《PUBMED使用方法》PPT课件.ppt

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1、PUBMED樊嵘樊嵘上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室医学院医学院主页地址主页地址 图书馆主页地址图书馆主页地址上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室课题课题查新查新校外访问图书馆资源校外访问图书馆资源v申请了校园网统一账号申请了校园网统一账号(JAccount)可使用内部可使用内部代理功能。代理功能。v校外访问限定在校内访问的资源，请在浏览器中校外访问限定在校内访问的资源，请在浏览器中设定使用代理服务器：设定使用代理服务器：地址：端口：8000或80v访问时按提示输入访问时按提示输入JAccount账号和口令即可。账号和

2、口令即可。上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室医学文献检索四大经典文摘工具医学文献检索四大经典文摘工具vIMMEDLINE（光盘版、网络版（光盘版、网络版PUBMED、OVID等）等）vEMEMbase光盘版光盘版EMBASE.COMvBABA光盘版光盘版BIOSISPREVIEW（OVID、ISI）vCACA光盘版光盘版ScifinderScholar2023/1/172023/1/176 6Pubmed概况概况 由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的，是全球最著名的免费医学专业题录型数据库网上检索系统。从1997年6月起，PubMed在网上免费向用

3、户开放。它具有收录范围广泛、更新速度快、检索系统完备、链接广泛的特点。v5000来源期刊来源期刊,其中英文期刊约占其中英文期刊约占85%v2200万条高质量的题录摘要万条高质量的题录摘要v每日完成来自全球的检索每日完成来自全球的检索200万次万次v医学医学护理护理牙科牙科兽医兽医保健保健临床前临床前v生命科学的期刊生命科学的期刊v全文链接超过全文链接超过3000+种种 2023/1/172023/1/177 7PubMed系统包含的数据库（1 1）MEDLINE MEDLINE(1966-)(1966-)(2(2）PreMEDLINEPreMEDLINE(3(3）Record supplied

4、 by PublisherRecord supplied by Publisher(4)OLD MEDLINE (1946-1965)(4)OLD MEDLINE (1946-1965)(5)(5)NCBI其它数据库的相关记录其它数据库的相关记录 2023/1/172023/1/178 8MEDLINE 是美国国立医学图书馆是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中系统中最大的生物医学数据库，收录最大的生物医学数据库，收录1966年以来年以来70多个国家近多个国家近4000多种生物医学期刊的多种生物医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。书目信息和著者文摘，每周更新。2023/1/172023/

5、1/179 9MEDLINE的组成Index Medicus（医学索引）Index to Dental Literature （牙科文献索引）International Nursing Index（国际护理索引）2023/1/172023/1/171010PreMedline收收集集未未正正式式给给予予MeSH词词、出出版版类类型型等等深深度度标标引引信信息息的的一一个个临临时时库库。NLM每每天天把把最最新新记记录录加加入入到到PreMedline库库中中。工工作作人人员员在在一一周周内内将将这这些些记记录录 标标 引引，然然 后后 转转 入入 MEDLINE，同同 时时 从从PreMedl

6、ine中删去。中删去。2023/1/172023/1/171111Pre-MedlineMedlineNew DataCollectPubMedProcess2023/1/172023/1/171212Record supplied by PublisherRecord supplied by Publisherv出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被被MEDLINE收录，收录，PubMed仍保存。仍保存。2023/1/172023/1/171313OLDMEDLINE1949-1965年间发表的年间发表的200多万篇文献多万篇文献没有没有MeS

7、H字段和摘要。字段和摘要。2023/1/172023/1/171414美国国立卫生研究院美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)美国国立医学图书馆（美国国立医学图书馆（National Library of medicine,NLM）美国国立生物技术信息中心美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，ncbi）或或pubmed主页地址主页地址2023/1/172023/1/1715152023/1/172023/1/171616PubMed基本检索v自由词检索自由词检索自由

8、词检索自由词检索 v主题词检索主题词检索主题词检索主题词检索v布尔逻辑检索布尔逻辑检索布尔逻辑检索布尔逻辑检索v字段限制检索字段限制检索字段限制检索字段限制检索 著者检索著者检索著者检索著者检索 刊名检索刊名检索刊名检索刊名检索v截词检索截词检索截词检索截词检索v强制检索强制检索强制检索强制检索2023/1/172023/1/171717自由词检索自由词检索自由词检索自由词检索在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点击均可），点击均可），点击均可），

9、点击SearchSearch按钮，按钮，按钮，按钮，PubMedPubMed系统会自系统会自系统会自系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能自动词汇匹配功能自动词汇匹配功能自动词汇匹配功能”。2023/1/172023/1/171818vPubMedPubMed对输入检索对输入

10、检索框中的检索词进行智框中的检索词进行智能化地校对，将其逐能化地校对，将其逐步地与其数据库中的步地与其数据库中的各类术语匹配的原则。各类术语匹配的原则。MeSH Translation Table主题词注释表主题词注释表Journals Translation Table期刊注释表期刊注释表Common Phrase List常用词组表常用词组表Author Index作者索引表作者索引表NoMappingNoMapping检索词拆分检索词拆分AND自动词汇匹配自动词汇匹配上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室如果在上述如果在上述4个表或索引中仍个表或索引中仍

11、找不到相匹配的词时，的词时，PubMed就将就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别查找，再重复以上顺序单独分别查找，直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配词，则直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配词，则用AND 将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找。例例：h1n1 flu转转 换换 为为 h1n1All Fields AND(influenza,humanMeSH Terms OR(influenzaAll Fields AND humanAll Fields)OR human influenzaAll Fields OR fluAll Fields)上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院

12、医学文献检索教研室献检索教研室强制检索强制检索vvPubMedPubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。允许使用双引号来强制系统进行短语检索。允许使用双引号来强制系统进行短语检索。允许使用双引号来强制系统进行短语检索。vv如：在如：在如：在如：在PubMedPubMed主页的检索提问框中键入主页的检索提问框中键入主页的检索提问框中键入主页的检索提问框中键入“heartheartfailure”failure”，并用双引号引起来。点击，并用双引号引起来。点击，并用双引号引起来。点击，并用双引号引起来。点击“GO”GO”按钮，系统会按钮，系统会按钮，系统会按钮，系统会将其作为一个不可分割的

13、词组在数据库的全部字段中进行将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。检索。检索。检索。vv如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2 2个个个个词：词：词：词：heaartheaart和和和和failurefailure检索检索检索检索,并进行自动匹配并进行自动匹配并进行自动匹配并进行自动匹配2023/1/172023/1/172121自

14、然检索语言自然检索语言2023/1/172023/1/172222主题检索语言主题检索语言上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室主题词检索主题词检索(MESHDATABASE)v主题词主题词(headings)：27000余个余个直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能用一个主题词表达，如：心力衰竭用一个主题词表达，如：心力衰竭Cardiac FailureMyocardial FailureHeart FailureHeart DecompensationHeart Failure主题词检索主题词检索(ME

15、SHDATABASE)v副主题词副主题词(subheadings)：83个个v用于对主题词的某一特定方面加以限定，强调主题概念用于对主题词的某一特定方面加以限定，强调主题概念的某些专指方面。的某些专指方面。v如：治疗（如：治疗（therapy）、外科学（）、外科学（surgery）、）、代谢（代谢（metabolism）、）、诊断（诊断（diagnosis）v主题词与副主题词之间的组配检索，起到对主主题词与副主题词之间的组配检索，起到对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专指性，题词的限定作用，是主题词具有更高的专指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。缩小检索范围，保证检索结果的准确性。v

16、如：心衰的药物治疗如：心衰的药物治疗heart failure/drug therapy上海交通大学医学院医学文上海交通大学医学院医学文献检索教研室献检索教研室2023/1/172023/1/172525举例举例v检索胃癌检索胃癌(gastriccancer)的文献的文献2023/1/172023/1/1726262023/1/172023/1/1727272023/1/172023/1/1728282023/1/172023/1/172929自由词检索优缺点自由词检索优缺点v优点优点:检索非常简单方便检索非常简单方便v缺点缺点:检索结果不精确检索结果不精确v建议建议:如果有主题词的如果有主题

17、词的,尽量用主题词检索尽量用主题词检索2023/1/172023/1/173030主题词检索主题词检索(MESHDATABASE)v采用主题词与副主题词组配的方法采用主题词与副主题词组配的方法,使检索结果更使检索结果更精准精准.v如如:胃癌病因的文献胃癌病因的文献.2023/1/172023/1/1731312023/1/172023/1/1732322023/1/172023/1/1733332023/1/172023/1/1734342023/1/172023/1/1735352023/1/172023/1/173636v如检索如检索”乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶LDH与胃癌关系与胃癌关系”的文献

18、的文献2023/1/172023/1/173737A BA B 逻辑与（逻辑与（逻辑与（逻辑与（ANDAND）-检出记录中同时含有检索词检出记录中同时含有检索词检出记录中同时含有检索词检出记录中同时含有检索词A A和检索词和检索词和检索词和检索词B.B.如：如：如：如：A AND BA AND B 逻辑非（逻辑非（逻辑非（逻辑非（NOTNOT）-在含检索词在含检索词在含检索词在含检索词A A的记录中，去掉含检索词的记录中，去掉含检索词的记录中，去掉含检索词的记录中，去掉含检索词B B的记录。的记录。的记录。的记录。如：如：如：如：A NOT BA NOT B 逻辑或（逻辑或（逻辑或（逻辑或（O

19、ROR）-检出记录中含有检索词检出记录中含有检索词检出记录中含有检索词检出记录中含有检索词A A或检索词或检索词或检索词或检索词B B或同时含有检索词或同时含有检索词或同时含有检索词或同时含有检索词A A和和和和B B的文献。的文献。的文献。的文献。如：如：如：如：A OR BA OR BA B布尔逻辑组合检索布尔逻辑组合检索2023/1/172023/1/1738382023/1/172023/1/1739392023/1/172023/1/1740402023/1/172023/1/1741412023/1/172023/1/1742422023/1/172023/1/1743432023

20、/1/172023/1/1744442023/1/172023/1/174545过滤器选择过滤器选择临床试验临床试验综述综述全文链接全文链接发表日期发表日期文献语种文献语种年龄年龄性别研究对象研究对象期刊类型期刊类型学科主题学科主题2023/1/172023/1/174646乳酸脱氢酶与胃癌关系的中英文综述乳酸脱氢酶与胃癌关系的中英文综述2023/1/172023/1/1747472023/1/172023/1/1748482023/1/172023/1/174949高级检索高级检索高级检索提供高级检索提供组合组合检索检索,检索历史列表。检索历史列表。2023/1/172023/1/17505

21、0举例举例v美托洛尔治疗心力衰竭的文献美托洛尔治疗心力衰竭的文献HeartFailure/drugtherapyMetoprolol/therapeuticuse2023/1/172023/1/1751512023/1/172023/1/1752522023/1/172023/1/175353保存检索结果保存检索结果vSendtoFile默认：把检索到的所有结果保存成.txt文件勾选：只将勾选的记录保存成.txt文件Clipboard(剪贴板，最多保存500)Collections(保存到My NCBI,最多保存1000)E-Mail(检索结果发送到邮箱)Order(订阅全文，全文传递系统)2

22、023/1/172023/1/175454期刊检索期刊检索期刊检索期刊检索 2023/1/172023/1/175555期刊检索期刊检索v刊名缩写刊名缩写N Engl J Medv刊名全称刊名全称“The New England Journal of Medicine”vISSN “0028-4793”2023/1/172023/1/175656作者检索作者检索v作者姓在前作者姓在前,名在后名在后,姓全称姓全称,名缩写名缩写如如:alving c *注意与 alving c的区别v作者全名作者全名如如:julia s wong (2002年起增加作者全名字段FAU)2023/1/172023/

23、1/1757572023/1/172023/1/1758582023/1/172023/1/175959v使用使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键号作为通配符进行截词检索。如：键入入“bacter*”，系，系统会找到那些前一部分是统会找到那些前一部分是bacter的单词（如的单词（如bacteria,bacterium,bacteriophage等），并对其分别进行检索。等），并对其分别进行检索。但只能查前600个变形 使用截词功能无法进行自由匹配 截词检索功能 2023/1/172023/1/176060字段限制检索字段限制检索v采用字段限制方式进行检索，其规则：采用字段限制方式进行检

24、索，其规则：采用字段限制方式进行检索，其规则：采用字段限制方式进行检索，其规则：使用字段限制无法进行自由匹配检索词检索词检索词检索词 字段标识字段标识字段标识字段标识 v如检索如检索如检索如检索 CellCell期刊期刊期刊期刊celltacelltav如检索如检索如检索如检索 篇名中有篇名中有篇名中有篇名中有CellCell的文献的文献的文献的文献cellticelltiv如检索作者姓如检索作者姓如检索作者姓如检索作者姓CellCell所发表的文献所发表的文献所发表的文献所发表的文献cellaucellauv如检索地址名为如检索地址名为如检索地址名为如检索地址名为CellCell的文献的文献

25、的文献的文献celladcellad2023/1/172023/1/176161Single Citation Matcher Single Citation Matcher 2023/1/172023/1/176262Single Citation MatcherSingle Citation Matcherv快速找寻一篇特定文章快速找寻一篇特定文章如如:Science.2009Oct23;326(5952):565-8.SunshineJM,FarnhamTL,FeagaLM,etal.2023/1/172023/1/1763632023/1/172023/1/1764642023/1/1

26、72023/1/1765652023/1/172023/1/1766662023/1/172023/1/176767如如PUBMED没有给出全文链接，怎么办？没有给出全文链接，怎么办？检索全文检索全文Diabetes.1988Jul;37(7):901-7.Effectofintensiveinsulintherapyonglycemicthresholdsforcounterregulatoryhormonerelease.AmielSA,SherwinRS,SimonsonDC,TamborlaneWV.2023/1/172023/1/1768682023/1/172023/1/17696

27、92023/1/172023/1/177070请用请用GOOGLE2023/1/172023/1/1771712023/1/172023/1/177272Clinical QueriesClinical Queries检索临床研究类文献检索临床研究类文献 检索系统评价类文献检索系统评价类文献 检索遗传学类文献检索遗传学类文献 2023/1/172023/1/177373举例举例v肾炎肾炎(Nephritis)病因学的相关文献病因学的相关文献2023/1/172023/1/1774742023/1/172023/1/1775752023/1/172023/1/1776762023/1/17202

28、3/1/1777772023/1/172023/1/177878ClinicalTrials2023/1/172023/1/177979ClinicalTrials.govv由美国卫生研究所由美国卫生研究所(NIH)下属国家医学图书馆下属国家医学图书馆运作的一个注册库，收录了全球由国家拨款或私运作的一个注册库，收录了全球由国家拨款或私募经费资助的各项试验目录。只要能上网，任何募经费资助的各项试验目录。只要能上网，任何人都可以免费使用该注册库。人都可以免费使用该注册库。2023/1/172023/1/178080PMC免费全文v生命科学期刊资源中心生命科学期刊资源中心v免费提供近免费提供近100

29、01000种期刊的种期刊的200200多万篇全文多万篇全文2023/1/172023/1/178181MyNCBIv个性化服务个性化服务,免费申请帐号免费申请帐号,登录登录v用于保存检索式、收藏检索结果、自动更新检索结果、更新结果用于保存检索式、收藏检索结果、自动更新检索结果、更新结果E-mail提醒等：提醒等：保存检索策略(Saved Search)：可长期保存检索策略；收藏(Collection)：可保存检索结果，最多保存1000条记录；允许用户每月、每周或每天以Email方式接收系统对这些检索策略进行自动更新的结果，从而大大方便了用户对课题进行定期检索的需求；过滤(Search Filters)：按照用户兴趣把检索结果分类。2023/1/172023/1/178282