schfinder讲座.pdf

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1、1SciFinder Web使用介绍使用介绍CAS中国代表处培训专员：祁晶晶2011.10.252提纲提纲 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台美国化学文摘社美国化学文摘社Chemical Abstract Service创建于创建于1907年年ACS的分支机构的分支机构密切关注，索引和提炼着全球化学相关的文献和专利密

2、切关注，索引和提炼着全球化学相关的文献和专利最早创立了最早创立了化学文摘化学文摘总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市3SciFinder中的内容中的内容4期刊期刊专利专利论文论文会议报告会议报告溶剂，催化剂，产率溶剂，催化剂，产率等等物质物质基因基因合成信息合成信息CAPlusMedlineRegistryCASReactChemcatsChemlistSciFinder中的内容中的内容文献数据库文献数据库CAPlus（Pre 1907）覆盖化学相关众多学科领域的参考文献。3400万条文献信息。上万种期刊和61个专利发行机构的专利（含专利族）。会议录、技术报告、图书、学位论

3、文、评论、会议摘要日更新4500条以上的记录Medline美国国立医学图书馆出品生命科学医学相关毒理，病理学报告期刊、临床报告SciFinder中的内容中的内容反应数据库反应数据库6 6CAS React（1840）源自61专利机构和上万种期刊包含有机、有机金属、无机、生化反应。3650万单步，多步反应。1400万制备信息每周更新3-5万条单步、多步反应。SciFinder中的内容中的内容物质数据库物质数据库Registry（Pre 1957）世界上最大的物质数据库6300万个物质、序列无机物、有机物、聚合物、混合物、合金、核酸蛋白质序列等所有具有CAS No 物质日更新1.2万个物质Chem

4、List查询备案/管控化学信息的工具。Chemcats4000万化学物质提供商的联系信息包含价格情况、运送方式、质量等级等信息。8提纲提纲 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台SciFinder的注册和登陆的注册和登陆9SciFinder Web的系统要求的系统要求Windows用户支持用户支持IE 8.x或者或者Fi

5、reFox 2.xMac 用户支持用户支持 Firefox 和和 SafariJava 安装（初次使用结构时自动安装）安装（初次使用结构时自动安装）在图书馆相关页面上找到在图书馆相关页面上找到SciFinder Web注册用的网址注册用的网址注册地址注册地址10点击点击URL创建创建SciFinder账号账号11开始创建开始创建SciFinder帐号帐号每个用户必须输入各自信息每个用户必须输入各自信息12用大学后缀名的邮箱注册用大学后缀名的邮箱注册设置用户名及密码注意事项设置用户名及密码注意事项13用户名：用户名：必须是唯一的，且包含必须是唯一的，且包含 5-15 个字符。它可以只包含字母或字

6、个字符。它可以只包含字母或字母组合、数字和母组合、数字和/或以下特殊字符：或以下特殊字符：-（破折号）（破折号）_（下划线）（下划线）.（句点）（句点）（表示“（表示“at”的符号）的符号）密码：密码：必须包含必须包含 7-15 个字符，并且至少包含三个以下字符：个字符，并且至少包含三个以下字符：字母字母 混合的大小写字母混合的大小写字母 数字数字 非字母数字的字符（例如非字母数字的字符（例如、#、%、&、*）对新对新ID的的email确认确认1448小时内打开并阅读小时内打开并阅读 CAS 的电子邮件激活链接的电子邮件激活链接使用这个链接登陆使用这个链接登陆SciFinder15Http:/

7、scifinder.cas.orgHttp:/origin-scifinder.cas.orgSciFinder登陆界面登陆界面16输入输入SciFinder帐号帐号和密码和密码SciFinder登陆后主界面登陆后主界面17文献，物质，反应检索入口，默认文献检索入口文献，物质，反应检索入口，默认文献检索入口可用的检索方法可用的检索方法保存过的结果集保存过的结果集邮件提醒结果集邮件提醒结果集检索完，请点击退出检索完，请点击退出18课题研究中各个阶段的信息需求课题研究中各个阶段的信息需求1JACS 19952JOC 1987Synthesis of Amino Acids课题总结：期刊课题总结：期

8、刊、专利、会议报、专利、会议报告。告。问题？选题：现问题？选题：现有的研究条件、有的研究条件、背景、能力。背景、能力。课题申报、开题课题申报、开题论证：国内外研论证：国内外研究前景。究前景。实验：实验方法，实验：实验方法，活性评价方法。活性评价方法。信息检索、分析、信息检索、分析、精选。精选。选题、课题申报、开题论证。选题、课题申报、开题论证。19课题的国际发展现状是什么？（有哪些国家参与？发展趋势是什么？）课题的国际发展现状是什么？（有哪些国家参与？发展趋势是什么？）课题的国内外的研究成果有哪些？（研究方法是什么？存在的问题？）课题的国内外的研究成果有哪些？（研究方法是什么？存在的问题？）课

9、题未来可能的应用领域涉及哪些方面？课题未来可能的应用领域涉及哪些方面？课题在国内的核心研究人员是谁？核心研究机构有哪些？课题在国内的核心研究人员是谁？核心研究机构有哪些？本课题的研究都涉及到哪些交叉学科？（是否有重大研究进展本课题的研究都涉及到哪些交叉学科？（是否有重大研究进展?)本课题的研究适合在哪些期刊投稿？本课题的研究适合在哪些期刊投稿？20提纲提纲 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索

10、SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台Explore References 文献检索文献检索21可用的检索方法可用的检索方法提前限定出版年限、文献类型等提前限定出版年限、文献类型等SciFinder中的文献检索中的文献检索22Li电池阳极材料（电池阳极材料（lithium battery,positive pole）使用介词来连接关键词，点击使用介词来连接关键词，点击Search主题检索的候选项主题检索的候选项23“Concept”表示做了同意词的扩展表示做了同意词的扩展“Closely associated with one another”表示同时出现

11、在一个句子中表示同时出现在一个句子中“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一段话中表示同时出现在一段话中为什么只有这么少的文献为什么只有这么少的文献？24文献的分析工具文献的分析工具11种分析方法，种分析方法，可以帮助我们逐步可以帮助我们逐步了解信息需求了解信息需求Scifinder分析工具分析工具Index term 分析分析25发现发现Battery Cathodes,Battery anodesBattery Cathodes,Battery anodes这些这些概念，分别代表电池阴极和电池阳极。那么是概念，分别代表电池阴极和电池阳

12、极。那么是不是使用不是使用Battery anodeBattery anode代替代替Positive PolePositive Pole去去检索会更好，尝试另外的检索。检索会更好，尝试另外的检索。Index TermIndex Term帮助分析文献中重要的概念。帮助分析文献中重要的概念。尝试新的检索尝试新的检索（lithium battery with battery anode）26如何在大量文献中发现最关键信息？如何在大量文献中发现最关键信息？27文献的分析工具文献的分析工具Author name、Company-organization分析分析28作者名分析，了解作者名分析，了解本领域

13、、本课题的本领域、本课题的主要研究人员主要研究人员松下松下三洋三洋索尼索尼万胜万胜三星三星组织机构分析，了解本领组织机构分析，了解本领域的核心研究机构，寻找域的核心研究机构，寻找国际合作伙伴。国际合作伙伴。获得获得509篇索尼公司的文献篇索尼公司的文献29点击“点击“keep analysis”继续分析”继续分析历史导航条历史导航条返回原先的检索界面返回原先的检索界面30Refine限定工具限定工具文献类型分析，快速文献类型分析，快速获得专利、综述、临获得专利、综述、临床研究等特定类型的床研究等特定类型的文献文献获得专利文献获得专利文献31Publication Year 出版年限分析出版年限

14、分析32依据出版年限排序依据出版年限排序出版年限分析，了解出版年限分析，了解近年来的发展趋势近年来的发展趋势010020030040050060070080090010002002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011文献排序功能文献排序功能33引文索引获得最有参考价值的文献引文索引获得最有参考价值的文献点击点击文献标题文献标题，查看查看、获取文献更多的获取文献更多的详细信息详细信息34摘要摘要信息信息文献详细文献详细著录著录信息信息专利专利信息信息重要重要概念索引概念索引35课题研究涉及到哪些交叉学科课题研究涉及到哪些交叉学科？Catego

15、rize系统分析工具系统分析工具Categorize系统分析工具系统分析工具36一级目录一级目录二级目录二级目录和二级目录有关的和二级目录有关的Index Term这里可以选这里可以选择感兴趣的择感兴趣的内容，用于内容，用于文献的筛选文献的筛选37结果的保存结果的保存使用使用Export将结果输出将结果输出Citation manager:保存成保存成RIS格式，用于导入格式，用于导入EndNote等文献管理工具等文献管理工具Offline Review:保存过成保存过成PDF，RTF格式，用于脱机格式，用于脱机浏览浏览文献检索小结文献检索小结 主题检索时，使用介词作为连接主题检索时，使用介词

16、作为连接 尽量选择包含尽量选择包含Concepts和和Closed Associated with的候选项的候选项 通过通过SciFinder 的的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围功能来缩小检索的范围 尝试将不同的尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益功能组合起来用，会有更多的收益 使用使用Categorize可以让系统来实现自动分类可以让系统来实现自动分类 更多细节化内容，请参考更多细节化内容，请参考 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinde

17、r 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台Explore substance 物质检索物质检索40四种物质检索方式：四种物质检索方式：结构检索结构检索Markush检索检索分子式检索分子式检索物质标示符检索物质标示符检索物质标示符检索物质标示符检索41只知道物质的名称，能否找到该物质的具体信息？只知道物质的名称，能否找到该物质的具体信息？物质物质名称检索举例名称检索举例：卟啉：卟啉porphyrin这里可以通过输入物质的名称，这里可以通过输入物质的名称，CA号，号，

18、俗名，商品名，来进行检索俗名，商品名，来进行检索SciFinder中的物质记录中的物质记录42在在SciFinder中，鼠标滑过中，鼠标滑过物质，可以打开物质的标准物质，可以打开物质的标准菜单，通过标准菜单，可以菜单，通过标准菜单，可以获得和物质有关的所有内容获得和物质有关的所有内容查看详细的物质信息查看详细的物质信息43卟啉卟啉CAS号、分子式、结构式、化学名、别名号、分子式、结构式、化学名、别名按照按照CAS Role分类分类的专利、非专利文献的专利、非专利文献列表。对某类文献感列表。对某类文献感兴趣，仅需点击交叉兴趣，仅需点击交叉处的处的即可方便快捷即可方便快捷地获取。地获取。预测数据和

19、实验数据预测数据和实验数据44实验数据，可以看到原始文献对应实验数据，可以看到原始文献对应的链接的链接实验谱图信息实验谱图信息45点击，直接查看物点击，直接查看物质的实验谱图信息质的实验谱图信息物质到文献快速链接物质到文献快速链接46获得分析化学类的文献获得分析化学类的文献获得物质的特定文献获得物质的特定文献47利用利用categorize精选各个学科的文献精选各个学科的文献只了解一个化学结构式，怎样获得具体的物质信息？只了解一个化学结构式，怎样获得具体的物质信息？48点击画图版来进行结点击画图版来进行结构输入，初次使用时构输入，初次使用时需要安装需要安装Java插件插件SciFinder结构

20、绘制工具结构绘制工具重复基团工具重复基团工具铅笔铅笔元素周期表元素周期表可变基团可变基团碳链工具碳链工具选择工具选择工具旋转工具旋转工具环锁定工具环锁定工具正电子正电子橡皮橡皮常用基团常用基团R基团定义工具基团定义工具可变位置连接工具可变位置连接工具模版工具模版工具原子锁定工具原子锁定工具镜面旋转工具镜面旋转工具负电子负电子索套选择工具索套选择工具常见环，多元环工具常见环，多元环工具C原子和单键恢复工具原子和单键恢复工具结构检索选择结构检索选择单双键，单双键，RS构构型，不确定键型，不确定键定义工具定义工具结构和反应切换功能结构和反应切换功能Exact search 精确结构检索精确结构检索5

21、0精确结构检索精确结构检索Java界面界面51提前设置检索条件提前设置检索条件精确结构获取物质的本身，盐，混合物，聚合物等精确结构获取物质的本身，盐，混合物，聚合物等52化学结构式检索化学结构式检索53查找查找8-羟基喹啉衍生物为配体的金属化合物羟基喹啉衍生物为配体的金属化合物绘制结构绘制结构54亚结构检索，亚结构检索，可以查找特定母可以查找特定母核结构的一类物核结构的一类物质质物质检索的提前限定物质检索的提前限定55单一组分物质单一组分物质配位化合物配位化合物物质检索结果物质检索结果56获得与物质相关的文获得与物质相关的文献、反应、商品信息献、反应、商品信息分析和限定工具分析和限定工具物质检

22、索的分析工具物质检索的分析工具57一共一共4种分析工具：种分析工具：商业来源分析商业来源分析元素分析元素分析反应分析反应分析物质角色分析物质角色分析了解配体与哪了解配体与哪些金属螯合些金属螯合了解物质的研了解物质的研究情况究情况物质检索的限定工具物质检索的限定工具58七种限定功能：七种限定功能：1 结构修饰结构修饰2 同位素包含同位素包含3 金属包含金属包含4 商业来源商业来源5 理化性质理化性质6 文献来源文献来源7 原子附属性原子附属性精选对精选对PH、熔点、沸点等理、熔点、沸点等理化性质有特殊要求的物质化性质有特殊要求的物质Atom attachment59鼠标放在任意原子上，显示？，左

23、侧会列出该原子的修饰情况鼠标放在任意原子上，显示？，左侧会列出该原子的修饰情况帮助科研工作者了解化学结构中各个位点的修饰情况帮助科研工作者了解化学结构中各个位点的修饰情况新设计的化合物，如何预测其理化性质？新设计的化合物，如何预测其理化性质？Scifinder化学结构检索化学结构检索60化学结构检索化学结构检索61Exact 精确结构检索精确结构检索Substructure 亚结构检索亚结构检索Similarity 相似结构检索相似结构检索62Similarity 相似结构检索相似结构检索63相似度越高，结构越相近相似度越高，结构越相近与原结构存在的区别与原结构存在的区别64取代基不同取代基不

24、同取代基位置不同取代基位置不同母核结构不同母核结构不同结构检索小结结构检索小结65 精确结构检索：获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等，母体结构不能修改，不能修饰 亚结构检索：所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰 相似结构检索：相似度越高结构越相近，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果化学结构检索化学结构检索66Exact 精确结构检索精确结构检索Substructure 亚结构检索亚结构检索无检索记录，意味着我们设计的化合物就是新结构无检索记录，意味着我们设计的化合物就是新结构67提纲提纲 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册

25、和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台Markush检索检索初步的专利评估初步的专利评估68Markush检索直接返回保护了该结构的专利检索直接返回保护了该结构的专利69获得专利原文获得专利原文查看专利权利要求说明书查看专利权利要求说明书7071X1，X2，X3为为C、N原子，至少有两个是原子，至少有两个是N原子原子R1包括包括COOH基团，基团，R6包括包括SH基团基团保护了我们设计

26、的目标化合物保护了我们设计的目标化合物设计的目标化合物设计的目标化合物专利原文中保护的结构专利原文中保护的结构72提纲提纲 介绍介绍 SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台SciFinder中的反应定义工具中的反应定义工具73反应位置标记工具反应位置标记工具反应箭头反应箭头反应官能反应官能团列表团列表反应原子标反应原子标记工具记工

27、具反应角色工具反应角色工具反应检索反应检索特定物质之间的反应特定物质之间的反应74CHOCOOH精确反应检索帮助获得特精确反应检索帮助获得特定物质之间的反应，点击定物质之间的反应，点击确定确定可以提前设定反应溶剂和不参与反应的官能团可以提前设定反应溶剂和不参与反应的官能团75可以自定义一些反应溶剂以及不参与反应的官可以自定义一些反应溶剂以及不参与反应的官能团。能团。反应检索结果反应检索结果76点击点击Overview查看具体信息查看具体信息反应结果分析反应结果分析77催化剂分析，用于找到经催化剂分析，用于找到经济型催化剂济型催化剂实验过程分析，用于找到实验过程分析，用于找到有实验过程描述的反应

28、有实验过程描述的反应查看实验过程查看实验过程78获得反应中心相似的反应获得反应中心相似的反应79相似反应检索，依据和反应中心相似反应检索，依据和反应中心的相似程度，查询反应中心彼此的相似程度，查询反应中心彼此相似的反应。相似的反应。选择相似级别选择相似级别80对于选择是全部反应中检索相似反应，对于选择是全部反应中检索相似反应，还是在当前结果集中检索相似反应还是在当前结果集中检索相似反应选择相似反应的相似限制选择相似反应的相似限制Broad：仅反应中心相似：仅反应中心相似Miedum：反应中心及附属原子和健：反应中心及附属原子和健Narrow：反应中心及扩展的原子和健：反应中心及扩展的原子和健如

29、何加工整合得到一份完整的合成路线报告？如何加工整合得到一份完整的合成路线报告？81合成路线合成路线合成步骤合成步骤中间体物质信息中间体物质信息阿司匹林的合成路线报告阿司匹林的合成路线报告82阿司匹林阿司匹林定义为产物定义为产物SciPlanner检索结果的智能编辑器检索结果的智能编辑器83勾选感兴趣的反应勾选感兴趣的反应点击点击Send to SciPlanner可以看到有可以看到有1条反应推送到条反应推送到SciPlannerSciPlanner主面板主面板84创建一个新的创建一个新的SciPlanner文件文件SciPlanner拖入反应，并尝试中间体的合成检索拖入反应，并尝试中间体的合成

30、检索85将右侧的反应，拖入将右侧的反应，拖入SciPlanner中中如对其中一个物质的合成很感兴趣，可以如对其中一个物质的合成很感兴趣，可以直接点击，使用物质标准菜单，获得它的直接点击，使用物质标准菜单，获得它的合成方法合成方法SciPlanner将中间体的合成路线添加至将中间体的合成路线添加至SciPlanner86类似上述的步骤，将中间体的反应拖至类似上述的步骤，将中间体的反应拖至SciPlanner中中可以看到这两条反应的产物和反应物是同样的可以看到这两条反应的产物和反应物是同样的用鼠标将这两个结构拖至重贴状态用鼠标将这两个结构拖至重贴状态编辑为完整的反应路线编辑为完整的反应路线87Sc

31、iPlanner获得反应对应的文献获得反应对应的文献88框选所有的反应，所有的结构都显示为红色框选所有的反应，所有的结构都显示为红色点击上面的点击上面的Goto，选择，选择Selected ReferencesSciPlanner反应对应的文献反应对应的文献89勾选文献勾选文献Send to SciPlanner2篇文献推送到篇文献推送到SciPlanner中中SciPlanner自由组合文献和反应的排列自由组合文献和反应的排列90获得结果后，点击获得结果后，点击WorkPlace下的下的Export，将结果输出成，将结果输出成PDF格式格式获得完整的报告获得完整的报告91提纲提纲 介绍介绍

32、SciFinder 中的内容 SciFinder 的注册和登陆 SciFinder 中的检索和后处理中的检索和后处理 SciFinder 中的文献检索 SciFinder 中的物质检索 SciFinder 中的Markush检索 SciFinder 中的反应检索 SciFinder网络资源平台网络资源平台网络在线资源平台网络在线资源平台 Web 常见问题常见问题并发用户数已满并发用户数已满，请稍后再试请稍后再试94SciFinder Web 常见问题常见问题账号或密码错误账号或密码错误，请在请在username处填写处填写，截图截图，并与图书馆联系并与图书馆联系95SciFinder Web 常见问题常见问题请点击测试请点击测试IP地址的链接地址的链接http:/www.cas.org/cgi-bin/casip96将页面截图下来，一并发给图书馆将页面截图下来，一并发给图书馆97