生化蛋白质化学.pptx
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1、1什么是生物化学?什么是生物化学?生生物物化化学学是是用用化化学学的的原原理理和和方方法法,研研究究生生物物体体的的化化学学组组成成及及其其在在体体内内的的代代谢谢转转变变规规律律,从从而而阐阐明明生生命命现现象象本本质质的的一门科学。一门科学。第1页/共99页2学习内容学习内容生物大分子的结构与功能:生物大分子的结构与功能:蛋白质化学、核酸化学、酶蛋白质化学、核酸化学、酶物质代谢及其调节物质代谢及其调节 糖、脂、氨基酸、核苷酸代谢、糖、脂、氨基酸、核苷酸代谢、生物氧化、代谢联系与调节生物氧化、代谢联系与调节遗传信息的传递遗传信息的传递 DNA复制、复制、RNA转录、蛋白质生物合成、转录、蛋白
2、质生物合成、基因表达调控与基因工程基因表达调控与基因工程专题篇专题篇 肝胆生化、血液生化肝胆生化、血液生化第2页/共99页3生化学习方法与要求生化学习方法与要求基本概念要清楚基本概念要清楚勤于动手、善于思考、注意总结勤于动手、善于思考、注意总结课前认真预习课前认真预习课上认真听讲课上认真听讲课后及时、认真复习课后及时、认真复习第3页/共99页4参考书目l童坦君主编 生物化学 北京大学医学出版社,2003l查锡良主编.生物化学 7th 人卫出版社,2008l贾弘禔主编.生物化学 1st 人卫出版社,2005l贾弘禔主编.生物化学 3th 北大医学出版社,2005lBerg JM,Tymoczko
3、 JL&Stryer L.BIOCHEMISTRY 6th W.H.Freeman Co,2007lNelson DL&Cox MM.Lehninger Principles of Biochemistry 4th W.H.Freeman Co,2005中英文的生物化学均可参阅第4页/共99页5本课程的评估:实验 20分平时测验 10分考试 70分合计 100分第5页/共99页6核 酸:是遗传的物质基础第一篇 生物分子的结构与功能酶:生物催化剂蛋白质:是生命的物质基础第6页/共99页7第一章 蛋白质化学biochemistry of Protein蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成蛋白质的分子结
4、构蛋白质的分子结构蛋白质分子结构与功能的关系蛋白质分子结构与功能的关系蛋白质的理化性质蛋白质的理化性质第7页/共99页8什么是蛋白质?蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。第8页/共99页9 第一节蛋白质在生命活动中的重要性 The importance of protein in the life生命活动的物质基础:生命活动的物质基础:除水以外,机体组织中最多的是蛋白质,占 人体干重的45%。多种生物学功能:多种生物学功能:催化功能:酶催化功能:酶 调节功能:多肽类激素调节功能:多肽类激素 收缩和运动功
5、能:肌肉蛋白收缩和运动功能:肌肉蛋白 运输和储存功能:血红蛋白运输和储存功能:血红蛋白 防御功能:免疫球蛋白防御功能:免疫球蛋白 第9页/共99页10第二节 蛋白质的分子组成蛋白质的元素组成蛋白质分子的基本结构单位氨基酸氨基酸的连接及连接产物:肽键和肽链蛋白质的分类第10页/共99页11平均16%一、主要元素组成C:50-55%H:6-8%O:19-24%N:13-19%S:0-4%其他:P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I等第11页/共99页12定氮法测量蛋白质含量依据是:蛋白质的平均含氮量为16每克样品的蛋白质含量(克)=每克样品的含氮量 6.25(100/16)题:已知一样品的含氮
6、量为0.04g克样品,请计算出此样品的蛋白质含量。答案:每克样品中蛋白质的含量:0.04g16%=0.04g 0.16=0.25g 0.04g X 6.25=0.25g第12页/共99页13二、蛋白质分子的基本结构单位:二、蛋白质分子的基本结构单位:氨基氨基酸酸 自然界中氨基酸有300300多种,但组成人体蛋白质的氨基酸只有2020种,且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)。(一)氨基酸的结构(amino acid,aa)第13页/共99页14 HOHCRNHO2CH OCRNHOC3+_氨基酸结构通式:或第14页/共99页15甘氨酸不属于L-氨基酸,无不对称的C原子20第15页/共99页16(二)
7、氨基酸的分类(P4 表1-1)非极性疏水性氨基酸:具有非极性R侧链,呈疏水 性,包括脂肪族和芳香族氨基酸。(8种)不带电荷的极性氨基酸:具有极性R侧链,呈亲水 性,通常含羟基、巯基、酰胺基等。(7种)带正电荷的碱性氨基酸:精氨酸、赖氨酸、组氨酸(含氨基)(3种)带负电荷的酸性氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸(含羧基)(2种)第16页/共99页171.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸第17页/共99页182.不带电荷的极性氨基酸不带电荷的极性氨基酸不带电荷的极性氨基酸 第18页/共99页19天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid G
8、lu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸目目 录录第19页/共99页20几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)第20页/共99页21 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH第21页/共99页22n蛋蛋白质的元素组成白质的元素组成:含含N量量 16%n蛋白质基本结构单位:蛋白质基本结构单位:L 氨基酸氨基酸n L氨基酸:甘氨酸(无不对称氨基酸:甘氨酸(无不对称C)除外)除外n
9、氨基酸结构通式:氨基酸结构通式:RCH(NH2)COOHn 常见氨基酸种类:常见氨基酸种类:20种。种。小结第22页/共99页23氨基酸分类:酸性氨基酸:谷、天冬氨酸碱性氨基酸:组、赖、精氨酸不带电荷的极性氨基酸:7 甘、丝、苏、酪(羟基)、半胱氨酸(巯基)、谷氨酰胺、天冬酰胺非极性疏水性氨基酸:8 脂肪烃侧链:丙、缬、亮、异亮氨酸 芳香环侧链:苯丙、色氨酸 含S:蛋氨酸(甲硫氨酸)亚氨基:脯氨酸第23页/共99页24(三)氨基酸的理化性质1、两性解离及等电点 氨基酸是两性电解质,既可解离成阳离子,也可解离成阴离子,解离方式取决于溶液的酸碱度。两性解离两性解离紫外吸收紫外吸收茚三酮反应茚三酮反
10、应第24页/共99页25等电点:isoelectric point,pI在某种pH环境中,氨基酸不解离或解离成阴、阳离子的程度及趋势相等,静电荷为0,此pH为该氨基酸的等电点。R-CH-COOHNH2R-CH-COO NH3+R-CH-COO NH2R-CH-COOHNH3+氨基酸的兼性离子pH=pI阳离子pH pIOH H+OH H+第25页/共99页26问题某氨基酸的等电点是5.1,它在PH=8.0的溶液中带何种电荷?在PH=2.0的溶液中带何种电荷?答:在PH=8.0的溶液中带负电;(pHpI)在PH=2.0的溶液中带正电。(pHpI)第26页/共99页27等电点的计算:R为非极性基团(
11、R为非游离基团)pI=1/2(pK1+pK2)如:甘氨酸pK-COOH=2.34,pK-NH2=9.60 pI=1/2(2.34+9.6)=5.97第27页/共99页28R为极性基团为极性基团 酸性酸性aa:pI=1/2(pK-COOH+pKR)如:天冬氨酸如:天冬氨酸 pI=(pK-COOH+pKR)=(2.09+3.86)=2.98 碱性碱性aa:pI=1/2(pK-NH2+pKR)如:赖氨酸如:赖氨酸 pI=(pK-NH2+pKR)=(8.95+10.53)=9.74第28页/共99页292、紫外吸收性质:280 nm色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在280nm280nm波长附近具有最大吸收峰常
12、用于蛋白质含量测定第29页/共99页303、茚三酮反应氨基酸定量分析(A570)加热第30页/共99页31三、肽键和多肽链 1.肽键peptide bond:一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基脱一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基脱水缩合形成的键称为水缩合形成的键称为肽键肽键 (共价键共价键)。也称酰胺键。NH2 CH C OHOH-NH CH C OHO+NH2 CH C NH-CH-C-OHR1OOR 2R 2R1H2O(一).氨基酸的成肽反应第31页/共99页322.肽:氨基酸借肽键相互连接形成的化合物两个aa组成的肽叫二肽三个aa组成的肽叫三肽多个aa组成的肽叫多肽氨基酸借肽键连成长
13、链,成为多肽链寡肽(氨基酸残基 10)(肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合,基团不全称为氨基酸残基)(肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合,基团不全称为氨基酸残基)第32页/共99页333.肽链两端:氨基末端(N-terminal,N末端)羧基末端(C-terminal,C末端)4.肽链中的aa的排列顺序,一般-NH2端开始,N C,即多肽链有方向性,N端为头,C端为尾 NH2 CH C OHOH-NH CH C OHO+NH2 CH C NH-CH-C-OHR1OOR 2R 2R1H2O第33页/共99页34+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键第34页/共99页35(二(二).生物活性肽生物活性肽glutath
14、ione(GSH)谷胱甘肽)谷胱甘肽谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸作用:体内重要的还原剂第35页/共99页36 多肽类激素、神经肽 催产素(9肽)加压素(9肽)促肾上腺皮质激素(39肽)脑啡肽(5肽)强啡肽(17肽)-内啡肽(31肽)第36页/共99页37四、蛋白质分类 单纯蛋白质(只含氨基酸):白蛋白,球蛋白,组蛋白,精蛋白白蛋白,球蛋白,组蛋白,精蛋白 结合蛋白质(除氨基酸,还有辅基:糖、脂、磷酸、金属离子等)核蛋白,色蛋白,糖蛋白,脂蛋白,磷蛋白,金属蛋白。核蛋白,色蛋白,糖蛋白,脂蛋白,磷蛋白,金属蛋白。(一)按组分分类(二)按形状或空间构象分类 纤维状蛋白质(水溶性差,多为结构蛋白)球状蛋
15、白质(易溶于水,多为功能蛋白)第37页/共99页38第三节 蛋白质的分子结构 高级结构或空间结构二级结构三级结构四级结构一级结构基本结构第38页/共99页39一、蛋白质的一级结构 primary structure概念:蛋白质分子中氨基酸的组成和排列顺序。基本结构键:肽键 peptide bond,有些还有二硫键 disulfide bridges人胰岛素一级结构:A链(21aa)、B链(30aa)H2N-甘-异-缬-谷-谷胺-半-半-苏-丝-异-半-丝-亮-酪-谷胺-亮-谷-天胺-酪-半-天胺-COOHH2N-苯-缬-天胺-谷胺-丝-亮-半-甘-丝-组-亮-缬-谷-丙-亮-酪-亮-缬-半-甘
16、-谷 -精-甘-苯-苯-酪-苏-脯-赖-苏-COOHSSABSSSS第39页/共99页40 二.蛋白质分子的空间结构二级结构二级结构Secondary Structure三级结构三级结构Tertiary Structure四级结构四级结构Quaternary Structure第40页/共99页41(一)(一)、蛋白质分子的二级结构、蛋白质分子的二级结构 指多肽链骨架原子的局部空间排列,指多肽链骨架原子的局部空间排列,不涉及侧链构象不涉及侧链构象稳定结构的主要化学键氢键 蛋白质主链以肽键平面为基本单位,经折叠或盘曲所形成的局部空间构象,蛋白质二级结构的主要形式:-螺旋 -折叠(-片层)-转角
17、无规卷曲第41页/共99页42肽键(CO-NH)具有双键性质,参与形成肽键的4个原子(C,O,N,H)和相邻的两个 碳原子位于同一平面,构成一个肽单元。1 1、肽键平面(也称肽单元)peptide unit CN,半双键性(,半双键性(partial double-bond character),不能旋转),不能旋转C C、N C,真正单键(,真正单键(pure single bond),可以旋转),可以旋转第42页/共99页43第43页/共99页442 2、-螺旋螺旋(-Helix)(Pauling,Corey,1951)特点 -螺旋与-折叠是蛋白质二级结构的主要 形式n右手螺旋:多肽链主链
18、围绕中心轴螺旋式上升右手螺旋:多肽链主链围绕中心轴螺旋式上升n3.6个个AA/圈,螺距圈,螺距0.54nm;n氢键维系:链内氢键(氢键维系:链内氢键(AA1AA4),平行长),平行长轴;轴;n侧链伸出,在螺旋外侧侧链伸出,在螺旋外侧第44页/共99页4549第45页/共99页46 特点n 多肽链充分伸展,肽平面折叠成锯齿状;多肽链充分伸展,肽平面折叠成锯齿状;n 氢键维系:氢键的方向垂直长轴;氢键维系:氢键的方向垂直长轴;n 侧链伸出、位于侧链伸出、位于“锯齿锯齿”状结构的上下方;状结构的上下方;n 由一条多肽链形成,也可由多条肽链顺平行或反平行形成。由一条多肽链形成,也可由多条肽链顺平行或反
19、平行形成。3.-折叠(-片层,-pleated sheets)(Pauling,1951)第46页/共99页47第47页/共99页48第48页/共99页494、-转角和无规卷曲-转角(-bend or -turn):蛋白质分子中,肽链进行1800回折时出现的结构。无规卷曲:指没有确定性规律的肽链结构。-转角分类:I型,中间肽单元的氧原子与侧链R2、R3呈反式位置。II型,中间肽单元的氧原子与侧链R2、R3呈顺式位置第49页/共99页50第50页/共99页51(二)蛋白质的三级结构 指一条多肽链中所有原子在三维空间的整体排布,称为三级结构,是包括主、侧链在内的空间排列。主要化学键:疏水键、离子键
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