《酶学基础三》PPT课件.ppt
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1、酶学基础(三)酶学基础(三)1.1.5 酶促反应的机制酶促反应的机制1.酶底物复合物的形成酶底物复合物的形成(1)(1)中间产物学说:中间产物学说:E+S ES E+P(2)酶与底物结合特点:酶与底物结合特点:1)可逆的、非共价的结合;)可逆的、非共价的结合;2)底物只与酶的活性中心结合;)底物只与酶的活性中心结合;3)酶与底物结合是通过一种称为诱导契)酶与底物结合是通过一种称为诱导契合模式进行的。合模式进行的。k1 k-1k2 酶促反应:酶促反应:酶促反应:酶促反应:E+S =ES E+S =ES E+S =ES E+S =ES EP EP EP EP E+P E+P E+P E+P 反应方
2、向反应方向反应方向反应方向,即化学平衡方向即化学平衡方向即化学平衡方向即化学平衡方向,主要取决于反应主要取决于反应主要取决于反应主要取决于反应自由能变化自由能变化自由能变化自由能变化 H H H H 。而反应速度快慢而反应速度快慢而反应速度快慢而反应速度快慢,则主要取决于反应的活化能则主要取决于反应的活化能则主要取决于反应的活化能则主要取决于反应的活化能EaEaEaEa。催化剂的作用是降低反应活化能催化剂的作用是降低反应活化能催化剂的作用是降低反应活化能催化剂的作用是降低反应活化能EaEaEaEa,从而起到从而起到从而起到从而起到提高反应速度的作用提高反应速度的作用提高反应速度的作用提高反应速
3、度的作用2.2.活化能降低活化能降低活化能活化能:在一定温在一定温度下,度下,1mol1mol底物底物全部进入全部进入活化状态活化状态所需的自所需的自由能,单由能,单位位J/molJ/mol。E+SP+EES能能量量水水平平反应过程反应过程 G E1 E2S 酶催化作用的本质是酶的活性中心与底酶催化作用的本质是酶的活性中心与底物分子通过短程非共价力物分子通过短程非共价力(如氢键如氢键,离子离子键和疏水键等键和疏水键等)的作用,形成的作用,形成E-SE-S反应中反应中间物。间物。其结果使底物的价键状态发生形变或极其结果使底物的价键状态发生形变或极化,起到激活底物分子和降低过渡态活化,起到激活底物
4、分子和降低过渡态活化能作用。化能作用。3 3、影响酶催化的有关因素、影响酶催化的有关因素(1)(1)底物与酶的靠近及定向底物与酶的靠近及定向(2)(2)“张力张力”和和“形变形变”(3)(3)酸碱催化酸碱催化(4)(4)共价催化共价催化(5)(5)金属离子催化作用金属离子催化作用 在酶促反应中,底物分子结合到酶的活在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心,一方面底物在酶活性中心的有效性中心,一方面底物在酶活性中心的有效浓度大大增加,有利于提高反应速度;浓度大大增加,有利于提高反应速度;另一方面,由于活性中心的立体结构和相另一方面,由于活性中心的立体结构和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中关
5、基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定向参与反应的基团相互接近,并被严格定向定位,使酶促反应具有高效率和专一性特定位,使酶促反应具有高效率和专一性特点。点。3 3、影响酶催化的有关因素、影响酶催化的有关因素(1)(1)底物与酶的靠近及定向底物与酶的靠近及定向临近效应临近效应定向效应定向效应(2)(2)“张力张力”和和“形变形变”底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变化的酶分子又使底物分子的敏感键产生化的酶分子又使底物分子的敏感键产生“张力张力”甚至甚至“形变形变”,从而促使酶底物中间产物,从而促使酶底物中间产物进入过渡态进入过渡态
6、。(3)(3)酸碱催化:酸碱催化:一般都是广义的酸碱催化方式。一般都是广义的酸碱催化方式。广义酸碱催化是指通过质子酸提广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子供部分质子,或是通过质子碱接受部分或是通过质子碱接受部分质子的作用,达到降低反应活化能的质子的作用,达到降低反应活化能的过程。过程。广义氢的供体广义氢的供体广义氢的受体广义氢的受体组氨酸的咪唑基:组氨酸的咪唑基:(1 1)pI pI值约为,在接近中性的条件下,值约为,在接近中性的条件下,一半以广义酸的形式存在,另一半以广一半以广义酸的形式存在,另一半以广义碱的形式存在,因而它既能作为质子义碱的形式存在,因而它既能作为质子供体,又能作为质子受
7、体,有效地进行供体,又能作为质子受体,有效地进行酸碱催化。酸碱催化。(2 2)咪唑基供出和接受质子的速度很)咪唑基供出和接受质子的速度很快,其半衰期短,小于快,其半衰期短,小于0.10.1毫微秒。所毫微秒。所以许多酶活性中心都有组氨酸残基。以许多酶活性中心都有组氨酸残基。酶分子中可作为酸碱催化的功能基团酶分子中可作为酸碱催化的功能基团(4)(4)共价催化共价催化 某些酶在催化过程中,能通过共价某些酶在催化过程中,能通过共价键与底物结合成不稳定的酶键与底物结合成不稳定的酶-底物复合底物复合物,这个中间产物很容易变成过渡中物,这个中间产物很容易变成过渡中间物,反应的活化能大大降低。间物,反应的活化
8、能大大降低。1 1)亲核催化)亲核催化 指酶分子中具有非共用电子对的指酶分子中具有非共用电子对的亲核基团攻击底物分子中具有部分正亲核基团攻击底物分子中具有部分正电性的原子,并与之作用形成共价键电性的原子,并与之作用形成共价键而产生不稳定的过渡态复合物,活化而产生不稳定的过渡态复合物,活化能降低。能降低。2 2)亲电催化)亲电催化亲电基团亲电基团:ZnZn2+2+、FeFe3+3+、MgMg2+2+等等(5)(5)金属离子催化作用金属离子催化作用 金属离子可以和水分子的金属离子可以和水分子的OH-OH-结合,使水结合,使水显示出更大的亲核催化性能。显示出更大的亲核催化性能。提高水的亲核性能提高水
9、的亲核性能 电荷屏蔽作用电荷屏蔽作用v电荷屏蔽作用是酶中金属离子的一个重要功能。电荷屏蔽作用是酶中金属离子的一个重要功能。多种激酶多种激酶(如磷酸转移酶如磷酸转移酶)的底物是的底物是MgMg2+2+-ATP-ATP复合物。复合物。1.1.6.1.1.6.酶催化机理的实例酶催化机理的实例(一一)E)E的特点的特点胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶:(EC3.4.4.5):(EC3.4.4.5)1.2411.241个个AAAA残基组成,分子量残基组成,分子量25000250002.2.专一性专一性AAAAAAAAAAAAAAAA1 1 AA AA2 2AAAAAAAAAA AA N N端端 芳香族芳香族AA
10、 CAA C端端3.3.活性中心活性中心Ser195,His57,Asp102Ser195,His57,Asp102,构成一个氢键,构成一个氢键 体系体系,His57,His57成为桥梁。成为桥梁。(二)作用机理(二)作用机理1.1.通过电荷转移,使通过电荷转移,使SerSer有更强的亲核力;有更强的亲核力;2.2.放出产物放出产物P P1,N1,N末端末端;3.3.形成产物形成产物P P2 2,C C 末端末端;底物底物结合底物结合底物形形成成共共价价ES复复合合物物His57 质子供体质子供体C-N键断裂键断裂R-NH2氨基产氨基产物释放物释放水水亲亲核核攻攻击击H2O四面体中间四面体中间
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