核酸的降解与核苷酸代谢.pptx
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1、教学目的和要求教学目的和要求1 1、了解核酸的酶促降解及降解所用的酶;、了解核酸的酶促降解及降解所用的酶;2 2、掌握嘌呤核苷酸、嘧啶核苷酸的分解代谢;、掌握嘌呤核苷酸、嘧啶核苷酸的分解代谢;3 3、掌握嘌呤核苷酸、嘧啶核苷酸从头合成途径、掌握嘌呤核苷酸、嘧啶核苷酸从头合成途径、补救合成途径及其生理意义。补救合成途径及其生理意义。第第1 1页页/共共5454页页核酸酶的定义及分类核酸酶的定义及分类核酸酶核酸酶是指作用于核酸的磷酸二酯键的酶是指作用于核酸的磷酸二酯键的酶u 依据底物不同分类依据底物不同分类vDNADNA酶酶(deoxyribonuclease,DNase)(deoxyribonu
2、clease,DNase):专一降解专一降解DNADNAvRNARNA酶酶 (ribonuclease,RNase)(ribonuclease,RNase):专一降解专一降解RNARNA一、概述第一节第一节 核酸的酶促降解核酸的酶促降解 第第2 2页页/共共5454页页u依据切割部位不同依据切割部位不同 核酸内切酶:核酸内切酶:分为限制性核酸内切酶和分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性核酸内切酶。非特异性限制性核酸内切酶。限制性内切酶:在细菌细胞内存在的一限制性内切酶:在细菌细胞内存在的一类能识别并水解外源双链类能识别并水解外源双链DNADNA的核酸内切的核酸内切酶,可用于特异切割酶,可用于特
3、异切割DNADNA,常作为工具酶。,常作为工具酶。核酸外切酶:核酸外切酶:5 533或或3 355核酸外切酶核酸外切酶第第3 3页页/共共5454页页一、核酸外切酶一、核酸外切酶(exonuclease)作用于核酸链的末端,逐个水解下核苷酸。DNA外切酶:只作用于DNA。RNA外切酶:只作用于RNA。同时作用于DNA和RNA的外切酶。核糖核酸酶核糖核酸酶(RNase)和脱氧核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶(DNase)从核酸链的3端开始切,生成5核苷酸。从核酸链的5端开始切,生成3核苷酸。同时切核酸链的3端和5端。第第4 4页页/共共5454页页外切核酸酶对核酸的水解位点外切核酸酶对核酸的水解位点5
4、 p p p pOHB p p p p3BBBBBBB牛脾磷酸二酯酶牛脾磷酸二酯酶(55端外切端外切5 5得得3 3)蛇毒磷酸二酯酶蛇毒磷酸二酯酶(33端外切端外切3 3得得5 5)第第5 5页页/共共5454页页 二、核酸内切酶二、核酸内切酶(endonuclease)水解多核苷酸链内部的磷酸二酯键。DNA内切酶:只作用于DNA。RNA内切酶:只作用于RNA。同时作用于DNA和RNA的内切酶。第第6 6页页/共共5454页页1、非特异性内切酶(、非特异性内切酶(P285)(1 1)核酸酶)核酸酶(2 2)核糖核酸酶)核糖核酸酶(3 3)脱氧核糖核酸酶)脱氧核糖核酸酶第第7 7页页/共共545
5、4页页 2 2、限制性内切酶、限制性内切酶 (ristriction endonucleaseristriction endonuclease)对某些碱基顺序专一的核酸内切酶。生物学功能:(1)、识别双链DNA上的特定位点即“回文结构”(长度在4-8个碱基对范围内,从前往后读和从后往前读完全一样的碱基序列),切割后错开的切口会产生互补的单链末端(粘性末端、平末端)。(2)、降解外面侵入的DNA,但不降解自身细胞的DNA,因为自身DNA的酶切位点上经甲基化修饰而得到保护。第第8 8页页/共共5454页页限制性内切酶类型限制性内切酶类型I I型:分子量大于型:分子量大于型:分子量大于型:分子量大于
6、10105 5,多亚基,需,多亚基,需,多亚基,需,多亚基,需S-S-线苷蛋氨酸、线苷蛋氨酸、线苷蛋氨酸、线苷蛋氨酸、ATPATP和和和和MgMg2+2+,识别位点与切割位点相差甚远,产物为异质,是限,识别位点与切割位点相差甚远,产物为异质,是限,识别位点与切割位点相差甚远,产物为异质,是限,识别位点与切割位点相差甚远,产物为异质,是限制与修饰相排斥的多功能酶制与修饰相排斥的多功能酶制与修饰相排斥的多功能酶制与修饰相排斥的多功能酶.型:分子量小于型:分子量小于型:分子量小于型:分子量小于10105 5,需,需,需,需MgMg2+2+,切割位点位于识别,切割位点位于识别,切割位点位于识别,切割位
7、点位于识别 位位位位点上,产物为专一性片段,不具修饰酶功能。现在分子生物点上,产物为专一性片段,不具修饰酶功能。现在分子生物点上,产物为专一性片段,不具修饰酶功能。现在分子生物点上,产物为专一性片段,不具修饰酶功能。现在分子生物学研究所用的限制性内切酶均为此类。学研究所用的限制性内切酶均为此类。学研究所用的限制性内切酶均为此类。学研究所用的限制性内切酶均为此类。IIII型:识别位点为型:识别位点为型:识别位点为型:识别位点为5-7bp5-7bp的非对称序列的非对称序列的非对称序列的非对称序列,切割位点在,切割位点在,切割位点在,切割位点在顺序之外离识别顺序之外离识别顺序之外离识别顺序之外离识别
8、 序列序列序列序列5-10bp5-10bp,切割双链,个别也切割单链。,切割双链,个别也切割单链。,切割双链,个别也切割单链。,切割双链,个别也切割单链。是限制与修饰相多功能酶是限制与修饰相多功能酶是限制与修饰相多功能酶是限制与修饰相多功能酶.第第9 9页页/共共5454页页常用的常用的DNA限制性内切酶的专一性限制性内切酶的专一性酶酶辨认的序列和切口辨认的序列和切口说明说明AGCTTCGAGGATCCCCTAGGAGATCTTCTAGAGAATTCCTTAAGAAGCTTTTCGAAGTCGACCAGCTGCCCGGGGGGCCCBamHIAluIBglIEcoRIHindSalISmaI四
9、核苷酸,平端切口四核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口第第1010页页/共共5454页页限制性内切酶的命名和意义限制性内切酶的命名和意义EcoRI序号序号序号序号属名属名属名属名种名种名种名种名株名株名株名株名例:例:例:例:EcoRIEcoRI,这是从大肠杆菌(,这是从大肠杆菌(,这是从大肠杆菌(,这是从大肠杆菌(EcoliEcoli)R R菌珠中分离出的一种限制性内切酶菌珠中分离出的一种限制性内切
10、酶菌珠中分离出的一种限制性内切酶菌珠中分离出的一种限制性内切酶 限制性内切酶是分析染色体结构、制作限制性内切酶是分析染色体结构、制作DNADNA限限制图谱、进行制图谱、进行DNADNA序列测定和基因分离、基因体外序列测定和基因分离、基因体外重组等研究中不可缺少的工具,是一把天赐的神刀,重组等研究中不可缺少的工具,是一把天赐的神刀,用来解剖纤细的用来解剖纤细的DNADNA分子。分子。第第1111页页/共共5454页页5GAATTC33CTTAAG55G TTAAC33CAATT G5粘性末端EcoR第第1212页页/共共5454页页核酸核酸磷酸磷酸核苷酸核苷酸核苷核苷磷酸磷酸-戊糖戊糖碱基碱基水
11、水解解核酸酶核酸酶核苷酸酶核苷酸酶核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶何处去?何处去?进入磷酸戊糖途径进入磷酸戊糖途径或或重新合成核酸重新合成核酸?分解分解合成合成第二节第二节 核苷酸的分解代谢核苷酸的分解代谢 第第1313页页/共共5454页页(1)、嘌呤的降解第第1414页页/共共5454页页不不同同种种类类的的生生物物分分解解嘌嘌呤呤碱碱的的能能力力不不同同,因因此此,终终产产物物也不同。也不同。排尿酸动物:灵长类、鸟类、昆虫、排尿酸爬虫类排尿酸动物:灵长类、鸟类、昆虫、排尿酸爬虫类排尿囊素动物:哺乳动物(灵长类除外)、腹足类排尿囊素动物:哺乳动物(灵长类除外)、腹足类排尿囊酸动物:硬骨鱼类排尿囊酸
12、动物:硬骨鱼类排尿素动物:大多数鱼类、两栖类排尿素动物:大多数鱼类、两栖类某些低等动物能将尿素进一步分解成某些低等动物能将尿素进一步分解成NHNH3 3和和COCO2 2排出。排出。植植物物分分解解嘌嘌呤呤的的途途径径与与动动物物相相似似,产产生生各各种种中中间间产产物物(尿囊素、尿囊酸、尿素、(尿囊素、尿囊酸、尿素、NHNH3 3)。)。微生物分解嘌呤类物质,生成微生物分解嘌呤类物质,生成NHNH3 3、COCO2 2及有机酸(甲酸、及有机酸(甲酸、乙酸、乳酸、等)。乙酸、乳酸、等)。第第1515页页/共共5454页页第第1616页页/共共5454页页(2)、嘧啶的降解第第1717页页/共共
13、5454页页胞嘧啶胞嘧啶NH3尿嘧啶尿嘧啶二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶H2OCO2+NH3-丙氨酸丙氨酸胸腺嘧啶胸腺嘧啶-脲基异丁酸脲基异丁酸-氨基异丁酸氨基异丁酸H2O丙二酸单酰丙二酸单酰CoA乙酰乙酰CoATCA肝肝尿素尿素甲基丙二酸单酰甲基丙二酸单酰CoA琥珀酰琥珀酰CoATCA糖异生糖异生第第1818页页/共共5454页页核苷酸的合成途径一般有两条:u从头合成:从最简单的原料如CO2、氨基酸、甲酸盐等开始组装碱基环。u补救途径:从来自核酸降解的中间产物或外源核苷、碱基直接合成核苷酸,不需组装碱基环。第三节第三节 核苷酸的合成代谢核苷酸的合成代谢第第1919页页/共共5454页页 一、核糖核苷酸
14、的生物合成一、核糖核苷酸的生物合成(一)嘌呤核糖核苷酸的合成(一)嘌呤核糖核苷酸的合成 1 1、从头合成路线、从头合成路线 原料:CO2、甲酸盐、甘氨酸、天冬氨酸、谷氨酰胺 核糖碳架来源:5P核糖+ATP 5磷酸核糖1焦磷酸(PRPP)过程:先直接合成次黄嘌呤核苷酸(IMP,肌苷酸),不先形成嘌呤环,再转变为腺苷酸AMP、黄苷酸XMP、尿苷酸GMP。第第2020页页/共共5454页页嘌呤环上各原子的来源嘌呤环上各原子的来源来自谷氨酰胺的酰胺氮来自谷氨酰胺的酰胺氮来自来自“甲酸盐甲酸盐”来自天冬氨酸来自天冬氨酸来自甘氨酸来自甘氨酸来自来自CO2来自来自“甲酸盐甲酸盐”第第2121页页/共共545
15、4页页 IMP的合成(1)5-磷酸核糖焦磷酸(PRPP)的生成起始步骤 磷酸核糖焦磷酸合成酶催化5-磷酸核糖和ATP生成。第第2222页页/共共5454页页(2)5-磷酸核糖焦磷酸与谷氨酰胺反应生成5-磷酸核糖胺、谷氨酸和无机焦磷酸。催化此反应的酶是磷酸核糖焦磷酸酰胺基转移酶。第第2323页页/共共5454页页(3)5-磷酸核糖胺在ATP参与下与甘氨酸合成甘氨酰胺核苷酸。催化此反应的酶是甘氨酰胺核苷酸合成酶。第第2424页页/共共5454页页(4)甘胺酰胺核苷酸在甘胺酰胺核苷酸甲酰基转移酶作用下生成甲酰甘胺酰胺核苷酸。第第2525页页/共共5454页页(5)甲酰甘胺酰胺核苷酸与谷氨酰胺、ATP
16、作用,闭环之前在第3位上加上氮原子。催化此反应的酶是甲酰甘氨咪唑核苷酸合成酶。第第2626页页/共共5454页页(6)闭环 在氨基咪唑核苷酸合成酶作用下生成5-氨基咪唑核苷酸。第第2727页页/共共5454页页(7)六员环的合成开始 在氨基咪唑核苷酸羧化酶催化下,5-氨基咪唑核苷酸与二氧化碳生成5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸。第第2828页页/共共5454页页(8)嘌呤环的第1位氮的固定 在氨基咪唑琥珀酸氨甲酰核苷酸合成酶催化下,5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸与天冬氨酸和ATP生成5-氨基咪唑-4-琥珀酸甲酰胺核苷酸。第第2929页页/共共5454页页(9)脱掉延胡索酸 反应由腺甘酸裂解酶催化。生
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- 核酸 降解 核苷酸 代谢
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