUC系列载体系列载体 是在是在pBR322基础上衍生出来的一基础上衍生出来的一系列质粒载体系列质粒载体npUC质粒载体的优点质粒载体的优点:具有更小的分子量和更高的拷贝数具有更小的分子量和更高的拷贝数 (2.7kb,500700 copies/cell)适用于组织化学法检测重组体,一步适用于组织化学法检测重组体,一步实现对阳性克隆的鉴定实现对阳性克隆的鉴定具有多克隆位点区(具有多克隆位点区(MCS)Common plasmid vectors can carry up to 15kb foreign DNA问题n1.质粒具备下列特征,因此
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