核酸的化学组成精选课件.ppt
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1、关于核酸的化学组成第一页,本课件共有53页一、核酸的一般化学组分一、核酸的一般化学组分DNADNA、RNARNA中主要的碱基、核苷和核苷酸中主要的碱基、核苷和核苷酸 戊糖戊糖 碱基碱基 核苷核苷 核苷酸核苷酸 RNA D-D-核糖核糖 A A 腺苷腺苷A 5-A 5-腺苷酸(腺苷酸(AMPAMP)G G 鸟苷鸟苷G 5-G 5-鸟苷酸(鸟苷酸(GMPGMP)C C 胞苷胞苷C 5-C 5-胞苷酸(胞苷酸(CMPCMP)U U 尿苷尿苷U 5-U 5-尿苷酸(尿苷酸(UMPUMP)DNA D-2-D-2-脱氧核糖脱氧核糖 A A 脱氧腺苷脱氧腺苷dA 5-dA 5-脱氧腺苷酸(脱氧腺苷酸(dAM
2、PdAMP)G G 脱氧鸟苷脱氧鸟苷dG 5-dG 5-脱氧鸟苷酸(脱氧鸟苷酸(dGMPdGMP)C C 脱氧胞苷脱氧胞苷dC 5-dC 5-脱氧胞苷酸(脱氧胞苷酸(dCMPdCMP)T T 脱氧胸苷脱氧胸苷dT 5-dT 5-脱氧胸苷酸(脱氧胸苷酸(dTMPdTMP)第二页,本课件共有53页1.1.组成核酸的碱基组成核酸的碱基 腺嘌呤腺嘌呤 鸟嘌呤鸟嘌呤 嘌呤嘌呤 Adenine guanine A G9NNNN12346587第三页,本课件共有53页1.1.组成核酸的碱基组成核酸的碱基 尿嘧啶尿嘧啶 胞嘧啶胞嘧啶 胸腺嘧啶胸腺嘧啶 uracil cytosine thymine NN654
3、321嘧啶嘧啶U C TU C TH3C2 2,4-4-二氧嘧啶二氧嘧啶2-2-氧氧-4-4-氨基嘧啶氨基嘧啶5-5-甲基甲基-2-2,4-4-二氧嘧啶二氧嘧啶第四页,本课件共有53页l核酸中除了核酸中除了5 5类基本的碱基外,还有一些含量甚类基本的碱基外,还有一些含量甚少的碱基,称为少的碱基,称为稀有碱基稀有碱基。组成核酸的稀有碱基组成核酸的稀有碱基NNNNONNNH2OCH3I Im m5 5C CDHUDHU第五页,本课件共有53页碱基的结构特征碱基的结构特征l碱碱基基都都具具有有芳芳香香环环的的结结构构特特征征。嘌嘌呤呤环环和和嘧嘧啶啶环均呈平面或接近于平面的结构。环均呈平面或接近于平
4、面的结构。l碱碱基基的的芳芳香香环环与与环环外外基基团团可可以以发发生生酮酮式式烯烯醇醇式或胺式式或胺式亚胺式亚胺式互变异构。互变异构。第六页,本课件共有53页胺胺式式亚亚胺胺式式互互变变异异构构第七页,本课件共有53页酮酮式式烯烯醇醇式式互互变变异异构构已公认:氢原子在碱基上有固定的位置已公认:氢原子在碱基上有固定的位置第八页,本课件共有53页2.2.戊糖戊糖l组成核酸的戊糖有两种。组成核酸的戊糖有两种。DNADNA所含的戊糖所含的戊糖为为-D-2-D-2-脱氧核糖;脱氧核糖;RNARNA所含的戊糖则为所含的戊糖则为-D-D-核糖。核糖。第九页,本课件共有53页糖环的折叠构象糖环的折叠构象
5、核酸中糖环的折叠形式是一个构象问题。核酸中糖环的折叠形式是一个构象问题。所谓所谓构象构象是指化合物中可以自由转动的单键上的原子或基是指化合物中可以自由转动的单键上的原子或基团绕单键旋转或随单键扭转时产生的若干种不同的空间排团绕单键旋转或随单键扭转时产生的若干种不同的空间排列形式;列形式;构象的改变不伴随着共价键的破坏构象的改变不伴随着共价键的破坏。构型构型是指共是指共价键化合物分子中各原子在空间的相对排列关系。由于共价价键化合物分子中各原子在空间的相对排列关系。由于共价键具有方向性,所以每一分子具有一定的几何构型,如乳酸键具有方向性,所以每一分子具有一定的几何构型,如乳酸的的D和和L型、单糖的
6、型、单糖的和和型。型。构型的改变涉及共价键的破构型的改变涉及共价键的破坏坏。核酸中的戊糖只有一种构型,即核酸中的戊糖只有一种构型,即-D型,但它们的构象却有许多种。型,但它们的构象却有许多种。第十页,本课件共有53页 核酸中戊糖的五元糖环不呈一个平面,其中的核酸中戊糖的五元糖环不呈一个平面,其中的C1-O-C4这这3个原子一般在一个平面上,而个原子一般在一个平面上,而C2和和C3偏偏离平面离平面0.050.06nm,这种偏离就使糖环具有不同的这种偏离就使糖环具有不同的构象。若构象。若C2或或C3偏离平面的方向与偏离平面的方向与C5同向,则称为同向,则称为内式(内式(endo)构象;若与构象;若
7、与C5反向,则称为外式反向,则称为外式(exo)构象。构象。综合综合C2和和C3偏离平面的情况,糖环的折叠形偏离平面的情况,糖环的折叠形式有两大类:式有两大类:第十一页,本课件共有53页(1)信封式)信封式 糖环的糖环的C2和和C3中只有一个原子偏离平面则称为信封式折叠中只有一个原子偏离平面则称为信封式折叠(Envelope,简写为简写为E)。如)。如C2-endo(2E),C2-exo(E2),C3-endo(3E),C3-exo(E3)。上述几种构象可分别上述几种构象可分别以侧视简图表示:以侧视简图表示:32C541ONC2-endo(2E)2C541ON3C3-endo(3E)C541O
8、N23C3-exo(E3)C541ON32C2-exo(E2)第十二页,本课件共有53页(2)扭转式)扭转式 糖环的糖环的C2和和C3都偏离平面而且偏离方向相反称为扭转式折叠都偏离平面而且偏离方向相反称为扭转式折叠(Twist,简写为简写为T)。如)。如C2-endo-C3-exo(23T),C2-exo-C3-endo(3T2)。上述几种构象可分别以侧视简图上述几种构象可分别以侧视简图表示:表示:32C541ONC2-endo-C3-exo(3T)23C541ONC2-exo-C3-endo(3T2)2第十三页,本课件共有53页3.3.核苷核苷(nucleoside)nucleoside)l
9、核苷由戊糖和碱基缩合而成,嘌呤的核苷由戊糖和碱基缩合而成,嘌呤的N N9 9或嘧啶的或嘧啶的N N1 1与与戊糖戊糖C-1-OHC-1-OH以以C-NC-N糖苷键相连接糖苷键相连接。dAdANNNNNH2OH HOHOCH2H HHH9 9NONOOHOCH2H HHHOH O HU1第十四页,本课件共有53页假尿苷假尿苷 胸腺嘧啶核糖核苷胸腺嘧啶核糖核苷稀有核苷(稀有核苷(tRNA)第十五页,本课件共有53页4.4.核苷酸核苷酸(nucleotide)nucleotide)l核苷酸是核苷的磷酸酯。作为核苷酸是核苷的磷酸酯。作为DNADNA或或RNARNA结构单元的核苷结构单元的核苷酸分别是酸
10、分别是5-5-磷酸磷酸-脱氧核糖核苷和脱氧核糖核苷和5-5-磷酸磷酸-核糖核苷。核糖核苷。第十六页,本课件共有53页第十七页,本课件共有53页核苷酸的衍生物核苷酸的衍生物ATP是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它的结构如下:是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它的结构如下:(1 1)ATP(ATP(腺嘌呤核糖核苷三磷酸腺嘌呤核糖核苷三磷酸)第十八页,本课件共有53页(2)(2)GTP(GTP(鸟嘌呤核糖核苷三磷酸鸟嘌呤核糖核苷三磷酸)第十九页,本课件共有53页(3 3)环化核苷酸)环化核苷酸cAMP cAMP 和和 cGMPcGMPlcAMP(3,5-cAMP(3,5-环
11、环腺腺嘌嘌呤呤核核苷苷一一磷磷酸酸)和和 cGMP(cGMP(3,5-3,5-环环鸟鸟嘌嘌呤呤核核苷苷一一磷磷酸酸)的的主主要要功功能能是是作作为为细细胞胞之之间间传传递递信信息息的的信信使。使。lcAMP cAMP 和和 cGMP cGMP 的的环环状状磷磷酯酯键键是是一一个个高高能能键键。在在 pH pH 7.4 7.4 条条件件下下,cAMP cAMP 和和 cGMP cGMP 的的水水解解能能约约为为43.9 43.9 kj/molkj/mol,比比 ATP ATP 水解能高得多。水解能高得多。第二十页,本课件共有53页(1 1)参与)参与DNADNA、RNARNA的合成、蛋白质的合成
12、、糖与磷的合成、蛋白质的合成、糖与磷脂的合成。脂的合成。(2 2)在能量转化中起重要作用,)在能量转化中起重要作用,ATPATP是生物体内能量是生物体内能量的通用货币。的通用货币。(3 3)是构成多种辅酶的成分:)是构成多种辅酶的成分:NADNAD、NADPNADP、FADFAD、FMNFMN和和CoACoA。(4 4)参与细胞中的代谢与调节(参与细胞中的代谢与调节(cAMPcAMP、cGMPcGMP)。)。5 5核苷酸的生物学作用核苷酸的生物学作用第二十一页,本课件共有53页一、核酸的一般化学组分一、核酸的一般化学组分二、核酸的修饰组分二、核酸的修饰组分三、核酸及其组分的化学反应三、核酸及其
13、组分的化学反应四、核酸组分的分离鉴定四、核酸组分的分离鉴定第一章第一章 核酸化学组分的结构和性质核酸化学组分的结构和性质第二十二页,本课件共有53页 到到目目前前为为止止,核核酸酸中中发发现现了了近近8080种种特特别别的的组组分分,它它们们绝绝大大多多数数是是基基本本组组分分的的衍衍生生物物,即即在在碱碱基基或或核核糖糖的的某某些些位位置置上上附附加加或或取取代代掉掉某某些些基基团团。把把这这些些特特别别的的组组分分称称为为修修饰饰组组分分(也也称称稀稀有有组组分分或或附附加加组组分)。分)。二、核酸的修饰组分二、核酸的修饰组分 1948 1948年年HotchkissHotchkiss在小
14、牛胸腺在小牛胸腺DNADNA中检测到中检测到5 5甲基胞嘧啶脱氧核苷,这使人们认识到,除了基甲基胞嘧啶脱氧核苷,这使人们认识到,除了基本组分外,核酸中还有一些特别的组分存在。本组分外,核酸中还有一些特别的组分存在。第二十三页,本课件共有53页1.含有修饰碱基的核苷含有修饰碱基的核苷 目前在目前在RNA和和DNA中已检测到中已检测到60多种核苷含有修多种核苷含有修饰碱基。比较简单的修饰是原有的嘌呤或嘧啶上某个饰碱基。比较简单的修饰是原有的嘌呤或嘧啶上某个原子被甲基、甲硫基、羟甲基等取代,或经脱氨、加原子被甲基、甲硫基、羟甲基等取代,或经脱氨、加氢等成为修饰组分。如:氢等成为修饰组分。如:m5C、
15、S4U、DHU、I、m6A、m7G等。等。2.含有修饰核糖的核苷含有修饰核糖的核苷 目前只发现一种修饰核糖,即核糖目前只发现一种修饰核糖,即核糖22OHOH上的上的H H原原子被甲基取代,生成子被甲基取代,生成D D22O-O-甲基核糖,如:甲基核糖,如:Cm(2-o-Cm(2-o-甲基胞苷)甲基胞苷)。含有修饰核糖的核苷只存在于。含有修饰核糖的核苷只存在于RNARNA中,其中有些是碱基和核糖同时被修饰。中,其中有些是碱基和核糖同时被修饰。第二十四页,本课件共有53页3.含有含有C-C糖苷键的核苷糖苷键的核苷 目前所知只有假尿嘧啶核苷及其衍生物属目前所知只有假尿嘧啶核苷及其衍生物属此。尿嘧啶核
16、苷中糖苷键是此。尿嘧啶核苷中糖苷键是N1-C1,而假尿苷而假尿苷()中是中是C5-C1相连。相连。tRNA tRNA中修饰组分种类中修饰组分种类最多最多,有有6060多种。多种。rRNArRNA中的修饰组分有中的修饰组分有1010多种,其中多数是甲基化修多种,其中多数是甲基化修饰。饰。原核原核mRNAmRNA分子中至今未发现有修饰组分分子中至今未发现有修饰组分,真核真核mRNAmRNA中的修饰组分只有几种,主要是在帽子中的修饰组分只有几种,主要是在帽子结构中的结构中的m m7 7G G、m m2 22,72,7G G、m m3 32,2,72,2,7G G、NmNm和分子内部顺和分子内部顺序中
17、的序中的m m6 6A A、m m5 5C C。第二十五页,本课件共有53页4.DNA的甲基化修饰的甲基化修饰 甲基化是基因组甲基化是基因组DNA DNA 的一种主要表观遗传的一种主要表观遗传修饰形式修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。是调节基因组功能的重要手段。DNADNA的甲基化修饰发生在的甲基化修饰发生在DNADNA中一定的碱基顺序上,中一定的碱基顺序上,而且而且呈呈180180 旋转对称旋转对称。如脊椎动物如脊椎动物DNADNA的甲基化的甲基化多数在多数在55CpG3CpG3顺序的顺序的C C上,与它互补的上,与它互补的33GpC5GpC5顺序中的顺序中的C C也是甲基化的。也是甲基
18、化的。第二十六页,本课件共有53页各种生物体中各种生物体中DNA甲基化的特征甲基化的特征90%的位点的位点特征特征脊椎动物脊椎动物植物植物大肠杆菌大肠杆菌甲基化碱基甲基化碱基甲基化顺序甲基化顺序甲基化程度甲基化程度甲基化位点的甲基化位点的180 旋转对称旋转对称性性m5dCm5dCm5dC,m6dACGCG,CXG(X=A,C,T)CCA(T)GG,GATC90%的位点的位点100%的位点的位点第二十七页,本课件共有53页n DNA DNA甲基化是表观遗传修饰的一个重要机制,它能从甲基化是表观遗传修饰的一个重要机制,它能从一个一个DNADNA序列产生不同模式的基因表达。它对正常发育序列产生不同
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