生存时间资料分析方法学习教案.pptx

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1、会计学1生存时间生存时间(shjin)资料分析方法资料分析方法第一页，共49页。一、基本概念一、基本概念n n终点事件与起始事件终点事件与起始事件终点事件与起始事件终点事件与起始事件n n终点事件又称死亡事件、失效事件，是指研究者所关心的特定结局；终点事件又称死亡事件、失效事件，是指研究者所关心的特定结局；终点事件又称死亡事件、失效事件，是指研究者所关心的特定结局；终点事件又称死亡事件、失效事件，是指研究者所关心的特定结局；n n起始事件是反映研究对象生存过程起始事件是反映研究对象生存过程起始事件是反映研究对象生存过程起始事件是反映研究对象生存过程(guchng)(guchng)的起始特征的事

2、件。的起始特征的事件。的起始特征的事件。的起始特征的事件。第1页/共49页第二页，共49页。n n生存时间生存时间生存时间生存时间(survival time)(survival time)(survival time)(survival time)n n又称失效时间，为终点事件与起始事件之间的时间间隔，常用又称失效时间，为终点事件与起始事件之间的时间间隔，常用又称失效时间，为终点事件与起始事件之间的时间间隔，常用又称失效时间，为终点事件与起始事件之间的时间间隔，常用(chn yn)(chn yn)(chn yn)(chn yn)符号符号符号符号t t t t表示。表示。表示。表示。n n删失

3、值删失值删失值删失值n n在随访研究中，由于某种原因未能明确地观察到随访对象发生终点在随访研究中，由于某种原因未能明确地观察到随访对象发生终点在随访研究中，由于某种原因未能明确地观察到随访对象发生终点在随访研究中，由于某种原因未能明确地观察到随访对象发生终点事件的时间，无法得知随访对象的确切生存时间，这种现象称为事件的时间，无法得知随访对象的确切生存时间，这种现象称为事件的时间，无法得知随访对象的确切生存时间，这种现象称为事件的时间，无法得知随访对象的确切生存时间，这种现象称为删失，亦称截尾或终检，其有关生存时间的数据称为删失值、截删失，亦称截尾或终检，其有关生存时间的数据称为删失值、截删失，

4、亦称截尾或终检，其有关生存时间的数据称为删失值、截删失，亦称截尾或终检，其有关生存时间的数据称为删失值、截尾数据尾数据尾数据尾数据(censored data)(censored data)(censored data)(censored data)或终检数据。或终检数据。或终检数据。或终检数据。第2页/共49页第三页，共49页。二、资料二、资料(zlio)特点特点n n效应效应效应效应(xioyng)(xioyng)(xioyng)(xioyng)变量有变量有变量有变量有2 2 2 2个个个个n n生存时间生存时间生存时间生存时间n n结局结局结局结局n n存在截尾数据存在截尾数据存在截尾数

5、据存在截尾数据n n分布类型复杂分布类型复杂分布类型复杂分布类型复杂第3页/共49页第四页，共49页。三、统计三、统计(tngj)描述描述第4页/共49页第五页，共49页。1.1.死亡率、死亡概率死亡率、死亡概率(gil)(gil)、生存概率、生存概率(gil)(gil)n n死亡率死亡率(mortality rate,death rate)n n表示在某单位时间表示在某单位时间(shjin)里的死亡频率里的死亡频率或强度，记为或强度，记为m，年死亡率的计算公式为：，年死亡率的计算公式为：n nm=1000某年内死亡数某年平均(pngjn)人口数第5页/共49页第六页，共49页。n n死亡概率

6、死亡概率(gil)(mortality probability)n n是指死于某时段内的可能性大小，记为是指死于某时段内的可能性大小，记为q。年死亡概率年死亡概率(gil)的估计值为；的估计值为；n n q=某年内死亡数某年内死亡数某年年初某年年初(ninch)人口数人口数第6页/共49页第七页，共49页。生存概率生存概率(gil)(survival probability)与死亡概率与死亡概率(gil)相对立，记为相对立，记为p。年。年生存概率生存概率(gil)表示年初人口往后活表示年初人口往后活满一年的机会大小，其估计值为；满一年的机会大小，其估计值为；p=1-q=某年活满某年活满1年人数

7、年人数(rn sh)某年年初某年年初(ninch)人口数人口数第7页/共49页第八页，共49页。2.2.2.2.生存率、生存曲线生存率、生存曲线生存率、生存曲线生存率、生存曲线(qxin)(qxin)(qxin)(qxin)、半数生存期、半数生存期、半数生存期、半数生存期n n生存率生存率(survival rate)n n是指观察对象是指观察对象(duxing)（患者）能存活到（患者）能存活到某一时点某一时点tk的概率，记为的概率，记为S（tk）。其实质）。其实质是累积生存概率。常用的是一年生存率、是累积生存概率。常用的是一年生存率、五年生存率和十年生存率等。五年生存率和十年生存率等。n n

8、 n 年生存率年生存率=100%活满活满n年的例数年的例数观察观察(gunch)例数例数第8页/共49页第九页，共49页。n n生存率估计的概率乘法生存率估计的概率乘法生存率估计的概率乘法生存率估计的概率乘法(chngf(chngf)原理；原理；原理；原理；n n S S（tk tk）=P=P（t t tk tk）=P1P2Pk=P1P2Pk第9页/共49页第十页，共49页。n n生存生存(shngcn)曲线曲线(survival curve)n n是指将各个时点是指将各个时点tk的生存的生存(shngcn)率率S（tk）连接在一起的曲线图）连接在一起的曲线图(纵轴：生存纵轴：生存(shngc

9、n)率，横轴：生存率，横轴：生存(shngcn)时时间间)。n n阶梯型阶梯型n n折线型折线型第10页/共49页第十一页，共49页。n n半数生存期半数生存期(median survival time)n n又称中数生存期、中位生存时间，表示刚好又称中数生存期、中位生存时间，表示刚好(有且只有有且只有)50的个体的个体(gt)可活这么长可活这么长时间。它反映生存期的平均水平。时间。它反映生存期的平均水平。第11页/共49页第十二页，共49页。第二节第二节 小样本小样本(yngbn)(yngbn)生存率的生存率的Kaplan-MeierKaplan-Meier估计估计n n直接直接直接直接(z

10、hji)(zhji)用概率乘法原理估计生存率，又称乘积极限法。用概率乘法原理估计生存率，又称乘积极限法。用概率乘法原理估计生存率，又称乘积极限法。用概率乘法原理估计生存率，又称乘积极限法。第12页/共49页第十三页，共49页。SPSSSPSS演示演示(ynsh)(ynsh)第13页/共49页第十四页，共49页。小样本小样本小样本小样本(yngbn)(yngbn)生存率的生存率的生存率的生存率的Kaplan-MeierKaplan-Meier估计估计估计估计,例例例例12-212-2 View Variable:View Variable:View Data:第14页/共49页第十五页，共49页

11、。Analyze Survival Kaplan-MeierTime 框框:tStatus框框:cDefine EventSingle Value:1ContinueOptions Survival tablesMean and median survivalSurvivalContinueOK第15页/共49页第十六页，共49页。第16页/共49页第十七页，共49页。第17页/共49页第十八页，共49页。第三节第三节 大样本大样本(yngbn)(yngbn)生存率的寿命表法估计生存率的寿命表法估计第18页/共49页第十九页，共49页。SPSSSPSS演示演示(ynsh)(ynsh)第19页/

12、共49页第二十页，共49页。大样本生存率的寿命大样本生存率的寿命大样本生存率的寿命大样本生存率的寿命(shumng)(shumng)表法估计表法估计表法估计表法估计,例例例例12-312-3 View Variable:View Variable:View Data:第20页/共49页第二十一页，共49页。Data Weigh Cases Weigh Cases by:Frequency Variable 框：框：fOKAnalyze Survival Life TablesTime 框框:tDisplay Time Intervals:10 by 1Status框框:cDefine Even

13、tSingle Value:1ContinueOptions LifetablesSurvivalContinueOK第21页/共49页第二十二页，共49页。第22页/共49页第二十三页，共49页。第23页/共49页第二十四页，共49页。第四节第四节 生存生存(shngcn)(shngcn)曲线比较的假设检验曲线比较的假设检验第24页/共49页第二十五页，共49页。Log rankLog rank检验的基本检验的基本(jbn)(jbn)思想思想第25页/共49页第二十六页，共49页。SPSSSPSS演示演示(ynsh)(ynsh)第26页/共49页第二十七页，共49页。生存曲线比较生存曲线比较

14、生存曲线比较生存曲线比较(bjio)(bjio)的的的的Log rankLog rank检验检验检验检验,例例例例12-412-4 View Variable:View Variable:View Data:第27页/共49页第二十八页，共49页。Analyze Survival Kaplan-Meier Time 框框:tStatus框框:cDefine EventSingle Value:1ContinueFactor框框:gCompare Factor Log rankContinueOptions Survival tablesMean and median survivalSurvi

15、valContinueOK第28页/共49页第二十九页，共49页。第29页/共49页第三十页，共49页。第30页/共49页第三十一页，共49页。第五节第五节 Cox Cox比例比例(bl)(bl)风险模型风险模型第31页/共49页第三十二页，共49页。n nCoxCox回归是生存分析的重要方法回归是生存分析的重要方法回归是生存分析的重要方法回归是生存分析的重要方法(fngf(fngf)之一，其优点是适用范围很广以及便之一，其优点是适用范围很广以及便之一，其优点是适用范围很广以及便之一，其优点是适用范围很广以及便于做多因素分析。于做多因素分析。于做多因素分析。于做多因素分析。n nCoxCox回

16、归假定病人的风险函数如下式所示：回归假定病人的风险函数如下式所示：回归假定病人的风险函数如下式所示：回归假定病人的风险函数如下式所示：h(t)=h0(t)exp(b1X1+b2X2+h(t)=h0(t)exp(b1X1+b2X2+bpXp)+bpXp)n n生存函数如下式所示：生存函数如下式所示：生存函数如下式所示：生存函数如下式所示：S(t)=exp-S(t)=exp-h0(t)exp(b1X1+b2X2+h0(t)exp(b1X1+b2X2+bpXp)dt+bpXp)dt第32页/共49页第三十三页，共49页。SPSSSPSS演示演示(ynsh)(ynsh)n n例例例例1 1 1 1：为

17、了研究恶性胆道梗阻住院患者：为了研究恶性胆道梗阻住院患者：为了研究恶性胆道梗阻住院患者：为了研究恶性胆道梗阻住院患者(hunzh)(hunzh)(hunzh)(hunzh)生存时间的影响因生存时间的影响因生存时间的影响因生存时间的影响因素，从三所医院获得素，从三所医院获得素，从三所医院获得素，从三所医院获得1995-20001995-20001995-20001995-2000年年年年95959595例住院患者例住院患者例住院患者例住院患者(hunzh)(hunzh)(hunzh)(hunzh)的数据，的数据，的数据，的数据，试用试用试用试用CoxCoxCoxCox回归模型做生存分析。回归模型

18、做生存分析。回归模型做生存分析。回归模型做生存分析。第33页/共49页第三十四页，共49页。View Variable:第34页/共49页第三十五页，共49页。View Data:第35页/共49页第三十六页，共49页。Analyze Survival Cox RegressionTime:timeStatus:status(1)Covariates:group gender age cost duration complica obstruct size stage hb stb alt ast alp rgt wbcMethod:Enter/Forward LRPlots:Survival

19、Options CI for exp(B):95%ContinueOK第36页/共49页第三十七页，共49页。第37页/共49页第三十八页，共49页。第38页/共49页第三十九页，共49页。第39页/共49页第四十页，共49页。第40页/共49页第四十一页，共49页。n n例2：某医师在研究白血病患者的生存率时收集了33名患者的资料，按Ag阴阳性把33个数据文件分为两组，并分别记录了两组患者的生存月数，是否死亡及白细胞数，试做Cox回归(hugu)分析。第41页/共49页第四十二页，共49页。View Variable:第42页/共49页第四十三页，共49页。View Data:第43页/共4

20、9页第四十四页，共49页。Analyze Survival Cox RegressionTime:生存生存(shngcn)时间时间Status:是否死亡是否死亡(1)Covariates:Ag阴阳性阴阳性 白细胞数白细胞数Method:EnterCategorical:Categorical Covariates:Ag阴阳性阴阳性 Plots:Survival HazardOptions CI for exp(B):95%ContinueOK第44页/共49页第四十五页，共49页。第45页/共49页第四十六页，共49页。第46页/共49页第四十七页，共49页。第47页/共49页第四十八页，共49页。第48页/共49页第四十九页，共49页。