理学大连理工大学生物化学蛋白质合成与转运.pptx
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1、中心法则中心法则第1页/共76页蛋白质合成概述蛋白质合成概述细胞:成千上万个蛋白维持功能细胞:成千上万个蛋白维持功能蛋白质生物合成:最复杂,参与蛋白质生物合成:最复杂,参与300多种大分子、使多种大分子、使用细胞用细胞90%能量;蛋白质占细胞重量的能量;蛋白质占细胞重量的35%细菌:细菌:2万个核糖体(蛋白质合成场所)万个核糖体(蛋白质合成场所)10万个酶因子万个酶因子20万个万个tRNA合成速度:合成速度:20个个aa/s目前研究热点:细胞中的准确定位目前研究热点:细胞中的准确定位蛋白质选择性降解机制蛋白质选择性降解机制第2页/共76页蛋蛋白白质质的的生生物物合合成成过过程程,就就是是将将D
2、NA传传递递给给mRNA的的遗遗传传信信息息,解解译译为为蛋蛋白白质质中中氨氨基基酸酸排排列列顺顺序序的的过过程程,这这一一过过程程被被称称为为翻翻译译(translation)。蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成第3页/共76页参与蛋白质合成的参与蛋白质合成的RNA分子体系分子体系mRNA:蛋白质合成的直接模板:蛋白质合成的直接模板遗传密码存在于遗传密码存在于mRNA分子上,每分子上,每3个碱基决定个碱基决定1个氨基酸个氨基酸起始密码:起始密码:AUG氨基酸码:氨基酸码:61种种终止密码:终止密码:UAA、UAG、UGAtRNA:专一运送氨基酸至专一运送氨基酸至mRNA并于密码子配对并于密码子
3、配对rRNA:与蛋白质构成核糖核蛋白体,是蛋白质合成的场所,核糖体由与蛋白质构成核糖核蛋白体,是蛋白质合成的场所,核糖体由大亚基和小亚基构成大亚基和小亚基构成蛋白质合成的过程蛋白质合成的过程氨基酸的活化氨基酸的活化:氨基酸与:氨基酸与tRNA合成氨基酰合成氨基酰-tRNA1、起始阶段:、起始阶段:mRNA、Met-tRNA、核糖体构成起始复合体、核糖体构成起始复合体2、肽链的延伸:、肽链的延伸:进位、转肽、移位循环、肽链延长进位、转肽、移位循环、肽链延长3、终止阶段:、终止阶段:延伸至终止密码,肽链释放,核糖体大小亚基与延伸至终止密码,肽链释放,核糖体大小亚基与mRNA解离解离蛋白质的生物合成
4、蛋白质的生物合成第4页/共76页一、参与蛋白质生物合成的物质一、参与蛋白质生物合成的物质生物体内的各种蛋白质都是利用生物体内的氨基酸生物体内的各种蛋白质都是利用生物体内的氨基酸为原料自行合成的。参与蛋白质生物合成的各种因为原料自行合成的。参与蛋白质生物合成的各种因素构成了蛋白质合成体系,该体系包括:素构成了蛋白质合成体系,该体系包括:mRNA:作为蛋白质生物合成的模板,决定多肽:作为蛋白质生物合成的模板,决定多肽链中氨基酸的排列顺序;链中氨基酸的排列顺序;tRNA:搬运氨基酸的工具;:搬运氨基酸的工具;核蛋白体:蛋白体生物合成的场所;核蛋白体:蛋白体生物合成的场所;酶及其他蛋白质因子;氨酰酶及
5、其他蛋白质因子;氨酰-tRNA合成酶;合成酶;供能物质及无机离子。供能物质及无机离子。ATP和和GTP,Mg2+、K+;第5页/共76页原核生物和真核生物原核生物和真核生物mRNA的比较的比较1、mRNA(messengerRNA):蛋白质生物合成过程中蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的模板,是直接指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体遗传信息的载体。第6页/共76页mRNA是是蛋蛋白白质质合合成成的的模模板板mRNA分子中每三个相邻碱基组成一个密码子,分子中每三个相邻碱基组成一个密码子,密码子分为密码子分为起始码、氨基酸码和终止码起始码、氨基酸码和终止码3类。类。mRNA上的四种碱基可
6、组成上的四种碱基可组成64个密码子,其中个密码子,其中61个代表不同的氨基酸,其余三个代表终止信号。个代表不同的氨基酸,其余三个代表终止信号。第7页/共76页连续性:连续性:密码为不重叠、无标点的三联体密码密码为不重叠、无标点的三联体密码简并性:简并性:一种氨基酸有两个或多个密码子的现象。一种氨基酸有两个或多个密码子的现象。对应同一种氨基酸的不同密码子叫对应同一种氨基酸的不同密码子叫同义密码子。同义密码子。减少减少了氨基酸突变的几率,在物种的稳定上起一定作用。了氨基酸突变的几率,在物种的稳定上起一定作用。简并性常表现在密码子的第三位碱基上。简并性常表现在密码子的第三位碱基上。通用性:通用性:(
7、但在线粒体或叶绿体中特殊)(但在线粒体或叶绿体中特殊)方向性:方向性:阅读方向为阅读方向为53;变偶性(摆动性):变偶性(摆动性):密码子中第三位碱基可有一定密码子中第三位碱基可有一定的变动。的变动。起始密码:起始密码:AUG(Met););终止密码:终止密码:UAA、UAG、UGA。遗传密码的基本特性遗传密码的基本特性第8页/共76页翻译时须从翻译时须从起始密码起始密码AUG开始确定阅读框架、移开始确定阅读框架、移码码突变是最严重的突变突变是最严重的突变第9页/共76页原核生物的原核生物的mRNA可包含几个基因信息可包含几个基因信息-多顺反子多顺反子真核生物的真核生物的mRNA只有一个基因信
8、息只有一个基因信息-单顺反子单顺反子绝大多数基因不重叠,但少数病毒基因有重叠现象绝大多数基因不重叠,但少数病毒基因有重叠现象噬菌体噬菌体X174:5386bp/10种种pr噬菌体:噬菌体:第10页/共76页密码的简并性和通用性密码的简并性和通用性第11页/共76页密码子的专一性主要由第密码子的专一性主要由第1,2位碱基位碱基决定,第决定,第3位碱基可在一定范围内摆动位碱基可在一定范围内摆动而不影响氨基酸种类。而不影响氨基酸种类。无变偶性的密码子无变偶性的密码子AUG,UGG。之外。之外的其余密码子第的其余密码子第3位碱基可在同类嘌呤位碱基可在同类嘌呤或嘧啶中摆动,如或嘧啶中摆动,如Tyr码码U
9、AU,UAC某些氨基酸码第某些氨基酸码第3位碱基可在任意位碱基可在任意4种种碱基中摆动,如碱基中摆动,如Tyr码码ACU,ACC,ACA,ACG。tRNA反密码子与反密码子与mRNA的第的第1位第位第2位位碱基严格配对(碱基严格配对(AU,CG),但密码),但密码子第子第3位碱基与反密码子第一位碱基有位碱基与反密码子第一位碱基有变偶配对现象。变偶配对现象。密码的简并性和变偶性密码的简并性和变偶性第12页/共76页密码的变偶性(摆动性)密码的变偶性(摆动性)第13页/共76页遗遗传传密密码码的的摆摆动动配配对对第14页/共76页密码的通用性和变异性密码的通用性和变异性绝大多数生物共同使用同一套遗
10、传密码(遗传密码的保守性)绝大多数生物共同使用同一套遗传密码(遗传密码的保守性),这意味着生物有一个共同的祖先,这意味着生物有一个共同的祖先但是在线粒体中发现了少数与通用密码不一致的密码子但是在线粒体中发现了少数与通用密码不一致的密码子其他少数生物中也存在非通用密码其他少数生物中也存在非通用密码第15页/共76页密码的防错系统密码的防错系统第16页/共76页起始密码的选择起始密码的选择第17页/共76页49个嘌呤碱基个嘌呤碱基813个碱基对个碱基对16SrRNA与与SD序列的配对序列的配对第18页/共76页mRNA是蛋白质合成的模板是蛋白质合成的模板辨认起始密码子是翻译(蛋白质合成)起始的必须
11、步骤:确定阅读框架!辨认起始密码子是翻译(蛋白质合成)起始的必须步骤:确定阅读框架!按照不重叠的三联密码子翻译产生对应的氨基酸并形成肽键按照不重叠的三联密码子翻译产生对应的氨基酸并形成肽键当到达终止密码时,合成结束,肽键释放当到达终止密码时,合成结束,肽键释放通常终止密码不止一个,而是连续出现通常终止密码不止一个,而是连续出现2-3个终止密码个终止密码对于某些病毒,如果中间有起始密码,则一条对于某些病毒,如果中间有起始密码,则一条mRNA可产生可产生2条或多条条或多条肽链肽链第19页/共76页2、tRNA在氨酰在氨酰-tRNA合成酶催化下,特定的合成酶催化下,特定的tRNA与相应与相应的氨基酸
12、结合,生成氨酰的氨基酸结合,生成氨酰-tRNA,从而携带氨基,从而携带氨基酸参与蛋白质的生物合成。酸参与蛋白质的生物合成。氨基酸氨基酸+tRNA+ATP氨酰氨酰-tRNA+AMP+2Pi无机磷酸酶无机磷酸酶氨酰氨酰-tRNA合成酶合成酶第20页/共76页氨氨基基酸酸的的活活化化第21页/共76页tRNA反反密密码码环环中中部部的的三三个个核核苷苷酸酸构构成成三三联联体体,识识别别mRNA上上相相应应的的密密码码,此此三三联联体体称称为为反反密码密码(anticoden)。反反密密码码对对密密码码的的识识别别,也也是是根根据据碱碱基基互互补补原原则则,即即A-U,G-C。但但反反密密码码的的第第
13、一一个个核核苷苷酸酸与与密密码码的的第第三三个个核核苷苷酸酸之之间间的的配配对对,并并不不严严格格遵遵循循碱碱基基互互补补原原则则。如如反反密密码码的的第第一一个个核核苷苷酸酸为为,则则可可与与密密码码的的A、U或或C配配对对,如如为为U,则则可可与与A或或G配配对对,不稳定配对不稳定配对。第22页/共76页能够识别能够识别mRNA中中5端起动密码端起动密码AUG的的tRNA是一种特殊的是一种特殊的tRNA,称为,称为起动起动tRNA。原核生物中,起动原核生物中,起动tRNA是一种携带是一种携带甲酰甲硫氨酸的甲酰甲硫氨酸的tRNA,即,即tRNAifmet;真核生物中,起动真核生物中,起动tR
14、NA是一种携带是一种携带蛋氨酸的蛋氨酸的tRNA,即,即tRNAimet。在原核生物和真核生物中,均存在另一种携带蛋氨酸的在原核生物和真核生物中,均存在另一种携带蛋氨酸的tRNA,识别非起动部位的蛋,识别非起动部位的蛋氨酸密码,氨酸密码,AUG。第23页/共76页tRNA转运氨基酸至转运氨基酸至mRNA模板模板第24页/共76页氨基酸氨基酸+tRNA+ATP氨酰氨酰-tRNA+AMP+2Pi无机磷酸酶无机磷酸酶氨酰氨酰-tRNA合成酶合成酶N-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫氨酰-tRNAifMet的形成的形成CHO-HN-CH-COO-tRNACH2CH2SCOO-+H2N-CH-COO-tRNACH2
15、CH2SCOO-Met-tRNAifMetfMet-tRNAifMetN N1010-CHO-FH-CHO-FH4 4FHFH4 4转甲酰酶转甲酰酶Met+tRNAifMet+ATPMet-tRNAifMet+AMP+PPi第25页/共76页3、rRNA和核蛋白体和核蛋白体原原核核生生物物中中的的核核蛋蛋白白体体大大小小为为70S,可可分分为为30S小小亚亚基基和和50S大大亚亚基基。小小亚亚基基由由16SrRNA和和21种种蛋蛋白白质质构构成成,大大亚亚基基由由5SrRNA,23SRNA和和35种种蛋白质构成。蛋白质构成。真真核核生生物物中中的的核核蛋蛋白白体体大大小小为为80S,也也分分为
16、为40S小小亚亚基基和和60S大大亚亚基基。小小亚亚基基由由18SrRNA和和30多多种种蛋蛋白白质质构构成成,大大亚亚基基则则由由5SrRNA,28SrRNA和和50多多种种蛋蛋白白质质构构成成,在在哺哺乳乳动动物物中中还还含含有有5.8SrRNA。第26页/共76页rRNA与与蛋蛋白白质质构构成成核核糖糖体体第27页/共76页rRNA与与蛋蛋白白质质构构成成核核糖糖体体第28页/共76页核蛋白体的大、小亚基分别有不同的功能:核蛋白体的大、小亚基分别有不同的功能:1小亚基:可与小亚基:可与mRNA、GTP和起动和起动tRNA结合。结合。2大亚基:(大亚基:(1)具有两个不同的)具有两个不同的
17、tRNA结合点。结合点。A位:受位或氨酰基位,可与新进入的氨基酰位:受位或氨酰基位,可与新进入的氨基酰tRNA结合;结合;P位:给位或肽酰基位,可与延伸中的肽酰基位:给位或肽酰基位,可与延伸中的肽酰基tRNA结合。结合。第29页/共76页(2)具有转肽酶活性)具有转肽酶活性:将给位上的肽酰基转移给受位上:将给位上的肽酰基转移给受位上的氨酰的氨酰-tRNA,形成肽键。,形成肽键。(3)具有)具有GTPase活性,水解活性,水解GTP,获得能量。,获得能量。(4)具有起动因子、延长因子及释放因子的结合部位。)具有起动因子、延长因子及释放因子的结合部位。在蛋白质生物合成过程中,常常由若干核蛋白体结在
18、蛋白质生物合成过程中,常常由若干核蛋白体结合在同一合在同一mRNAmRNA分子上,同时进行翻译,但每两个相分子上,同时进行翻译,但每两个相邻核蛋白之间存在一定的间隔,形成念球状结构。邻核蛋白之间存在一定的间隔,形成念球状结构。由若干核蛋白体结合在一由若干核蛋白体结合在一条条mRNA上同时进行多肽上同时进行多肽链的翻译,所形成的念球链的翻译,所形成的念球状结构称为状结构称为多核蛋白体。多核蛋白体。第30页/共76页一一一一条条条条mmR RN NA A上上上上有有有有多多多多个个个个有有有有多多多多个个个个核核核核糖糖糖糖体体体体第31页/共76页4、起动因子(、起动因子(IF)这是一些与多肽链
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