外源基因的表达及其优化策略.pptx
《外源基因的表达及其优化策略.pptx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《外源基因的表达及其优化策略.pptx(90页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素基因表达:基因表达:从从DNA分子有序地将其所承载的遗传信息分子有序地将其所承载的遗传信息,通过密码子通过密码子和反密码子系统和反密码子系统,转变由特定氨基酸顺序构成的多肽或蛋白转变由特定氨基酸顺序构成的多肽或蛋白质分子过程,从而决定生物有机体遗传表型。质分子过程,从而决定生物有机体遗传表型。第1页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素基因表达基因表达 遗传信息从遗传信息从DNA到蛋白质的到蛋白质的传递过程传递过程中心法则(中心法则(central dogma)。
2、)。从从DNADNA分子有序地将其所承分子有序地将其所承载的遗传信息载的遗传信息,通过密码子和反密通过密码子和反密码子系统码子系统,转变由特定氨基酸顺序转变由特定氨基酸顺序构成的多肽或蛋白质分子过程,构成的多肽或蛋白质分子过程,从而决定生物有机体遗传表型。从而决定生物有机体遗传表型。第2页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素克隆基因的表达克隆基因的表达 外源基因在宿主细胞中表达。外源基因在宿主细胞中表达。外源基因外源基因 表达载体表达载体 重组载体重组载体 导入宿主细胞导入宿主细胞 在宿主细胞中在宿主细胞中 表达出蛋白质表达出蛋白质 提取蛋
3、白提取蛋白 宿主细胞:宿主细胞:原核细胞或真核细胞原核细胞或真核细胞第3页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素第4页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 影响外源基因表达的因素主要有:影响外源基因表达的因素主要有:阅读框架阅读框架 顺式作用元件顺式作用元件 翻译过程翻译过程 表达体系表达体系第5页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 一、阅读框架对转化基因的影响一、阅读框架对转化基因的影响 什么是阅读框架什么是阅读框架(open re
4、ading frame,ORF)?二、顺式作用元件对基因表达的影响二、顺式作用元件对基因表达的影响 1.对基因转录起始的调控对基因转录起始的调控 1)启动子启动子 2)增强子增强子 3)沉默子沉默子第6页/共90页生命科学学院生命科学学院第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 二、顺式作用元件对基因表达的影响二、顺式作用元件对基因表达的影响 2.对基因转录终止的调控对基因转录终止的调控 1)终止子终止子 2)衰减子衰减子 3.对对DNA结构的影响结构的影响 1)核基质结合区核基质结合区 2)绝缘子绝缘子 3)基因座控制区基因座控制区第7页/共90页生命科学学院生命科学学院第一
5、节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 三、翻译过程对表达的影响三、翻译过程对表达的影响 1.翻译起始对基因表达的影响翻译起始对基因表达的影响 2.密码子偏爱性对基因表达的影响密码子偏爱性对基因表达的影响 3.翻译终止对基因表达的影响翻译终止对基因表达的影响 四、表达系统对表达产物的影响四、表达系统对表达产物的影响第8页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达用原核生物作宿主。用原核生物作宿主。A dividingA dividing E.coli E.coli 原核或噬菌体启动子原核或噬菌体启动子 MCS SD序列序列
6、 终止子终止子 第9页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达的特点一、原核生物细胞表达的特点 1.原核生物只有原核生物只有一种一种RNA聚合酶聚合酶识别原核细胞的启动识别原核细胞的启动子,催化所有子,催化所有RNA的合成。的合成。2.原核生物的表达是以原核生物的表达是以操纵子操纵子为单位的。操纵子是数为单位的。操纵子是数个相关的结构基因及其调控区的结合,是一个基因表达的个相关的结构基因及其调控区的结合,是一个基因表达的协同单位。协同单位。Z Z编码编码-半乳糖苷酶;半乳糖苷酶;Y Y编码编码-半乳糖苷透过酶;半乳
7、糖苷透过酶;A A编码编码-半乳糖苷乙酰半乳糖苷乙酰基转移酶。基转移酶。第10页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达第11页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达乳糖操纵子乳糖操纵子(lac operon)的调控方式的调控方式第12页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达的特点一、原核生物细胞表达的特点 3.3.原核生物的转录与翻译是偶联的,也是连续原核生物的转录与翻译是偶联的,也是连续
8、进行的。进行的。每个核糖体可独立完成一条多肽链的合成,即这种多核糖每个核糖体可独立完成一条多肽链的合成,即这种多核糖体可以同时在一条体可以同时在一条mRNAmRNA链上合成多条肽链,大大提高了链上合成多条肽链,大大提高了翻译效率。翻译效率。4.4.原核细胞中缺乏真核细胞的转录后加工系统。因此原核细胞中缺乏真核细胞的转录后加工系统。因此当克隆的含有内含子的真核基因在原核细胞中转录成当克隆的含有内含子的真核基因在原核细胞中转录成mRNAmRNA前体后,其中内含子部分不能被切除。前体后,其中内含子部分不能被切除。第13页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基
9、因在原核细胞中的表达转录和翻译偶联、连续进行转录和翻译偶联、连续进行第14页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达的特点一、原核生物细胞表达的特点 5.原核生物基因的控制主要在转录水平,这种控制要比原核生物基因的控制主要在转录水平,这种控制要比对基因产物直接控制要慢。对对基因产物直接控制要慢。对RNA合成的控制有合成的控制有2种方式:种方式:一是起始控制一是起始控制(启动子控制启动子控制),二是终止控制,二是终止控制(衰减子控制衰减子控制)。6.在大肠杆菌在大肠杆菌mRNA的核糖体结合位点上,含有一个的核糖体结合
10、位点上,含有一个翻译起始密码子及同翻译起始密码子及同16S RNA 3末端碱基互补的序列,即末端碱基互补的序列,即SD序列序列。Shine-Dalgarno(S-D)sequence:含有一个启始密码子含有一个启始密码子和一段同核糖体和一段同核糖体16SRNA3末端碱基互补的序列,叫末端碱基互补的序列,叫Shine-Dalgarno(S-D)序列。)序列。第15页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达二、外源基因在原核细胞中表达具备条件二、外源基因在原核细胞中表达具备条件 1.1.通过表达载体将外源基因导入宿主菌,并指导宿主菌的酶系
11、统合通过表达载体将外源基因导入宿主菌,并指导宿主菌的酶系统合成外源蛋白。成外源蛋白。2.2.外源基因不能带有间隔顺序外源基因不能带有间隔顺序(内含子内含子),因而必须用,因而必须用cDNAcDNA或全化或全化学合成基因,而不能用基因组学合成基因,而不能用基因组DNADNA。3.3.必须利用原核细胞的强启动子和必须利用原核细胞的强启动子和SDSD序列等调控元件控制外源基序列等调控元件控制外源基因的表达。因的表达。4.4.外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架(ORF)(ORF)。ORF(open reading frame)ORF
12、(open reading frame):起始于:起始于AUGAUG、止于、止于UAAUAA、UGAUGA、UAGUAG的连续的密码子区域,是潜在的编码区。的连续的密码子区域,是潜在的编码区。5.5.利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的表达产物对宿主菌的毒害。表达产物对宿主菌的毒害。第16页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达 原核生物基因表达载体的组成特征原核生物基因表达载体的组成特征 启动子启动子 核糖体结合位点核糖体结合位点(SD序列序列)终止子终止
13、子 选择标记基因选择标记基因 复制子复制子 原核生物基因表达的受体系统原核生物基因表达的受体系统 大肠杆菌受体系统、芽孢杆菌受体系统、大肠杆菌受体系统、芽孢杆菌受体系统、链霉菌受体系统、链霉菌受体系统、蓝藻受体系统。蓝藻受体系统。第17页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、三、原核生物基因表达的调控原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子 是是DNA上的能与上的能与RNA聚合酶结合并能起始聚合酶结合并能起始mRNA合成合成的序列。的序列。(1)启动子序列)启动子序列 大大肠肠杆杆菌菌的的所所有有启启动动子子中中都都有有两两段段
14、一一致致顺顺序序(consensus sequence)。)。-35 Box 和-10 Box 第18页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达不同启动子的consensus sequences 第19页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子(1)启动子序列)启动子序列 -35box:RNA聚合酶聚合酶 亚基的识别位点亚基的识别位点。5-TTGACA-3 -10box(Pribnow Box):):5-T
15、ATAAT-3 TTGACATTGACA TATAAT TATAAT 转录起始位点转录起始位点 17bp17bp 5 5 核糖体结合位点核糖体结合位点 第20页/共90页第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达原核启动子共有序列的功能 三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子(1)启动子序列)启动子序列第21页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子 (2)翻译的起始位点)翻译的起始位点 a)核糖体结合位点(核
16、糖体结合位点(ribosome binding site,RBS)Shine-Dalgarno(SD)sequence:mRNA上与核上与核糖体糖体16sRNA结合的序列。结合的序列。S-D序列距离序列距离AUG的距离也影响翻译的距离也影响翻译 b)起始密码:起始密码:位于位于SD序列下游序列下游 AUG(91%)、)、GUG(8%)、)、UUG(1%)第22页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 2.RNA多聚酶多聚酶 大肠杆菌只有一种类型的大肠杆菌只有一种类型的RNA多聚酶转
17、录多聚酶转录tRNA,rRNA和和mRNA。(1)结构)结构:全酶是一个:全酶是一个5聚体,含有两个聚体,含有两个小亚基,和小亚基,和2两个大亚基(两个大亚基(和和),一个),一个亚基。亚基。第23页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.3.转录终止子转录终止子 在表达载体克隆位点的下游一般设计一段转录终止子。在表达载体克隆位点的下游一般设计一段转录终止子。启动子启动子 操纵子操纵子 S-D序列序列 目的基因目的基因 终止子终止子 内终止子(内终止子(intrinsic te
18、rminator):):E.coli中促使转录终中促使转录终止的止的DNA位置有一段位置有一段反向回文顺序反向回文顺序,其后紧接一串,其后紧接一串A,称,称为内终止子,形成终止信号。为内终止子,形成终止信号。第24页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.3.转录终止子转录终止子 原理:原理:茎环结构茎环结构 反向回文顺序被转录后,立即形成一个茎环结构,使反向回文顺序被转录后,立即形成一个茎环结构,使转录物与模板之间配对的碱基数降低,整个减弱了转录物与模板之间配对的碱基数降低,
19、整个减弱了RNA 与与DNA的互作的互作 多聚多聚A/U 由于茎环由于茎环3段紧接一串段紧接一串A/U的配对,稳定性比较差,有的配对,稳定性比较差,有利于转录物脱落而不利于转录延续。利于转录物脱落而不利于转录延续。第25页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.3.转录终止子转录终止子第26页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.转录终止子转录终止子第27页/
20、共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 4.4.翻译终止密码翻译终止密码 大肠杆菌偏爱大肠杆菌偏爱UAAU。一般安置上。一般安置上全部的三个终止密全部的三个终止密码码防止核糖体跳跃(防止核糖体跳跃(skipping)。)。5.翻译增强子(翻译增强子(Translation enhancer)能够显著增强外源基因在大肠杆菌细胞中的表达效率能够显著增强外源基因在大肠杆菌细胞中的表达效率的特殊序列。的特殊序列。T7噬菌体基因噬菌体基因10前导序列(简称前导序列(简称g10-L序列)序列);
21、大肠杆菌大肠杆菌atpE基因基因mRNA5-UTR中富含中富含U的区段的区段第28页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 1.最佳启动子必须具备的条件最佳启动子必须具备的条件 必须是一种强启动子必须是一种强启动子 能使外源基因的蛋白产量达到细胞总蛋白的能使外源基因的蛋白产量达到细胞总蛋白的10%-30%以上。以上。应呈现低水平的基础转录应呈现低水平的基础转录 便于表达毒性蛋白等。便于表达毒性蛋白等。应是可诱导型的应是可诱导型的 用温度或化学试剂诱导。用温度或化学试剂诱导。第2
22、9页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达 2.乳糖启动子乳糖启动子lac 来自大肠杆菌的乳糖操来自大肠杆菌的乳糖操纵子。纵子。用乳糖或其类似物用乳糖或其类似物IPTG充当诱导物,与阻遏蛋白结充当诱导物,与阻遏蛋白结合,解除抑制。合,解除抑制。四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子P Placlac OO 目的基因目的基因 第30页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 2.乳糖启动子乳糖启动子la
23、c阻遏物与操纵基因结合阻遏物与操纵基因结合 第31页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 2.乳糖启动子乳糖启动子lac四聚体的四聚体的阻遏物阻遏物 第32页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达阻遏物与DNA的结合四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 2.2.乳糖启动子乳糖启动子laclac第33页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的
24、表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 3.色氨酸启动子色氨酸启动子trp 来自大肠杆菌的色氨酸操纵子。来自大肠杆菌的色氨酸操纵子。trpR P1 O trpE trpD P2 trpC trpB trpA trpR 阻遏蛋白基因;阻遏蛋白基因;P1 P2 启动子;启动子;O 操纵基因;操纵基因;衰减子衰减子 第34页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 3.3.色氨酸启动子色氨酸启动子trptrp色氨酸操纵子 第35页/共90页生命科学学院生命科学学院
25、第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达 没有色氨酸时,阻遏蛋白不能与操纵基因结合,能转录合没有色氨酸时,阻遏蛋白不能与操纵基因结合,能转录合成色氨酸所需要的酶。成色氨酸所需要的酶。(P1P1是主要启动子,是主要启动子,P2P2的作用只有的作用只有3%3%。)。)四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 3.色氨酸启动子色氨酸启动子trp第36页/共90页生命科学学院生命科学学院第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达四、基因工程常用的原核启动子四、基因工程常用的原核启动子 4.PL和和PR启动子启动子 是从是从 噬菌体中得到
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 基因 表达 及其 优化 策略
限制150内