【教学课件】第16章群体遗传学.ppt
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1、第第1 16 6章章 群体遗传学群体遗传学Population Genetics 群体(群体(populationpopulation)v 又称为孟德尔群体又称为孟德尔群体(Mendelian population)v 指一定地域内一群可以相互交配的所有指一定地域内一群可以相互交配的所有生物个体。生物个体。遗传结构遗传结构生物群体中的生物群体中的等位基因频率等位基因频率以及由不同以及由不同的交配体制所决定的的交配体制所决定的基因型频率基因型频率 群体遗传学(群体遗传学(P Population Genetics)应用数学和统计学方法应用数学和统计学方法研究生物群体中研究生物群体中的基因频率和基
2、因型频率的基因频率和基因型频率以及以及影响影响这些这些频率的遗传学频率的遗传学因素,从而了解生物群体因素,从而了解生物群体遗传结构的变化规律。遗传结构的变化规律。遗传与进化遗传与进化遗传学研究生物遗传和变异的规律和机理;遗传学研究生物遗传和变异的规律和机理;进化论研究生物物种的起源和演变过程;进化论研究生物物种的起源和演变过程;遗传结构的逐代变化是生物进化的基础;遗传结构的逐代变化是生物进化的基础;群体遗传学直接为进化论提供遗传学基础。群体遗传学直接为进化论提供遗传学基础。第第1节节 群体的遗传平衡群体的遗传平衡 一、基因频率和基因型频率一、基因频率和基因型频率 二、二、HardyWeinbe
3、rg定律定律 一、基因频率和基因型频率一、基因频率和基因型频率基因型频率(基因型频率(genotype frequencygenotype frequency):群体中不同基因型个体所占的比例。群体中不同基因型个体所占的比例。某人群中某人群中MNMN血型的基因型频率血型的基因型频率 基因频率基因频率(gene frequency;allele frequency)在一个群体中,在一个群体中,在所研究的基因座位上在所研究的基因座位上不同的等位基因所占的比例不同的等位基因所占的比例。基因型频率的计算基因型频率的计算N N1111、N N1212和和N N2222分别代分别代表三种基因型个体表三种基
4、因型个体的数量的数量N N1111N N1212N N2222N N;D D、H H和和R R分别代表三分别代表三种基因型的频率种基因型的频率 基因型频率计算公式基因型频率计算公式基因频率计算公式基因频率计算公式 二倍体生物中,每个个体的每一个基因座位上有二倍体生物中,每个个体的每一个基因座位上有2 2个等位基因,个等位基因,N N个个体,共有个个体,共有2 2N N个等位基因。个等位基因。基因频率计算公式基因频率计算公式二、二、HardyWeinberg定律定律 在一个平衡的在一个平衡的随机交配的大随机交配的大群体群体内,内,A A和和a a的频率为的频率为p p和和q q,则三种基因则三种
5、基因型的频率为:型的频率为:HardyWeinberg定律定律v 在一个在一个完全随机交配的大群体中,如果完全随机交配的大群体中,如果没有突变、选择、基因迁移等因素的干没有突变、选择、基因迁移等因素的干扰,基因频率和基因型频率在世代之间扰,基因频率和基因型频率在世代之间保持不变。保持不变。v 也称为遗传平衡定律(也称为遗传平衡定律(law of genetic equilibrium)。所谓随机交配,实质上是不同基因型的配所谓随机交配,实质上是不同基因型的配子之间的随机结合子之间的随机结合不管群体中原始基因型频率如何,是不不管群体中原始基因型频率如何,是不是处于平衡状态,是处于平衡状态,只要经
6、过一代的随机只要经过一代的随机交配,群体就能达到平衡。交配,群体就能达到平衡。例,某一群体中,起始的基因型频率为例,某一群体中,起始的基因型频率为:则初始基因频率(初始群体产生的配子频率)为:则初始基因频率(初始群体产生的配子频率)为:这是一个不平衡群体。这是一个不平衡群体。随机交配一代的基因型频率和随机交配一代的基因型频率和基因频率基因频率为:为:在随机交配情况下,第二代的基因型频率和基因频率在随机交配情况下,第二代的基因型频率和基因频率为:为:在随机交配情况下,第三代的基因型频率和基因频率为在随机交配情况下,第三代的基因型频率和基因频率为 比较各代基因频率和基因型频率,基因频率在三代之间比
7、较各代基因频率和基因型频率,基因频率在三代之间没有变化。没有变化。基因型频率是有变化的,第基因型频率是有变化的,第2 2代的基因型频率不等于第代的基因型频率不等于第1 1代的基因型频率,但是,第代的基因型频率,但是,第3 3代的基因型频率与第代的基因型频率与第2 2代的基代的基因型频率是相等的。因型频率是相等的。表明,该表明,该群体已经平衡群体已经平衡。平衡群体的标志:平衡群体的标志:v 平衡群体的标志平衡群体的标志不是基因频率在上下代之不是基因频率在上下代之间保持不变,间保持不变,而是基因型频率在上下代之而是基因型频率在上下代之间保持不变间保持不变。v v 基因频率不变,基因型频率也可能会变
8、化基因频率不变,基因型频率也可能会变化v 基因型频率不变,基因频率一定不变基因型频率不变,基因频率一定不变平衡群体平衡群体在没有突变、选择、迁移的情况下,在没有突变、选择、迁移的情况下,随随机交配群体的基因型频率与等位基因频机交配群体的基因型频率与等位基因频率在世代间保持不变,率在世代间保持不变,这样的群体称为这样的群体称为平衡群体。平衡群体。平衡群体的鉴定平衡群体的鉴定 AA Aa aa 是否平衡?1.0.5 /0.5 -2.0.4 0.2 0.4 -3.0.25 0.5 0.25 +HardyHardyWeinbergWeinberg定律的要点如下:定律的要点如下:1、在在一一个个随随机机
9、交交配配的的大大群群体体中中,如如果果没没有有其其它它因因素素的的干干扰扰,各各世世代代之之间间基基因因频频率率和基因型频率保持不变。和基因型频率保持不变。2 2、在在一一个个大大群群体体内内,不不论论起起始始基基因因频频率率和和基基因因型型频频率率如如何何,只只要要经经过过一一代代的的随随机机交配交配,群体就能达到平衡。,群体就能达到平衡。HardyHardyWeinbergWeinberg定律的要点定律的要点3、基因型频率是随着基因频率的变化而变化的,基因型频率是随着基因频率的变化而变化的,l基因频率变化了,基因型频率一定会随之变化;基因频率变化了,基因型频率一定会随之变化;l基因频率不变
10、,基因型频率也可能变化;基因频率不变,基因型频率也可能变化;l基因型频率若保持不变,基因频率一定不会变化。基因型频率若保持不变,基因频率一定不会变化。l所以,所以,群体平衡的标志是基因型频率保持不变群体平衡的标志是基因型频率保持不变。4 4、如如果果一一个个群群体体的的基基因因频频率率和和基基因因型型频频率率在在世世代代间间保持不变,这个群体就被称为平衡群体保持不变,这个群体就被称为平衡群体。第第2 2节节 改变基因频率的因素改变基因频率的因素 一、突变对基因频率的影响一、突变对基因频率的影响 二、选择对基因频率的影响二、选择对基因频率的影响 三、遗传漂变和奠基者效应三、遗传漂变和奠基者效应
11、HardyWeinberg定律只是一种理想状态定律只是一种理想状态v影响基因频率变化的因素,如影响基因频率变化的因素,如突变、选择、突变、选择、迁移和遗传漂移迁移和遗传漂移等,时时刻刻存在着。等,时时刻刻存在着。v在自然界中,尤其人类社会中,在自然界中,尤其人类社会中,不可能有不可能有无限大的随机婚配群体无限大的随机婚配群体。v这些因素正是生物进化的促进因素。其中这些因素正是生物进化的促进因素。其中突变和选择的作用更大突变和选择的作用更大。一、突变对基因频率的影响一、突变对基因频率的影响v基基因因突突变变是是新新基基因因的的唯唯一一来来源源,是是自自然然选选择择的的原原始始材材料料;对对基基因
12、因频频率率的的影影响响也也是巨大的。是巨大的。v研研究究突突变变对对遗遗传传结结构构的的影影响响时时,仍仍然然假假定定是是一一个个无无限限大大的的随随机机交交配配群群体体,除除了了突变以外没有其它因素的作用。突变以外没有其它因素的作用。突变压(突变压(mutation pressuremutation pressure)v假设在常染色体上有一对基因假设在常染色体上有一对基因A A和和a a,若若A A在长时间内不断突变为在长时间内不断突变为a a,没有其它因素没有其它因素的干扰,最终这个群体中的的干扰,最终这个群体中的A A将全部消失,将全部消失,成为成为a a的纯合群体。的纯合群体。v这就是
13、这就是突变对遗传结构产生的压力突变对遗传结构产生的压力,称,称为突变压(为突变压(mutation pressuremutation pressure)。)。v如果如果A A的初始频率为的初始频率为p p,p p(1 1q q)a a的初始频率为的初始频率为q q,q q(1 1p p)p pq q1 1vA Aa a的速率为的速率为u u,a aA A的速率为的速率为v v;v(1 1q q)u uqvqv,q(q(a a)增大,增大,p(p(A A)下降;下降;v(1 1q q)u uqvqv,q(q(a a)下降,下降,p(p(A A)增大增大;v(1 1q q)u uqvqv,突突变变
14、压压相相等等,则则基基因因频频率率保保持持不不变变,没没有有其其它它因因素素的的干干扰扰,群群体体仍仍处处于平衡状态。于平衡状态。基因的频率完基因的频率完全由突变频率全由突变频率决定。决定。可见,可见,突变突变对群体遗传结对群体遗传结构的影响是十构的影响是十分巨大的。分巨大的。若若u uv v,则一定会有则一定会有p pq q0.50.5。设设A A的最初频率为的最初频率为p p0 0,n n代以后,代以后,A A的频率为的频率为p pn n,群体中群体中只发生只发生A Aa a的突变,经过的突变,经过n n代,群体中代,群体中A A的频率为:的频率为:大多数基因的突变频率很低,然而生物进化的
15、历程是大多数基因的突变频率很低,然而生物进化的历程是无限的,随无限的,随n n的增加,累积起来的突变效应是惊人的。的增加,累积起来的突变效应是惊人的。有些生物,如细菌,世代很短,在短时间内突变对基有些生物,如细菌,世代很短,在短时间内突变对基因频率的变化就会很显著。因频率的变化就会很显著。二、选择对基因频率的影响二、选择对基因频率的影响自然选择(自然选择(natural selection)人工选择(人工选择(artificial selection)自然选择自然选择v 比比较较适适应应环环境境的的个个体体生生育育率率高高,可可以以留留下下较较多多的的后后代代,这这样样下下一一代代群群体体中中
16、这这一一类基因型及相关基因的频率就会增加;类基因型及相关基因的频率就会增加;v 生生育育率率低低的的个个体体留留下下的的后后代代较较少少,下下一一代中有关的基因频率就会降低。代中有关的基因频率就会降低。自然选择自然选择v因因此此,自自然然选选择择的的结结果果总总是是使使群群体体向向着着更加适应于环境的方向发展更加适应于环境的方向发展。v只只有有自自然然选选择择才才能能解解释释生生物物在在适适应应性性和和结构上的合理性。结构上的合理性。v自然选择是进化的关键环节。自然选择是进化的关键环节。自然选择自然选择v 如如果果选选择择作作用用发发生生在在个个体体育育龄龄期期之之前前和和育育龄龄期期间间,就
17、就会会影影响响基基因因型型频频率率和和基基因因的频率;的频率;v 如如果果选选择择作作用用发发生生在在育育龄龄期期以以后后,对对基基因型频率和基因频率的影响不大。因型频率和基因频率的影响不大。人工选择人工选择对对于于人人类类种种植植或或饲饲养养的的物物种种来来说说,除除了了自自然选择以外,还要受到人工选择的作用。然选择以外,还要受到人工选择的作用。二、选择对基因频率的影响二、选择对基因频率的影响 1 1、完全淘汰显性基因的选择效应、完全淘汰显性基因的选择效应 2、完全淘汰隐性基因的选择效应、完全淘汰隐性基因的选择效应 3 3、自然选择,适合度和选择系数、自然选择,适合度和选择系数 4 4、对隐
18、性纯合体不利的选择、对隐性纯合体不利的选择 5 5、不利于显性基因的选择、不利于显性基因的选择 1 1、完全淘汰显性基因的选择效应、完全淘汰显性基因的选择效应v 淘汰显性性状改变基因频率的速度很快。淘汰显性性状改变基因频率的速度很快。v 水稻高杆基因水稻高杆基因SdSd1 1,半矮杆基因半矮杆基因sdsd1 1,SdSd1 1 sdsd1 1。v 某某一一群群体体中中p(p(SdSd1 1)=q()=q(sdsd1 1)=0.50.5,若若只只选选留留半半矮矮杆杆个体,淘汰高杆个体,下一代将全部为矮杆:个体,淘汰高杆个体,下一代将全部为矮杆:v q(q(sdsd1 1)=1=1;p(p(SdS
19、d1 1)=0)=0。2 2、完全淘汰隐性基因的选择效应、完全淘汰隐性基因的选择效应 v若淘汰隐性性状,改变基因频率的速度若淘汰隐性性状,改变基因频率的速度就就慢得多慢得多了。了。v即使隐性基因是致死的,而且也没有新即使隐性基因是致死的,而且也没有新产生的隐性突变基因来补偿,在选择压产生的隐性突变基因来补偿,在选择压力下,隐性有害基因仍然可以在群体中力下,隐性有害基因仍然可以在群体中保持很多世代保持很多世代。例,在杂合体例,在杂合体CcCc的后代中淘汰隐性个体的后代中淘汰隐性个体v玉米中的白化基因(玉米中的白化基因(c c)隐性致死隐性致死v开始时开始时C C和和c c相等,频率各为相等,频率
20、各为0.50.5,即,即v基因型频率为基因型频率为0.250.25CCCC,0.50.5CcCc,0.250.25ccccv隐性纯合体将全部死亡隐性纯合体将全部死亡v此时,此时,p(p(C C)2/32/3,q(q(c c)=)=1/31/3下一代中,基因型频率为下一代中,基因型频率为 v其其中中1/9 1/9 的的cccc个个体体又又死死亡亡,C C的的频频率率进进一一步步提高,提高,c c的频率进一步降低。的频率进一步降低。假设在选择以前隐性基因频率为假设在选择以前隐性基因频率为q q0 0,再下一代:再下一代:若淘汰所有若淘汰所有aaaa植株,下一代植株,下一代a a的频率为:的频率为:
21、再继续淘汰隐性植株:再继续淘汰隐性植株:经过经过n n代后:代后:隐性基因频率逐代下降的情况如下:隐性基因频率逐代下降的情况如下:0.5000.5000.3330.3330.2500.2500.2000.2000.1670.1670.1430.1430.1250.1250.1110.1110.1000.1000.0910.0910.0830.083 根据上述公式可以推算出达到某基因频率所需要的世代数根据上述公式可以推算出达到某基因频率所需要的世代数 若若q q0 0=0.5=0.5,希望希望q qn n0.1,0.1,则则 3 3、自然选择,适合度和选择系数、自然选择,适合度和选择系数 自然选
22、择(自然选择(natural selectionnatural selection)v 在自然状态下,对环境有较大适应能力在自然状态下,对环境有较大适应能力的个体会留下较多的后代,对环境不太的个体会留下较多的后代,对环境不太适应的个体会留下较少的后代。适应的个体会留下较少的后代。v 这就是所谓的自然选择,这就是所谓的自然选择,自然选择的自然选择的结果会使群体向着更加适应环境的方向结果会使群体向着更加适应环境的方向发展。发展。适合度适合度(fitness)fitness)v 不同基因型的个体对环境的相对适应能力不同基因型的个体对环境的相对适应能力可以用适合度来度量可以用适合度来度量v 适合度又称
23、为适应值适合度又称为适应值(adaptive value)adaptive value)或或选择值选择值(selective value)selective value)。适合度适合度(fitness)fitness)v 适合度一般用适合度一般用W W表示,是指某种基因型的个体与表示,是指某种基因型的个体与其它基因型个体相比较,在相同的环境条件下其它基因型个体相比较,在相同的环境条件下能能够存活并留下后代的相对能力够存活并留下后代的相对能力。v 不管基因型的表现如何,只要在同样的环境下和不管基因型的表现如何,只要在同样的环境下和其它基因型相比能够留下较多的后代,它的适合其它基因型相比能够留下较
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