发酵机制及发酵动力学精选PPT.ppt
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1、关于发酵机制及发酵动力学第1页,讲稿共78张,创作于星期日第三章第三章 发酵机制及发酵动力学发酵机制及发酵动力学第一节第一节 发酵工程微生物的基本代谢及产物代谢发酵工程微生物的基本代谢及产物代谢第二节第二节 微生物代谢调节机制微生物代谢调节机制第三节第三节 糖代谢产物的发酵机制糖代谢产物的发酵机制第四节第四节 氨基酸和核苷酸发酵机制氨基酸和核苷酸发酵机制第五节第五节 抗生素发酵机制抗生素发酵机制第六节第六节 微生物发酵动力学微生物发酵动力学第2页,讲稿共78张,创作于星期日本章要求本章要求w掌握初级与次级代谢的产物掌握初级与次级代谢的产物w掌握微生物代谢调节的方式掌握微生物代谢调节的方式w掌握
2、酶活性被抑制的方式掌握酶活性被抑制的方式w了解发酵产物的发酵机制及发酵动力学了解发酵产物的发酵机制及发酵动力学第3页,讲稿共78张,创作于星期日第一节第一节 发酵工程微生物的基本代谢及产物发酵工程微生物的基本代谢及产物w初级代谢及产物初级代谢及产物 多糖、蛋白质、核酸和氨基酸等。多糖、蛋白质、核酸和氨基酸等。w次级代谢及产物次级代谢及产物 抗生素、毒素、激素和色素等。抗生素、毒素、激素和色素等。对数生长期形成的产物是细胞自身生长所必需的,称对数生长期形成的产物是细胞自身生长所必需的,称为初级代谢产物或中间代谢产物。为初级代谢产物或中间代谢产物。各种次级代谢产物都是在微生物生长缓慢或停止生长时期
3、即稳各种次级代谢产物都是在微生物生长缓慢或停止生长时期即稳定期所产生的,来自于中间代谢产物和初级代谢产物。定期所产生的,来自于中间代谢产物和初级代谢产物。第4页,讲稿共78张,创作于星期日第二节第二节 代谢调节方式与机制代谢调节方式与机制一、调节方式一、调节方式w代谢途径区域化代谢途径区域化w代谢流向的调控代谢流向的调控w代谢速度的调控代谢速度的调控w细胞透性的调节细胞透性的调节w能荷调节能荷调节酶量(粗调)酶量(粗调)酶活(细调)酶活(细调)酶酶合成合成的的诱导诱导酶酶合成合成的的阻遏阻遏酶酶活性活性的的激活激活酶酶活性活性的的抑制抑制第5页,讲稿共78张,创作于星期日原核微生物细胞原核微生
4、物细胞虽然没有复杂的具有膜结构的细胞器,但虽然没有复杂的具有膜结构的细胞器,但也划分出不同的区域,对于也划分出不同的区域,对于某一代谢途径有关的酶系集中在某某一代谢途径有关的酶系集中在某一区域一区域,以保证这一代谢途径酶促反应的顺利进行,避免了,以保证这一代谢途径酶促反应的顺利进行,避免了其他途径的干扰;其他途径的干扰;真核微生物细胞真核微生物细胞里,各种酶系被里,各种酶系被细胞器隔离分细胞器隔离分布,使其代布,使其代谢活动只能在特定的部位上进行,如与呼吸产能有关的酶谢活动只能在特定的部位上进行,如与呼吸产能有关的酶系集中于系集中于线粒体内膜线粒体内膜上,上,DNA合成的某些酶位于合成的某些酶
5、位于细胞核细胞核里。里。第6页,讲稿共78张,创作于星期日微生物在不同条件下可以通过控制各代谢途径中微生物在不同条件下可以通过控制各代谢途径中某个酶促反应的速率某个酶促反应的速率来控制代谢物的流向,从而保持机体代谢的平衡。来控制代谢物的流向,从而保持机体代谢的平衡。1、由一个关键酶控制的可逆反应、由一个关键酶控制的可逆反应 同一个酶可以通过不同的同一个酶可以通过不同的辅基(或辅酶)辅基(或辅酶)控制代谢物的流向;控制代谢物的流向;谷氨酸脱氢酶谷氨酸脱氢酶 +NADP+催化谷氨酸的催化谷氨酸的合成合成谷氨酸脱氢酶谷氨酸脱氢酶 +NAD+催化谷氨酸的催化谷氨酸的分解分解第7页,讲稿共78张,创作于
6、星期日2、由两种酶控制的逆单向反应、由两种酶控制的逆单向反应 在生物体代谢的关键部位的某些反应,是由两种不同的酶来在生物体代谢的关键部位的某些反应,是由两种不同的酶来催化的。即在一个催化的。即在一个“可逆可逆”反应中,其中一个酶催化正反应,反应中,其中一个酶催化正反应,另一种酶则催化逆反应。另一种酶则催化逆反应。如:如:葡萄糖葡萄糖+ATP 6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖+H2O 葡萄糖葡萄糖+Pi己糖激酶己糖激酶6-磷酸葡萄糖酯酶磷酸葡萄糖酯酶微生物体内利用两种完全不同的酶,能十分精确地控制微生物体内利用两种完全不同的酶,能十分精确地控制正正反应和逆反应反应和逆反应。第8页
7、,讲稿共78张,创作于星期日1、酶合成的调节(粗调)、酶合成的调节(粗调)通过通过酶量的变化酶量的变化来控制代谢的速率。从本质上看,酶合成来控制代谢的速率。从本质上看,酶合成的调节是在的调节是在基因表达水基因表达水平上起作用的。平上起作用的。酶合成的诱导(酶合成的诱导(induction of enzyme synthesis)协同诱导:协同诱导:一种诱导剂可以同时诱导产生若干种酶的现象。一种诱导剂可以同时诱导产生若干种酶的现象。顺序诱导:顺序诱导:一种诱导剂诱导产生的酶的反应产物可继续诱导一种诱导剂诱导产生的酶的反应产物可继续诱导产生下一个酶,这种连续诱导产生一系列酶的现象称为顺序产生下一个
8、酶,这种连续诱导产生一系列酶的现象称为顺序诱导。诱导。第9页,讲稿共78张,创作于星期日 酶合成的阻遏(酶合成的阻遏(repression of enzyme synthesis)终点产物反馈阻遏:终点产物反馈阻遏:合成代谢过程中,相关酶的合成被过量终合成代谢过程中,相关酶的合成被过量终点产物所阻遏。点产物所阻遏。分解代谢物阻遏:分解代谢物阻遏:可被组成酶快速利用的基质,阻遏了分解难可被组成酶快速利用的基质,阻遏了分解难利用基质的酶的合成。利用基质的酶的合成。1、酶合成的调节(粗调)、酶合成的调节(粗调)如:二次生长现象。在启动序列上游有两个位点,如:二次生长现象。在启动序列上游有两个位点,R
9、NA聚合酶的结合位点和聚合酶的结合位点和cAMP-CAP结合位点。当没有葡萄糖及结合位点。当没有葡萄糖及cAMP浓度较高时,浓度较高时,形成形成cAMP-CAP,该复合物,该复合物结合在启动序列后,结合在启动序列后,RNA聚合酶才能与启动序列结合,酶的合成才能开始;当葡萄聚合酶才能与启动序列结合,酶的合成才能开始;当葡萄糖存在时,糖存在时,葡萄糖降解物葡萄糖降解物抑制腺苷酸环化酶的活性,抑制腺苷酸环化酶的活性,导致导致cAMP浓度降低浓度降低,cAMP与与CAP的结合受阻,的结合受阻,CAP不能被活化而无法结合至启动子,导致不能被活化而无法结合至启动子,导致RNA聚合酶无法与聚合酶无法与启动序
10、列结合,因此启动序列结合,因此乳糖操纵子表达下降乳糖操纵子表达下降。第10页,讲稿共78张,创作于星期日酶合成调节的遗传机制:操纵子学说酶合成调节的遗传机制:操纵子学说1、酶合成的调节(粗调)、酶合成的调节(粗调)乳糖操纵子乳糖操纵子操纵子操纵子是指基因组是指基因组DNA分子的一个片段,这个片断由分子的一个片段,这个片断由启启动子、调节基因、操纵基因和结构基因动子、调节基因、操纵基因和结构基因组成。组成。诱导型操纵子:效应物存在导致基因表达。诱导型操纵子:效应物存在导致基因表达。阻遏型操纵子:效应物存在导致基因表达的关闭。阻遏型操纵子:效应物存在导致基因表达的关闭。第11页,讲稿共78张,创作
11、于星期日第12页,讲稿共78张,创作于星期日PRP Ozya半乳糖苷酶半乳糖苷渗透酶半乳糖苷转乙酰基酶乳糖操纵子的诱导机制乳糖操纵子的诱导机制第13页,讲稿共78张,创作于星期日2、酶活性的调节(细调)、酶活性的调节(细调)一定数量的酶,通过其一定数量的酶,通过其分子构象或分子结构的改变分子构象或分子结构的改变来调节来调节其催化反应的速率。酶活调节的影响因素包括:其催化反应的速率。酶活调节的影响因素包括:底物和产物的底物和产物的性质和浓度、压力、性质和浓度、压力、pH、离子强度、辅助因子离子强度、辅助因子以及其他酶的存在等以及其他酶的存在等等。特点是反应快速。等。特点是反应快速。酶活性的激活(
12、酶活性的激活(activation)前体激活:前体激活:代谢途径中后面的酶促反应,可被该途径中较前面代谢途径中后面的酶促反应,可被该途径中较前面的一个中间产物所促进。的一个中间产物所促进。代谢中间产物的反馈激活:代谢中间产物的反馈激活:代谢中间产物对该代谢途径的前面代谢中间产物对该代谢途径的前面的酶起激活作用。的酶起激活作用。第14页,讲稿共78张,创作于星期日2、酶活性的调节(细调)、酶活性的调节(细调)酶活性的抑制(酶活性的抑制(inhibition):):大多是反馈抑制大多是反馈抑制A.无分支代谢途径无分支代谢途径的调节:通常是在线形的代谢途径中末的调节:通常是在线形的代谢途径中末端产物
13、对催化第一步反应的酶活性有抑制作用。端产物对催化第一步反应的酶活性有抑制作用。A B C D X Ea Eb Ec 抑制抑制第15页,讲稿共78张,创作于星期日B.有分支代谢途径有分支代谢途径的调节:在有两种或两种以上的末端产的调节:在有两种或两种以上的末端产物的分支代谢途径中,调节方式较为复杂。分述如下:物的分支代谢途径中,调节方式较为复杂。分述如下:2、酶活性的调节(细调)、酶活性的调节(细调)A B C EaD E YF G Z Eb Ec抑制抑制抑制抑制抑制抑制两个末端产物,不能直接抑制途径中的第一个酶两个末端产物,不能直接抑制途径中的第一个酶Ea,而是分别抑制而是分别抑制分支点后的分
14、支点后的Eb和和Ec,造成中间产物造成中间产物C的积累,高浓度的的积累,高浓度的C再反馈再反馈抑制抑制Ea。第16页,讲稿共78张,创作于星期日途径中的第一个反应(途径中的第一个反应(A B)被两个不同的酶所催化,一个酶被被两个不同的酶所催化,一个酶被Y抑制,另一个酶被抑制,另一个酶被Z抑制。只有当抑制。只有当Y和和Z同时过量才能完全阻止同时过量才能完全阻止A转变为转变为B。另两个控制点(另两个控制点(C D),(),(C F),),分别受分别受Y或或Z的抑的抑制。制。同工酶是能催化同一生化反应,但它们的结构稍有不同,可分别被相应的末端产同工酶是能催化同一生化反应,但它们的结构稍有不同,可分别
15、被相应的末端产物抑制的一类酶。物抑制的一类酶。A B C E2D E YF G ZE1E3E4抑制抑制抑制抑制抑制抑制抑制抑制第17页,讲稿共78张,创作于星期日末端产物末端产物Y和和Z单独过量,对途径中第一个酶单独过量,对途径中第一个酶E1无抑制作用,只有无抑制作用,只有Y和和Z同时过量,才能对同时过量,才能对E1具有抑制作用。另两个控制点的酶具有抑制作用。另两个控制点的酶E2和和E3分别被分别被Y和和Z所抑制。所抑制。A B C E1D E YF G ZE3E2抑制抑制抑制抑制抑制抑制第18页,讲稿共78张,创作于星期日末端产物末端产物Y和和Z单独过量时,各自对途径中第一个酶单独过量时,各
16、自对途径中第一个酶E1仅产生较仅产生较小的抑制作用,一种末端产物过量并不影响其他末端产物的形成。小的抑制作用,一种末端产物过量并不影响其他末端产物的形成。只有当只有当Y和和Z同时过量,才能对同时过量,才能对E1产生较大的抑制作用。产生较大的抑制作用。A B C E1D E YF G Z40%30%58%第19页,讲稿共78张,创作于星期日末端产物末端产物Y和和Z单独过量时,各自对途径中第一个酶单独过量时,各自对途径中第一个酶E1仅产生较仅产生较小的抑制作用,一种末端产物过量并不影响其他末端产物的形成。小的抑制作用,一种末端产物过量并不影响其他末端产物的形成。当当Y和和Z同时过量,对同时过量,对
17、E1产生的抑制作用则超过各种末端产物单独过产生的抑制作用则超过各种末端产物单独过量时的抑制的总和。量时的抑制的总和。A B C E1D E YF G Z15%20%90%第20页,讲稿共78张,创作于星期日 酶活性调节的分子机制酶活性调节的分子机制主要有两种理论解释:主要有两种理论解释:别构调节理论别构调节理论别构调节理论别构调节理论(酶分子构象的改变)(酶分子构象的改变)酶分子的化学修饰理论酶分子的化学修饰理论酶分子的化学修饰理论酶分子的化学修饰理论(酶分子结构的改变)(酶分子结构的改变)别构酶除了具有与底物结合的催化中心外,还具有与调节剂结别构酶除了具有与底物结合的催化中心外,还具有与调节
18、剂结合的合的调节中心调节中心。当酶与调节剂以非共价键结合后,酶蛋白的构象。当酶与调节剂以非共价键结合后,酶蛋白的构象发生变化,引起催化中心改变,从而引起酶活性的变化。发生变化,引起催化中心改变,从而引起酶活性的变化。酶的共价修饰是酶蛋白在修饰酶催化下,可与某些物质发生酶的共价修饰是酶蛋白在修饰酶催化下,可与某些物质发生共价共价键的结合或解离键的结合或解离,从而导致调节酶的活化或抑制,以控制代谢的速,从而导致调节酶的活化或抑制,以控制代谢的速度和方向。如糖原合成酶的度和方向。如糖原合成酶的磷酸化磷酸化(高活性)和(高活性)和去磷酸化去磷酸化(低活(低活性)。性)。第21页,讲稿共78张,创作于星
19、期日细胞质膜的透性直接影响物质的吸收和代细胞质膜的透性直接影响物质的吸收和代谢产物的分泌,从而影响到细胞内代谢的谢产物的分泌,从而影响到细胞内代谢的变化。变化。第22页,讲稿共78张,创作于星期日w对利用对利用ATPATP的途径(合成代谢)的酶活性或形成的途径(合成代谢)的酶活性或形成ATPATP的途径的途径(分解代谢)的酶活性的调节。(分解代谢)的酶活性的调节。第23页,讲稿共78张,创作于星期日二、微生物代谢调控机制二、微生物代谢调控机制 微生物在正常情况下,通过细胞内的自我调节,维持各个代谢途径的微生物在正常情况下,通过细胞内的自我调节,维持各个代谢途径的相互协调,使其代谢产物既相互协调
20、,使其代谢产物既不缺少又不会过多的积累不缺少又不会过多的积累。而人类利用微生物进行。而人类利用微生物进行发酵则需要微生物积累较多的代谢产物,因此对微生物的代谢必须进行人工控发酵则需要微生物积累较多的代谢产物,因此对微生物的代谢必须进行人工控制。制。一、一、积累代谢产物的有效措施积累代谢产物的有效措施(一)(一)反馈抑制作用的解除反馈抑制作用的解除:实质是使代谢途径中的关键酶(别构酶)的:实质是使代谢途径中的关键酶(别构酶)的调节亚基的结构基因发生突变,使末端产物或其类似物不再与别构中心结调节亚基的结构基因发生突变,使末端产物或其类似物不再与别构中心结合,从而解除反馈抑制,积累末端产物;合,从而
21、解除反馈抑制,积累末端产物;第24页,讲稿共78张,创作于星期日(二)(二)反馈阻遏作用的解除反馈阻遏作用的解除:实质是使:实质是使调节基因或操纵基因调节基因或操纵基因发生突变,使调发生突变,使调节蛋白改变或不发生,调节蛋白不再与末端产物相结合,或结合后的复合物不能同操节蛋白改变或不发生,调节蛋白不再与末端产物相结合,或结合后的复合物不能同操纵基因结合,从而解除了末端产物对酶合成的阻遏;纵基因结合,从而解除了末端产物对酶合成的阻遏;(三)(三)遗传障碍遗传障碍:使某:使某酶蛋白结构基因突变酶蛋白结构基因突变,使酶蛋白缺失或酶蛋白的活性,使酶蛋白缺失或酶蛋白的活性中心改变,可以解除末端产物对途径
22、中的第一个酶的反馈抑制,积累中间产物;中心改变,可以解除末端产物对途径中的第一个酶的反馈抑制,积累中间产物;(四)(四)使细胞膜透性增大使细胞膜透性增大:如利用甘油缺陷型或生物素缺陷型或油酸缺陷型,:如利用甘油缺陷型或生物素缺陷型或油酸缺陷型,通过控制甘油或生物素或油酸浓度以控制细胞膜的透性,使通过控制甘油或生物素或油酸浓度以控制细胞膜的透性,使胞内代谢产物外漏,缓解胞内代谢产物外漏,缓解反馈抑制或阻遏作用反馈抑制或阻遏作用。第25页,讲稿共78张,创作于星期日二、人工控制微生物代谢的手段二、人工控制微生物代谢的手段1、代谢缺陷型菌株、代谢缺陷型菌株2、利用抗代谢类似物的突变积累氨基酸、利用抗
23、代谢类似物的突变积累氨基酸3、产物降解酶缺失突变株、产物降解酶缺失突变株4、细胞膜组分的缺失突变、细胞膜组分的缺失突变代谢调节控制育种通过特定突变型的选育,达到改变代谢通路、降代谢调节控制育种通过特定突变型的选育,达到改变代谢通路、降低支路代谢总产物的产生或切断代谢途径及提高细胞膜的透性,使低支路代谢总产物的产生或切断代谢途径及提高细胞膜的透性,使代谢流向目的产物积累方向进行。代谢流向目的产物积累方向进行。第26页,讲稿共78张,创作于星期日1、代谢缺陷型菌株、代谢缺陷型菌株 直线型合成途径中的营养缺陷型突变株,这类菌株不能积累末端直线型合成途径中的营养缺陷型突变株,这类菌株不能积累末端产物,
24、只能积累中间产物;产物,只能积累中间产物;在分支代谢途径中,可利用营养缺陷型来合成某种末端产物。在分支代谢途径中,可利用营养缺陷型来合成某种末端产物。第27页,讲稿共78张,创作于星期日2 2、抗代谢类似物的突变菌株、抗代谢类似物的突变菌株菌体通常需要各种代谢物如维生素、氨基酸等合成菌体需要的成菌体通常需要各种代谢物如维生素、氨基酸等合成菌体需要的成分,如果有分,如果有与代谢物结构相似的物质与代谢物结构相似的物质(即抗代谢物)存在,则可(即抗代谢物)存在,则可能产生两种结果:抗代谢物和代谢物竞争同一个酶,使代谢物不能产生两种结果:抗代谢物和代谢物竞争同一个酶,使代谢物不能进一步合成菌体需要的成
25、分;抗代谢物代替代谢物合成生理上能进一步合成菌体需要的成分;抗代谢物代替代谢物合成生理上无活性的化合物。无活性的化合物。通过诱变筛选出对通过诱变筛选出对抗代谢物相对应的代谢物抗代谢物相对应的代谢物不敏感,因此可以解除不敏感,因此可以解除代谢物的反馈抑制作用。代谢物的反馈抑制作用。第28页,讲稿共78张,创作于星期日Asp Asp-P AsaMetHseThrLysAK1AK2AK3HSDH例:例:黄色短杆菌抗黄色短杆菌抗-氨基氨基-羟基戊酸(羟基戊酸(AHV)菌株能积累)菌株能积累苏氨酸苏氨酸AK1和和HSDH的调节亚基的结构基因突变,不能与苏氨酸的的调节亚基的结构基因突变,不能与苏氨酸的结结
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