X3-1-2基因工程的基本操作程序.ppt
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1、1.2 1.2 基因工程的基因工程的基本操作程序基本操作程序专题专题1 1 基因工程基因工程1 1基因工程的基本操作程序基因工程的基本操作程序v目的基因的获取目的基因的获取v基因表达载体的构建基因表达载体的构建v将目的基因导入受体细胞将目的基因导入受体细胞v目的基因的检测与鉴定目的基因的检测与鉴定2 23 3编码区编码区编码区编码区非非非非编码区编码区编码区编码区非非非非编码区编码区编码区编码区编码区上游编码区上游编码区上游编码区上游 编码区下游编码区下游编码区下游编码区下游 终止子终止子终止子终止子启动子启动子启动子启动子与与与与RNARNA聚合酶结合位点聚合酶结合位点聚合酶结合位点聚合酶结
2、合位点补:补:原核原核细胞的基因结构细胞的基因结构编码区编码区:非编码区非编码区:编码蛋白质编码蛋白质,连续不间断连续不间断不编码蛋白质,有调控作用不编码蛋白质,有调控作用4 4编码区编码区编码区编码区非非非非编码区编码区编码区编码区非非非非编码区编码区编码区编码区编码区上游编码区上游编码区上游编码区上游 编码区下游编码区下游编码区下游编码区下游 终止子终止子终止子终止子启动子启动子启动子启动子与与与与RNARNA聚酶结合位点聚酶结合位点聚酶结合位点聚酶结合位点补:补:真真核核细胞的基因结构细胞的基因结构外显子外显子内含子内含子不编码蛋白质,有调控作用不编码蛋白质,有调控作用编码区编码区:非编
3、码区非编码区:外显子:能编码蛋白质的序列外显子:能编码蛋白质的序列内含子:不能编码蛋白质的序列内含子:不能编码蛋白质的序列5 5结构基因结构基因外显子外显子内含子内含子转录、加工修饰转录、加工修饰成熟成熟mRNA6 6 关于内含子和外显子的说法正确的是关于内含子和外显子的说法正确的是关于内含子和外显子的说法正确的是关于内含子和外显子的说法正确的是 ()A.A.内含子和外显子在转录的过程中都能够转录成成内含子和外显子在转录的过程中都能够转录成成内含子和外显子在转录的过程中都能够转录成成内含子和外显子在转录的过程中都能够转录成成 熟的熟的熟的熟的mRNAmRNAB.B.只有外显子能够转录成只有外显
4、子能够转录成只有外显子能够转录成只有外显子能够转录成mRNAmRNA,tRNAtRNA,rRNArRNAC.C.原核细胞基因中也有内含子和外显子原核细胞基因中也有内含子和外显子原核细胞基因中也有内含子和外显子原核细胞基因中也有内含子和外显子D.D.由于内含子不能编码蛋白质,故它属于非编码区由于内含子不能编码蛋白质,故它属于非编码区由于内含子不能编码蛋白质,故它属于非编码区由于内含子不能编码蛋白质,故它属于非编码区B7 7一、目的基因的获取一、目的基因的获取(指编码蛋白质指编码蛋白质结构基因结构基因)鸟枪法鸟枪法供体供体DNADNADNADNA片段片段目的基因目的基因逆转录法逆转录法信使信使RN
5、ARNA目的基因目的基因化学合成法化学合成法肽链氨基酸序列肽链氨基酸序列信使信使RNARNA序列序列基因基因DNADNA序列序列目的基因目的基因合成合成推测推测逆转录逆转录合成合成直接提取法(原核生物)直接提取法(原核生物)人工合成法(真核生物)人工合成法(真核生物)8 8三种目的基因提取的方法有何优缺点?三种目的基因提取的方法有何优缺点?优点优点缺点缺点鸟枪法鸟枪法反转反转录法录法化学合化学合成法成法操作简便,广泛使用操作简便,广泛使用操作简便,广泛使用操作简便,广泛使用工作量大,盲目,分离出工作量大,盲目,分离出工作量大,盲目,分离出工作量大,盲目,分离出来的有时并非一个基因来的有时并非一
6、个基因来的有时并非一个基因来的有时并非一个基因专一性强,目的基因专一性强,目的基因专一性强,目的基因专一性强,目的基因中不含不表达部分中不含不表达部分中不含不表达部分中不含不表达部分操作过程麻烦,操作过程麻烦,操作过程麻烦,操作过程麻烦,mRNAmRNA很很很很不稳定,要求的技术条件不稳定,要求的技术条件不稳定,要求的技术条件不稳定,要求的技术条件较高较高较高较高专一性最强,目的基因专一性最强,目的基因专一性最强,目的基因专一性最强,目的基因中不含不表达部分,可中不含不表达部分,可中不含不表达部分,可中不含不表达部分,可合成自然界中不存在的合成自然界中不存在的合成自然界中不存在的合成自然界中不
7、存在的基因基因基因基因仅限于合成核苷酸对较仅限于合成核苷酸对较仅限于合成核苷酸对较仅限于合成核苷酸对较少的简单基因少的简单基因少的简单基因少的简单基因9 9从基因文库中提取目的基因从基因文库中提取目的基因1 1 基因文库基因文库(gene library)(gene library)概念概念n又称又称DNADNA文库,是指某个生物的基因组文库,是指某个生物的基因组DNADNA或或cDNAcDNA片段与适当的载体在体外重组后,转化片段与适当的载体在体外重组后,转化宿主细胞,并通过一定的选择机制筛选后得宿主细胞,并通过一定的选择机制筛选后得到大量的阳性菌落到大量的阳性菌落(或噬菌体或噬菌体),所有
8、菌落或,所有菌落或噬菌体的集合即为该生物的基因文库。噬菌体的集合即为该生物的基因文库。n基因文库由外源基因文库由外源DNADNA片段、载体和宿主组成。片段、载体和宿主组成。1010基因文库的分类基因文库的分类按照外源按照外源DNADNA片段的来源:片段的来源:u从特定组织提取的染色体基因组从特定组织提取的染色体基因组DNADNA-基因组基因组DNADNA文库文库(总)(总)umRNAmRNA反转录成的反转录成的cDNAcDNA拷贝拷贝-cDNAcDNA文库文库(部分)(部分)基因文库的目的基因文库的目的 为了在不知目的基因序列的情况为了在不知目的基因序列的情况下,便于获得所需的目的基因。下,便
9、于获得所需的目的基因。1111基因组文库基因组文库部分基因文库部分基因文库1212基因组基因组DNADNA文库文库限制性内切酶限制性内切酶基因组基因组DNADNA基因重组基因重组转化细菌转化细菌体外包装体外包装基因组文库基因组文库 (Genomic library)(Genomic library)是指将某种生物体的全部基是指将某种生物体的全部基因组因组DNA用限制性内切酶或机械用限制性内切酶或机械力量切割成一定长度范围的力量切割成一定长度范围的DNA片段,再与合适的载体在体外重片段,再与合适的载体在体外重组并转化相应的宿主细胞获得的组并转化相应的宿主细胞获得的所有阳性菌落,这个群体就称为所有
10、阳性菌落,这个群体就称为该生物基因组文库。其目的是分该生物基因组文库。其目的是分离有用的目的基因和保存某种生离有用的目的基因和保存某种生物的全部基因。物的全部基因。1313cDNAcDNA文库文库 (cDNAcDNA library)library)n是指将某种生物体基因组转录的全部是指将某种生物体基因组转录的全部mRNAmRNA经反转录产生的经反转录产生的cDNAcDNA片段分别与克隆载体片段分别与克隆载体重组,储存于某种受体菌中,该群体就称重组,储存于某种受体菌中,该群体就称该生物基因组的该生物基因组的cDNAcDNA文库。文库。ncDNA(complementarycDNA(comple
11、mentary DNA DNA,互补,互补DNA)DNA):是:是由生物的某一特定器官或特定发育时期细由生物的某一特定器官或特定发育时期细胞内的胞内的mRNAmRNA经体外反转录后形成的互补经体外反转录后形成的互补DNADNA。1414cDNAcDNA文库的构建文库的构建反转录酶反转录酶mRNAmRNAcDNAcDNAcDNAcDNA文库文库 (cDNAcDNA library)library)基因重组基因重组单链单链DNADNARNARNADNADNA杂交链杂交链1515基因组基因组DNA文库与文库与cDNA文库的比较文库的比较1616cDNAcDNA文库和基因组文库对比表文库和基因组文库对
12、比表文库类型cDNA文库基因组文库文库大小小大基因中启动子无有基因中内含子无有基因多少某种生物的部分基因 某种生物的全部基因物种间的基因交流可以部分基因可以目的性强比较盲目工作量相对小大1717u基因文库基因文库中不是直接保管相中不是直接保管相应基因,而是应基因,而是保存受体菌保存受体菌,菌,菌中含基因中含基因1818利用利用PCRPCR提取目的基因提取目的基因PCRPCR:是一项在生物:是一项在生物体外体外复制特定复制特定DNADNA片段片段的核酸合成技术。的核酸合成技术。原理:原理:DNADNA双链复制双链复制原料:模板原料:模板DNADNA;DNADNA引物;四种脱氧核苷引物;四种脱氧核
13、苷酸;热稳定酸;热稳定DNADNA聚合酶(聚合酶(TaqTaq酶);离子酶);离子1919PCR的基本原理的基本原理n类似于类似于DNA的体内复制。首先待扩增的体内复制。首先待扩增DNA模模板加热板加热变性变性解链,随之将反应混合物冷却至解链,随之将反应混合物冷却至某一温度,这一温度可使引物与它的靶序列某一温度,这一温度可使引物与它的靶序列发生发生退火退火,再将温度升高使退火引物在,再将温度升高使退火引物在DNA聚合酶作用下得以聚合酶作用下得以延伸延伸。这种热。这种热变性复性变性复性延伸延伸的过程就是一个的过程就是一个PCR循环,循环,PCR就是就是在合适条件下的这种循环的不断重复。在合适条件
14、下的这种循环的不断重复。2020n模板模板DNA(已知碱基序列已知碱基序列)n 特异性引物(特异性引物(DNA)n耐热耐热DNA聚合酶(聚合酶(Taq酶)酶)n dNTPs(4种脱氧核苷酸种脱氧核苷酸)nMg+(促进促进dNTP与核酸骨架作用与核酸骨架作用)PCRPCR体系基本组成成分体系基本组成成分2121PCR的基本反应步骤的基本反应步骤变性变性90-95C延伸延伸70-75C退火退火55-60C第三步:将反应体系升温第三步:将反应体系升温至至7075,在耐高温的,在耐高温的DNA聚合酶催化作用下,聚合酶催化作用下,将与模板互补的单个核苷将与模板互补的单个核苷酸加到引物所提供的酸加到引物所
15、提供的3-OH上,使上,使DNA链延伸合成链延伸合成,产生一条与模板链互补的产生一条与模板链互补的DNA链。链。第一步:将反应体系(包括双链模第一步:将反应体系(包括双链模板、引物、耐高温的板、引物、耐高温的DNA聚合酶、聚合酶、四种脱氧核糖核苷酸以及酶促反应四种脱氧核糖核苷酸以及酶促反应所需的离子等)加热至所需的离子等)加热至9095,使双链使双链DNA模板两条链之间的模板两条链之间的氢键氢键打开,变成单链打开,变成单链DNA,作为互补链,作为互补链聚合反应的模板。聚合反应的模板。第二步:将反应体系降温第二步:将反应体系降温至至5560,使,使两种引两种引物分别与模板物分别与模板DNA链配对
16、链配对结合结合,这个过程称为复性。,这个过程称为复性。2222引物引物引物引物Mullis的构思DNADNA聚合酶聚合酶DNADNA聚合酶聚合酶特定特定特定特定DNADNADNADNA片段片段片段片段2323模板模板模板模板DNADNADNADNA959553355335变性变性24245555533555AB引物引物引物引物AB退火退火25257272533555Taq酶酶延伸延伸126267272533555延伸延伸227277272949494945555PCRPCR循环循环循环循环29291234522557294时间(min)温度()PCRPCR反应反应PCR反应条件PCR过程PCR
17、的特点适温延伸3高温变性1低温退火2重复13步2530轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性DNA变性形成2条单链子链延伸DNA加倍3030模板DNA953131PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点50引物1引物2DNA引物3232PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点引物1引物2DNA引物72Taq酶Taq酶3333PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点72第1轮结束第2轮开始3434PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点955072TaqTaqTaqTaq3535PCR的基本原理n
18、PCR反应条件nPCR过程nPCR的特点72第2轮结束3636PCR的基本原理nPCR反应条件nPCR过程nPCR的特点重复重复3030轮后轮后2 23030=1,073,741,824=1,073,741,824模板DNA第1轮扩增第2轮扩增第3轮扩增第4轮扩增第5轮扩增第6轮扩增理想拷贝数=2n n 循环次数实际拷贝数=(1+x)n X 平均效率,约为0.85 n 循环次数 3737利用利用PCRPCR技术扩增目的基因技术扩增目的基因3838靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列PCR PCR 循环第一步:加热变性循环第一步:加热变性3939靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶
19、序列靶序列引物引物引物引物 引物引物引物引物 55553333555555553333555533333333PCR PCR 循环第二步:引物与靶序列退火循环第二步:引物与靶序列退火4040靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列靶序列引物引物引物引物引物引物引物引物55553 3 3 3555555553333555533333333TaqTaqTaqTaq DNA DNA DNA DNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶PCR PCR 循环第三步:引物延伸循环第三步:引物延伸4141靶序列靶序列靶序列靶序列 靶序列靶序列靶序列靶序列第第1 1个个 PCR PCR 循环完成后:得到两个拷贝的循环完成
20、后:得到两个拷贝的靶序列靶序列4242QPCR是针对特定是针对特定DNA片断片断的快速体外复制增殖技术的快速体外复制增殖技术Q每循环一轮,目的基因的每循环一轮,目的基因的量可增加一倍量可增加一倍Q增殖速率为增殖速率为2n,(n为循环为循环次数)次数)每完成一个循环需每完成一个循环需2-42-4分钟,分钟,2-32-3小时就小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。4343PCRPCR技术扩增过程技术扩增过程a a、DNADNA变性(变性(90-9590-95):双链):双链DNADNA模板模板 在热作用下,在热作用下,断裂,形成断裂,形成 。b b、复性(复性(
21、55-6055-60):系统温度降低,引物):系统温度降低,引物 与与DNADNA模板结合,形成局部模板结合,形成局部 。c c、延伸(、延伸(70-7570-75):在):在TaqTaq酶的作用下,从酶的作用下,从 引物的引物的55端端33端延伸,合成与模板互补端延伸,合成与模板互补 的的 。氢键氢键单链单链DNADNA双链双链DNADNA链链4444q从基因文库中获取从基因文库中获取q利用利用PCRPCR技术扩增技术扩增q利用化学方法人工合成利用化学方法人工合成归纳:获取目的基因的方法归纳:获取目的基因的方法DNADNADNADNA合成仪合成仪合成仪合成仪DNADNADNADNA序列自动测
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