工业微生物 第5章 微生物的代谢及调控.ppt
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1、工业微生物工业微生物第五章第五章 微生物的代谢及调控微生物的代谢及调控 微生物代谢是微生物活细胞中各种生化反应的总称。微生物的代谢分为物质代谢和能量代谢。物质代谢包括分解代谢和合成代谢。能量代谢包括产能代谢和耗能代谢。分解代谢指复杂的有机物分子在分解酶系作用下形成简单分子、ATP和还原力(用NAD(P)H表示)的过程;合成代谢指简单小分子、ATP和还原力在合成代谢酶催化下合成复杂生物大分子的过程,二者之间的关系为:第五章第五章 微生物的代谢及调控微生物的代谢及调控第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢一切生命活动都是耗能反应,因此,能量代谢是一切生物代谢的核心问题。能量代谢的中心任务,
2、是生物体如何把外界环境中的多种形式的最初能源转换成对一切生命活动都能使用的通用能源ATP,这就是产能代谢。对于微生物而言,微生物利用的最初能源主要是有机物、日光辐射能和还原态无机物三大类。如下图所示:第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 一、生物氧化一、生物氧化分解代谢实际上是物质在生物体内经过一系列连续的氧化还原反应,逐步分解并释放能量的过程,这个过程也称为生物氧化,是一个产能代谢过程。在生物氧化过程中释放的能量可被微生物直接利用,也可通过能量转换储存在高能化合物(如ATP)中,以便逐步被利用,还有部分能量以热的形式被释放到环境中。不同类型微生物进行生物氧化所利用的物质是不同的,异
3、养微生物利用有机物或无机物,自养微生物则利用无机物,通过生物氧化来进行产能代谢。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 二、异养微生物的生物氧化与二、异养微生物的生物氧化与产产能能产能代谢与分解代谢密不可分。任何生物体的生命活动都必须有能量驱动,产能代谢是生命活动的能量保障。微生物细胞内的产能与能量储存、转换和利用主要依赖于氧化还原反应。异养微生物将有机物氧化,根据氧化还原反应中电子受体的不同,可将微生物细胞内发生的生物氧化反应分成发酵和呼吸两种类型,而呼吸又可分为有氧呼吸和厌氧呼吸两种方式。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢(一)发酵(fermentation)广义的发酵
4、是指利用好氧或厌氧性微生物来生产有用代谢产物的一类生产方式。这里介绍的是生物体能量代谢中的狭义发酵概念,是指微生物细胞将有机物底物氧化释放的电子或脱下的氢原子直接交给某种中间代谢物,同时释放能量并产生各种不同的发酵产物。在发酵条件下有机化合物只是底物水平磷酸化获取能量,因此,只释放出一小部分的能量。发酵过程的氧化是与有机物的还原偶联在一起的。被还原的有机物来自于发酵过程中的中间代谢物,即不需要外界提供电子受体或受氢体。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢发酵的种类有很多,发酵的底物有碳水化合物、有机酸、氨基酸等,其中以微生物发酵葡萄糖最为重要。生物体内葡萄糖的降解主要有四种途径:EM
5、P途径、HMP途径、ED途径、磷酸解酮酶途径。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 1.EMP途径(双磷酸己糖降解途径)EMP(Embden-Meyerhof-Parnas pathway)途径又称为糖酵解,是生物体内葡萄糖被降解成丙酮酸的过程。该途径大致可分为两个阶段(图5-1)。第一阶段可认为是不涉及氧化还原反应及能量释放的准备阶段,只是生成两分子的主要中间代谢产物:3-磷酸-甘油醛。第二阶段发生氧化还原反应,合成ATP并形成两分子的丙酮酸。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 EMP途径可为微生物的生理活动提供ATP和NADH,其中间产物又可为微生物的合成代谢提供碳骨
6、架,并在一定条件下可逆转合成多糖。酵母菌是通过EMP途径发酵生成乙醇的。在发酵过程中,酵母菌将葡萄糖经EMP途径降解为两分子丙酮酸,然后丙酮酸脱羧生成乙醛,乙醛作为氢受体使NAD+再生,发酵终产物为乙醇,这种发酵类型称为酵母的一型发酵,酵母的二型发酵、三型发酵见甘油发酵。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 2.HMP途径(单磷酸己糖裂解途径)HMP途径(图5-2)是从6-磷酸葡萄糖酸开始的,即在单磷酸己糖基础上开始降解的,故称为单磷酸己糖途径。HMP途径与EMP途径有着密切的关系,因为HMP途径中的3-磷酸甘油醛可以进入EMP,因此该途
7、径又可称为磷酸戊糖支路。HMP途径的一个循环的最终结果是一分子6-磷酸葡萄糖转变成一分子3-磷酸甘油醛,三分子CO2和六分子NADPH。一般认为HMP途径不是产能途径,而是为生物合成提供大量的还原力(NADPH)和中间代谢产物。如5-磷酸核酮糖是合成核酸、某些辅酶及组氨酸的原料;第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 NADPH是合成脂肪酸、类固醇和谷氨酸的供氢体。另外,HMP途径中产生的5-磷酸核酮糖,还可以转化为1,5-二磷酸核酮糖,在羧化酶作用下固定CO2,对于光能自养菌、化能自养菌具有重要意义(见卡尔文循环)。许多微生物中往往同时存在EMP和HMP途径,单独具有EMP或HMP途
8、径的微生物较少见。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 3.ED途径(2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖裂解途径)ED(Entner-Doudoroff pathway)途径是在研究嗜糖假单胞菌时发现的。在ED途径中,6-磷酸葡萄糖首先脱氢产生6-磷酸葡萄糖酸,接着在脱水酶和醛缩酶的作用下,产生一分子3-磷酸甘油醛和一分子丙酮酸。然后3-磷酸甘油醛进入EMP途径转变成丙酮酸。一分子葡萄糖经ED途径最后生成两分子丙酮酸,一分子ATP,一分子NADPH和NADH(图5-3)。ED途径是存在于某些缺乏完整EMP途径的微生物中的一种替代途径,为微生
9、物所特有。该途径的特征酶为2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡糖酸醛缩酶(KDPG醛缩酶),催化KDPG裂解为3-磷酸甘油醛和丙酮酸。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 ED途径也可用来发酵生产乙醇,该方法称为细菌酒精发酵。对于不同的细菌进行乙醇发酵时,其发酵途径也各不相同。如运动发酵单胞菌和厌氧发酵单胞菌是利用ED途径分解葡萄糖为丙酮酸,最后得到乙醇;对于某些生长在极端酸性条件下的严格厌氧菌,如胃八叠球菌和肠杆菌则是利用EMP途径进行乙醇发酵。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 4.磷酸解酮酶途径 磷酸解酮酶途径是明串珠菌在进行异
10、型乳酸发酵过程中分解己糖和戊糖的途径。该途径的特征性酶是磷酸解酮酶,根据解酮酶的不同,把具有磷酸戊糖解酮酶的途径称为PK途径,PK途径有两种形式:一种是利用葡萄糖,产物是乳酸、乙醇和CO2(图5-4-a),另一种是利用核糖(图5-4-b),产物是乳酸和乙酸,其共同点是途径中都有磷酸戊糖解酮酶起作用。把具有磷酸己糖解酮酶的途径叫HK途径,又称双歧杆菌途径(如图5-5),产物是乳酸和乙酸,其特征是由磷酸己糖解酮酶和磷酸戊糖解酮酶共同起作用。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢图5-4a磷酸戊糖酮酶(PK)途径第一节第一节 微生物的能量代谢微生
11、物的能量代谢图5-4b磷酸戊糖酮酶(PK)途径第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢图5-5磷酸己糖解酮酶(HK)途径许多细菌能利用葡萄糖产生乳酸,这类细菌称为乳酸细菌。根据产物的不同,乳酸发酵有三种类型:同型乳酸发酵、异型乳酸发酵和双歧发酵。同型乳酸发酵的过程是:葡萄糖经EMP途径降解为丙酮酸,丙酮酸在乳酸脱氢酶的作用下被NADH还原为乳酸。由于终产物只有乳酸一种,故称为同型乳酸发酵。在异型乳酸发酵中,葡萄糖首先经PK途径分解,发酵终产物除乳酸以外还有一部分乙醇或乙酸。在肠膜明串珠菌中,当发酵葡萄糖时,利用PK途径分解葡萄糖,产生3-磷酸甘油醛和乙酰磷酸,其中3-磷酸甘油醛进一步转化
12、为乳酸,乙酰磷酸经两次还原变为乙醇;当发酵戊糖时,则是利用PK途径,磷酸解酮糖酶催化5-P-木酮糖裂解生成乙酰磷酸和3-P-甘油醛。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 双歧发酵是两歧双歧杆菌发酵葡萄糖产生乳酸的一条途径。此反应中有两种磷酸酮糖酶参加反应,即6-磷酸果糖磷酸酮糖酶和5-磷酸木酮糖磷酸酮糖酶分别催化6-磷酸果糖和5-磷酸木酮糖裂解产生乙酰磷酸和4-磷酸赤藓糖,及3-磷酸甘油醛和乙酰磷酸。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 5.其他发酵途径 (1)甘油发酵途径 甘油通常由酵母菌在不同条件下发酵生成,即酵母的二型发酵与三型发酵。酵母的二型发酵:当环境中存在亚硫酸
13、氢钠时,它可与乙醛反应生成难溶的结晶状亚硫酸钠加成物,这样使乙醛不能作为NADH2的受氢体,所以不能形成乙醇,迫使磷酸二羟丙酮代替乙醛作为受氢体,生成-磷酸甘油。-磷酸甘油在磷酯酶的催化下进一步水解脱磷酸生成甘油。因此该方法又称亚硫酸盐法甘油发酵。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢酵母的三型发酵:在弱碱性条件下(pH7.6),乙醛因得不到足够的氢而积累,两个乙醛分子间会发生歧化反应,一分子乙醛作为氧化剂被还原成乙醇,另一个则作为还原剂被氧化为乙酸。氢受体则由磷酸二羟丙酮担任。发酵终产物为甘油、乙醇和乙酸,这种发酵方式又称为碱法甘油发酵。
14、第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 (2)丙酸发酵途径 许多厌氧菌可进行丙酸发酵。葡萄糖经EMP途径分解为两个丙酮酸后,再被转化为丙酸(如下图所示)。少数丙酸细菌还能将乳酸(或利用葡萄糖分解而产生的乳酸)转变为丙酸。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 (3)丙酮-丁醇发酵途径 某些专性厌氧菌,如梭菌属、丁酸弧菌属、真杆菌属和梭杆菌属,能进行丁酸与丙酮-丁醇发酵。在发酵过程中,葡萄糖经EMP途径降解为丙酮酸,丙酮酸脱羧生成乙酰辅酶A,然后经一系列变化生成丁酰辅酶A及丁醛,丁醛作为受氢体被还原生成丁醇,生成物中还有丙酮、乙醇。第
15、一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 某些肠杆菌,如埃希氏菌属、沙门氏菌属和志贺氏菌属中的一些菌,能够利用葡萄糖进行混合酸发酵。先通过EMP途径将葡萄糖分解为丙酮酸,然后由不同的酶系将丙酮酸转化成不同的产物,如乳酸、乙酸、甲酸、乙醇、CO2和氢气,还有一部分磷酸烯醇式丙酮酸用于生成琥珀酸;而肠杆菌、欧文氏菌属中的一些细菌,能将丙酮酸转变成乙酰乳酸,乙酰乳酸经一系列反应生成丁二醇。由于这类肠道菌还具有丙酮酸-甲酸裂解酶,乳酸脱氢酶等,所以其终产物还有甲酸、乳酸、乙醇等。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 (二)呼吸作用 上面所述发酵过程是在无氧等外源受氢体的条件下,底物脱氢后
16、所产生的还原力H未经呼吸链而直接交给中间代谢物接受,实现底物水平磷酸化并产生很少的能量。然而,如果有氧或其他外源电子受体存在时,底物分子可被完全氧化为CO2和水,且在此过程中可合成的ATP的量大大多于发酵过程。微生物在降解底物的过程中,将释放出的电子交给NAD(P)+、FAD或FMN等电子载体,再经电子传递系统传给外源电子受体,从而生成水或其他还原型第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 产物并释放出能量的过程,称为呼吸作用。其中,以分子氧作为最终电子受体的称为有氧呼吸(aerobic respiration),以氧化型化合物作为最终电子受体的称为无氧呼吸(anaerobic resp
17、iration)。呼吸作用与发酵作用的根本区别在于:电子载体不是将电子直接传递给底物降解的中间产物,而是交给电子传递系统,逐步释放出能量后再交给最终电子受体。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 1.有氧呼吸 葡萄糖经过糖酵解作用形成丙酮酸,在发酵过程中,丙酮酸在厌氧条件下转变成不同的发酵产物;而在有氧呼吸过程中,丙酮酸进入三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle,简称TCA循环),被彻底氧化生成CO2和水,同时释放大量能量(图5-6)。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 对于每个经TCA循环而被氧化的丙酮
18、酸分子来讲,在整个氧化过程中共释放出三个分子的CO2。一个是在乙酰辅酶A形成过程中,一个是在异柠檬酸的脱羧时产生的,另一个是在a-酮戊二酸的脱羧过程中。与发酵过程相一致,TCA循环中间产物氧化时所释放出的电子通常先传递给含辅酶NAD+的酶分子。然而,NADH的氧化方式在发酵及呼吸作用中是不同的。在呼吸过程中,NADH中的电子不是传递给中间产物,如丙酮酸,而是通过电子传递系统传递给氧分子或其他最终电子受体,因此,在呼吸过程中,因有外源电子受体的存在,葡萄糖可以被完全氧化成CO2,从而可产生比发酵过程更多的能量。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 在糖酵解和三羧酸循环过程中形成的NAD
19、H和FADH2通过电子传递系统被氧化,最终形成ATP为微生物的生命活动提供能量。电子传递系统是由一系列氢和电子传递体组成的多酶氧化还原体系。NADH、FADH2以及其他还原型载体上的氢原子,以质子和电子的形式在其上进行定向传递;其组成酶系是定向有序的,又是不对称地排列在原核微生物的细胞质膜上或是在真核微生物的线粒体内膜上。这些系统具有两种基本功能:一是从电子供体接受电子并将电子传递给电子受体;二是通过合成ATP把在电子传递过程中释放的一部分能量保存起来。电子传递系统中的氧化还原酶包括:NADH脱氢酶、黄素蛋白、铁硫蛋白、醌及其衍生物、细胞色素。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 2
20、.无氧呼吸 某些厌氧和兼性厌氧微生物在无氧条件下进行无氧呼吸。无氧呼吸是指一类呼吸链末端的氢受体为外源无机氧化物(少数是有机氧化物)的生物氧化。无氧呼吸的最终电子受体不是氧,而是像NO3-、SO42-、S、CO2等这类外源受体(图5-7)。在无氧条件下,某些微生物在没有氧、氮或硫作为呼吸作用的最终电子受体时,可以磷酸盐代替,生成磷化氢(PH3)的一种易燃气体,在夜晚发出绿幽幽的光,这就是人们常称之的“鬼火”。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢图5-7无氧呼吸 无氧呼吸也需要细胞色素等电子传递体,并在能量分级释放过程中伴随有磷酸化作用,也
21、能产生较多的能量用于生命活动。但由于部分能量随电子转移传给最终电子受体,所以生成的能量不如有氧呼吸产生的多。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 三、自养微生物的生物氧化与三、自养微生物的生物氧化与产产能能一些能利用光或氧化无机物获得能量,以二氧化碳或碳酸盐为碳源生长并具有特殊生物合成能力的微生物称为自养微生物。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 (一)光能自养微生物的生物氧化和产能 光能自养微生物具有叶绿素、细菌叶绿素、类胡萝卜素和藻胆色素等光合色素,能以二氧化碳作为唯一或主要碳源进行光合作用。光合作用是自然界一个极其重要的生物学过程,其实质是通过光合磷酸化将光能转变成
22、化学能,用于合成细胞物质。进行光合作用的生物体除了绿色植物外,还包括光合微生物,如藻类、蓝细菌和光合细菌(包括紫色细菌、绿色细菌、嗜盐菌等)。它们利用光能维持生命,同时也为其他生物(如动物和异养微生物)提供了赖以生存的有机物。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 (二)化能自养微生物的生物氧化和产能能从无机物氧化中获得能量,以二氧化碳或碳酸盐作为碳源的微生物称为化能自养微生物。化能自养微生物是好氧菌,对自然界物质转化起重要的作用,主要有硝化细菌、硫化细菌、氢细菌和铁细菌等。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 1.氨的氧化(硝化作用)NH3和亚硝酸(NO2-)是可以用作能源
23、的最普通的无机氮化合物,能被硝化细菌所氧化,硝化细菌可分为两个亚群:亚硝酸细菌和硝酸细菌。亚硝酸细菌有亚硝酸极毛杆菌、亚硝酸球菌、亚硝酸螺菌等。硝酸细菌有硝酸杆菌属、硝酸球菌属等。硝化细菌将氨氧化,释放能量并同化CO2合成细胞物质。氨氧化为硝酸的过程可分为两个阶段,先由亚硝酸细菌将氨氧化为亚硝酸,再由硝酸细菌将亚硝酸氧化为硝酸。由氨氧化为硝酸是通过这两类细菌依次进行的(如下图所示)。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 2.硫的氧化(硫化作用)硫细菌能够利用一种或多种还原态或部分还原态的硫化合物(包括硫化物、元素硫、硫代硫酸盐、多硫酸盐和
24、亚硫酸盐)作能源,最后生成H2SO4的过程。H2S首先被氧化成元素硫,随之被硫氧化酶和细胞色素系统氧化成亚硫酸盐,放出的电子在传递过程中可以偶联产生四个ATP,亚硫酸盐的氧化可直接氧化成SO42-。硫细菌是指引起硫化作用的微生物的总称,有硫杆菌属、贝氏硫细菌、绿紫硫细菌等。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 3.氢的氧化 氢细菌都是一些呈革兰氏阴性的兼性化能自养菌。它们能利用分子氢氧化产生的能量同化CO2,也能利用其他有机物生长。氢细菌的细胞膜上有泛醌、维生素K2及细胞色素等呼吸链组分。在该菌中,电子直接从氢传递给电子传递系统,电子在呼吸链传递过程中产生ATP。在多数氢细菌中有两种
25、与氢的氧化有关的酶。一种是位于壁膜间隙或结合在细胞质膜上的不需NAD+的颗粒状氧化酶,它能够催化以下反应:第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢该酶在氧化氢并通过电子传递系统传递电子的过程中,可驱动质子的跨膜运输,形成跨膜质子梯度,为ATP的合成提供动力;另一种是可溶性氢化酶,它能催化氢的氧化,而使NAD+还原的反应。所生成的NADH主要用于CO2的还原。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 4.铁的氧化 从亚铁到高铁状态的铁的氧化,对于少数细菌来说也是一种产能反应,但从这种氧化中只有少量的能量可以被利用。例如嗜酸性的氧化亚铁硫杆菌在低pH环境中能利用亚铁氧化时放出的能量获得
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