酵母表达体系42890.pdf

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1、1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 1d 毕赤酵母是甲醇营养型，甲醇代谢的第一步是：醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛和过氧化氢。为避免过氧化氢的毒性，甲醛代谢主要在过氧化物酶体里进行，使得有毒的副产物远离细胞其余组分。由于醇氧化酶与O2 的结合率较低，因而毕赤酵母代偿性地产生大量的酶。而调控产生醇氧化物酶的启动子也正是驱动外源基因在毕赤酵母中表达的启动子。毕赤酵母含有两种醇氧化物酶，AOX1 AOX2。细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1 基因产物。甲醇可紧密调节、诱导 AOX1 基因的高水平表达，为Mut+菌株，可占可溶性蛋白的 30%以上。AOX2

2、基因与 AOX1 基因有 97%的同源性，但在甲醇中带 AOX2 基因的菌株比带 AOX1 基因菌株慢得多，通过这种甲醇利用缓慢表型可分离 Muts 菌株。毕赤酵母表达外源蛋白：分泌型和胞内表达。利用含有因子序列的分泌型载体即可。翻译后修饰：酿酒酵母与毕赤酵母大多数为 N-连接糖基化高甘露糖型，毕赤酵母中蛋白转录后所增加的寡糖链长度（平均每个支链 8-14 个甘露糖残基）比酿酒酵母中的（50-150 个甘露糖残基）短得多。菌株：GS115（Mut+，Muts）和 KM71（Muts）分泌型载体:pPICZ A,B,and C(5AOX1启动子，紧密型调节，甲醇诱导表达，分泌信号介导的分泌表达，

3、Zeocin抗性基因，C端含有6XHis标签)胞内表达型载体：pPICZ A,B,and C，一：分子克隆 1.设计引物 分泌型载体图谱：见酵母表达说明书（p13-pPICZ A，p14-pPICZB,p15-pPICZ C）1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 2d 2.PCR扩增基因 PCR 反应体系（50l）模板 DNA 1l Forward Primer（10M）1l Reverse Primer（10M）1l dNTP Mixture(各 2mM):4l 5PrimerSTAR buffer（Mg2+plus）10l PrimerSTAR DN

4、A Polymerase 0.5l ddH2O up to 50l PCR 反应流程 预变性 98 2min 变性 98 10sec 退火 56 10sec 30 个循环 延伸 72 30sec 完全延伸 72 10min 保存 4 3.双酶切及其回收 双酶切反应体系（40l）DNA(空载体或目的基因)30l BamH 1.5l Xhol 1.5l 10Buffer K 4.0l 4.酶连接 首先利用1%的琼脂糖电泳将双酶切后的PCR产物和载体进行分离,并通过胶回收试剂盒回收，按照目的基因和空载体的碱基摩尔比在1:3-1:9之间，一共吸取目的基因和空载体的总体积为5l，在加入等量的5l DNA

5、快速连接试剂盒Solution，16连接4-6h。转化到克隆型感受态（DH5和Top10），使用低盐LB培养基，加入25 g/ml Zeocin，双酶切法鉴定重组质粒后，送测序。双酶切鉴定体系（10l）DNA(空载体或目的基因)6l BamH 0.5l Xhol 0.5l 10Buffer K 1.0l 二：线性化重组质粒 1.提取重组质粒 1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 3d 20ml低盐LB培养基(25 g/ml Zeocin)，提取150ul重组质粒 2.重组质粒线性化体系：重组质粒线性化体系（80l）重组质粒 70l Sac1/Pme 2l

6、 Buffer 8l 37水浴酶切过夜（约12-24小时）,取0.5-1ul酶切后质粒，用1%琼脂糖凝胶电泳检测，可冻存在-20。3.线性化产物的浓缩（若回收的线性化质粒浓度大于100ng/ul,则不需要浓缩，50ml酵母培养液得到200ul感受态细胞，使用10ul线性化质粒+100ul感受态进行电转）(1)65，20min灭活限制性内切酶(2)加入等体积（酚：氯仿：异戊醇=25:24:1），振荡均匀，RT，12000rpm，离心1min,取上清。(3)加入等体积氯仿，振荡均匀，RT，12000rpm，离心1min,取上清。(4)加入0.1倍体积醋酸钠（pH=5.2，3M）,2倍体积预冷无水乙

7、醇，振荡均匀，-80，放置30min后，4，12000rpm,离心40min.(5)将沉淀用70%乙醇500ul，洗两次，14000rpm,4，离心10min,晾干后，加入10ulddH2O溶解即可，-20保存。三：酵母电转化感受态细胞的制备 1活化酵母菌：取出存于-20冰箱的GS115无抗YPD平板，挑取单克隆，划线于新的无抗YPD平板上，30烘箱培养16h 2挑取酵母单菌落，接种到50ml无抗YPD液体培养基，250rpm，30培养15h 3取50l菌液接种于100ml培养基中，250rpm，培养至OD值在1.21.5之间。4分装菌液至灭菌的50ml离心管，4，3700rpm，离心10mi

8、n 5弃上清，加50ml预冷至4的无菌水，重悬细胞，剧烈震荡200次，4，3700rpm，离心1min，重复用无菌水洗一次。6弃上清，用2ml1M山梨醇（1M）清洗沉淀后，加入400ul 1M山梨醇重悬 四：电转化至酵母感受态细胞中 1 取 5l 线性化回收产物，加入至 100l 新鲜制备的电转化感受态细胞中，混匀移入干净的 1.5ml EP1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 4d 管中（避免气泡出现）。2 取预冷于-20的电极杯，放在冰上。设置电转化参数：电压 1200V，时间 5ms。3 将重组质粒与感受态细胞混均匀后，加入到电极杯中，等待 1-2

9、min(使细胞 DNA 体系与电极杯能充分接触，利于电转的成功)4 立即向电转杯中加入 1ml 山梨醇，用移液枪充分混匀。从电转杯中吸出液体，加入到灭菌 1.5ml EP管中。30烘箱 1h(1-2)复苏 5 取出复苏的菌液，4000rpm，离心 5 分钟,弃掉 800l 上清。将剩余的 300l 细胞重悬，涂含有25g/ml Zeocin 抗性的 YPDS 平板上，30培养箱避光，倒置培养 3 天。五：(可省略直接进行小试)菌落 PCR 鉴定 待 YPDS 的 ZeocinTM平板上长出单克隆后，挑取单克隆，接种于 YPD 液体培养基中，加25g/mlZeocinT M抗生素。避光培养，转速

10、250rpm，30培养 16 小时。酵母菌落 PCR 鉴定体系如下：PCR 鉴定反应体系（50l）菌液 0.5l Forward Primer（10M）1l Reverse Primer（10M）1l dNTP Mixture(各 2mM):4l 10Easy Tag buffer（Mg2+plus）5l Easy Tag DNA Polymerase 0.5l ddH2O up to 50l PCR 反应程序设定：PCR 鉴定反应流程 预变性 95 5min 变性 95 60sec 45 个循环 退火 54 60sec 延伸 72 90sec 再延伸 72 10min 保存 4 1%的琼脂糖

11、凝胶电泳检测 PCR 结果。六：小试 1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 5d 1.挑取隆菌落，接种到 5ml YPD 培养基，28-30培养过夜，全部转入 20-50ml BMGY 中，28-30培养至 OD600=2-6,4000rpm 离心 10min，弃上清,将菌体转入 50-100ml BMMY 中，加入 1%甲醇诱导表达。2.若蛋白小于 10kDa，分别 12，24h 取样，SDS-PAGE 检测；一般情况，12，24，36h 分别取样，SDS-PAGE检测表达情况 七：重组蛋白的表达 1、挑取酵母阳性单克隆菌落，接种于 5ml YPD 中

12、，28-30培养过夜。全部转入 100ml BMGY 培养基中，加抗生素 ZeocinTM至浓度 2ul/ml,250rpm，28-30摇床培养 16-18h。用紫外分光光度计测 OD 值为 2-6。2、将培养的酵母菌取出，分装至 50ml 离心管中，4000rpm，4，离心 10 分钟，弃上清，向沉淀中加入 20-30ml 的 BMMY 培养基重悬酵母菌。3、将菌液倒入 400ml 培养基的 2L 锥形瓶中，每瓶加入 2ml(体积分数为 0.5%)的甲醇，250rpm，30培养，诱导蛋白表达。4、每隔 24 小时，向瓶中加入 4ml 甲醇诱导（体积分数为 1%），诱导 96 小时左右。5、收

13、菌：取出培养瓶，4500rpm，离心 30 分钟，取上清，倒入 50ml 高速离心管中，14000rpm，离心 40min.弃沉淀物，取上清 或者破菌，进行纯化 配制溶液 1.Low Salt LB Medium with Zeocin 10 g Tryptone 5 g NaCl 5 g Yeast Extract 1.Combine the dry reagents above and add deionized,distilled water to 1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 6d 950 ml.Adjust pH to 7.5 with

14、 1N NaOH.Bring the volume up to 1 liter.For plates,add 15 g/L agar before autoclaving.2.Autoclave on liquid cycle at 15 psi and 121C for 20 minutes.3.Allow the medium to cool to at least 55C before adding the Zeocin to 25 g/ml final concentration.Store plates at 4C in the dark.Plates containing Zeoc

15、in are stable for up to 2 weeks.2.YPD(+Zeocin)Yeast Extract Peptone Dextrose Medium(1 liter)1%yeast extract 2%peptone 2%dextrose(glucose)+2%agar +appropriate concentration of Zeocin 1.Dissolve:10 g yeast extract 20 g of peptone in 900 ml of water.2.Include 20 g of agar if making YPD slants or plates

16、.3.Autoclave for 20 minutes on liquid cycle.4.Add 100 ml of 20%dextrose(filter-sterilize dextrose before use).5.Cool solution to 60C and add the appropriate amount of Zeocin from a 100 mg/ml stock solution.Note:It is necessary to include Zeocin in the medium for selection of Pichia transformants onl

17、y.Zeocin may be omitted from the medium when performing expression studies.Store YPD slants or plates containing Zeocin at 4C.The shelf life is one to two weeks.3.YPDS+Zeocin Agar Yeast Extract Peptone Dextrose Medium with Sorbitol(1 liter)1%yeast extract 2%peptone 2%dextrose(glucose)1 M sorbitol +2

18、%agar +appropriate concentration of Zeocin 1.Dissolve:10 g yeast extract 182.2 g sorbitol 20 g of peptone 1.1 附件 1：ace 与 GBT19011-2008 标准主要差异性分析 7d in 900 ml of water.2.Add 20 g of agar.3.Autoclave for 20 minutes on liquid cycle.4.Add 100 ml of 20%dextrose(filter-sterilize dextrose before use).5.Coo

19、l solution to 60C and add the appropriate amount of Zeocin from a 100 mg/ml stock solution.Note:It is necessary to include Zeocin in the medium for selection of Pichia transformants only.Zeocin may be omitted from the medium when performing expression studies.Store YPDS slants or plates containing Z

20、eocin at 4C.The shelf life is one to two weeks.4.BMGY and BMMY Buffered Glycerol-complex Medium Buffered Methanol-complex Medium(1 liter)1%yeast extract 2%peptone 100 mM potassium phosphate,pH 6.0 1.34%YNB 4 10-5%biotin 1%glycerol or 0.5%methanol 1.Dissolve 10 g of yeast extract,20 g peptone in 700

21、mL water.2.Autoclave 20 minutes on liquid cycle.3.Cool to room temperature,then add the following and mix well:100 mL 1 M potassium phosphate buffer,pH 6.0 100 mL 10X YNB 2 mL 500X B 100 mL 10X GY 4.For BMMY,add 100 mL 10X M instead of glycerol.5.Store the media at 4C.The shelf life of this solution is approximately two months.Store Zeocinat 20C and thaw on ice before use.精品文档 word 文档可以编辑！谢谢下载！