微生物的生态2.pptx
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1、几几 个个 概概念念生物圈:地球上的所有生物。生态系统:生物群落与其无机环境相结合、相作用、相调控而成的动态系统。群落:同一环境中两个以上种群由于生活繁殖上的连锁而构成相依赖、相制约的生物集团。种群:生活在同一环境中的同种个体组成的能繁殖集团。与同种别地的种群有隔离、有界限。第1页/共56页第一节微生物在自然界中的分布与菌种资源本节内容:一、微生物在自然界的分布二、菌种资源的开发第2页/共56页一、微生物在自然界中的分布生物体内外的正常菌群人体的正常微生物区系正常菌群正常菌群:生活在健康动物各部位,数量大、种类较稳定且一般是有益无害的微生物,称为正常菌群。正常菌群与人体的关系:一般能维持平衡,
2、菌群内部的各种微生物之间,也是相互制约而维持相对稳定。变化情况:正常菌群是相对的、可变的、有条件的。机体防御机能减弱时,一部分正常菌群会成为病原微生物;正常菌群在非正常部位时也可引起疾病;由于外界因素的影响,破坏了各种微生物之间的相互制约关系,正常菌群也会引起疾病(菌群失调症)。第3页/共56页其它生物体其它生物体 无菌动物无菌动物(germ-free animal):体内外检查不到任何正常菌群的动物 悉生生物悉生生物(gnotobiotics):已经人为接种某已知纯种微生物的无菌动物 根际微生物根际微生物(rhizosphere microorganism):植物根系经常向周围土壤分泌各种外
3、渗物质,故根际有大量微生物活动。种类组成受植物的种类和植物发育阶段影响。作用是改善植物营养、分泌生长刺激素及抗生素等;有时也有害,与植物争夺N、P等营养、分泌毒素等。附生微生物附生微生物(epibiotic microbe):指生活在植物体表面,主要借其外渗物质或分泌物质为营养的微生物。叶面微生物是主要的附生微生物。第4页/共56页土壤中的微生物土壤中的微生物土壤中的环境条件:营养、水分、空气、酸碱度、渗透压和温度条件都适于微生物的生活,是微生物的大本营、也是人类最丰富的“菌种资源库”。土壤中微生物的数量:按种类递减细菌放线菌霉菌酵母菌藻类原生动物108107106105104103个/g耕作
4、土壤中,细菌湿重约90 225kg;以土壤有机质含量为2%计算,则所含细菌干重约为土壤有机质的1%左右。土壤微生物的代谢活动,可改变土壤的理化性质,进行物质转化,因此,土壤微生物是构成土壤肥力的重要因素。若按生物量计算则各种微生物的生物量基本相当。第5页/共56页土壤中微生物的含量土壤中微生物的含量土壤中微生物的含量与土壤有机质含量有直接关系。表层耕作土中含量最高,耕作层厚度2030cm,地表土受阳光直接照射,其中微生物含量较低。采取土样时一般要刮开表土23cm后采样。第6页/共56页我国各主要土壤的含菌量我国各主要土壤的含菌量(万万/克干土克干土)土类地点细菌放线菌真菌暗棕壤黑龙江呼玛2,3
5、2761213棕壤辽宁沈阳1,2843936黄棕壤江苏南京1,4062716红壤浙江杭州1,1031234砖红壤广东徐闻5073911磷质石灰土西沙群岛2,2291,10515黑土黑龙江哈尔滨2,1111,02419黑钙土黑龙江安达1,0743192棕钙土宁夏宁武140114草甸土黑龙江亚沟7,8632923嵝土陕西武功9511,0324白浆土吉林皎河1,598553滨海盐土江苏连云港466410.4第7页/共56页水中的微生物水中的微生物自然界江河湖海等各种淡水与咸水水域中都生存着相应的微生物。水域中微生物的种类和数量与水域的有机物、无机物的种类和含量,光照、酸碱度、渗透压、温度、含氧量和有
6、毒物质的含量有密切关系。各种水系:水淡水海水地下水:无色杆菌、黄杆菌、革兰氏阳性杆菌、微球菌、诺卡氏菌地表水溪水:营养少、主要是革兰氏阴性无芽孢杆菌、生丝微菌河水:出现假单孢菌、芽孢、肠杆菌、弧菌、螺菌、硫细菌、微球菌、八叠球菌、诺卡氏菌、链球菌、螺旋体等污水生活污水:荧光、绿脓、变形、枯草、阴沟、大肠、粪链球菌、病毒和噬菌体生产污水:与所含污物有关第8页/共56页海水:海水:平均含盐量:3.5%,密度大、渗透压高、冰点低微生物组成:多数为革兰氏阴性菌、多嗜盐、河口处有耐盐菌,嗜盐菌:低嗜盐菌,适于生活在盐浓度25%;中等嗜盐菌,适于生活在盐浓度520%;高嗜盐菌:适于生活在盐浓度2030%形
7、 态:多有鞭毛,常见多形性、可变为球形、弧形、丝状及螺旋状,个体小;生 理:兼性厌氧,生长慢,能在低营养下生活,常产色素,分解蛋白质能力强,解糖能力低,多嗜冷,对热敏感;分 布:不均匀,与水深成反比,010米少1050米呈上升变化50米以下数量减少海底沉积物上多常见菌种:假单孢菌、弧菌、螺菌、无色杆菌、黄杆菌第9页/共56页清水型水生微生物清水型水生微生物洁净湖泊和水库,微生物数量少(10103/ml),以化能自养型和光能自养型微生物为主,部分腐生细菌,如色杆菌、无色杆菌和微球菌等;霉菌中如水霉、绵霉等的一些种;以及单细胞和丝状的藻类和一些原生动物常在水面生长,数量较少。以上微生物种类可以认为
8、是水中的“土著”菌群。根据微生物对水生环境中的营养要求,将其分为三类:贫营养细菌(115mgC/L)、兼性贫营养细菌(指一些在富营养培养基中经反复培养后也能适应并生长的贫营养细菌)、富营养细菌(10gC/L)贫营养指数(O.I):某水样中贫营养细菌占总菌数的百分比第10页/共56页类型:流经城市的河水、港口附近的海水、滞留的池水、阴沟水环境情况:流入了大量的人畜排泄物、生活污物和工业废水等,有机物含量大增微生物数量和类群:数量:大量外来的腐生细菌,使腐败型水生微生物尤其是细菌和原生动物大量繁殖,每毫升污水的微生物含量达到107108个。类群:革兰氏阴性无芽孢杆菌,如Proteus、E.coli
9、、Enterobacter aerogenes和Alcaligenes等,各种Bacillus、Vibrio和Spirillum等的一些种纤毛虫类、鞭毛虫类和根足虫类等原生动物还有一些随人畜排泄物和病体污物进入水体的动植物致病菌繁殖及后果:通常因水体环境中的营养等条件不能满足其生长繁殖的要求,加上周围其它微生物的竞争和拮抗关系,一般难以长期生存,但由于水体的流动,也会造成病原菌的传播甚至疾病的流行。腐败型水生微生物腐败型水生微生物第11页/共56页水的自净作水的自净作用用污水中的微生物在污水环境中大量繁殖,逐渐把水中的有机物分解成简单的无机物,同时它们的数量随之减少,污水也就逐步净化变清。水源
10、的饮用价值:良好的饮用水细菌含量应在100个/ml以下,当超过500个/ml时,即不适合作为饮用水。更重要的是水中的微生物种类,一般用大肠菌群数作为是否含有病原菌的指标。在自然水体尤其是快速流动的水中,存在着对有机或无机污染物的自净作用。其原因是多方面的,有稀释、沉降、吸附等物理作用,更重要的是各种生物学和生物化学作用,如好氧菌对有机物的分解作用、原生动物对细菌等的吞噬作用,噬菌体对宿主的裂解作用,以及微生物产生的凝胶物质对污染物的吸附、沉降作用等使水中有机物含量降低,这种作用称为水的自净作用。是流水不腐的原因。第12页/共56页空气中的微生物空气中的微生物空气中的环境条件:无营养和水分、紫外
11、线直射存在状态:漂浮,短暂停留,以吸附于尘埃微粒上的形式存在。空气中的尘埃颗粒数与微生物数量有直接关系。分布:越接近地面的空气含菌量越高,目前人类检测到微生物存在的最高处为85km的高空。种类:球菌、芽孢杆菌、产色素细菌、真菌孢子空气中微生物数量的测定:培养皿沉降法、液体阻留法空气中微生物的杀灭与去除:紫外线照射、甲醛熏蒸、药物喷雾、过滤除菌等,常用的过滤介质有棉花、纱布、石棉滤板、活性炭或超细玻璃纤维过滤纸等。第13页/共56页工农业产品上的微生物工农业产品上的微生物工业品:食品:农产品:极端环境中的微生物(自学)第14页/共56页微生物引起的工业产品的霉腐微生物引起的工业产品的霉腐工业品类
12、型:纤维制品、革制品、橡胶制品、油漆、卷烟、化妆品等,塑料、水性涂料等,光学镜头、棱镜、建筑泥浆、钢缆、地下管道、金属材料等,电讯器材、感光和录音录象材料、文物、书画等材料劣化:工农业产品因受气候、物理、化学或生物因素的作用而被破坏的现象微生物引起的劣化种类:霉变(mildew,mouldness):由霉菌引起的劣化腐朽(decay)泛指在好氧条件下微生物酶解有机质使其劣化的现象,常见的如由担子菌引起的木材或木制品的腐朽现象腐烂(或腐败,Putrefection,rot)主要指由细菌或酵母菌引起的使物体变软、发臭性的劣化腐蚀(corrosion)主要指由硫酸盐还原细菌、铁细菌或硫细菌引起的金属
13、材料的侵蚀、破坏性劣化变质(deterioration)指由各种生物或非生物因素引起的工农业产品质量下降的现象第15页/共56页霉腐微生物学霉腐微生物学定义:工农业产品的劣化主要是霉变与腐烂,故研究危害各种工农业产品的微生物种类、分布、作用机理以及如何防治其危害的科学。霉腐微生物的作用机理:通过微生物酶系分解各种工农业产品中的相应组分产生危害。在矿物油中生长,不仅因大量菌体阻塞机件,代谢产物会腐蚀金属器件硫细菌、铁细菌和硫酸盐还原菌会对金属制品、管道和船体外壳等产生腐蚀菌体和代谢物属于电解质,对电讯、电机器材等会危及其电学性能有些霉菌分泌的有机酸能腐蚀玻璃以致严重降低光学仪器的性能烟叶、中药材
14、、化妆品建材、图书、文物、档案、艺术品、生物标本第16页/共56页霉腐微生物的控制霉腐微生物的控制控制其温度、湿度、氧气和养料采用有效的化学抑菌剂、杀菌剂或物理杀菌剂在工业产品加工、包装过程中,尽量保持环境卫生并严防杂菌污染工业防霉剂筛选的试验菌种及其特性 菌 名 破 坏 性 能Aspergillus niger(黑曲霉)在许多材料上广泛生长,抗铜盐Asp.terreus(土曲霉)侵蚀多种材料Aureobacidium pullulans(出芽短梗霉)侵蚀涂漆与喷漆Paecilomyces varioti(宛氏拟青霉)侵蚀塑料和皮革Penicillium funiculosum(绳状青霉)侵蚀
15、织物及多种材料P.ochro-chloron(赭绿青霉)侵蚀塑料与织物,抗铜盐Scopularriopsis brevicaulis(短柄帚霉)侵蚀橡胶Tricoderma viride(绿色木霉)侵蚀纤维织物与塑料第17页/共56页食品上的微生物食品上的微生物食品的基质条件:含有丰富的营养物质和适宜的环境食品上微生物的来源:食品原料的采收、运输、加工和包装过程中被微生物污染,食品原料在土壤中生长所正常带有的微生物污染食品的微生物种类:Aspergillus、Penicillium、Fusarium、Alternaria、Paecilomyces、Rhizopus、Mucor、Trichode
16、rma、Phoma、Escherichia coli、Staphylococcus aureus、Bacillus subtilis、B.megaterium、Salmonella、Proteus vulgaris、Pseudomonas aeroginosa、Lactobacillus、Streptococcus lactis、Clostridium、Sacchromyces cerevisiae等。微生物污染的危害:除引起食品变质外,还可能含有各种致病菌和毒素等有害代谢产物,会引起人类的各种严重疾病第18页/共56页防止霉腐的方法:防止霉腐的方法:在加工、制造、包装过程中必须特别注意清洁卫
17、生控制保藏条件采用低温、干燥、密封等措施添加少量无毒的化学防腐剂如苯甲酸、山梨酸、脱氢醋酸、维生素K、丙酸、二甲基延胡索酸等主要食品中常见防腐剂的应用情况食品名 硝酸盐 SO2环六甲甲酸 乙酸 丙酸 山梨酸苯甲酸 对羟基 联苯 烟熏 亚硝酸盐 基胺 苯甲酸酯干酪(+)(+)+(+)(+)+肉制品 +(+)+(+)+水产品 +蔬菜食品 +(+)果品 +(+)(+)软饮料 +(+)葡萄酒 +面包 +糖果糕点 +(+)+第19页/共56页罐头食品的变质与微生物罐头食品的变质与微生物罐头食品的种类:酸性食品罐头:属于一般酸性食品(pH3.74.5)者,如番茄、梨、无花果、菠萝和其它水果罐头;属于高酸食
18、品(pH5的食品称低酸食品,如多数肉类、海产品、牛奶、玉米和豌豆等;pH为4.55的食品则称中酸食品,如肉菜混合物、汤料和沙司等。需要用较高的灭菌温度,特别是肉类罐头。变质时,可检出Bacillus stearothermophilus(嗜热脂肪芽孢杆菌)和B.coagulans(凝结芽孢杆菌)等“平酸菌”,还可分离到Clostridium thermosaccharolyticum(嗜热解糖梭菌)等成算产气菌以及分解蛋白质的C.sporogenes(生孢梭菌)、C.histolyticum(溶组织梭菌)和C.botulinun(肉毒梭菌)等厌氧梭状芽孢杆菌。除平酸菌外在生长过程中都会产生大量
19、的CO2和H2,从而引起罐头膨胀(“胖听”)。其中的C.botulinum还会产生对人畜有剧毒的细菌外毒素肉毒毒素。第20页/共56页农产品上的微生物农产品上的微生物粮食和饲料上的微生物粮食和饲料上的微生物主要菌种:以青霉属、曲霉属、镰孢霉属(Fusarium)等的一些种为主。真菌毒素:目前已知的五万多种真菌中,至少有两百多个种能产生一百多种真菌毒素,其中有14种致癌,两种是剧毒致癌剂,其一为黄曲霉毒素(aflatoxin),另一种是由某些镰孢菌产生的单端孢烯族毒素T2。凡是被霉菌严重污染的粮食一般都含有多种真菌毒素,因此,“防癌必先防霉防癌必先防霉”。一份“黄变米”试样中70%米粒污染有产毒
20、真菌,并都含有真菌毒素;北京空气中飘浮的真菌中11.5是产毒真菌。主要真菌毒素:黄曲霉毒素、赭曲霉素、杂色曲霉素、岛青霉素、黄天精、环氯素、展青霉素、桔青霉素、皱褶青霉素、黄绿青霉素、青霉酸、圆弧青霉素、偶氮酸、单端孢烯族毒素、二氢雪腐镰刀菌烯酮和T2毒素等。第21页/共56页二、菌种资源的开发工业发酵产物的性质:菌体物质生产分解酶类生产主流代谢产物、次生代谢产物或生物合成产物菌种筛选的一般原则和基本步骤:采集菌样:了解目标菌分布情况、首选样品是土壤富集培养:利用选择性培养基的原理,向所采土样中加入某些特殊营养物,并创造一些有利于待分离对象生长的条件,使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物大
21、量繁殖,以提高其在群体中的比例,使之便于分离。纯种分离:见第八章第五节“菌种的衰退、复壮与保藏”。性能测定:见第八章第五节“菌种的衰退、复壮与保藏”。第22页/共56页采取土壤样品要考虑的几个问题采取土壤样品要考虑的几个问题土质肥,微生物含量高,特别肥沃的土壤中细菌多,放线菌少;在植物残体枯枝落叶下的土壤中较多含有拮抗性真菌。离地面520cm处的土壤通气良好、不受阳光直射,喊菌量最高。采土季节以春秋两季最好。采土方法:选择适当地点、铲除表土、取土样数十克,盛入事先准备的无菌防水纸袋中,其上记录采土时间、地点、植被情况等。多点采土、混合分离,可以代表每一地块上的微生物分布平均情况第23页/共56
22、页土样的富集培养土样的富集培养含有目的菌较多的土样不需要富集培养如果原有样品中目的菌含量低,可以人为地添加相应的基质,培养使之以较其它微生物更快的速度生长繁殖,从而提高它们在样品中的比例,便于分离。富集培养的一般方法:采用有利于目的菌种而不利于无关微生物的营养和培养条件,以达到使目的菌种在群体中比例上升的目的。一些有特定物质产生能力的菌种,不容易富集,只有通过大量艰苦的工作筛选取得。第24页/共56页某些细菌的富集条件某些细菌的富集条件 富集对象 接种菌样添加营养物(g)特殊培养条件好氧氨基酸氧化菌土壤好氧,pH7.0好氧性芽孢杆菌土壤,巴氏消毒 好氧,pH7.0氨基酸发酵性梭菌土壤,巴氏消毒
23、 厌氧,pH7.0耐碱解尿素芽孢菌土壤,巴氏消毒 尿素50 好氧,pH8.6 厌氧八叠球菌土壤 葡萄糖20厌氧,pH23 乳酸菌植物体或牛奶 葡萄糖20厌氧,pH6.5 肠道细菌土壤或污水葡萄糖20,CaCO320 好氧或厌氧,pH7.0 丙酸菌干酪 乳酸钠20厌氧,pH7.0 醋酸菌果实或生啤酒 乙醇40 好氧,pH6.0注:培养基成分为酵母膏10g,KH2PO4或K2HPO4 1.0g,MgSO47H2O 0.2g,加水1000ml。一般培养在30下。第25页/共56页第二节微生物与生物环境之间的相互关系微生物与任何一种生物之间的关系:双方获益:共生、互利共栖、协同共栖、互养共栖(+)单方
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