生物化学复习静态部分.pptx
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1、小结:生物化学的主要内容糖类糖类脂脂蛋白质蛋白质(酶酶)核酸核酸 维生素维生素代谢代谢合成合成分解分解调控调控静静态态生物氧化生物氧化动动态态结构结构性质性质功能功能l l化学变化化学变化l l能量代谢能量代谢l l调节规律调节规律生物膜生物膜激素激素第1页/共54页第二章 糖类生物化学目的和要求:了解糖的现代概念、分类及生物功能;掌握单糖的分子结构、性质和几种重要单糖的分子结构;了解常见寡糖的结构、性质;掌握几种常见多糖的结构、性质和生物功能;掌握糖蛋白、蛋白聚糖的概念、结构、类型,寡糖链的类型、结构及生物学特性和功能;了解糖肽的结构、作用。第2页/共54页链链状状结结构构 (构构型型、L-
2、L-型型D-D-型型、构构象象、镜镜象象对对映映体体、差差向向异异构构体体、旋旋光光异异构构现现和和旋旋光光度度(构构型型与与旋旋光光方方向向的的区别区别)环环状状结结构构(单单糖糖的的-型型和和-型型):变变旋旋现现象象环状结构与链状结构的关系环状结构与链状结构的关系结构结构单糖单糖1、醛基或酮基参加的反应:、醛基或酮基参加的反应:1 1)单糖氧化单糖氧化 2 2)单糖还原)单糖还原 3 3)成脎作用)成脎作用 4 4)异构化作用)异构化作用 2 2、由羟基产生的性质:、由羟基产生的性质:1 1)酯化反应)酯化反应 2 2)成苷作用)成苷作用 3 3)脱水作用)脱水作用 4 4)氨基化作用)
3、氨基化作用5 5)脱氧作用:)脱氧作用:性质性质化学性质化学性质物理性质:旋光性、甜度、溶解度物理性质:旋光性、甜度、溶解度单糖衍生物单糖衍生物 糖类化学糖类化学糖类化学糖类化学第3页/共54页麦麦麦麦芽芽芽芽糖糖糖糖 结结构构 两两分分子子-D-G-D-G按按(1-41-4)糖糖苷苷键键连接连接 性质性质 化学性质化学性质 还原性、成脎作用还原性、成脎作用 物理性质物理性质 旋光度与变旋作用旋光度与变旋作用蔗蔗糖糖 结结构构 由由-D-G-D-G、-D-F-D-F按按、(1-21-2)连接连接 性质性质 化学性质化学性质 无游离醛基、不具还原性。无游离醛基、不具还原性。物理性质物理性质 溶于
4、水、甜度高。溶于水、甜度高。乳糖乳糖 结构结构 -D-G-D-G和和-D-L-D-L按按(1-41-4)连接)连接 性质性质 化学性质:由还原性,能与苯肼成脎化学性质:由还原性,能与苯肼成脎 物物理理性性质质:乳乳糖糖为为白白色色晶晶体体、有有变变旋旋现象现象纤纤维维二二糖糖 两两分分子子的的葡葡萄萄糖糖按按(1-41-4)键键型型相相连连而成而成寡寡寡寡 糖糖糖糖二糖二糖三糖三糖棉籽糖,水解生成葡萄糖和果糖各一分子棉籽糖,水解生成葡萄糖和果糖各一分子 寡糖链寡糖链第4页/共54页1 1、淀粉、淀粉 1 1)结构)结构 直链淀粉直链淀粉 (1-41-4)糖苷键)糖苷键 支支链链淀淀粉粉:两两个
5、个糖糖的的直直链链之之间间的的连连 接接 为为(1 1、6 6)糖糖 苷苷键键 2 2)性性质质:淀淀粉粉 红红色色糊糊精精 无无色色糊糊精精 麦麦芽芽糖糖 葡葡萄糖萄糖2 2、糖原:、糖原:遇碘成棕红色遇碘成棕红色3 3、纤纤纤纤维维维维素素素素:1 1)结结构构 -(1-41-4)糖糖苷苷键键的的连连接接成成直链直链 2 2)性性质质:纤纤维维素素纤纤维维素素糊糊精精纤纤维维二二糖糖 葡葡萄萄糖糖4 4、几丁质:结构、几丁质:结构 与纤维素相似。与纤维素相似。性质:性质:不容易水不容易水多多多多 糖糖糖糖均均一一多多糖糖不不均均一一多多糖糖1 1、透明质酸、透明质酸2 2、硫酸软骨素、硫酸
6、软骨素3 3、肝素、肝素4 4、硫酸角质素和硫酸皮肤素、硫酸角质素和硫酸皮肤素糖胺聚糖糖胺聚糖其他其他琼脂琼脂半纤维素和果胶质半纤维素和果胶质第5页/共54页糖蛋白糖蛋白结结 合合 糖糖糖肽键糖肽键糖糖 链链功能功能N-N-糖肽键糖肽键O-O-糖肽键糖肽键N-N-糖链糖链O-O-糖链糖链蛋白聚糖蛋白聚糖糖糖 脂脂脂多糖脂多糖多糖链多糖链结构结构功能功能鞘糖脂鞘糖脂中性鞘糖脂中性鞘糖脂酸性鞘糖脂酸性鞘糖脂甘油糖脂甘油糖脂第6页/共54页第三章 脂类生物化学目的和要求:了解脂类的概念、分类和生物学功能;了解脂酰甘油类的概念、类型,甘油三酯的类型和性质;掌握磷脂的基本结构、常见磷脂的结构、性质和生物
7、功能;了解萜类、类固醇的结构和功能;掌握糖脂、脂多糖的概念、性质和功能,了解脂蛋白的类型和功能。第7页/共54页单纯脂质衍生脂质 脂酰甘油类(三脂酰甘油)磷脂类脂肪酸甘油甘油磷脂鞘氨醇磷脂类萜类类固醇类前列腺素脂类化学脂类化学脂类化学脂类化学复合脂质第8页/共54页1、它们之中大部分是不分枝和无环的羟基单羧酸2、自然界中分子中的碳原子数目绝大多数是偶数。3、饱和脂肪酸中最普遍的软脂酸和硬脂酸。不饱和脂肪酸中最普遍的是油酸。4、不饱和脂肪酸的熔点比同等链长的饱和脂肪酸低5、细菌中所含的脂肪酸比植物动物少得多绝大多数为饱和脂肪酸。高等植物和低温生活的动物中不饱和脂肪酸含量高于饱和脂肪酸含量。6、高
8、等动物的不饱和脂肪酸从结构上讲部分是顺式结构7、必需脂肪酸:脂肪酸结构的共性第9页/共54页 类型 简单三脂酰甘油 混合三酯酰甘油 性质 物理性质1、溶解度2、熔点 化学性质:皂化价和皂化值 酸败和酸值 氢化 卤化和碘值 乙酰化值甘油三酯第10页/共54页1、磷脂酰胆碱俗称卵磷脂磷脂酰胆碱俗称卵磷脂X X是胆碱是胆碱2、磷脂酰乙醇胺3、磷脂酰丝氨酸4、肌醇磷脂5、二磷脂酰甘油6、缩醛磷脂 磷磷脂脂类类甘油磷脂鞘氨醇磷脂类总结:磷脂类从结构上讲其共性是都含有磷酸基团,都含有极性的基团。其结构骨架是醇,可分成两类甘油醇与鞘氨醇以其极性头部的种类可将甘油磷酯分成几大类,鞘氨醇亦然。它是鞘氨醇衍生物鞘
9、磷脂极性头部是磷酯酰胆碱或磷酰乙醇氨第11页/共54页萜类:是异戊二烯的衍生物类固醇类:胆固醇 功能:作为激素起某种代 谢调节作用;作为乳化剂 有助于脂肪的消化和吸收;有抗炎症的作用。固醇类衍生物 胆汁酸胆汁酸是一 种乳化剂 前列腺素:是花生四烯酸及其他不饱和脂肪酸的衍生物。衍衍生生脂脂质质第12页/共54页蛋蛋白白质质化化学学第四章第四章 氨基酸氨基酸第五章第五章 蛋白质的共价结构蛋白质的共价结构第六章第六章 蛋白质的三维结构蛋白质的三维结构第七章第七章 蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系第13页/共54页第四章 氨基酸(amino acid)目的和要求:掌握氨基酸的结构特点,从各
10、氨基酸的结构特点上理解氨基酸的分类和各自的生物特性;了解不常见蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸;掌握氨基酸的理化性质,重点掌握两性电离与等电点含义,氨基酸参加的化学反应,特别是测链基团的反应,是多肽和蛋白质合成、修饰的基础。第14页/共54页氨基酸(一)结构:(一)结构:(一)结构:(一)结构:1 1 1 1、脂肪族、脂肪族、脂肪族、脂肪族 一一一一氨氨氨氨基基基基一一一一羧羧羧羧基基基基的的的的中中中中性性性性氨氨氨氨基基基基酸酸酸酸:甘甘甘甘氨氨氨氨酸酸酸酸、丙丙丙丙氨氨氨氨酸酸酸酸、缬缬缬缬氨氨氨氨酸酸酸酸、亮亮亮亮氨氨氨氨酸、异亮氨酸和蛋氨酸酸、异亮氨酸和蛋氨酸酸、异亮氨酸和蛋氨酸酸、异亮
11、氨酸和蛋氨酸 极性氨基酸极性氨基酸极性氨基酸极性氨基酸 含羟基的氨基酸含羟基的氨基酸含羟基的氨基酸含羟基的氨基酸 含巯基氨基酸含巯基氨基酸含巯基氨基酸含巯基氨基酸 含酰氨基的氨基酸含酰氨基的氨基酸含酰氨基的氨基酸含酰氨基的氨基酸 二羧基一氨基二羧基一氨基二羧基一氨基二羧基一氨基 二氨基一羧基二氨基一羧基二氨基一羧基二氨基一羧基 2 2 2 2、芳香族氨基酸、芳香族氨基酸、芳香族氨基酸、芳香族氨基酸 3 3 3 3、杂环族氨基酸、杂环族氨基酸、杂环族氨基酸、杂环族氨基酸第15页/共54页(二)性质(二)性质(二)性质(二)性质1 1 1 1、物理性质、物理性质、物理性质、物理性质:可见光全无吸收
12、,远紫外光全有吸收,可见光全无吸收,远紫外光全有吸收,可见光全无吸收,远紫外光全有吸收,可见光全无吸收,远紫外光全有吸收,紫外光区酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有光吸收;紫外光区酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有光吸收;紫外光区酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有光吸收;紫外光区酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有光吸收;2 2 2 2、化学性质、化学性质、化学性质、化学性质1 1 1 1)酸碱性质)酸碱性质)酸碱性质)酸碱性质:等电点:等电点:等电点:等电点2 2 2 2)化学反应:)化学反应:)化学反应:)化学反应:-氨基参加的反应:氨基参加的反应:氨基参加的反应:氨基参加的反应:-羧基参加的反应:羧基参加的反应:羧基参加
13、的反应:羧基参加的反应:-氨基和氨基和氨基和氨基和-羧基共同参加的反应:羧基共同参加的反应:羧基共同参加的反应:羧基共同参加的反应:侧链基团参加的反应:侧链基团参加的反应:侧链基团参加的反应:侧链基团参加的反应:第16页/共54页-氨基参加的反应:氨基参加的反应:氨基参加的反应:氨基参加的反应:1 1、与亚硝酸的反应、与亚硝酸的反应2 2、与酰化试剂的反应:、与酰化试剂的反应:3 3、烃基化反应:、烃基化反应:2 2、4-4-二硝基氟苯二硝基氟苯(DNFBDNFB)苯异硫氰酸酯苯异硫氰酸酯(PITCPITC):):4 4、西佛碱反应、西佛碱反应5 5、脱氨基反应:、脱氨基反应:-羧基参加的反应
14、羧基参加的反应羧基参加的反应羧基参加的反应1 1、成盐和成酯反应:、成盐和成酯反应:2 2、成酰氯反应、成酰氯反应3 3、叠氮反应、叠氮反应4 4、脱羧基作用、脱羧基作用-氨基和氨基和-羧基共同参加羧基共同参加的反应的反应1 1、与茚三酮反应、与茚三酮反应2 2、成肽反应、成肽反应第17页/共54页第五章 蛋白质的共价结构目的和要求:、结构组织层次和蛋白质生物功能的多样性;了解肽、肽键的概念、结构和常见肽的性质、作用;掌握蛋白质一级结构的概念,蛋白质一级结构的测定方法与思路,能根据实验结果分析简单多肽的氨基酸顺序;了解蛋白质一级结构和生物功能的关系。第18页/共54页第五章第五章 蛋白质的共价
15、结构蛋白质的共价结构一、肽一、肽、肽和肽键的结构:、肽和肽键的结构:一级结构的概念、肽键的特点、肽键的特点、肽的物理和化学性质、肽的物理和化学性质 物理性质:酸碱性:化学性质、天然存在的活性肽、天然存在的活性肽 第19页/共54页 二、蛋白质序列测定二、蛋白质序列测定二、蛋白质序列测定二、蛋白质序列测定 1 1 1 1、测定蛋白质分子中多肽链的数目。、测定蛋白质分子中多肽链的数目。、测定蛋白质分子中多肽链的数目。、测定蛋白质分子中多肽链的数目。2 2 2 2、拆分蛋白质分子得多肽链。、拆分蛋白质分子得多肽链。、拆分蛋白质分子得多肽链。、拆分蛋白质分子得多肽链。3 3 3 3、测定氨基酸的组成:
16、完全水解,计算出氨基酸成分比。、测定氨基酸的组成:完全水解,计算出氨基酸成分比。、测定氨基酸的组成:完全水解,计算出氨基酸成分比。、测定氨基酸的组成:完全水解,计算出氨基酸成分比。4 4 4 4、分析多肽链的、分析多肽链的、分析多肽链的、分析多肽链的N-N-N-N-末端和末端和末端和末端和C-C-C-C-末端末端末端末端 5 5 5 5、断裂二硫键、断裂二硫键、断裂二硫键、断裂二硫键 6 6 6 6、部份水解,、部份水解,、部份水解,、部份水解,7 7 7 7、测定各肽段的氨基酸顺序。、测定各肽段的氨基酸顺序。、测定各肽段的氨基酸顺序。、测定各肽段的氨基酸顺序。EdmanEdmanEdmanE
17、dman化学降解法:化学降解法:化学降解法:化学降解法:酶解法酶解法酶解法酶解法 cDNAcDNAcDNAcDNA法法法法 8 8 8 8、片段重叠法确定各肽段的顺序、片段重叠法确定各肽段的顺序、片段重叠法确定各肽段的顺序、片段重叠法确定各肽段的顺序 9 9 9 9、二硫键位置的确定。、二硫键位置的确定。、二硫键位置的确定。、二硫键位置的确定。第20页/共54页三、蛋白质一级结构举例三、蛋白质一级结构举例 胰岛素:核糖核酸酶。血红蛋白:四、一级结构与生物功能四、一级结构与生物功能同源蛋白质与生物进化:同源蛋白质不变残基可变残基:一级结构的局部断裂与蛋白质激活第21页/共54页第六章 蛋白质的三
18、维结构目的和要求:了解研究蛋白质构象的方法和多肽链折叠的空间限制;掌握稳定蛋白质三级结构的作用力的类型、形成机理和作用;掌握蛋白质二级结构、超二级结构、结构域、三级结构的概念、类型、结构特点;了解蛋白质四级缔合的概念、作用力、方式和优越性;了解纤维蛋白的结构特点和功能;掌握膜蛋白的类型、结构特点和功能;了解蛋白质折叠的热力学、动力学和蛋白质结构预测的规则。第22页/共54页一、稳定蛋白质三维结构的作用力一、稳定蛋白质三维结构的作用力一、稳定蛋白质三维结构的作用力一、稳定蛋白质三维结构的作用力 共价键:肽键、二硫键共价键:肽键、二硫键 次级键:离子键、氢键、疏水键、范德华力,次级键微弱但数量巨大
19、,是次级键:离子键、氢键、疏水键、范德华力,次级键微弱但数量巨大,是维持蛋白质三级结构中主要的作用力维持蛋白质三级结构中主要的作用力 氢键氢键氢键氢键 范德华力范德华力范德华力范德华力 疏水相互作用(熵效应)疏水相互作用(熵效应)疏水相互作用(熵效应)疏水相互作用(熵效应)盐键或离子键盐键或离子键盐键或离子键盐键或离子键 二硫键二硫键二硫键二硫键第六章第六章 蛋白质的三维结构蛋白质的三维结构第23页/共54页二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构(一)二级结构(一)二级结构1 1、-螺旋:螺旋:结构特点结构特点影响螺旋形成的因素影响螺旋形成的因素2 2、-折折叠叠:(定定义义结结构构特特点)
20、点)3 3、-转角和转角和 凸起凸起1 1)-转角转角2 2)凸起凸起4 4、无规卷曲、无规卷曲(二)举例:纤维状蛋白质:(二)举例:纤维状蛋白质:角蛋白(角蛋白(-角蛋白、角蛋白、-角角蛋白)、胶原蛋白蛋白)、胶原蛋白(三)超二级结构与结构域(三)超二级结构与结构域 定义定义 类型(类型(、)三、球状蛋白质与三级结构三、球状蛋白质与三级结构 球状蛋白质的分类球状蛋白质的分类 球状蛋白分子三维结构的特征球状蛋白分子三维结构的特征(三)维持蛋白质三级结构的作用力:(三)维持蛋白质三级结构的作用力:四、蛋白质折叠和结构预测四、蛋白质折叠和结构预测 蛋白质的变性蛋白质的变性1 1、概念:、概念:2
21、2、变性的可逆性、变性的可逆性3 3、变性的因素及作用机制:、变性的因素及作用机制:4 4、变性蛋白质的特性、变性蛋白质的特性 氨基酸序列规定蛋白质的三维结构氨基酸序列规定蛋白质的三维结构 蛋白质折叠的热力学蛋白质折叠的热力学蛋白质折叠动力学蛋白质折叠动力学 蛋白质结构的预测蛋白质结构的预测第24页/共54页五、亚基缔合和四级结构五、亚基缔合和四级结构 有关四级结构的一些概念有关四级结构的一些概念 四级缔合的驱动力四级缔合的驱动力范德华力,氢键,离子键,疏水作用和二硫键;其中主要为疏水作用;氢键,离子键提供专一性作用 亚基相互作用的方式亚基相互作用的方式 四级结构的对称性四级结构的对称性 四级
22、缔合在结构和功能上的优越性四级缔合在结构和功能上的优越性第25页/共54页第七章蛋白质结构与功能的关系目的和要求:掌握肌红蛋白和血红蛋白的结构特征;氧结合的动力学特征及对结构的影响;血红蛋白运输氧高效性的特点;了解血红蛋白分子病和结构变异对功能的影响;了解免疫球蛋白的结构、类型;第26页/共54页蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系一、一、肌红蛋白质的结构与肌红蛋白质的结构与功能功能 肌红蛋白质的三级结肌红蛋白质的三级结构构 辅基血红素辅基血红素 氧与肌红蛋白的结合氧与肌红蛋白的结合 氧氧的的结结合合改改变变肌肌红红蛋蛋白白的构象的构象 肌红
23、蛋白氧结合曲线肌红蛋白氧结合曲线二、血红蛋白的结构与功能:二、血红蛋白的结构与功能:1、血红蛋白的结构 结合引起的血红蛋白构象变化结合引起的血红蛋白构象变化 血红蛋白的氧结合曲线血红蛋白的氧结合曲线2、H+、CO2和DPG对于血红蛋白结合氧的影响1)波耳效应H+、CO2促进O2的释放2)二磷酸甘油酸降低血红蛋白氧亲合力。三、血红蛋白的分子病镰镰刀刀状细胞贫血病状细胞贫血病第27页/共54页酶酶化化学学第八章第八章 酶通论酶通论第九章第九章第九章第九章 酶促反应动力学酶促反应动力学酶促反应动力学酶促反应动力学第十章第十章第十章第十章 酶的作用机制和酶的调节酶的作用机制和酶的调节酶的作用机制和酶的
24、调节酶的作用机制和酶的调节第28页/共54页第八章 酶 通 论目的和要求:了解酶作为生物催化剂的特点,酶的化学本质、分类和命名原则;掌握酶的专一性及其机理;掌握酶活力、比活力、总活力的概念和测定方法;掌握核酶、抗体酶的概念,了解核酶的类型和抗体酶的诱导原理;了解酶工程的概念和研究范畴,常见酶工程的技术。第29页/共54页第八章第八章 酶通论酶通论一、酶催化作用的特点一、酶催化作用的特点 酶和一般催化剂的比较酶和一般催化剂的比较 酶作为生物催化剂的特酶作为生物催化剂的特点点1、生物大分子2、酶具有很高的催化效率3、催化具有高度的专一性4、反应条件温和,且活力可调节5、催化活力与辅助因子有关二、酶
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