酶的命名和分类课件.ppt
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1、关于酶的命名和分类第1页,此课件共120页哦(Biocatalytics)酶的命名和分类酶的作用特性酶促反应动力学酶的抑制剂与与药物分子设计核酸酶和抗体酶寡聚酶、同功酶和固定化酶酶的应用生物催化剂的发现和发展酶活力的测定学习要求第2页,此课件共120页哦学习要求学习要求了解酶的了解酶的命名命名和和分类分类弄清酶的弄清酶的化学本质化学本质掌握理解掌握理解活性中心活性中心、酶活性酶活性、反应初速度反应初速度、比活性比活性、KmKm 最适最适PHPH、最适温度最适温度、酶原酶原、竞争性抑制竞争性抑制弄清弄清影响影响酶促作用的各种酶促作用的各种因素因素掌握掌握酶促作用酶促作用的动力学和结构基础的动力学
2、和结构基础对比酶的几种不同类型的对比酶的几种不同类型的抑制作用抑制作用酶的作用机制与药物分子的设计酶的作用机制与药物分子的设计了解了解核酸酶核酸酶、抗体酶抗体酶的相关知识的相关知识了解了解同功酶同功酶、诱导酶诱导酶、别构酶别构酶、固定化酶固定化酶的本质和应用的本质和应用章首章首第3页,此课件共120页哦5.1 生物催化剂的发现和发展生物催化剂的发现和发展一、生物催化剂的发现1、ferment2、淀粉糖化酶:18333、enzyme 1878年4、1926年,脲酶结晶,提出酶的蛋白质的本质5、1963年,牛胰核糖核酸酶的一级结构 1965年,鸡卵清溶菌酶的三维结构 1969年,人工合成核糖核酸酶
3、第4页,此课件共120页哦二、生物催化剂的发展1、Ribozyme 1982年 2、抗体酶(abzymes)3、生物酶工程4、人工酶5、模拟酶酶的本质?章首章首第5页,此课件共120页哦5.2 酶的命名和分类酶的命名和分类国际系统命名法:1、名称由两部分组成:底物反应名称、名称由两部分组成:底物反应名称 如:如:ATP:己糖磷酸转移酶己糖磷酸转移酶 2、不管酶催化正反应还是逆反应,都用同一名称。、不管酶催化正反应还是逆反应,都用同一名称。如:如:DH2:NAD氧化还原酶氧化还原酶习惯名或常用名:1、根据酶所作用的底物命名、根据酶所作用的底物命名 如:淀粉酶,蛋白酶如:淀粉酶,蛋白酶 2、根据酶
4、所催化的反应命名、根据酶所催化的反应命名 如:转氨酶,脱氢酶如:转氨酶,脱氢酶 3、在底物、反应基础上加上酶的来源或其它特点命名、在底物、反应基础上加上酶的来源或其它特点命名 如:胰蛋白酶、碱性磷酸酶如:胰蛋白酶、碱性磷酸酶 第6页,此课件共120页哦国际系统分类法酶的六大类:1.氧化还原酶类(oxido-reductases)2.转移酶类(transferases)3.水解酶类(hydrolases)4.裂合酶类(lyases)5.异构酶类(isomerases)6.合成酶类(ligases)如:SOD(超氧化物歧化酶)EC1.15.1.1(Enzyme Commission)第7页,此课件
5、共120页哦章首章首第8页,此课件共120页哦5.3 酶的作用特性酶的作用特性酶的催化作用特性与酶的催化特性有关的因素酶的非蛋白组分辅酶和金属离子章首章首第9页,此课件共120页哦酶的催化作用特性(一)酶是自然界中催化活性最高的一类催化剂 比普通催化剂效能高比普通催化剂效能高10107 710101313倍倍Movie.decrease energy第10页,此课件共120页哦(二)酶是具有高度选择性的催化剂(二)酶是具有高度选择性的催化剂反应专一性反应专一性(reaction specificity)只催化一种或一类反应,几乎不产生副反应底物专一性底物专一性(substrate specif
6、icity)(1)(1)结构专一性结构专一性(structure specificity)如:脲酶:只催化水解尿素 (2)(2)立体专一性立体专一性(stereo specificity)手性底物,如:淀粉酶只水解D葡萄糖形成的1,4-糖苷键(3)(3)几何专一性几何专一性(geometric specificity)只催化某种几何异构体底物的反应酶的催化作用特性返回第11页,此课件共120页哦酶的催化作用特性(三)酶促反应遵循米氏动力学方程第12页,此课件共120页哦1 酶分子的结构2 酶与底物分子之间的相互作用3 酶与底物分子之间的定向效应4 酶与反应过渡态的结合作用5 酶与底物的手性选择
7、性结合作用与酶催化特性有关的因素返回第13页,此课件共120页哦(一)酶分子的结构酶的活性中心酶的活性中心结合部位结合部位:专一性:专一性空间形状和氨基酸残基组成上,利于酶底物复合物的形成。催化部位催化部位:高效性:高效性 与结合部位重叠或非常靠近;含有多种具有活性侧链的氨基酸残基;有的含有辅酶或金属离子;激活底物或降低过渡态活化能。Movie.ES complex第14页,此课件共120页哦第15页,此课件共120页哦酶分子的结构必需基团:与酶的催化活性有关:与酶的催化活性有关活性中心的必需基团:与底物结合活性中心的必需基团:与底物结合非活性中心的必需基团:具有空间非活性中心的必需基团:具有
8、空间 支撑或结构支撑或结构维持作用维持作用非必需基团:与酶的其它活性有关,如识别、:与酶的其它活性有关,如识别、定位、免疫等定位、免疫等Movie.enzyme reaction1第16页,此课件共120页哦第17页,此课件共120页哦返回第18页,此课件共120页哦(二)酶与底物分子相互作用酶底物中间复合物(enzyme-substrate complex)E+S ES E+PMovie.Enzyme reaction2返回第19页,此课件共120页哦1、静电引力、静电引力2、氢键、氢键3、疏水键相互作用:活性中心是相对的疏水环境、疏水键相互作用:活性中心是相对的疏水环境酶底物结合力第20页
9、,此课件共120页哦(三)酶与底物的定向效应底物分子结合到酶的活性中心:1)底物在酶活性中心的有效浓度大大增加底物在酶活性中心的有效浓度大大增加2)活性中心的立体构型和相关基团的诱导和定向活性中心的立体构型和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定位并被严格定位3)是酶促反应具有高效率和专一性的原因是酶促反应具有高效率和专一性的原因返回第21页,此课件共120页哦(四)酶与反应过渡状态的结合作用酶与反应过渡状态的亲和力远大于酶与底酶与反应过渡状态的亲和力远大于酶与底物或产物的亲和能力物或产物的亲和能力Movie.ES P
10、 curve返回第22页,此课件共120页哦(五)酶与底物的手性选择结合作用不对称催化不对称催化作用作用大多数天然产物都具有大多数天然产物都具有旋光性旋光性酶分子的活性中心部位,含有多个具有催酶分子的活性中心部位,含有多个具有催化活性的化活性的手性中心手性中心,对底物分子起诱导和,对底物分子起诱导和定向作用,使反应按单一的方向进行。定向作用,使反应按单一的方向进行。第23页,此课件共120页哦第24页,此课件共120页哦返回第25页,此课件共120页哦三、酶的非蛋白组分 辅酶和金属离子返回第26页,此课件共120页哦(一)辅酶和辅基1、辅酶和辅基的区别 与酶蛋白结合的强弱与酶蛋白结合的强弱透析
11、透析2、辅酶和辅基的功能 本质:小分子有机化合物本质:小分子有机化合物 具有氧化还原性或转移基团的能力具有氧化还原性或转移基团的能力3、辅酶和辅基的作用特点 直接参与反应直接参与反应“第二底物第二底物”全酶中的辅酶决定全酶中的辅酶决定酶反应专一性酶反应专一性同一辅酶或辅基可以和同一辅酶或辅基可以和多种不同的酶蛋白结合形成不同的全酶。多种不同的酶蛋白结合形成不同的全酶。全酶中的酶蛋白决定全酶中的酶蛋白决定底物专一性底物专一性第27页,此课件共120页哦4、辅酶和维生素大多数辅酶或辅基的前体是维生素,主要是水溶性大多数辅酶或辅基的前体是维生素,主要是水溶性B族维族维生素。生素。(一)辅酶和辅基第2
12、8页,此课件共120页哦返回第29页,此课件共120页哦(二)酶分子中的金属离子金属酶金属酶(mentalloenzymes),如,如SOD1)酶蛋白与金属离子结合紧密酶蛋白与金属离子结合紧密2)过渡金属离子:)过渡金属离子:如如Fe2+/Fe3+,Cu2+/Cu+,Zn2+,Mn2+等等3)通过配位健与氨基酸残基侧链基团相连)通过配位健与氨基酸残基侧链基团相连 或作为酶的辅助因子或作为酶的辅助因子金属激活酶金属激活酶(metal-actived enzymes)1)结合较松散)结合较松散2)碱金属离子或碱土金属离子,如)碱金属离子或碱土金属离子,如K+,Na+,Mg2+,Ca2+等等返回第3
13、0页,此课件共120页哦什么是酶促反应动力学?米氏方程米氏方程的推导影响酶促反应的因素5.4 酶促反应动力学酶促反应动力学章首章首第31页,此课件共120页哦酶促反应动力学酶促反应动力学 研究酶促反应的速度以及各种因素对反应速度的影响,其中酶与底物之间的作用问题是研究酶促反应的核心问题。返回第32页,此课件共120页哦酶促反应动力学酶促反应动力学米氏方程(Michaelis Menten 方程)Km的意义?的意义?返回第33页,此课件共120页哦米氏方程的推导酶促反应历程Movie.equation1ES降解速率Movie.equation2反应平衡时Movie.equation3米氏方程Mo
14、vie.equation4米氏曲线Movie.double-curveES形成速率Movie.ES k1返回第34页,此课件共120页哦影响酶作用的因素(1)温度对酶作用的影响(2)pH对酶作用的影响(3)酶浓度对酶作用的影响(4)激活剂对酶作用的影响(5)抑制剂对酶作用的影响返回第35页,此课件共120页哦1)温度对酶作用的影响酶的最适温度(酶的最适温度(optimum temperature,Tm)在在一一定定范范围围内内,反反应应速速度度达达到到最最大大时时的的温温度度称称为为酶酶的的最最适适温温度度(optimum temperature,Tm)。)。最适温度不是酶的特征物理常数。最适
15、温度不是酶的特征物理常数。返回第36页,此课件共120页哦2)pH对酶作用的影响 pH对对酶酶促促反反应应速速度度的的影影响响,主主要要有有下下列原因:列原因:1 影响酶和底物的解离影响酶和底物的解离2 影响酶分子的构象影响酶分子的构象第37页,此课件共120页哦第38页,此课件共120页哦返回第39页,此课件共120页哦3)酶浓度对酶作用的影响返回第40页,此课件共120页哦4)激活剂对酶作用的影响凡凡能能提提高高酶酶的的活活性性,加加速速酶酶促促反反应应进进行行的的物物质都称为激活剂或活化剂质都称为激活剂或活化剂(activator)。一一般般认认为为,激激活活剂剂的的作作用用主主要要有有
16、以以下下几几个个方方面:面:1解除抑制剂的抑制作用解除抑制剂的抑制作用 2辅辅酶酶和和辅辅基基是是构构成成某某些些有有活活性性的的全全酶酶的的必必要要组组成成成成份份3无机离子激活许多酶类无机离子激活许多酶类返回第41页,此课件共120页哦4.5 酶的抑制剂与药物分子设计酶的抑制剂与药物分子设计返回酶的作用机理movie第42页,此课件共120页哦什么是抑制剂?抑制剂的作用机理?抑制剂的分类及特点?抑制剂的作用机理与药物分子设计第43页,此课件共120页哦抑制剂定义能够降低酶的活性,使酶促反应速度减慢的物质。第44页,此课件共120页哦抑制剂作用机理1.底物类似物活性中心结合2.非底物类似物不
17、与活性部位结合,但和酶活性部位以外的必需基团结合,从而影响酶促反应过程。第45页,此课件共120页哦抑制作用分类抑制作用分类:根据抑制剂与酶作用方式的不同根据抑制剂与酶作用方式的不同不可逆抑制不可逆抑制可逆抑制可逆抑制第46页,此课件共120页哦不可逆抑制(irreversible inhibition)v概念:抑制剂与酶活性中心必需基团以共价键结合,阻碍了底物的结合或破坏了酶的催化基团,不能用透析或超滤等方法去除抑制剂。v结合部位:活性中心必需基团v结合方式:共价键v分类:根据抑制剂对酶选择性的方式非专一性不可逆抑制专一性不可逆抑制第47页,此课件共120页哦非专一性不可逆抑制概念:一种抑制
18、剂可作用于酶分子上的不同基团或作用于几种不同的酶例如:烷化剂类:碘乙酸 酰化剂类:酸酐、磺酰氯第48页,此课件共120页哦专一性不可逆抑制qKs型:一种抑制剂只作用于酶分子中一种氨基酸侧链基团,该氨基酸残基属于酶的必需基团。如:有机汞:专一作用于巯基如:有机汞:专一作用于巯基 有机磷农药:专一作用于丝氨酸羟基有机磷农药:专一作用于丝氨酸羟基 如如乐果、敌百虫乐果、敌百虫等等qKcat型:结构及作用特点:抑制剂为底物的类似物,但其结构中潜藏着一种化学活性基团,抑制剂为底物的类似物,但其结构中潜藏着一种化学活性基团,在酶的作用下,潜在的化学活性基团被激活,与酶的活性中心在酶的作用下,潜在的化学活性
19、基团被激活,与酶的活性中心发生共价结合,不能再分解,酶因此失活。发生共价结合,不能再分解,酶因此失活。第49页,此课件共120页哦用自杀性底物对付抗青霉素的菌株v青霉素分子青霉素分子v耐药性产生的原因耐药性产生的原因v解决耐药性的方法解决耐药性的方法第50页,此课件共120页哦青霉素分子青霉素分子诱导酶,耐药性内酰胺环与内酰胺环与噻唑环融合噻唑环融合第51页,此课件共120页哦对青霉素酶具有抑制作用的青霉素产品lclavulanic acid本身没有显著的抗菌活性,但它对青霉素酶来说,因此,将clavulanic acid与对青霉素酶敏感的青霉素可以组合成新的青霉素制剂。现在这种类型的青霉素产
20、品己经被广泛应用。第52页,此课件共120页哦lcefoxitincefoxitin,先先锋锋霉霉素素(或或称称为为头头抱抱菌菌素素)类类抗抗生生素素,其结构为其结构为:由链霉菌产生,稳定性好的原因主由链霉菌产生,稳定性好的原因主要是其分子中要是其分子中-内酰胺环上连接的内酰胺环上连接的噻唑侧链基团和甲氧基的空间位阻噻唑侧链基团和甲氧基的空间位阻作用,影响了与青霉素酶的结合。作用,影响了与青霉素酶的结合。对青霉素酶不敏感的青霉素新品种对青霉素酶不敏感的青霉素新品种第53页,此课件共120页哦可逆抑制(reversible inhibition)reversible inhibition)rev
21、ersible inhibition)reversible inhibition)v概念:抑制剂与酶蛋白以非共价键结合,具有可逆性,可用透析、过滤等方法将抑制剂除去。v结合部位:活性中心,非活性中心v结合方式:非共价键v分类:第54页,此课件共120页哦可逆抑制的分类抑制剂与底物是否竞争与酶的结合1.竞争性抑制(Competitive inhibition)2.非竞争性抑制(uncompetitive inhibition)3.反竞争性抑制(anticompetitive inhibition)第55页,此课件共120页哦1.竞争性抑制(Competitive inhibition)概念:抑制
22、剂的化学结构与底物相似,与底物竞争性的与酶的活性中心结合。第56页,此课件共120页哦第57页,此课件共120页哦概念:酶可以同时与底物及抑制剂结合,两者没有竞争作用。2.2.非竞争性抑制非竞争性抑制(noncompetitive inhibition)第58页,此课件共120页哦第59页,此课件共120页哦3.3.反竞争性抑制反竞争性抑制 (anticompetitive inhibition)(anticompetitive inhibition)(anticompetitive inhibition)(anticompetitive inhibition)概念:抑制剂能与酶与底物的复合物
23、ES结合,不再分 解,从而降低形成产物的数量。第60页,此课件共120页哦第61页,此课件共120页哦Vmax减小,减小,Km不变不变第62页,此课件共120页哦磺胺类药物l显效结构对氨基苯磺酰胺l与对氨基苯甲酸产生竞争性拮抗节首 第63页,此课件共120页哦结构类似物结构类似物l对氨基苯磺酰胺l对氨基苯甲酸(PABA)节首 第64页,此课件共120页哦与与PABAPABA产生竞争性拮抗产生竞争性拮抗竞争酶表面返回 FH2 L-Glu+对氨基苯甲酸喋啶FH2 合成酶-FH4 FH2 还原酶安全:人体可从食物获取FH2,而微生物不能从外界环境获得,故磺胺类药物对人体无害。抗菌谱广:凡需自身合成F
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