微生物遗传变异.pptx
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1、目的要求:目的要求:通通过过本本章章的的学学习习,使使学学生生掌掌握握细细菌菌基基因因重重组组,真真菌菌基基因因重重组和微生物诱变育种的基本原理和方法。组和微生物诱变育种的基本原理和方法。要求掌握:要求掌握:1、细菌基因重组的原理和方法。、细菌基因重组的原理和方法。2、真菌基因重组的原理和方法。、真菌基因重组的原理和方法。3、微生物诱变育种的原理和方法。、微生物诱变育种的原理和方法。4、基因工程的基本原理、基因工程的基本原理5、基因表达的调控、基因表达的调控重重点:点:基因突变及修复、细菌的基因重组基因突变及修复、细菌的基因重组难难点:点:低频转导,高频转导,低频转导,高频转导,准性生殖,基因
2、表达的调控准性生殖,基因表达的调控第1页/共107页遗传遗传:亲代与子代相似亲代与子代相似变异变异:亲代与子代、子代间不同个体不完全相同亲代与子代、子代间不同个体不完全相同遗传(遗传(inheritance)和变异(和变异(variation)是生命的最本质特性之一是生命的最本质特性之一遗传型遗传型:(genotype)表型表型:(phenotype)生物的全部遗传因子所携带的遗传信息生物的全部遗传因子所携带的遗传信息具有一定遗传型的个体,在特定环境条件下通具有一定遗传型的个体,在特定环境条件下通过生长发育所表现出来的外表特征和内在特征过生长发育所表现出来的外表特征和内在特征的总和。的总和。表
3、型是由遗传型所决定,但也和环境有关。表型是由遗传型所决定,但也和环境有关。遗传型遗传型环境条件环境条件表型表型第2页/共107页微生物是遗传学研究中的明星:微生物是遗传学研究中的明星:t微生物细胞结构简单,营养体一般为单倍体,微生物细胞结构简单,营养体一般为单倍体,方便建立纯系。方便建立纯系。t很多常见微生物都易于人工培养,快速、大很多常见微生物都易于人工培养,快速、大量生长繁殖。量生长繁殖。t物种和代谢类型多样物种和代谢类型多样t对环境因素的作用敏感,易于获得各类突变株,对环境因素的作用敏感,易于获得各类突变株,操作性强。操作性强。第4页/共107页第一节第一节遗传的物质基础遗传的物质基础1
4、、经典转化实验、经典转化实验肺炎链球菌:肺炎链球菌:S型(菌体具荚膜,菌落表面光滑,有型(菌体具荚膜,菌落表面光滑,有致病能力)致病能力)R型(菌体无荚膜,菌落表面粗糙,无型(菌体无荚膜,菌落表面粗糙,无致病能力)致病能力)一、三个证明核酸是遗传物质的经典实验一、三个证明核酸是遗传物质的经典实验第5页/共107页1928年,年,F.Griffth的转化实验的转化实验第6页/共107页1944年,年,Avery的转化实验,确定了转化因子的转化实验,确定了转化因子实验证明,将实验证明,将R菌转化为菌转化为S菌的转化因子是菌的转化因子是DNA!第7页/共107页2、噬菌体感染实验、噬菌体感染实验实验
5、证明,进入细菌细胞内部的物质是实验证明,进入细菌细胞内部的物质是DNA。DNA包含有产包含有产生完整噬菌体的全部信息。生完整噬菌体的全部信息。32P标记标记DNA35S标记蛋白质标记蛋白质第8页/共107页3、植物病毒、植物病毒TMV重建实验重建实验实验证明,实验证明,TMV的遗传物质是的遗传物质是RNA。第9页/共107页朊病毒的发现和思考朊病毒的发现和思考:朊病毒朊病毒蛋白质是遗传物质蛋白质是遗传物质?第10页/共107页1、细胞水平、细胞水平2、细胞核水平、细胞核水平3、染色体水平、染色体水平4、核酸水平、核酸水平5、基因水平、基因水平6、密码子水平、密码子水平7、核苷酸水平、核苷酸水平
6、二、遗传物质在微生物细胞内存在的部位和形式二、遗传物质在微生物细胞内存在的部位和形式(一)遗传物质在(一)遗传物质在7个水平上的形式个水平上的形式第11页/共107页1、细胞水平、细胞水平真核微生物:细胞核真核微生物:细胞核原核微生物:核区原核微生物:核区细胞核或核区的数目在不同的微生物中是不同的细胞核或核区的数目在不同的微生物中是不同的第12页/共107页2、细胞核水平、细胞核水平真核生物真核生物细胞核细胞核核染色体核染色体原核生物原核生物核区核区DNA链链核基因组核基因组在核基因组之外,还存在各种形式的核外遗传物质在核基因组之外,还存在各种形式的核外遗传物质第13页/共107页3、染色体水
7、平、染色体水平真核生物染色体是由组蛋真核生物染色体是由组蛋白与白与DNA构成的线状结构构成的线状结构真核生物通常为多倍体真核生物通常为多倍体原核生物的染色体只有闭原核生物的染色体只有闭合环状的合环状的DNA链链原核生物为单倍体原核生物为单倍体染色体的数目在不同的生染色体的数目在不同的生物中是不同的物中是不同的第14页/共107页4、核酸水平、核酸水平核酸种类:核酸种类:DNA,RNA核酸结构:双链、单链;核酸结构:双链、单链;环状,线状,超螺旋状环状,线状,超螺旋状DNA长度:因种而异长度:因种而异微生物基因组测序工作是在人类基因组计划的促进下开微生物基因组测序工作是在人类基因组计划的促进下开
8、始的,最开始是作为模式生物,后来不断发展,已成为始的,最开始是作为模式生物,后来不断发展,已成为研究微生物学的最有力的手段。研究微生物学的最有力的手段。第15页/共107页5、基因水平、基因水平它的物质基础是一个具有特定核苷酸顺序的它的物质基础是一个具有特定核苷酸顺序的DNA片段。片段。1909年年 丹麦生物学家丹麦生物学家WJohansen结构基因:结构基因:是为细胞结构、组成是为细胞结构、组成(如细胞生化反应所需的酶如细胞生化反应所需的酶)及及 完成细胞功能所需的蛋白质等进行编码的基因完成细胞功能所需的蛋白质等进行编码的基因。调节基因:调节基因:用于编码调节蛋白的基因用于编码调节蛋白的基因
9、。操纵基因:操纵基因:是位于启动子和结构基因之间的一段碱基顺序,是位于启动子和结构基因之间的一段碱基顺序,能与调节蛋白相结合,以此来决定结构基因的转能与调节蛋白相结合,以此来决定结构基因的转 录是否能进行。录是否能进行。重复基因:重复基因:DNA片段重复片段重复跳跃基因:跳跃基因:可在可在DNA上转上转移位置的基因(移位置的基因(ISIS因子、因子、TnTn因子)因子)第16页/共107页6、密码子水平、密码子水平第17页/共107页7、核苷酸水平、核苷酸水平核苷酸是最小突变单位和交换单位核苷酸是最小突变单位和交换单位第18页/共107页(二)微生物基因组结构的特点(二)微生物基因组结构的特点
10、1、原核生物(细菌)的基因组、原核生物(细菌)的基因组1)染色体为)染色体为双链环状的双链环状的DNA分子(单倍体);分子(单倍体);2)基因组上遗传信息具有连续性;)基因组上遗传信息具有连续性;基因数基本接近由它的基因组大小所估计的基因数基因数基本接近由它的基因组大小所估计的基因数一般不含内含子,遗传信息是连续的而不是中断的。一般不含内含子,遗传信息是连续的而不是中断的。3)功能相关的结构基因组成操纵子结构;)功能相关的结构基因组成操纵子结构;4)结构基因的单拷贝及)结构基因的单拷贝及rRNA基因的多拷贝;基因的多拷贝;5)基因组的重复序列少而短;)基因组的重复序列少而短;第19页/共107
11、页2、真核微生物(啤酒酵母)的基因组、真核微生物(啤酒酵母)的基因组1)典型的真核染色体结构;)典型的真核染色体结构;啤酒酵母基因组大小为啤酒酵母基因组大小为13.5106bp,分布在分布在16条染色体中。条染色体中。2)没有明显的操纵子结构;)没有明显的操纵子结构;3)有间隔区(即非编码区)或内含子序列;)有间隔区(即非编码区)或内含子序列;4)重复序列多;)重复序列多;第一个完成基因组测序的真核生物基因组第一个完成基因组测序的真核生物基因组第21页/共107页第22页/共107页2、古生菌(詹氏甲烷球菌)的基因组、古生菌(詹氏甲烷球菌)的基因组第一个完成基因组测序的古生菌第一个完成基因组测
12、序的古生菌1)只有只有40的基因与其他两界的生物有同源性的基因与其他两界的生物有同源性2)古生菌的基因组在结构上类似于细菌古生菌的基因组在结构上类似于细菌1.66x106bp的环状染色体的环状染色体DNA1682个个ORF(OpenReadingFrame)3)负责信息传递功能的基因(复制负责信息传递功能的基因(复制、转录和翻译)则类似、转录和翻译)则类似于真核生物于真核生物第23页/共107页(三)转座因子(三)转座因子转座因子:转座因子:细胞中能细胞中能改变自身位置改变自身位置(例如从染色体或质粒转移到(例如从染色体或质粒转移到另一个位点,或者在两个复制子之间转移)的一段另一个位点,或者在
13、两个复制子之间转移)的一段DNA序列序列。插入序列(插入序列(insertionsequence,IS)转座子(转座子(transposon,Tn)某些病毒(某些病毒(Mu噬菌体)噬菌体)原核生物的转座因子:原核生物的转座因子:第24页/共107页质粒通常不含有细胞初级质粒通常不含有细胞初级代谢的遗传信息,代谢的遗传信息,而含有而含有关于次级代谢的遗传信息关于次级代谢的遗传信息质粒是独立存在于细菌染色体外或附加在染色体上质粒是独立存在于细菌染色体外或附加在染色体上的遗传物质。它由一共价闭合环的遗传物质。它由一共价闭合环DNA分子组成。分子组成。(四)染色体外的遗传因子(四)染色体外的遗传因子质
14、粒(质粒(Plasmid)第26页/共107页 第27页/共107页1、致育因子(fertility factor,F因子)又称F质粒质粒,一种与大肠杆菌的有性生殖现象(接合作用)有关的质粒。携带F F质粒的菌株称为F+菌株菌株(相当于雄性),无F F质粒的菌株称为F F-菌株(相当于雌性)。F F质粒整合到宿主细胞染色体上的菌株称为高频重组菌高频重组菌株株(high frequence recombination,简称Hfr)由于F因子能以游离状态(F+)和以与染色体相结合与染色体相结合的状态(Hfr)存在于细胞中,所以又称之为附加体附加体(episome)。质粒的类型质粒的类型:第28页/
15、共107页2、抗性因子(resistancefactor,R因子)另一类普遍而重要普遍而重要的质粒,主要包括抗药性和抗重金属抗药性和抗重金属二大类,简称R质粒。带有抗药性因子的细菌有时对于几种抗生素或其它药物呈现抗性。例如例如R1质粒质粒(94kb)可使宿主对下列五种药物具有抗性:可使宿主对下列五种药物具有抗性:氯霉素氯霉素(Cm)、链霉素链霉素(Sm)、磺胺磺胺(Su)、氨苄青霉素氨苄青霉素(Ap)、卡那霉素卡那霉素(Km)。并且负责这些抗性的基因是成簇地存在于并且负责这些抗性的基因是成簇地存在于R1抗性质粒上。抗性质粒上。许多R质粒能使宿主细胞宿主细胞对许多金属离子呈现抗性金属离子呈现抗性
16、,包括碲(Te6+)、砷(As3+)、汞(Hg2+)、镍(Ni2+)、钴(Co2+)、银(Ag+)、镉(Cd2+)等。在肠道细菌中发现的R质粒,约有25是抗汞离子的,而铜绿假单胞菌中约占75。第29页/共107页3 3、细菌素质粒 ColCol质粒含有编码大肠菌素的基因 4 4、毒性质粒 具有编码毒素的基因5 5、降解质粒 携带有能降解某些物质的酶的基因 6 6、共生质粒 携带有与固氮有关的基因7 7、代谢型质粒 控制某一特殊代谢过程8 8、隐蔽质粒此类质粒不显示任何表型效应,只有通过物理的方法检测其存在 第30页/共107页松弛型质粒松弛型质粒(relaxedplasmid):质粒在宿主中可
17、以有质粒在宿主中可以有10100个拷贝,也称为高拷贝数质粒。个拷贝,也称为高拷贝数质粒。严谨型质粒严谨型质粒(stringentplasmid):质粒在每个宿主细胞质粒在每个宿主细胞中只有中只有14个拷贝,也叫低拷贝数质粒。个拷贝,也叫低拷贝数质粒。窄宿主范围质粒窄宿主范围质粒:质粒的复制起点较特异,只能在一种:质粒的复制起点较特异,只能在一种特定的宿主细胞中复制。特定的宿主细胞中复制。广宿主范围质粒广宿主范围质粒:质粒的复制起点不太特异,可以在许:质粒的复制起点不太特异,可以在许多种细菌中复制。多种细菌中复制。第31页/共107页质粒的特点:1 1、不亲和性 可以共存于同一细胞中的不同质粒彼
18、此是亲和的,而不能共存于同一细胞的质粒彼此不亲和,质粒的这种特性称为不亲和性。2 2、可消除性 3 3、能自我复制,稳定的遗传;4 4、没有质粒的细菌不能自发的产生质粒,但可以通过转化、转导或接合作用的转移获得质粒;5 5、质粒可以携带供体细胞的DNADNA转移。第32页/共107页质粒的功能:2 2、可作为基因转移的载体。1 1、质粒控制细菌的某一遗传性状;第33页/共107页第二节第二节基因突变和诱变育种基因突变和诱变育种基因突变:基因突变:一个基因内部遗传结构或一个基因内部遗传结构或DNA序列的任何可序列的任何可遗传的改变。遗传的改变。基因突变狭义:点突变(狭义:点突变(一对或少数几对碱
19、基的缺失、插入或置换一对或少数几对碱基的缺失、插入或置换)野生型(原始性状)野生型(原始性状)基因突变突变型(新性状)突变型(新性状)广义:基因突变和染色体畸变(广义:基因突变和染色体畸变(大片段染色体的缺失、重大片段染色体的缺失、重复、倒位复、倒位)一、基因突变的定义一、基因突变的定义第34页/共107页自发突变:自发突变:在自然条件下发生的基因突变。在自然条件下发生的基因突变。诱发突变:诱发突变:利用物理化学因子处理微生物使其产生的突变。利用物理化学因子处理微生物使其产生的突变。回复突变:回复突变:突变菌株发生突变,回复到出发菌株的状态。突变菌株发生突变,回复到出发菌株的状态。基因基因突变
20、突变分为分为二、基因突变的类型二、基因突变的类型同义突变:同义突变:碱基的变化没有改变产物氨基酸序列的变化。碱基的变化没有改变产物氨基酸序列的变化。错义突变:错义突变:碱基序列的变化引起产物氨基酸的变化。碱基序列的变化引起产物氨基酸的变化。无义突变:无义突变:碱基的改变使得密码子变为终止密码子。碱基的改变使得密码子变为终止密码子。移码突变:移码突变:碱基的缺失或插入使翻译的阅读框发生改变,碱基的缺失或插入使翻译的阅读框发生改变,从而使氨基酸序列完全变化。从而使氨基酸序列完全变化。不同的碱基变化对遗传信息的改变不同:不同的碱基变化对遗传信息的改变不同:第35页/共107页U第36页/共107页常
21、见的微生物突变体类型:常见的微生物突变体类型:1、营养缺陷型(、营养缺陷型(auxotroph)特点:特点:在选择培养基(一般为基本培养基)上不生长在选择培养基(一般为基本培养基)上不生长负选择标记负选择标记(突变株不能通过选择平板直接获得)(突变株不能通过选择平板直接获得)缺乏合成其生存所必需的营养物的突变型。缺乏合成其生存所必需的营养物的突变型。第37页/共107页影印平板(影印平板(Replicaplating)法是法是LederbergLederberg夫妇在夫妇在19521952年建立年建立第38页/共107页2、抗药性突变型(、抗药性突变型(resistantmutant)由于基因
22、突变使菌株对某种或某几种药物,特别是由于基因突变使菌株对某种或某几种药物,特别是抗生素,产生抗性的突变型。抗生素,产生抗性的突变型。3、条件致死突变型、条件致死突变型(conditionallethalmutant)在某一条件下具有致死效应,而在另一条件下没有在某一条件下具有致死效应,而在另一条件下没有致死效应的突变型。致死效应的突变型。4、形态突变型、形态突变型(morphologicalmutant)指造成形态改变的突变型。指造成形态改变的突变型。5、其他突变型、其他突变型第39页/共107页1)自发性)自发性2)不对应性)不对应性3)稀有性)稀有性4)规律性)规律性三、基因突变的机制三、
23、基因突变的机制5)独立性)独立性6)可诱变性)可诱变性7)遗传性)遗传性8)可逆性)可逆性1、基因突变的特点:、基因突变的特点:第40页/共107页基因突变自发性和不对应性的实验证明:基因突变自发性和不对应性的实验证明:三个经典实验三个经典实验变量实验变量实验涂布实验涂布实验影印实验影印实验证明突变是自发产生的,并且突变的性状与引起突变的原因间无直接对应关系。野生型野生型(原始性状)(原始性状)特定环境突变型突变型(适应环境的新性状)(适应环境的新性状)驯化驯化定向定向诱变诱变筛选筛选?突变的原因?第41页/共107页变量实验(变量实验(fluctuationanalysis)Salvador
24、LuriaandMaxDelbruck(1943)Salvador LuriaMax DelbruckTheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1969第42页/共107页变量实验(变量实验(fluctuationanalysis)第43页/共107页Newcombe的涂布实验(的涂布实验(1949)第44页/共107页影印实验(影印实验(replicaplating)JoshuaLederbergandEstherLederberg(1952)Joshua LederbergJ.Lederberg is awarded the Noble Prize in J.L
25、ederberg is awarded the Noble Prize in Medicine and Physiology in 1958Medicine and Physiology in 1958第45页/共107页2、自发突变的机制、自发突变的机制主要的原因是:碱基主要的原因是:碱基互变异构体互变异构体的存在导致形成不同的存在导致形成不同的碱基配对。的碱基配对。腺嘌呤氨基式腺嘌呤氨基式AT配对配对腺嘌呤亚氨基式腺嘌呤亚氨基式AC配对配对碱基置换碱基置换:碱基与碱基之间的交换导致突变的发生:碱基与碱基之间的交换导致突变的发生转换转换:嘌呤到嘌呤或嘧啶到嘧啶的碱基置换。:嘌呤到嘌呤或嘧啶到
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