酶蛋白的结构与功能.ppt
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1、第第三三章章 酶蛋白的结构与功能酶蛋白的结构与功能本章主要内容:本章主要内容:1.1.酶的定义;酶的定义;2.2.酶的化学组成与结构;酶的化学组成与结构;3.3.酶催化作用的一般特点;酶催化作用的一般特点;4.4.酶的作用机制;酶的作用机制;5.5.影响酶活性的因素;影响酶活性的因素;6.6.酶工程简介。酶工程简介。生命生命=新陈代谢新陈代谢+遗传变异遗传变异物质代谢物质代谢消消 化化排泄废物排泄废物化学变化(分解,合成)化学变化(分解,合成)产生产生 储存储存 利用利用细细 胞胞能量代谢能量代谢+营养吸收营养吸收酶的研究简史酶的研究简史 公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国
2、已有酿酒记载。1857年,年,Pasteur认为发酵是酵母细胞中酵素催化作用认为发酵是酵母细胞中酵素催化作用的结果。的结果。1877年,年,Khne首次提出首次提出enzyme的概念的概念 1926年,年,Summer首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。1982年,年,Cech首先发现首先发现RNA也具有酶的催化活性,并也具有酶的催化活性,并提出核酶(提出核酶(ribozyme)的概念。)的概念。1995年年Cuenoud等发现等发现DNA也有酶的活性。也有酶的活性。第一节第一节 酶的一般概念酶的一般概念 酶是由生物活细胞所产生的,在体内外均具有酶是由生物活细胞所产生的,在
3、体内外均具有高度专一性和极高催化效率的生物大分子,包括蛋高度专一性和极高催化效率的生物大分子,包括蛋白质和核酸。白质和核酸。早在早在19261926年,年,SummerSummer就提出酶的化学本质是蛋就提出酶的化学本质是蛋白质。后来白质。后来NorthropNorthrop进一步证实了这一结论。现已进一步证实了这一结论。现已发现发现2000020000多种蛋白酶。多种蛋白酶。一、酶的定义一、酶的定义 经酸碱水解后的终产物是氨基酸,能被蛋白酶经酸碱水解后的终产物是氨基酸,能被蛋白酶水解而失活;水解而失活;具有空间结构的生物大分子,凡使蛋白质变性具有空间结构的生物大分子,凡使蛋白质变性的因素都可
4、使酶变性失活;的因素都可使酶变性失活;两性电解质,在不同两性电解质,在不同pH下呈现不同的离子状下呈现不同的离子状态,在电场中向某一电极泳动,具有特定的态,在电场中向某一电极泳动,具有特定的pI;与蛋白质一样,具有不能通过半透膜的胶体性与蛋白质一样,具有不能通过半透膜的胶体性质;质;具有蛋白质所具有的化学呈色反应。具有蛋白质所具有的化学呈色反应。以上事实表明酶在本质上属于蛋白质。以上事实表明酶在本质上属于蛋白质。酶是蛋白质的主要依据:酶是蛋白质的主要依据:1982年,年,Cech和和Altman首先发现首先发现rRNA的前体的前体本身具有自我催化作用本身具有自我催化作用核酶(核酶(ribozy
5、me)的概念。)的概念。以后不少的实验证明,某些以后不少的实验证明,某些RNA和和DNA确实具有酶确实具有酶的催化活性。的催化活性。以蛋白质为主要成分的具有催化活性的生物分以蛋白质为主要成分的具有催化活性的生物分子,在生物体中温和的条件下,能高效且专一地催子,在生物体中温和的条件下,能高效且专一地催化各种生物化学反应,故又称为生物催化剂。化各种生物化学反应,故又称为生物催化剂。酶的命名有酶的命名有习惯命名法习惯命名法和和系统命名法系统命名法。习惯命名法大多根据酶所催化的底物、反应的性质以及习惯命名法大多根据酶所催化的底物、反应的性质以及酶的来源而定。酶的来源而定。系统命名法规定每一酶均有一个系
6、统名称,它标明酶的系统命名法规定每一酶均有一个系统名称,它标明酶的所有底物与反应性质,底物名称之间以所有底物与反应性质,底物名称之间以“”分隔。分隔。由于许多酶的系统名称过长,为了应用方便,国际酶学由于许多酶的系统名称过长,为了应用方便,国际酶学委员会又从每种酶的数个习惯名称中选定一个简便实用的推委员会又从每种酶的数个习惯名称中选定一个简便实用的推荐名称。荐名称。二、酶的命名与分类二、酶的命名与分类(一)酶的命名(一)酶的命名 1.根据酶蛋白的化学组成分类根据酶蛋白的化学组成分类 简单酶蛋白简单酶蛋白&结合酶蛋白结合酶蛋白 简单酶蛋白简单酶蛋白(simple protein):除了蛋白质外,不
7、含其他除了蛋白质外,不含其他物质,如脲酶、蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶和核糖核酸酶等。物质,如脲酶、蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶和核糖核酸酶等。结合酶蛋白结合酶蛋白(conjugated protein):除了蛋白质外,还要除了蛋白质外,还要结合一些对热稳定的非蛋白质小分子物质或金属离子,前者称结合一些对热稳定的非蛋白质小分子物质或金属离子,前者称为为脱辅酶脱辅酶(apoenzyme或或apoprotein),后者称为),后者称为辅助因子辅助因子(cofactor),脱辅酶与辅因子结合后所形成的复合物称为),脱辅酶与辅因子结合后所形成的复合物称为“全酶全酶”(holoenzyme)。)。(二)酶的分类(二
8、)酶的分类脱辅酶脱辅酶+辅助因子辅助因子=全酶全酶Apoenzyme+cofactor=holoenzyme 金属离子:金属离子:辅助因子辅助因子 有机小分子有机小分子Na+、K+、Mg2+、Cu2+、Zn2+和和Fe2+辅酶辅酶(coenzyme)辅基辅基(prosthetic group)辅辅助因子助因子(cofactor)1)1)1)1)稳定酶的构象;稳定酶的构象;稳定酶的构象;稳定酶的构象;2)2)2)2)参与催化反应,传递电子、参与催化反应,传递电子、参与催化反应,传递电子、参与催化反应,传递电子、H H H H和一些基团;和一些基团;和一些基团;和一些基团;3)3)3)3)在酶与底
9、物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;4)4)4)4)正电荷可中和底物的阴离子,降低反应中的正电荷可中和底物的阴离子,降低反应中的正电荷可中和底物的阴离子,降低反应中的正电荷可中和底物的阴离子,降低反应中的 静电斥力等。静电斥力等。静电斥力等。静电斥力等。金属离子的作用:金属离子的作用:金金属属离子:离子:Na+、K+、Mg2+、Cu2+、Zn2+和和Fe2+等。等。表表.一些金属酶和金属激活酶类一些金属酶和金属激活酶类 金属酶金属酶 金金属离子属离子 金属激活酶金属激活酶 金属离子金属离子 碳酸酐酶碳酸酐酶 Zn2+柠檬酸合成酶柠檬酸合成酶
10、K+羧基肽酶羧基肽酶 Zn2+丙酮酸激酶丙酮酸激酶 K+Mg2+过氧化物酶过氧化物酶 Fe2+丙丙酮酸羧化酶酮酸羧化酶 Mn2+Zn2+过氧化氢酶过氧化氢酶 Fe2+精氨酸酶精氨酸酶 Mn2+己糖激酶己糖激酶 Mg2+磷磷酸水解酶类酸水解酶类 Mg2+磷酸转移酶磷酸转移酶 Mg2+蛋蛋白激酶白激酶 Mg2+Mn2+锰超氧化物歧化酶锰超氧化物歧化酶 Mn2+磷磷脂酶脂酶C Ca2+谷胱甘肽过氧化物酶谷胱甘肽过氧化物酶 Se 磷磷脂酶脂酶A2 Ca2+根据与脱辅酶结合的松紧程度,可将根据与脱辅酶结合的松紧程度,可将有机小分子有机小分子分为两类:分为两类:辅酶辅酶(coenzyme)和和辅基辅基(p
11、rosthetic group)。辅酶:辅酶:与脱辅酶结合比较松散,易透析除去,如与脱辅酶结合比较松散,易透析除去,如辅酶辅酶和辅酶和辅酶等。等。辅基:辅基:以共价键和脱辅酶结合,不能透析除去,以共价键和脱辅酶结合,不能透析除去,需经化学处理才能与蛋白分开,如细胞色素氧化酶中需经化学处理才能与蛋白分开,如细胞色素氧化酶中的铁卟啉。的铁卟啉。有机小分子有机小分子:参加催化过程,在反应中起运载体的作用,传递参加催化过程,在反应中起运载体的作用,传递参加催化过程,在反应中起运载体的作用,传递参加催化过程,在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其电子、质子或其电子、质子或其电子、质子或其他他他他基团
12、。基团。基团。基团。表表5-3 一些酶含有一些酶含有机小分机小分子辅酶和金属离子子辅酶和金属离子 酶名称酶名称 金属离子金属离子 有机分子辅基有机分子辅基 细胞色素氧化酶细胞色素氧化酶 Cu 血红素血红素 醇脱氢酶醇脱氢酶 Fe Mo FAD 黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶 Fe Mo FAD 丁酰丁酰CoA脱氢酶脱氢酶 Mo FAD 琥珀酸脱氢酶琥珀酸脱氢酶 Fe FAD NADH-细胞色素还原酶细胞色素还原酶 Fe FAD 甲基丙二酰甲基丙二酰CoA异构酶异构酶 Co 钴胺辅酶钴胺辅酶维生素的分类维生素的分类 2.根据酶蛋白分子的特点,可将酶分为根据酶蛋白分子的特点,可将酶分为4类类:(1)单体
13、酶)单体酶(monomeric enzyme):一般是由一条肽链):一般是由一条肽链组成,例如溶菌酶、羧肽酶组成,例如溶菌酶、羧肽酶A等,但有的单体酶是由多条肽链等,但有的单体酶是由多条肽链组成,如胰凝乳蛋白酶是由组成,如胰凝乳蛋白酶是由3条肽链组成,肽链间二硫键相连条肽链组成,肽链间二硫键相连构成一个共价整体。种类较少,多催化水解反应。构成一个共价整体。种类较少,多催化水解反应。(2)寡聚酶)寡聚酶(oligomeric enzyme):是由两个或两个以):是由两个或两个以上亚基组成的酶。亚基可以相同,也可以不同。亚基一般无活上亚基组成的酶。亚基可以相同,也可以不同。亚基一般无活性。相当数量
14、的寡聚酶是调节酶,在代谢调控中起重要作用。性。相当数量的寡聚酶是调节酶,在代谢调控中起重要作用。(3)多酶复合体)多酶复合体(multienzyme complex):是):是由几种酶靠非共价键嵌合而成。所有反应依次连接,有利由几种酶靠非共价键嵌合而成。所有反应依次连接,有利于一系列反应的连续进行。如脂肪酸合成酶(于一系列反应的连续进行。如脂肪酸合成酶(fatty acid synthase)。)。(4)多功能酶)多功能酶(multifunctional enzyme)或串联酶或串联酶(tandem enzyme):一些多酶体系在进化过程中由于基因一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不
15、同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。称为多功能酶。(1 1)氧化还原酶类()氧化还原酶类(oxidoreductasesoxidoreductases)催化底物进行)催化底物进行氧化还原反应的酶类。例如乳酸脱氢酶、细胞色素氧化酶、氧化还原反应的酶类。例如乳酸脱氢酶、细胞色素氧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶等。过氧化氢酶、过氧化物酶等。(2 2)转移酶类()转移酶类(transferasestransferases)催化底物之间进行某些催化底物之间进行某些基团的转移或交换的酶类。例如甲基转移酶、氨基转移酶、基团的转移或交换的酶类。例如
16、甲基转移酶、氨基转移酶、磷酸化酶等。磷酸化酶等。(3 3)水解酶类()水解酶类(hydrolaseshydrolases)催化底物发生水解反应的催化底物发生水解反应的酶类。例如淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶等。酶类。例如淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶等。3.IEC根据酶催化的反应类型,将酶分为根据酶催化的反应类型,将酶分为6大类大类 (4)裂解酶类(或裂合酶类,)裂解酶类(或裂合酶类,lyases)催化从底物移去催化从底物移去一个基团并留下双键的反应或其逆反应的酶类。例如碳酸酐一个基团并留下双键的反应或其逆反应的酶类。例如碳酸酐酶、醛缩酶、柠檬酸合酶等。酶、醛缩酶、柠檬酸合酶等。(5)异构酶类()异构酶类(i
17、somerases)催化同分异构体之间相互催化同分异构体之间相互转化的酶类。如葡萄糖异构酶、消旋酶等。转化的酶类。如葡萄糖异构酶、消旋酶等。(6)合成酶类)合成酶类(或连接酶类,或连接酶类,ligases)催化两分子底物合催化两分子底物合成为一分子化合物,同时必须由成为一分子化合物,同时必须由ATP(GTP或或UTP)提供能)提供能量的酶类。例如谷氨酰胺合成酶、量的酶类。例如谷氨酰胺合成酶、DNA聚合酶等。聚合酶等。国际系统分类法除按上述六类将酶依次编号外,还根据酶国际系统分类法除按上述六类将酶依次编号外,还根据酶所催化的化学键的特点和参加反应的基团不同,将每一大类又所催化的化学键的特点和参加
18、反应的基团不同,将每一大类又进一步分类。进一步分类。每种酶的分类编号均由四个数字组成,数字前冠以每种酶的分类编号均由四个数字组成,数字前冠以EC(enzyme commission)。编号中第。编号中第1个数字表示该酶属于个数字表示该酶属于六大类中的哪一类;第六大类中的哪一类;第2个数字表示该酶属于哪一亚类;第个数字表示该酶属于哪一亚类;第3个个数字表示亚数字表示亚-亚类;第亚类;第4个数字是该酶在亚个数字是该酶在亚-亚类中的排序。亚类中的排序。酶国际系统分类法酶国际系统分类法以乳酸脱氢酶以乳酸脱氢酶(EC1.1.1.27)为例,其编号解释为例,其编号解释如下:如下:(一)酶活性(一)酶活性
19、酶活性又称酶活力,是指酶催化化学反应的能力。酶活力酶活性又称酶活力,是指酶催化化学反应的能力。酶活力的大小可用在一定条件下催化某一化学反应的速度来表示。的大小可用在一定条件下催化某一化学反应的速度来表示。(二)酶活力单位(二)酶活力单位(active unit)1个酶活力国际单位(个酶活力国际单位(IU)是指:)是指:在最适条件下,每分钟在最适条件下,每分钟催化减少催化减少1mol/L底物或生成底物或生成1mol/L产物所需的酶量。温度一产物所需的酶量。温度一般规定为般规定为25。1Kat(催量)(催量)=6107 IU。(三)比活力(三)比活力(specific activity)酶的比活力
20、也称为比活性,是指每毫克酶蛋白所具有的活酶的比活力也称为比活性,是指每毫克酶蛋白所具有的活力单位数。比活力是表示酶制剂纯度的一个重要指标。力单位数。比活力是表示酶制剂纯度的一个重要指标。三、酶活性及其测定三、酶活性及其测定 四、酶催化作用的特点四、酶催化作用的特点 (一)酶与一般催化剂的(一)酶与一般催化剂的共同点共同点 1.只能催化热力学所允许的化学反应,缩短达到化学平只能催化热力学所允许的化学反应,缩短达到化学平衡的时间,而不改变平衡常数;衡的时间,而不改变平衡常数;2.在化学反应的前后没有质和量的改变;在化学反应的前后没有质和量的改变;(?)(?)3.很少的量就能发挥较大的催化作用(量少
21、作用大);很少的量就能发挥较大的催化作用(量少作用大);4.其作用机理都在于降低了反应的活化能其作用机理都在于降低了反应的活化能(activation energy)。(二)酶与一般催化剂的(二)酶与一般催化剂的不同点不同点 1.1.极高的催化效率极高的催化效率 一般而言,酶促反应的速度比非催化反应高一般而言,酶促反应的速度比非催化反应高10108 810102020倍,比其他催化反应高倍,比其他催化反应高10107 710101313倍。例如,在相倍。例如,在相同的条件下同的条件下,过氧化氢酶要比铁离子催化过氧化氢酶要比铁离子催化H H2 2O O2 2的分解的分解效率高效率高1010111
22、1倍。倍。例一:例一:过氧化氢酶过氧化氢酶 2H2O2 2H2O+O2 铁铁离子离子 过氧化氢酶比铁离子的催化效率高过氧化氢酶比铁离子的催化效率高1011倍。倍。例例二:二:淀粉淀粉 糊精糊精 麦芽糖麦芽糖 葡萄糖葡萄糖n 体内:体内:唾液淀粉酶唾液淀粉酶n 体外:强酸(煮沸体外:强酸(煮沸15分钟)分钟)2.2.高度专一性(高度专一性(specificityspecificity)对底物,反应类型有高度的选择性。对底物,反应类型有高度的选择性。1)1)绝对专一性绝对专一性 2)2)相对专一性相对专一性 3)3)立体异构专一性立体异构专一性1)1)绝对特异性绝对特异性(absolute(abs
23、olute specificity)specificity)一种酶只作用于一种底物,发生一定的反应,并产生特定一种酶只作用于一种底物,发生一定的反应,并产生特定的产物,称为绝对专一性的产物,称为绝对专一性(absolute specificity)。如脲酶。如脲酶(urease),只能催化尿素水解成,只能催化尿素水解成NH3和和CO2,而不能催化甲基,而不能催化甲基尿素的水解反应。尿素的水解反应。2)2)相相对特异性对特异性(relative specificity)(relative specificity)一种酶可作用于一类化合物或一种化学键,这种不太严格一种酶可作用于一类化合物或一种化学
24、键,这种不太严格的专一性称为相对专一性的专一性称为相对专一性(relative specificity)(relative specificity)。如脂肪酶。如脂肪酶不仅水解脂肪,也能水解简单的酯类;磷酸酯酶对一般的磷酸不仅水解脂肪,也能水解简单的酯类;磷酸酯酶对一般的磷酸酯的水解反应都有作用。酯的水解反应都有作用。3 3)立体异构特异性立体异构特异性(stereo specificity)一些酶仅能催化一种立体异构体进行反应,或一些酶仅能催化一种立体异构体进行反应,或其催化的结果只产生一种立体异构体,酶对立体异其催化的结果只产生一种立体异构体,酶对立体异构物的选择性称为立体异构特异性。构物
25、的选择性称为立体异构特异性。例如:例如:延胡索酸延胡索酸+H2O =苹果酸苹果酸 (反丁稀二酸)(反丁稀二酸)顺丁稀二酸顺丁稀二酸+H2O=延胡索酸酶延胡索酸酶 高高效性和专一性的生物学意义:效性和专一性的生物学意义:1 1.高效性高效性大大加快了反应的进行。使代谢的速大大加快了反应的进行。使代谢的速度适合于动物生命活动的需要。度适合于动物生命活动的需要。(量少作用大量少作用大)2.2.酶的高度专一性酶的高度专一性避免了许多副产物的产生,避免了许多副产物的产生,避免了化学反应的多样性,使代谢能按一定的方向避免了化学反应的多样性,使代谢能按一定的方向有序进行。有序进行。3.酶的不稳定性。酶的不稳
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