生物化学ppt第六章生物氧化.ppt
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1、第六章第六章 生物氧化与氧化磷酸化生物氧化与氧化磷酸化一、生物氧化概述二、电子传递链三、氧化磷酸化四、其他末端氧化酶系统 一、一、生物氧化生物氧化概念概念 生物细胞将糖、脂、蛋白质等燃料分子生物细胞将糖、脂、蛋白质等燃料分子氧化分解氧化分解,最终生成最终生成co2和和H2o并并释放出能量释放出能量的作用称为生物氧化。的作用称为生物氧化。生物氧化包含了细胞呼吸作用中的一系列氧化还原反生物氧化包含了细胞呼吸作用中的一系列氧化还原反应,所以又称为应,所以又称为细胞氧化或细胞呼吸细胞氧化或细胞呼吸。第一节第一节 生物氧化概述生物氧化概述热能热能CO2和和H2O 糖糖 脂肪脂肪 蛋白质蛋白质 O2能量能
2、量ADP+PiATP2、生物氧化的特点、生物氧化的特点1.1.生物氧化是在生物细胞内进行的酶促氧化过程,生物氧化是在生物细胞内进行的酶促氧化过程,反应反应条件温和条件温和(水溶液,中性(水溶液,中性pHpH和常温)。和常温)。2.2.氧化进行过程中,必然伴随氧化进行过程中,必然伴随生物还原反应生物还原反应的的 发生。发生。3.3.水水是是许许多多生生物物氧氧化化反反应应的的氧氧供供体体。通通过过加加水水脱脱氢氢作用直接参予了氧化反应。作用直接参予了氧化反应。4.4.在在生生物物氧氧化化中中,碳碳的的氧氧化化和和氢氢的的氧氧化化是是非非同同步步进进行行的的。氧氧化化过过程程中中脱脱下下来来的的氢
3、氢质质子子和和电电子子,通通常常由各种载体,如由各种载体,如NADHNADH等传递到氧并生成水。等传递到氧并生成水。5.5.生物氧化是一个生物氧化是一个分步分步进行的过程。每一步都由进行的过程。每一步都由特殊的酶催化,每一步反应的产物都可以分离特殊的酶催化,每一步反应的产物都可以分离出来。这种逐步进行的反应模式有利于在温和出来。这种逐步进行的反应模式有利于在温和的条件下释放能量,提高能量利用率。的条件下释放能量,提高能量利用率。6.6.生物氧化释放的能量,通过与生物氧化释放的能量,通过与ATPATP合成相偶联,合成相偶联,转换成生物体能够直接利用的生物能转换成生物体能够直接利用的生物能ATPA
4、TP。*生物氧化与体外氧化之相同点n生生物物氧氧化化中中物物质质的的氧氧化化方方式式有有加加氧氧、脱脱氢氢、失电子,遵循氧化还原反应的一般规律。失电子,遵循氧化还原反应的一般规律。n物物质质在在体体内内外外氧氧化化时时所所消消耗耗的的氧氧量量、最最终终产物(产物(CO2,H2O)和释放能量均相同。)和释放能量均相同。w是是在在细细胞胞内内温温和和的的环环境境中中(体体温温,pH接接近近中中性性),在在一一系系列列酶酶促促反反应应逐逐步步进进行行,能能量量逐逐步步释释放放有有利利于于机机体体捕捕获获能能量量,提提高高ATP生成的效率。生成的效率。w进进行行广广泛泛的的加加水水脱脱氢氢反反应应使使
5、物物质质能能间间接接获获得得氧氧,并并增增加加脱脱氢氢的的机机会会;脱脱下下的的氢氢与与氧氧结结合合产产生生H2O,有机酸脱羧产生,有机酸脱羧产生CO2。*生物氧化与体外氧化之不同点生物氧化生物氧化体外氧化体外氧化w能量是突然释放的。能量是突然释放的。w产产生生的的CO2、H2O由由物物质质中中的的碳碳和和氢氢直直接接与与氧氧结结合生成。合生成。COCO2 2的生成的生成 方方式式:糖糖、脂脂、蛋蛋白白质质等等有有机机物物转转变变成成含含羧羧基基的的中间化合物,然后在酶催化下中间化合物,然后在酶催化下脱羧脱羧而生成而生成COCO2 2。类型类型:-脱羧和脱羧和-脱羧脱羧 氧化脱羧和单纯脱羧氧化
6、脱羧和单纯脱羧CH3COSCoA+CO2CH3-C-COOH O丙酮酸脱氢酶系丙酮酸脱氢酶系NAD+NADH+H+CoASH例:例:+CO2H2N-CH-COOHR氨基酸脱羧酶氨基酸脱羧酶CH2-NH2R3、生物氧化中CO2 2和和H2 2O的生成的生成H2O的生成的生成 代代谢谢物物在在脱脱氢氢酶酶催催化化下下脱脱下下的的氢氢由由相相应应的的氢氢载载体体(NADNAD+、NADPNADP+、FADFAD、FMNFMN等等)所所接接受受,再再通通过过一一系列递氢体或递电子体传递给氧而生成系列递氢体或递电子体传递给氧而生成H H2 2O O。CH3CH2OHCH3CHONAD+NADH+H+乙醇
7、脱氢酶乙醇脱氢酶例:例:12 O2NAD+电子传递链电子传递链 H2O2eO=2H+脂肪脂肪葡萄糖、葡萄糖、其它单糖其它单糖三羧酸三羧酸循环循环电子传递电子传递(氧化)(氧化)蛋白质蛋白质脂肪酸、甘油脂肪酸、甘油多糖多糖氨基酸氨基酸乙酰乙酰CoAe-磷酸化磷酸化+Pi 小分子化合物小分子化合物分解成共同的分解成共同的中间产物(如中间产物(如丙酮酸、乙酰丙酮酸、乙酰CoA等)等)共同中间物进共同中间物进入三羧酸循环入三羧酸循环,氧化脱下的氢由氧化脱下的氢由电子传递链传递电子传递链传递生成生成H2O,释放,释放出大量能量,其出大量能量,其中一部分通过磷中一部分通过磷酸化储存在酸化储存在ATP中。中
8、。大分子降解大分子降解成基本结构成基本结构单位单位 4 生物氧化的三个阶段生物氧化的三个阶段1.1.自由能(自由能(free energyfree energy)的概念)的概念 概概念念:在在恒恒温温恒恒压压下下,体体系系可可以以用用来来对对环环境境作作功功的的那一部分能量叫作那一部分能量叫作自由能自由能 定义式定义式:=H-TS=H-TS G代表体内自由能的变化;代表体内自由能的变化;H为体系的焓变化;为体系的焓变化;T为热力学温度;为热力学温度;S代表体系墒(体系的散乱无序程度)变化。代表体系墒(体系的散乱无序程度)变化。二、生物能学简介二、生物能学简介物理意义物理意义:*(体系中能对环境
9、作功的能量体系中能对环境作功的能量)自由能的变化能预示某一过程能否自发进行,即:自由能的变化能预示某一过程能否自发进行,即:G0,反应不能自发进行,反应不能自发进行 G=0,反应处于平衡状态。,反应处于平衡状态。注意:注意:反应的反应的 G仅决定于仅决定于反应物反应物(初始状态初始状态)的自由能与的自由能与产物产物(最终状态最终状态)的自由能,而与反应途径和反应机制的自由能,而与反应途径和反应机制无关。无关。其次其次,G是判断一个化学反应能否向某个方向进行的是判断一个化学反应能否向某个方向进行的根据,而与反应速度无关。负的根据,而与反应速度无关。负的 G表明反应可以自发表明反应可以自发进行,但
10、并不表明反应以多大的速度进行。进行,但并不表明反应以多大的速度进行。2.2.化学反应自由能的计算化学反应自由能的计算 a.a.利用化学反应平衡常数计算利用化学反应平衡常数计算 基本公式:基本公式:G=GG=G+RTlnQc+RTlnQc (Qc-(Qc-浓度商浓度商)GG=-RTlnKeq=-RTlnKeq 例例:计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化:计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化 b.b.利用标准氧化还原电位(利用标准氧化还原电位(E E)计算)计算(限于氧化还(限于氧化还原反应)原反应)基本公式:基本公式:GG=nFEnFE(E(E=E=E+-E-E-)例例:计算:计算NADHNAD
11、H氧化反应的氧化反应的GG计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化计算磷酸葡萄糖异构酶反应的自由能变化达平衡时达平衡时 =Keq=19解:解:GG=-RTlnKeq=-RTlnKeq =-2.303 =-2.303 8.314 8.314 311 311 lg19 lg19 =-7.6KJ.mol-1G=GG=G+RTlnQc(+RTlnQc(Qc-Qc-浓度商浓度商)=-7.6+2.303 =-7.6+2.303 8.314 8.314 311 311 lg0.1 lg0.1 =-13.6 =-13.6KJ.mol-1未达平衡时未达平衡时 =Qc=0.1反应反应G-1-PG-6-P在在380C达
12、到平衡时,达到平衡时,G-1-P占占5%,G-6-P占占95%,求,求 G0。如果反应未达到平衡,。如果反应未达到平衡,设设G-1-P=0.01mol.L,G-6-P=0.001mol.L,求反求反应的应的 G 是多少?是多少?例题:例题:例题:计算下反应式例题:计算下反应式GGNADH+HNADH+H+1/2O+1/2O2 2=NAD=NAD+H+H2 2O O正极反应:正极反应:1/2O1/2O2 2+2H+2H+2e+2e H H2 2O O E E+0.820.82负极反应:负极反应:NADNAD+H+H+2e+2e NADHNADH E E-0.32-0.32GG-nFE-nFE -
13、2-296.48596.4850.82-(-0.32)0.82-(-0.32)-220 KJ-220 KJmolmol-1-1 生物系统中的能流生物系统中的能流三、高能化合物三、高能化合物 生生化化反反应应中中,在在水水解解时时或或基基团团转转移移反反应应中中可可释释放放出出大大量量自自由由能能(2121千千焦焦/摩摩尔尔)的的化化合合物物称称为为高能化合物。高能化合物。生物化学中的高能键与普通化学中的高能键含义不同:普通化学中的高能键指形成或打断一个键要释放或消耗较多的能量,这里的高能键通常表示稳定的键;生物化学中的高能键是指具有高的磷酸基团转移势能或水解时释放较多自由能的磷酸酐键或硫酯键,
14、此处高能键是不稳定的键。高高能能化化合合物物类类型型n根据生物体内高能化合物键的特性可以把根据生物体内高能化合物键的特性可以把他们分成以下几种类型:他们分成以下几种类型:磷氧键型磷氧键型a)酰基磷酸化合物3-磷酸甘油酸磷酸乙酰磷酸10.1千卡/摩尔11.8千卡/摩尔氨甲酰磷酸酰基腺苷酸氨酰基腺苷酸b)b)焦磷酸化合物焦磷酸化合物ATP(三磷酸腺苷)(三磷酸腺苷)焦磷酸焦磷酸7.3千卡/摩尔c)c)烯醇式磷酸化合物烯醇式磷酸化合物磷酸烯醇式丙酮酸磷酸烯醇式丙酮酸14.8千卡/摩尔氮磷键型氮磷键型磷酸肌酸磷酸肌酸磷酸精氨酸磷酸精氨酸10.3千卡/摩尔7.7千卡/摩尔这两种高能化合物在生物体内起储存
15、能量的作用。硫酯键型硫酯键型3-磷酸腺苷-5-磷酸硫酸酰基辅酶A甲硫键型甲硫键型S-腺苷甲硫氨酸腺苷甲硫氨酸ATPATP的特点的特点 在在pH=7pH=7环环境境中中,ATPATP分分子子中中的的三三个个磷磷酸酸基基团团完完全全解解离离成成带带4 4个个负负电电荷荷的的离离子子形形式式(ATPATP4-4-),具具有有较较大大势势能能,加加之之水水解解产产物物稳稳定定,因因而而水水解解自自由由能能很很大大(GG=-30.5=-30.5千千焦焦/摩尔)。摩尔)。腺嘌呤腺嘌呤核糖核糖 O P O P O P O-OOOO-O-O-+Mg2+ATP4-+H2O ADP3-+Pi2-+H+G-30.5
16、kJMOL-1ATP3-+H2O AMP2-+Pi3-+H+G-33.1kJMOL-1 ATP之所以能充当之所以能充当“能量货币能量货币”与其结构特点有直接的关系。与其结构特点有直接的关系。ATPATP的特殊作用的特殊作用 ATPATP是细胞内的是细胞内的“能量通货能量通货”ATPATP是细胞内磷酸基团转移的中间载体是细胞内磷酸基团转移的中间载体PPPPATPP02108641214磷磷酸酸基基团团转转移移能能磷酸烯醇式丙酮酸磷酸烯醇式丙酮酸3-磷酸甘磷酸甘油酸磷酸油酸磷酸磷酸肌酸磷酸肌酸 (磷酸基团储备物)(磷酸基团储备物)6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖3-磷酸甘油磷酸甘油以高能磷酸形式贮能的物质
17、统称磷酸原,包括磷酸肌酸、磷酸精氨酸等。第二节第二节 线粒体电子传递体系线粒体电子传递体系 一、线粒体一、线粒体结构特点结构特点二、电子传递呼吸链的电子传递呼吸链的概念概念三、三、呼吸链的组成呼吸链的组成四、机体内四、机体内两条主要的呼吸链两条主要的呼吸链及其及其能量变化能量变化 五、五、电子传递抑制剂电子传递抑制剂一、线粒体结构一、线粒体结构二、线粒体呼吸链二、线粒体呼吸链 线线粒粒体体基基质质是是呼呼吸吸底底物物氧氧化化的的场场所所,底底物物在在这这里里氧氧化化所所产产生生的的NADHNADH和和FADHFADH2 2将将质质子子和和电电子子转转移移到到内内膜膜的的载载体体上上,经经过过一
18、一系系列列氢氢载载体体和和电电子子载载体体的的传传递,最后传递给递,最后传递给O O2 2生成生成H H2 2O O。这这种种由由一一系系列列电电子子载载体体按按对对电电子子亲亲和和力力逐逐渐渐升升高高的的顺顺序序组组成成的的电电子子传传递递系系统统称称电电子子传传递递链链(eclctron eclctron transfer transfer chain),chain),因因为为其其功功能能和和呼呼吸吸作作用直接相关,亦称为呼吸链。用直接相关,亦称为呼吸链。三、呼吸链的组成三、呼吸链的组成1.1.黄素蛋白酶类黄素蛋白酶类(flavoproteins,FPflavoproteins,FP)2.
19、2.铁铁-硫蛋白类硫蛋白类(ironironsulfur proteins)sulfur proteins)3 3.辅酶辅酶(ubiquinone,ubiquinone,亦写作亦写作CoQCoQ)4 4.细胞色素类细胞色素类(cytochromes)NADH辅辅 酶酶 Q(CoQ)Fe-SCyt c1O2Cyt bCyt cCyt aa3琥珀酸等琥珀酸等黄素蛋白黄素蛋白(FAD)黄素蛋白黄素蛋白(FMN)细胞色素类细胞色素类铁硫蛋白铁硫蛋白(Fe-S)铁硫蛋白铁硫蛋白(Fe-S)电电子子传传递递链链中中各各中中间间体体的的顺顺序序NADHFMNCoQFe-SCyt c1O2Cyt bCyt c
20、Cyt aa3Fe-SFMNFe-S琥珀酸琥珀酸等等复合物复合物 II复合物复合物 IV复合物复合物 I复合物复合物 IIINADH脱氢酶脱氢酶辅酶辅酶Q-细胞色素细胞色素还原酶还原酶细胞色素细胞色素C氧化酶氧化酶琥珀酸琥珀酸-辅酶辅酶Q脱氢酶脱氢酶 Cytc Q NADH+H+NAD+延胡索酸延胡索酸 琥珀酸琥珀酸 1/2O2+2H+H2O 胞液侧胞液侧 基质侧基质侧 线粒体内膜线粒体内膜 e-e-e-e-e-呼吸链各复合体在线粒体内膜中的位置1.烟酰胺核苷酸烟酰胺核苷酸nNAD+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide Adenine Dinucleotide),又叫Co,主要作为
21、呼吸链的一个组分,起递氢体作用;nNADP+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(Nicotin-amide Adenine Dinucleotide Phosphate),又叫Co,主要在还原性生物合成中作为供氢体。n二者的递氢部位是烟酰胺部分,为Vit PP。R=H:NAD+;R=H2PO3:NADP+NAD+和和NADP+的结构的结构NAD+(NADP+)的递氢机制)的递氢机制(氧化型)(氧化型)(还原型)(还原型)氧化还原反应时变化发生在五价氮和三价氮之间。氧化还原反应时变化发生在五价氮和三价氮之间。2.黄素辅基黄素辅基nFMN:黄素单核苷酸:黄素单核苷酸(Flavin Mononucleoti
22、de)nFAD:黄素腺嘌呤二核苷酸:黄素腺嘌呤二核苷酸(Flavin Adenine Dinucleotide)nFMN和和FAD中中异咯嗪环异咯嗪环起起递氢体递氢体作用。作用。n异咯嗪及核醇部分为异咯嗪及核醇部分为Vit B2(核黄素)。(核黄素)。FMN结构结构异咯嗪异咯嗪核醇核醇 FAD结构结构FMN和和FAD递氢机制递氢机制 (氧化型)(氧化型)(还原型)(还原型)3.铁硫蛋白铁硫蛋白(Iron-sulfur protein,Fe-S)n又叫铁硫中心或铁硫簇。又叫铁硫中心或铁硫簇。n含有等量铁原子和硫原子。含有等量铁原子和硫原子。n铁除与硫连接外,还与肽链中铁除与硫连接外,还与肽链中C
23、ys残基的巯残基的巯基连接。基连接。n铁原子可进行铁原子可进行Fe2+Fe3+e 反应传递电反应传递电子,子,为为单电子传递体单电子传递体。铁原子可进行铁原子可进行Fe2+Fe3+e 反应传递电子。反应传递电子。4.泛醌泛醌(ubiquinone,UQ)n即辅酶即辅酶Q(Coenzyme Q,CoQ),属于),属于脂溶性醌类化合物,带有多个异戊二烯侧脂溶性醌类化合物,带有多个异戊二烯侧链。链。n因其为脂溶性,游动性大,极易从线粒体内因其为脂溶性,游动性大,极易从线粒体内膜中分离出来,因此不包含在四种复合体膜中分离出来,因此不包含在四种复合体中。中。n分子中的苯醌结构能可逆地结合分子中的苯醌结构
24、能可逆地结合2个个H,为,为递氢体递氢体。异戊二烯异戊二烯 5.细胞色素类(细胞色素类(Cytochrome,Cyt)n是一类以铁卟啉为辅基的电子传递蛋白。是一类以铁卟啉为辅基的电子传递蛋白。n呼吸链中主要有呼吸链中主要有a、b、c、三类。差别在于铁卟、三类。差别在于铁卟啉的侧链以及铁卟啉与蛋白部分连接的方式不同。啉的侧链以及铁卟啉与蛋白部分连接的方式不同。Cyt b、c的铁卟啉与血红素相同;的铁卟啉与血红素相同;Cyt a的铁卟的铁卟啉为血红素啉为血红素A。n分子中的分子中的铁铁通过氧化还原而传递电子,为通过氧化还原而传递电子,为单电子单电子传递体传递体。传递电子机理传递电子机理:Fe3+F
25、e2+-e+e 复合体:NADH-泛醌脱氢酶u 功能功能:将电子从将电子从NADH传递给泛醌传递给泛醌(ubiquinone)复合体复合体NADH CoQ FMN;Fe-SN-1a,b;Fe-SN-4;Fe-SN-3;Fe-SN-2 复合体复合体的功能的功能 NADH+H+NAD+FMN FMNH2还原型还原型Fe-S 氧化型氧化型Fe-S QQH2复合体:琥珀酸-泛醌脱氢酶u 功能功能:将电子从琥珀酸传递给泛醌将电子从琥珀酸传递给泛醌 复合体复合体琥珀酸琥珀酸 CoQFe-S1;b560;FAD;Fe-S2;Fe-S3 复合体:泛醌-细胞色素c还原酶 u 功能:将电子从泛醌传递给细胞色素功能
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