《基因治疗》课件.ppt
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1、Andrew Z.Fire Craig Cameron Mello 安德鲁法尔和克雷格梅洛1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C.elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果是二者都同样地切断了par-1基因的表达途径。这是与传统上对反义RNA技术的解释正好相反的。该研究小组一直没能给这个意外以合理解释。直到1998年2月,华盛顿卡耐基研究院的Andrew Fire和马萨诸塞大学医学院的Crai
2、g Mello才首次揭开这个悬疑之谜。通过大量艰苦的工作,他们证实,Su Guo博士遇到的正义RNA抑制基因表达的现象,以及过去的反义RNA技术对基因表达的阻断,都是由于体外转录所得RNA中污染了微量双链RNA而引起。当他们将体外转录得到的单链RNA纯化后注射线虫时发现,基因抑制效应变得十分微弱,而经过纯化的双链RNA却正好相反,能够高效特异性阻断相应基因的表达。该小组将这一现象称为RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)。在随后的短短一年中,RNAi现象被广泛地发现于真菌、拟南芥、水螅、涡虫、锥虫、斑马鱼等大多数真核生物中。这种存在揭示了RNAi很可能是出现于生命进化的早
3、期阶段。随着研究的不断深入,RNAi的机制正在被逐步阐明,而同时作为功能基因组研究领域中的有力工具,RNAi也越来越为人们所重视。2000年,RNA的研究进展被美国科学杂志评为重大科技突破;2001年“RNA干扰”作为当年最重要的科学研究成果之一,再次入选“十大科技突破”;2002年12月20日,Science杂志将“Small RNA&RNAi”评为2002年度最耀眼的明星。同时,Nature杂志亦将Small RNA评为年度重大科技成功之一。2003年,小核糖核酸的研究第四次入选“十大科技突破”,排在第四位。RNA研究的突破性进展,是生物医学领域近20年来,可与HGP(人类基因组计划,生物
4、通网站注)相提并论的最重大成果之一。三、基因干预三、基因干预 Gene Interference基因干预的种类:基因干预的种类:1.1.反义反义RNA(antisense RNA)RNA(antisense RNA)2.2.干扰干扰RNA(RNA interference)RNA(RNA interference)3.3.核酶核酶 (ribozyme)反义RNA:与靶核酸(如mRNA或有义DNA)链互补的RNA分子,可抑制核酸的功能反义RNA,根据反义RNA的作用机制可将其分为3类:类反义RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分编码区,直接抑制翻译,或与靶mRNA结合形成双链RNA,
5、从而易被RNA酶 降解;类反义RNA与mRNA的非编码区结合,引起mRNA构象变化,抑制翻译;类反义RNA则直接抑制靶mRNA的转录。(一)反义(一)反义RNARNA 1.1.反义反义RNARNA与基因表达调控与基因表达调控 利用反义利用反义RNARNA对体外培养的细胞进行基因对体外培养的细胞进行基因表达调控,通常采用的方法有两种:表达调控,通常采用的方法有两种:(1 1)体外合成反义)体外合成反义RNARNA,直接作用于培养,直接作用于培养细胞,细胞吸收细胞,细胞吸收RNARNA后,发挥作用。后,发挥作用。(2 2)构建能转录反义)构建能转录反义RNARNA的重组质粒,将的重组质粒,将质粒转
6、入细胞,转录出反义质粒转入细胞,转录出反义RNARNA而发挥作用。而发挥作用。反义反义RNARNA的关键技术问题:的关键技术问题:反义反义RNARNA进入靶细胞前的降解问题进入靶细胞前的降解问题专一性转移问题:专一性转移问题:2.2.受体介导反义受体介导反义RNARNA技转移术技转移术 受体介导的受体介导的RNARNA转移十分专一,而且效率高;转移十分专一,而且效率高;被转移的被转移的RNARNA是被保护的,与周围环境之间存是被保护的,与周围环境之间存在多聚赖氨酸的保护层在多聚赖氨酸的保护层,可以抵抗环境中的核可以抵抗环境中的核酸酶的降解作用。酸酶的降解作用。将将脱脱唾唾液液酸酸血血清清类类粘
7、粘蛋蛋白白(ASGPASGP)与与多多聚聚赖赖氨氨酸酸(PLPL)共共价价连连接接,得得到到ASGP-PLASGP-PL复复合合物物,成成为为运运载载核核酸酸的的工工具具。ASGP-PLASGP-PL反反义义RNARNA复复合合物物可可以以专专一一性性地地被被肝肝细细胞胞表表面面的的ASGPASGP受受体体所所识识别别,并并吞吞噬噬到到肝肝细细胞胞中中,反反义义RNARNA进进入入肝肝细胞后,可被逐渐释放出来发挥作用。细胞后,可被逐渐释放出来发挥作用。借借助助受受体体介介导导DNADNA转转移移方方法法把把DNADNA换换成成反反义义RNARNA,就就可以实现受体介导的反义可以实现受体介导的反
8、义RNARNA的转移。的转移。3.3.反义反义RNARNA的应用前景的应用前景 受体介导的反义受体介导的反义RNARNA基因治疗有其自身的优点,而在基因治疗有其自身的优点,而在一定程度上补充了转基因治疗的不足。一定程度上补充了转基因治疗的不足。(l l)安全性高)安全性高 (2 2)反义)反义RNARNA设计和制备方便设计和制备方便 (3 3)具有剂量调节效应)具有剂量调节效应 (4 4)能直接作用于一些)能直接作用于一些RNARNA病毒病毒 反反义义RNARNA只只作作用用于于特特异异的的mRNAmRNA分分子子,不不改改变变所所调调节节基基因因的的结结构构。反反义义RNARNA分分子子无无
9、论论怎怎样样修修饰饰,最最终终将将在在细细胞胞内内部部被被降降解解,不不留留“残渣残渣”。在在治治疗疗RNARNA病病毒毒感感染染性性疾疾病病时时,受受体体介介导导的的反反义义RNARNA基基因因治治疗疗比比一一般般的的DNADNA基基因因治治疗疗有有更更大大的的优优势势。利利用用反反义义RNARNA可以直接作用于病毒可以直接作用于病毒RNARNA,阻断,阻断RNARNA病毒的繁殖。病毒的繁殖。(二)干扰(二)干扰RNARNA 实验结果显示,有义链实验结果显示,有义链RNARNA(sense RNAsense RNA)或反义链)或反义链RNARNA(antisense RNAantisense
10、 RNA)均能抑制线虫基因的表达,双链)均能抑制线虫基因的表达,双链RNARNA比单链比单链RNARNA更为有效。将特异的双链更为有效。将特异的双链RNARNA注入线虫体内注入线虫体内可抑制有同源序列的基因的表达。得到的结果是有义链可抑制有同源序列的基因的表达。得到的结果是有义链RNARNA和反义链和反义链RNARNA都同样阻断基因表达途径。这与传统上都同样阻断基因表达途径。这与传统上对反义对反义RNARNA技术的解释正好相反。而且其抑制基因表达的技术的解释正好相反。而且其抑制基因表达的效率比反义效率比反义RNARNA至少高至少高2 2个数量级。个数量级。1.RNA1.RNA干扰现象干扰现象
11、RNA RNA干扰干扰(RNA interferenceRNA interference,RNAi RNAi)是一种由双链是一种由双链RNARNA诱诱发的基因沉默现象。在此过程中,与双链发的基因沉默现象。在此过程中,与双链RNARNA有同源序列的有同源序列的信使信使RNARNA(mRNAmRNA)被降解,从而抑制该基因的表达。)被降解,从而抑制该基因的表达。对对RNARNA干扰的认识来源于用线虫(干扰的认识来源于用线虫(C.elegansC.elegans)和果)和果蝇所进行的实验。蝇所进行的实验。http:/2.RNA2.RNA干扰的机制干扰的机制 RNARNA干扰过程主要有干扰过程主要有2
12、 2个步骤:个步骤:(1 1)小干扰性)小干扰性RNARNA(siRNAsiRNA)(2 2)siRNAsiRNA与细胞内的某些酶和蛋白质形成复合与细胞内的某些酶和蛋白质形成复合体,称为体,称为RNARNA诱导的沉默复合体(诱导的沉默复合体(RNA-induced RNA-induced silencing complex,RISC)silencing complex,RISC)。该复合体可识别与该复合体可识别与siRNAsiRNA有同源序列的有同源序列的mRNAmRNA,并在特异的位点将该,并在特异的位点将该mRNAmRNA切断。切断。长双链长双链RNARNA被细胞内的双链被细胞内的双链RN
13、ARNA特异性核特异性核酸酶酸酶DicerDicer切成切成21-2321-23个碱基对的短双链个碱基对的短双链RNARNA,称为小干扰性,称为小干扰性RNARNA(small small interfering RNAinterfering RNA,siRNAsiRNA)。)。A.贾第鞭毛虫Dicer的晶体结构;RNA干扰机制示意图 1.1.体外化学合成体外化学合成;2.2.用用质质粒粒载载体体或或病病毒毒载载体体可可在在细细胞胞内稳定地生成。内稳定地生成。siRNAsiRNA的产生的产生3.RNA3.RNA干扰的应用前景干扰的应用前景 RNA RNA干扰研究目前已经在功能基因组学干扰研究目
14、前已经在功能基因组学研究、微生物学研究、基因治疗和信号转导研究、微生物学研究、基因治疗和信号转导等广泛领域取得了令人瞩目的进展,使其在等广泛领域取得了令人瞩目的进展,使其在医学、生物学领域的应用有着广阔的前景。医学、生物学领域的应用有着广阔的前景。(1 1)研究基因功能的新工具研究基因功能的新工具 由于由于 RNA RNA干扰技术具有高度的序列专一性干扰技术具有高度的序列专一性和有效的干扰能力,可以使特定基因沉默或功能和有效的干扰能力,可以使特定基因沉默或功能丧失,因此可以作为功能基因组学的一种强有力丧失,因此可以作为功能基因组学的一种强有力的研究工具。的研究工具。RNARNA干扰技术能够在哺
15、乳动物中抑制特定干扰技术能够在哺乳动物中抑制特定基因的表达,建立多种表型;抑制基因表达的时基因的表达,建立多种表型;抑制基因表达的时间可以控制在发育的任何阶段,间可以控制在发育的任何阶段,产生类似基因敲产生类似基因敲除的效应除的效应。(2 2)肿瘤的基因治疗肿瘤的基因治疗 传传统统反反义义RNARNA技技术术诱诱发发的的单单一一癌癌基基因因的的阻阻断断,不不可可能能完完全全抑抑制制或或逆逆转转肿肿瘤瘤的的生生长长,而而RNARNA干干扰扰技技术术可可以以利利用用同同一一基基因因家家族族的的多多个个基基因因具具有有一一段段同同源源性性很很高高的的保保守守序序列列这这一一特特性性,设设计计针针对对
16、这这一一区区段段序序列列的的双双链链RNARNA分分子子,只只使使用用一一种种双双链链RNARNA即即可可以以产产生生多多个个基基因因同同时时剔剔除除的的表表型型,也也可可以以同同时时使使用用多多种种双双链链RNARNA而而将将多多个个序序列列不不相相关关的的基基因因同同时时剔剔除除。RNARNA干干扰扰技技术术可可用用于于治治疗疗有有异异常常基基因因表表达达的的恶恶性肿瘤。性肿瘤。K-RASK-RAS蛋蛋白白为为肿肿瘤瘤发发生生所所必必需需,bcr/ab1bcr/ab1融融合合基基因因与与人人白白血血病病有有关关,用用RNARNA干干扰扰技技术术可可以以阻阻碍碍K-RASK-RAS蛋蛋白白的
17、的表表达达从从而抑制肿瘤发生,或杀死有而抑制肿瘤发生,或杀死有bcr/ab1bcr/ab1的人白血病细胞系。的人白血病细胞系。通通过过RNARNA干干扰扰抑抑制制某某些些内内源源性性基基因因的的表表达达,能能促促进进白白血病细胞系的细胞凋亡或增加其对化疗药物的反应性。血病细胞系的细胞凋亡或增加其对化疗药物的反应性。应应用用RNARNA干干扰扰技技术术成成功功地地阻阻断断了了MCF-7MCF-7乳乳腺腺癌癌细细胞胞中中一一种种异异常常表表达达的的与与细细胞胞增增殖殖分分化化相相关关的的核核转转录录因因子子基基因因Sp1Sp1的功能。的功能。“沉默”真的是金 (3 3)病毒性疾病的基因治疗病毒性疾
18、病的基因治疗 RNARNA干干扰扰可可以以被被看看成成是是一一种种与与免免疫疫系系统统类类似似的的防防御御机机制制。用用siRNAsiRNA抑抑制制人人类类免免疫疫缺缺陷陷病病毒毒(HIVHIV)某某些些基基因因的的表表达达,如如P24P24、VifVif、nefnef、tattat或或revrev,阻阻碍碍HIVHIV在在细细胞胞内内复复制制。用用RNARNA干干扰扰技技术术抑抑制制HIVHIV的的受受体体(CD4CD4)或或辅辅助助受受体体(CXCR4CXCR4或或CCR5CCR5)在在细细胞胞内内表表达达,可可阻阻碍碍HIVHIV感感染染细细胞胞。也也可可通通过过RNARNA干干扰扰抑抑
19、制制其其他他病病毒毒在在细细胞胞内内复复制制,如如脊脊髓髓灰灰质质炎炎病病毒毒、人人乳乳头头状状瘤瘤病病毒毒、乙乙型型肝肝炎病毒和丙型肝炎病毒等。炎病毒和丙型肝炎病毒等。“沉默”真的是金 siRNAsiRNA在病毒感染的在病毒感染的早期阶段早期阶段能有效地抑制病毒的复制能有效地抑制病毒的复制,病毒感,病毒感染能被针对病毒基因和相关宿主基染能被针对病毒基因和相关宿主基因的因的siRNAsiRNA所阻断,所阻断,RNARNA干扰技术将干扰技术将成为一种有效的抗病毒治疗手段。成为一种有效的抗病毒治疗手段。这对于许多严重的病毒性疾病的防这对于许多严重的病毒性疾病的防治具有十分重大的意义。治具有十分重大
20、的意义。siRNA的输送(siRNA delivery)siRNA的输送(siRNA delivery)T.Cech S.Altman 1989年,核酶的发现者T.Cech和S.Altman被授予 诺贝尔化学奖。(三)核酶三)核酶(ribozyme)核酶(ribozyme)是具有催化功能的RNA分子(三)核酶(三)核酶(ribozyme)天然核酶多为单一的天然核酶多为单一的RNARNA分子,具有自我剪切作分子,具有自我剪切作 用。但核酶也可以由两个用。但核酶也可以由两个RNARNA分子组成。分子组成。在基因治疗时,利用核酶分子结合到靶在基因治疗时,利用核酶分子结合到靶RNARNA分子中分子中适
21、当的邻位,形成锤头核酶结构,将靶适当的邻位,形成锤头核酶结构,将靶RNARNA分子切断,分子切断,通过破坏靶通过破坏靶RNARNA分子达到治疗疾病(如清除病毒基因组分子达到治疗疾病(如清除病毒基因组RNARNA)的目的。)的目的。只要两个只要两个RNARNA分子通过互补序列相结合,形成锤头分子通过互补序列相结合,形成锤头状的二级结构(状的二级结构(3 3个螺旋区),并能组成核酶的核心序个螺旋区),并能组成核酶的核心序列(列(1313个或个或1111个保守核苷酸序列),就可在锤头右上方个保守核苷酸序列),就可在锤头右上方产生剪切反应。产生剪切反应。1.核酶的设计核酶的设计 核核酶酶是是通通过过靶
22、靶RNARNA分分子子与与核核酶酶分分子子共共同同组组成成酶酶活活性性结结构构域域,要从靶分子和核酶分子两个方面来设计核酶。要从靶分子和核酶分子两个方面来设计核酶。(1 1)选选择择合合适适的的靶靶部部位位,该该部部位位具具有有核核酶酶切切割割位位点点,能能与核酶分子结合并组成酶活性结构域。与核酶分子结合并组成酶活性结构域。(2 2)核核酶酶的的基基本本组组成成:用用于于基基因因治治疗疗的的核核酶酶分分子子由由三三个个部部分分组组成成,中中间间是是保保守守序序列列(能能够够组组成成酶酶活活性性结结构构域),两端是引导序列。域),两端是引导序列。在基因治疗中,主要是根据治疗的靶基因序列的在基因治
23、疗中,主要是根据治疗的靶基因序列的特点,设计和合成特定的核酶。设计的基本原则是特点,设计和合成特定的核酶。设计的基本原则是核酶分子与靶部位结合后能形成酶活性结构域。核酶分子与靶部位结合后能形成酶活性结构域。核酶的作用机制 2.2.核酶的应用核酶的应用 与一般的反义与一般的反义RNARNA相比,核酶具有较稳相比,核酶具有较稳定的空间结构,不易受到定的空间结构,不易受到RNARNA酶的攻击。更酶的攻击。更重要的是,核酶在切断重要的是,核酶在切断mRNAmRNA后,又可从杂后,又可从杂交链上解脱下来,重新结合和切割其它的交链上解脱下来,重新结合和切割其它的mRNAmRNA分子。分子。四、治疗基因的受
24、控表达四、治疗基因的受控表达 Regulated Expression of Therapeutic Gene 时间时间:要要实实现现治治疗疗基基因因的的受受控控表表达达,必必须须建建立立完完善善的的基基因因表表达达调调控控体体系系。基基因因调调控控策策略略大大致致有有以以下下几几种种:基基因因内内部部调调节节机机制制、基基因因外外部部调调节节机机制制、利利用用病病灶灶微微环环境境使使治治疗疗基基因因特特异性表达以及治疗基因的诱导表达等。异性表达以及治疗基因的诱导表达等。治治疗疗基基因因的的受受控控表表达达包包括括控控制制治治疗疗基基因因表表达达的的时时间间、空间和水平空间和水平三个方面。三个
25、方面。空间空间:表达水平:表达水平:希望治疗基因能在一个适当的水平表达。希望治疗基因能在一个适当的水平表达。1.1.控控制制治治疗疗的的基基因因在在患患者者需需要要实实施施治治疗疗时时才才表表达,而平时不需要进行治疗时则处于关闭状态;达,而平时不需要进行治疗时则处于关闭状态;2.2.根根据据不不同同疾疾病病的的治治疗疗要要求求,控控制制治治疗疗基基因因持持续表达的时间跨度。续表达的时间跨度。是是指指为为了了提提高高基基因因治治疗疗的的专专一一性性和和安安全全性性,严严格格限限制制治治疗疗基基因因只只在在靶靶细细胞胞中中表表达达,避避免免治治疗疗基基因因指指导导合合成成的的蛋蛋白白质质干干扰扰非
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