《数量性状遗传分析》PPT课件.ppt
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1、第九章第九章 数量性状数量性状遗传分析分析第一节第一节 数量性状及其特征数量性状及其特征第二节第二节 数量性状遗传分析的基本方法数量性状遗传分析的基本方法第三节第三节 近亲繁殖与杂种优势近亲繁殖与杂种优势第一节第一节 数量性状及其特征数量性状及其特征一、数量性状的概念一、数量性状的概念 质量性状与数量性状质量性状与数量性状 质量性状质量性状(qualitative character):表型之间截然不同,具):表型之间截然不同,具有质的差别,可以用文字描述的性状。有质的差别,可以用文字描述的性状。表现不连续变异的性状表现不连续变异的性状。如红花、白花、水稻的糯与粳,豌豆的饱满与皱褶等性状。如红
2、花、白花、水稻的糯与粳,豌豆的饱满与皱褶等性状。数量性状数量性状(quantitative character):表型之间呈连续变异状):表型之间呈连续变异状态,界限不清楚,不易分类,只能用数字描述的性状。态,界限不清楚,不易分类,只能用数字描述的性状。表现连续表现连续变异的性状变异的性状。如作物的产量,奶牛的泌乳量等。如作物的产量,奶牛的泌乳量等。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征表表 玉米穗长的遗传玉米穗长的遗传频频 长长世世 率率f 度度 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 代代 短穗亲本短穗亲本 4 2
3、1 24 8 57 6.632 0.816 0.666(N0.60)长穗亲本长穗亲本 3 11 12 15 26 15 10 7 2 101 163802 1.887 3.561(No.54)F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.307 F2 1 10 19 26 47 73 68 68 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.072数量性状的特征数量性状的特征 数量性状的变异表现为连续的数量性状的变异表现为连续的,杂交后的分杂交后的分离世代不能明确分组离世代不能明确分组,只能用度量单位进行测量,只能用度量单位进行测量,并采用统计学方法
4、加以分析。并采用统计学方法加以分析。如水稻、小麦植株的高矮、生育期长短,产量如水稻、小麦植株的高矮、生育期长短,产量高低等。高低等。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征 数量性状的特征数量性状的特征 数量性状一般容易受环境条件的影响而发生变异,数量性状一般容易受环境条件的影响而发生变异,这种变异是不遗传这种变异是不遗传。数量性状举例:数量性状举例:玉米果穗长度不同的两个品系杂交,玉米果穗长度不同的两个品系杂交,F F1 1的穗长介于两的穗长介于两亲本之间,呈中间型;亲本之间,呈中间型;F F2 2出现连续变异,不易分组,即使出现连续变异,不易分组,即使P P1 1、P P2 2(纯合
5、)也呈连续分布。(纯合)也呈连续分布。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征表表 玉米穗长的遗传玉米穗长的遗传频频 长长世世 率率f 度度 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 代代 短穗亲本短穗亲本 4 21 24 8 57 6.632 0.816 0.666(N0.60)长穗亲本长穗亲本 3 11 12 15 26 15 10 7 2 101 163802 1.887 3.561(No.54)F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.307 F2 1 10 19 26 47 7
6、3 68 68 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.072数量性状的特征数量性状的特征 数量性状普遍存在着基因型与环境互作数量性状普遍存在着基因型与环境互作:控制数量性状的基因较多,且容易出现在特定的控制数量性状的基因较多,且容易出现在特定的发育阶段和环境中表达,在不同环境条件下基因表达发育阶段和环境中表达,在不同环境条件下基因表达的程度可能不同。的程度可能不同。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征 质量性状和数量性状的划分不是绝对,质量性状和数量性状的划分不是绝对,同一性状在不同亲本的杂交组合中可能表现不同。同一性状在不同亲本的杂交组合中可能表现不同。举例:植
7、株的高度是一个数量性状,但在有些杂举例:植株的高度是一个数量性状,但在有些杂交组合中,高株和矮株却表现为简单的质量性状遗传。交组合中,高株和矮株却表现为简单的质量性状遗传。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征数量性状与质量性状区别数量性状与质量性状区别 质量性状质量性状 数量性状数量性状1.变异变异 非连续性非连续性 连续性连续性 F1 显性显性 连续性连续性(中亲值或中亲值或 有偏向有偏向)F2 相对性状分离相对性状分离 连续性连续性(正态分布正态分布)2.对环境对环境 不敏感不敏感 易受环境条件影响易受环境条件影响 的效应的效应 产生变异产生变异3.控制性状控制性状 基因少基因少
8、,效应明显效应明显 微效多基因控制微效多基因控制 的基因及的基因及 存在显隐性存在显隐性 作用相等作用相等,累加累加 效应效应4.研究方法研究方法 群体小群体小,世代数少世代数少 群体大群体大,世代数多世代数多 用分组描述用分组描述 采用统计方法采用统计方法二、数量性状的多基因假说二、数量性状的多基因假说 1908年年Nilson-Ehle提出多基因假说(提出多基因假说(multiple-factor hypothesis),具体内容有:),具体内容有:决定数量性状的基因数目很多决定数量性状的基因数目很多 各基因的效应相等各基因的效应相等 各个等位基因的表现为不完全显性或无显性,各个等位基因的
9、表现为不完全显性或无显性,或表现为增效和减效作用或表现为增效和减效作用 各基因的作用是累加性的。各基因的作用是累加性的。1、数量性状多基因学说实验依据、数量性状多基因学说实验依据小麦籽粒颜色的遗传小麦籽粒颜色的遗传P 红粒红粒 白粒白粒 红粒红粒 白粒白粒 红粒红粒 白粒白粒 F1 红红 红红 红红 F2 3红红 1白白 15红红 1白白 63红红 1白白2、多基因学说的要点、多基因学说的要点 1908年年Nilson-Ehle提出多基因假说(提出多基因假说(multiple-factor hypothesis),具体内容有:),具体内容有:决定数量性状的基因数目很多决定数量性状的基因数目很多
10、 各基因的效应相等各基因的效应相等 各个等位基因的表现为不完全显性或无显性,各个等位基因的表现为不完全显性或无显性,或表现为增效和减效作用或表现为增效和减效作用 各基因的作用是累加性的。各基因的作用是累加性的。数量性状由多基因决定,而且受到环境的数量性状由多基因决定,而且受到环境的作用,使遗传和不遗传的变异混在一起,不易作用,使遗传和不遗传的变异混在一起,不易区别开来。所以,对数量性状的研究,一定要区别开来。所以,对数量性状的研究,一定要采用统计学的分析方法。采用统计学的分析方法。数量性状基因概念的发展数量性状基因概念的发展 微效多基因(微效多基因(Polygene)或微效基因()或微效基因(
11、minorgene)基因数量多,每个基因对表型的影响较微,所以不能把基因数量多,每个基因对表型的影响较微,所以不能把它们个别的作用区别开来,称这类基因为微效基因。它们个别的作用区别开来,称这类基因为微效基因。这是专门用来表述控制数量性状的基因,与控制质量性这是专门用来表述控制数量性状的基因,与控制质量性状的基因相区别。状的基因相区别。p 数量性状是许多对微效基因或多基因数量性状是许多对微效基因或多基因(polygene)的联合效应所造成。的联合效应所造成。p多基因中的每一对基因对性状表型的表现所产生的效应是微小的。多基因中的每一对基因对性状表型的表现所产生的效应是微小的。p微效基因的效应是相等
12、而且相加的,故又可称多基因为累加基因。微效基因的效应是相等而且相加的,故又可称多基因为累加基因。p微效基因的等位基因之间往往缺乏显隐性。有时用大写字母表示增效,微效基因的等位基因之间往往缺乏显隐性。有时用大写字母表示增效,小写字母表示减效。小写字母表示减效。p微效基因对环境敏感,因而数量性状的表现容易受环境因素的影响而微效基因对环境敏感,因而数量性状的表现容易受环境因素的影响而发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的影响所遮盖,发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的影响所遮盖,难以识别个别基因的作用。难以识别个别基因的作用。p多基因与主效基因多基因与主效基因(majorgen
13、e)一样都处在染色体上,并且具有分离、一样都处在染色体上,并且具有分离、重组、连锁等性质。重组、连锁等性质。数量性状位点(数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)在控制数量性状的多基因中,对该数量性状值贡在控制数量性状的多基因中,对该数量性状值贡献较大的位点。献较大的位点。DNA分子标记技术的发展,为分子标记技术的发展,为QTL的定位研究的定位研究和和QTL分子标记辅助选择育种提供了技术支持。分子标记辅助选择育种提供了技术支持。修饰基因(修饰基因(modifying facfors)是指有一些性状虽然是受一对或少数是指有一些性状虽然是受一对或少数n对主对主基因控制
14、,但另外还有一组效果微小的基因能基因控制,但另外还有一组效果微小的基因能增强或削弱主基因对表现型的作用,这类微效增强或削弱主基因对表现型的作用,这类微效基因在遗传学上称为修饰基因。基因在遗传学上称为修饰基因。举例举例 牛的毛色花斑是由一对隐性基因控制的,牛的毛色花斑是由一对隐性基因控制的,但花斑的大小则是一组修饰基因影响主基但花斑的大小则是一组修饰基因影响主基因的结果。因的结果。超亲遗传超亲遗传 杂种后代在某个(些)性状的度量值杂种后代在某个(些)性状的度量值超超过双亲过双亲。这种现象可用多基因假说来解释。详见这种现象可用多基因假说来解释。详见“杂种优势利用杂种优势利用”一章。一章。三、阈性状
15、及其特征三、阈性状及其特征阈性状:阈性状:指性状的指性状的遗传是由多基因决定,而它是由多基因决定,而它们的表型的表型 是是 非非连续性的一性的一类性状。性状。(threshold)。个体个体间度量数据表度量数据表现为连续分布,表型是非分布,表型是非连续性。性。第第一一节节 数数量量性性状状及及其其特特征征 分析数量性状的分析数量性状的基本统计方法基本统计方法l 均值(mean)又称为平均值(average)l 方差方差(variance)l 标准差(standard deviation,SD)或叫做标准误(standard error)l 相关(correlation)l 相关系数(corre
16、lation coefficient)l 协方差(covariance)l 回归(regressim)平均数(平均数(mean)通常是应用算术平均数,即把全部通常是应用算术平均数,即把全部资料中各个观察的数据总加起来,然后用资料中各个观察的数据总加起来,然后用观察总个数除之,所得的商就是平均数。观察总个数除之,所得的商就是平均数。X=X/n 平均数是用以表示平均数是用以表示一组资料的集中性一组资料的集中性第第二二节节 数量数量性状性状遗传遗传分析分析的基的基本方本方法法 方差(方差(方差(方差(VarianceVariance)和标准差()和标准差()和标准差()和标准差(standard s
17、tandard deviationdeviation)方差:方差:方差:方差:是用以表示是用以表示是用以表示是用以表示一组资料的分散程度或离中性一组资料的分散程度或离中性一组资料的分散程度或离中性一组资料的分散程度或离中性,方差(或称变量)开方即等于方差(或称变量)开方即等于方差(或称变量)开方即等于方差(或称变量)开方即等于标准差标准差标准差标准差,它们是,它们是,它们是,它们是全部观察全部观察全部观察全部观察数偏离平均数数偏离平均数数偏离平均数数偏离平均数的重要参数,的重要参数,的重要参数,的重要参数,方差或标准差愈大,表示这方差或标准差愈大,表示这方差或标准差愈大,表示这方差或标准差愈大
18、,表示这个资料的变异程度愈大,也说明平均数个资料的变异程度愈大,也说明平均数个资料的变异程度愈大,也说明平均数个资料的变异程度愈大,也说明平均数n nn n代表性愈小。代表性愈小。代表性愈小。代表性愈小。方差方差方差方差 V=(x-x)V=(x-x)22/(n-1)/(n-1)=x =x 22-(x)-(x)22/n/(n-1)/n/(n-1)标准差标准差标准差标准差 S=(x-x)S=(x-x)22/(n-1)(n30/(n-1)(n30时时时时,n-1,n-1 n)n)第第二二节节 数量数量性状性状遗传遗传分析分析的基的基本方本方法法S2=X 和(Xi-X)不是整数不便计算,所以将上式进一
19、步改为下式:(X-X)2 n (X2-2XX+X2)X2-2XX+X2 n n X n X2-2nXX+nX2 X2-nX2 n n X n n 假使平均数是从实际观察数计算来,公式(1)的分母是n-1。S2=X=nX=X(1)(2)(3)(3)代入(2)S2=()2X2-S2=表表 玉米穗玉米穗 长的平均数和标准差长的平均数和标准差频频 长长世世 率率f 度度 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 代代 短穗亲本短穗亲本 4 21 24 8 57 6.632 0.816 0.666(N0.60)长穗亲本长穗亲本 3 11
20、12 15 26 15 10 7 2 101 16.380 1.887 3.561(No.54)F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.307 F2 1 10 19 26 47 73 68 68 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.072一、数量性状的遗传率一、数量性状的遗传率1 1、表型值及其方差的分量、表型值及其方差的分量 一、数量性状的遗传率一、数量性状的遗传率 1 1、表型值及其方差的分量、表型值及其方差的分量 表现型值:表现型值:某性状表现型(度量或观察到)的数值,用某性状表现型(度量或观察到)的数值,用P表示;表示;基因型
21、值:基因型值:性状表达中由基因型所决定的数值,性状表达中由基因型所决定的数值,用用G表示;表示;环境型值:环境型值:表现型值与基因型值之差,用表现型值与基因型值之差,用E表示表示 三者关系:三者关系:P=G+E 表型方差表型方差=遗传(基因型)方差遗传(基因型)方差+环境方差环境方差 VPhenotype=VGenetics +VEnvironment 表型是基因型和环境相互作用的结果表型是基因型和环境相互作用的结果2.遗传率遗传率(1)、广义遗传率)、广义遗传率 定义:定义:遗传方差占总方差的比值遗传方差占总方差的比值,通常以百分数表示,通常以百分数表示 h2B(广义遗传率广义遗传率)=遗传
22、方差遗传方差/总方差总方差100%=VG/(VG+VE)100%推导推导:令令P、G和和E分别表示分别表示P(表现型值)、(表现型值)、G(基因型值)(基因型值)和和E(环境值)的平均数。(环境值)的平均数。那么上式那么上式P=G+E各项的方差可以推算如下:各项的方差可以推算如下:(P-P)2=(G+E)-(G+E)2 =(G-G)2+(E-E)2+2(G-G)(E-E)如果基因型与环境之间没有相互关系如果基因型与环境之间没有相互关系,则则 2(G-G)(E-E)=0那么那么 (P-P)2=(G-G)2+(E-E)2 除以除以n (P-P)2/n=(G-G)2/n+(E-E)2/n VP=VG
23、+VE h2B=VG/(VG+VE)100%=VG/VP 100%遗传率的意义遗传率的意义 从上式可以看出,遗传方差越大,占总方差的比从上式可以看出,遗传方差越大,占总方差的比重愈大,求得的遗传率数值愈大,说明这个性状传递重愈大,求得的遗传率数值愈大,说明这个性状传递给子代的传递能力就愈强,受环境的影响也就较小。给子代的传递能力就愈强,受环境的影响也就较小。这样,亲本性状在子代中将有较多的机会表现出来,这样,亲本性状在子代中将有较多的机会表现出来,选择的把握性就大;反之,则小。选择的把握性就大;反之,则小。所以,遗传率的大小可以作为衡量亲代和子代之所以,遗传率的大小可以作为衡量亲代和子代之间遗
24、传关系的标准间遗传关系的标准 广义遗传率的估算方法广义遗传率的估算方法 广义遗传率定义:广义遗传率定义:h2B=VG/VP =VG/(VG+VE)100%VP=VG+VE VG(遗传方差)(遗传方差)=VP-VE VP(总方差总方差)=F2的表型方差的表型方差 VE(环境方差环境方差)=VF1 =1/2(VP1+VP2)=1/3(VP1+VP2+VF1)VG(遗传方差)(遗传方差)=VP-VE h2B=VG/VF2100%=(VF2-VF1)/VF2 100%=VF2-1/2(VP1+VP2)/VF2100%=VF2-1/3(VF1+VP1+VP2)/VF2 100%表表 玉米穗玉米穗 长的平
25、均数和标准差长的平均数和标准差频频 长长世世 率率f 度度 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 N X S V 代代 短穗亲本短穗亲本 4 21 24 8 57 6.632 0.816 0.666(N0.60)长穗亲本长穗亲本 3 11 12 15 26 15 10 7 2 101 163802 1.887 3.561(No.54)F1 1 12 12 14 17 9 4 69 12.116 1.519 2.307 F2 1 10 19 26 47 73 68 68 25 15 9 1 401 12.888 2.252 5.072 举例举
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