外源基因的表达课件.ppt
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1、外源基因的表达现在学习的是第1页,共77页遗传信息从遗传信息从DNA到蛋白质的传递到蛋白质的传递过程过程中心法中心法则(则(central dogma)。)。基因表达:基因表达:现在学习的是第2页,共77页 克隆基因的表达:克隆基因的表达:外源基因在宿主细胞中表达。外源基因在宿主细胞中表达。外源基因外源基因表达载体表达载体重组载体重组载体导入宿主细胞导入宿主细胞在宿主细胞中在宿主细胞中 表达出蛋白质表达出蛋白质提取蛋白提取蛋白宿主细胞:宿主细胞:原核细胞或真核细胞。原核细胞或真核细胞。现在学习的是第3页,共77页 最佳的基因表达体系最佳的基因表达体系最佳的基因表达体系最佳的基因表达体系:目的基
2、因的表达产量高、表达产物稳定、目的基因的表达产量高、表达产物稳定、目的基因的表达产量高、表达产物稳定、目的基因的表达产量高、表达产物稳定、生物活性高和表达产物容易分离纯化。生物活性高和表达产物容易分离纯化。生物活性高和表达产物容易分离纯化。生物活性高和表达产物容易分离纯化。现在学习的是第4页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制2 基因表达的调控元件基因表达的调控元件3 外源基因表达系统外源基因表达系统4 基因表达产物的检测和分离纯化基因表达产物的检测和分离纯化第六章第六章第六章第六章 外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达现在学习的是第5页,共77页1 基因表达的机制基
3、因表达的机制1.1 外源基因的起始转录外源基因的起始转录1.2 mRNA的延伸和稳定性的延伸和稳定性1.3 外源基因外源基因mRNA的有效翻译的有效翻译1.4 表达蛋白在细胞中的稳定性表达蛋白在细胞中的稳定性1.5 目的基因沉默目的基因沉默现在学习的是第6页,共77页1.1 外源基因的外源基因的起始转录起始转录 外源基因在宿主细胞中有效表达是基因工程的外源基因在宿主细胞中有效表达是基因工程的核心问题核心问题外源基因的起始转录是基因表达的外源基因的起始转录是基因表达的关键步骤关键步骤。转录起始的速率是基因表达的转录起始的速率是基因表达的限速步骤限速步骤。选择可调控的启动子和相关的调控序列,是构建
4、一个表达系统首先选择可调控的启动子和相关的调控序列,是构建一个表达系统首先要考虑的问题。要考虑的问题。现在学习的是第7页,共77页原核生物启原核生物启动子动子诱导型启动子:诱导型启动子:组成型启动子:组成型启动子:如如lac、trp、PR、PL、tac等的启动子等的启动子如如T7噬菌体的启动噬菌体的启动子子真核生物启动子也可分为诱导型和组成型等类型。真核生物启动子也可分为诱导型和组成型等类型。现在学习的是第8页,共77页1.2 mRNA的延伸与稳定的延伸与稳定外源基因起始转录后,保持外源基因起始转录后,保持mRNA的有效延伸、终止及稳定存的有效延伸、终止及稳定存在是在是外源基因有效表达的关键外
5、源基因有效表达的关键。一方面,要防止因转录物内的衰减和非特异性终止而诱发的一方面,要防止因转录物内的衰减和非特异性终止而诱发的mRNA转录提前终止的现象;转录提前终止的现象;另一方面,又要存在正常的转录终止序列以防止产生不必要的另一方面,又要存在正常的转录终止序列以防止产生不必要的转录产物,使转录产物,使mRNA的长度限制在一定的范围内,从而增加外源基的长度限制在一定的范围内,从而增加外源基因表达的稳定性。因表达的稳定性。现在学习的是第9页,共77页 mRNA的稳定性直接决定翻译产物的多少。的稳定性直接决定翻译产物的多少。n对对原核细胞原核细胞来说,最佳的方法是选择一个来说,最佳的方法是选择一
6、个RNase缺缺失的受体菌。失的受体菌。n真核细胞真核细胞来说,则需要考虑增加来说,则需要考虑增加mRNA的正确加的正确加工,提高成熟工,提高成熟mRNA的稳定性。的稳定性。现在学习的是第10页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制1.1 外源基因的起始转录外源基因的起始转录1.2 mRNA的延伸和稳定性的延伸和稳定性1.3 外源基因外源基因mRNA的有效翻译的有效翻译1.4 表达蛋白在细胞中的稳定性表达蛋白在细胞中的稳定性1.5 目的基因沉默目的基因沉默现在学习的是第11页,共77页1.3 外源基因外源基因mRNA的有效翻译的有效翻译外源基因外源基因mRNA有效翻译必须考虑的基本原则:有
7、效翻译必须考虑的基本原则:AUG(ATG)是首选的起始密码子。是首选的起始密码子。SD序列为与核糖体序列为与核糖体16S rRNA互补结合的位点,该序列至少互补结合的位点,该序列至少含有含有AGGAGG序列中的序列中的4个碱基。个碱基。SD序列与翻译起始密码子之间的距离为序列与翻译起始密码子之间的距离为39个碱基。个碱基。在翻译起始区周围序列不易形成明显的二级结构。在翻译起始区周围序列不易形成明显的二级结构。真核细胞真核细胞mRNA的的5非翻译区含有共同的序列非翻译区含有共同的序列5-CCA(G)CCATGG-3。现在学习的是第12页,共77页不同基因组使用密码子具有选择性。不同基因组使用密码
8、子具有选择性。主密码子(主密码子(major codon)稀有密码子(稀有密码子(rare codon)如果外源基因如果外源基因mRNA的主密码子与受体细胞基因的主密码子与受体细胞基因组的主密码子相同或接近,则该基因表达的效率就高;组的主密码子相同或接近,则该基因表达的效率就高;反之,若外源基因含有较多的稀有密码子,其反之,若外源基因含有较多的稀有密码子,其表达效率就低。表达效率就低。现在学习的是第13页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制1.1 外源基因的起始转录外源基因的起始转录1.2 mRNA的延伸和稳定性的延伸和稳定性1.3 外源基因外源基因mRNA的有效翻译的有效翻译1.4 表
9、达蛋白在细胞中的稳定性表达蛋白在细胞中的稳定性1.5 目的基因沉默目的基因沉默现在学习的是第14页,共77页1.4 表达蛋白在细胞中的稳定性表达蛋白在细胞中的稳定性 外源基因的表达产物能否在宿主细外源基因的表达产物能否在宿主细胞中稳定积累而不被内源蛋白水解酶所水胞中稳定积累而不被内源蛋白水解酶所水解是基因有效表达的一个重要因素。解是基因有效表达的一个重要因素。(1)构建融合蛋白表达系统。)构建融合蛋白表达系统。(2)构建分泌蛋白表达系统。构建分泌蛋白表达系统。(3)构建包涵体表达系统。)构建包涵体表达系统。(4)选择蛋白水解酶基因缺陷型的受体系统)选择蛋白水解酶基因缺陷型的受体系统。现在学习的
10、是第15页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制1.1 外源基因的起始转录外源基因的起始转录1.2 mRNA的延伸和稳定性的延伸和稳定性1.3 外源基外源基mRNA的有效翻译的有效翻译1.4 表达蛋白在细胞中的稳定性表达蛋白在细胞中的稳定性1.5 目的基因沉默目的基因沉默现在学习的是第16页,共77页1.5 目的基因沉默目的基因沉默基因沉默的作基因沉默的作用机制用机制位置效应的基因沉默:位置效应的基因沉默:转录水平的基因沉默:转录水平的基因沉默:转录后水平的基因沉默:转录后水平的基因沉默:基因沉默(基因沉默(gene silencing)是导致外源基因不能正常表是导致外源基因不能正常表达的
11、重要因素。达的重要因素。现在学习的是第17页,共77页n共抑制(共抑制(cosuppression)是转录后水平的基因沉默是转录后水平的基因沉默的一种,指被整合的外源基因沉默的同时,与其的一种,指被整合的外源基因沉默的同时,与其同源的内源同源的内源DNA的表达也受到抑制。的表达也受到抑制。现在学习的是第18页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制2 基因表达的调控元件基因表达的调控元件3 外源基因表达系统外源基因表达系统4 基因表达产物的检测和分离纯化基因表达产物的检测和分离纯化第六章第六章第六章第六章 外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达现在学习的是第19页,共77页
12、2 基因表达的调控元件基因表达的调控元件2.1 启动子启动子2.2 增强子增强子2.3 终止子终止子2.4 衰减子衰减子2.5 绝缘子绝缘子2.6 反义子反义子现在学习的是第20页,共77页2.1 启动子启动子启动子(启动子(promoter):):是一段提供是一段提供RNA聚合酶识别和结合的聚合酶识别和结合的DNA序列,它位于基因的上游。序列,它位于基因的上游。RNA聚合酶正是通过与它的聚合酶正是通过与它的结合而启动基因的转录。结合而启动基因的转录。*启动子的特征启动子的特征序列特异性序列特异性方向性方向性位置特性位置特性种属特异性种属特异性现在学习的是第21页,共77页TTGACATATA
13、AT转录起始点转录起始点53-35-1016-19 bp5-9 bpT80A95T45A60A50T96T82T84G78A65C54A45原核生物的Promoter现在学习的是第22页,共77页RNA pol IITFIIDTAFs TBP Pol III 启启 动动 子子 TFIIIB TFIIIC TBP RNA pol III Pol I 启启 动动 子子 RNA pol I SL1 UBF1 TBP Pol II 启启 动动 子子 转录起始点转录起始点 TATA 现在学习的是第23页,共77页2 基因表达的调控元件基因表达的调控元件2.1 启动子启动子2.2 增强子增强子2.3 终止
14、子终止子2.4 衰减子衰减子2.5 绝缘子绝缘子2.6 反义子反义子现在学习的是第24页,共77页 2.2 增强子增强子增强子(增强子(enhancer):是能够增强启动子转录活性的:是能够增强启动子转录活性的DNA顺式顺式作用序列,又称作用序列,又称强化子强化子。v增强子的特性:增强子的特性:双向性。双向性。重复序列。重复序列。增强子行使功能与所处的位置无关。增强子行使功能与所处的位置无关。特异性。特异性。增强子不仅与同源基因相连时有调控功能,与异源基因相增强子不仅与同源基因相连时有调控功能,与异源基因相连时也有功能。连时也有功能。现在学习的是第25页,共77页2 基因表达的调控元件基因表达
15、的调控元件2.1 启动子启动子2.2 增强子增强子2.3 终止子终止子2.4 衰减子衰减子2.5 绝缘子绝缘子2.6 反义子反义子现在学习的是第26页,共77页2.3 终止子终止子本征终止子:本征终止子:不需要其他蛋白辅助因子便可在特殊的不需要其他蛋白辅助因子便可在特殊的RNA结结构区内实现终止作用。构区内实现终止作用。依赖终止信号的终止子:依赖终止信号的终止子:要依赖专一的蛋白质辅助因子。要依赖专一的蛋白质辅助因子。现在学习的是第27页,共77页2.4 衰减子衰减子 衰减子(衰减子(attenuator)是位于是位于mRNA分子前导序列中的一段控分子前导序列中的一段控制蛋白质合成起始速率的调
16、节区,亦即发生弱化作用的转制蛋白质合成起始速率的调节区,亦即发生弱化作用的转录终止信号序列,又称录终止信号序列,又称弱化子弱化子。现在学习的是第28页,共77页弱化子弱化子现在学习的是第29页,共77页色氨酸浓度高时色氨酸浓度高时色氨酸浓度低时色氨酸浓度低时现在学习的是第30页,共77页2.5 绝缘子绝缘子绝缘子(绝缘子(insulator):):既是基因表达的调控元件,也是一种边界元件;既是基因表达的调控元件,也是一种边界元件;它能阻止邻近的调控元件对其所界定基因的启动子起增强或抑制作用;它能阻止邻近的调控元件对其所界定基因的启动子起增强或抑制作用;现在学习的是第31页,共77页 2.6 反
17、义子反义子反义反义RNA(antisence RNA):同某种天然:同某种天然mRNA反向互补的反向互补的RNA分子称分子称为反义为反义RNA。反义子反义子:编码反义:编码反义RNA的的DNA称为反义子。称为反义子。反义子在反义子在DNA的的复制、转录和翻译复制、转录和翻译三个水平对基因的表达起调节作三个水平对基因的表达起调节作用,其中以对蛋白质合成的抑制最为普遍。用,其中以对蛋白质合成的抑制最为普遍。现在学习的是第32页,共77页n反义反义RNA作为作为调节物调节物调节物调节物质质质质的作用机制:的作用机制:与与mRNA上核糖体结上核糖体结合位点结合,使得翻合位点结合,使得翻译不能起始;译不
18、能起始;与与mRNA形成双螺形成双螺旋结构,作为内切酶旋结构,作为内切酶底物;底物;与转录产物结合,与转录产物结合,使转录提前终止使转录提前终止。现在学习的是第33页,共77页1 基因表达的机制基因表达的机制2 基因表达的调控元件基因表达的调控元件3 外源基因表达系统外源基因表达系统4 基因表达产物的检测和分离纯化基因表达产物的检测和分离纯化第六章第六章第六章第六章 外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达外源基因的表达现在学习的是第34页,共77页 3 外源基因表达系统外源基因表达系统外源基因表达系统:外源基因表达系统:泛指目的基因与表达载体重组后,导入合泛指目的基因与表达载体重组后,导入
19、合适的受体细胞,并能在其中有效表达,产生目的基因产物(目适的受体细胞,并能在其中有效表达,产生目的基因产物(目的蛋白)。的蛋白)。外源基因表达系统外源基因表达系统基因表达载体基因表达载体受体细胞受体细胞基因表达系统基因表达系统原核生物基因表达系统:原核生物基因表达系统:如大肠杆菌表达系如大肠杆菌表达系统、芽孢杆菌表达系统、链霉菌表达系统、统、芽孢杆菌表达系统、链霉菌表达系统、蓝藻表达系统等。蓝藻表达系统等。真核生物基因表达系统:真核生物基因表达系统:如酵母表达系统、植如酵母表达系统、植物细胞表达系统、昆虫细胞表达系统、哺乳动物物细胞表达系统、昆虫细胞表达系统、哺乳动物细胞表达系统等。细胞表达系
20、统等。现在学习的是第35页,共77页 3.1 大肠杆菌基因表达系统大肠杆菌基因表达系统大肠杆菌大肠杆菌革兰氏阴性细菌;革兰氏阴性细菌;目前应目前应用最广泛的基因表达系统。用最广泛的基因表达系统。v大肠杆菌表达系统的优越性:大肠杆菌表达系统的优越性:掌握了大肠杆菌基础生物学、遗传学以及分子生物学等方面的背景知识,掌握了大肠杆菌基础生物学、遗传学以及分子生物学等方面的背景知识,特别是对其基因表达调控的分子机理有深刻了解;特别是对其基因表达调控的分子机理有深刻了解;大肠杆菌已被发展成为一种安全的基因工程实验体系,拥有各类大肠杆菌已被发展成为一种安全的基因工程实验体系,拥有各类适用的寄主菌株和不同类型
21、的载体系列;适用的寄主菌株和不同类型的载体系列;实验已经证明,许多克隆的真核基因,都可以在大肠杆菌细胞中实现有效实验已经证明,许多克隆的真核基因,都可以在大肠杆菌细胞中实现有效的、高水平的表达;的、高水平的表达;大肠杆菌培养方便、操作简单、成本低廉,易于进行工业化批量生大肠杆菌培养方便、操作简单、成本低廉,易于进行工业化批量生产。产。现在学习的是第36页,共77页3.1.1 大肠杆菌基因表达载体大肠杆菌基因表达载体3.1.2 宿主菌宿主菌3.1.3 常见的大肠杆菌表达系统常见的大肠杆菌表达系统3.1.4 外源基因在大肠杆菌表达的形式外源基因在大肠杆菌表达的形式3.1.5 外源基因的高效表达策略
22、外源基因的高效表达策略现在学习的是第37页,共77页3.1.1 大肠杆菌基因表达载体大肠杆菌基因表达载体现在学习的是第38页,共77页大肠杆菌基因表达载体可分为大肠杆菌基因表达载体可分为3个系统:个系统:DNA复制及重组载体的选择系统复制及重组载体的选择系统外源目的基因的转录系统外源目的基因的转录系统蛋白质的翻译系统蛋白质的翻译系统现在学习的是第39页,共77页(1)DNA复制及重组载体的选择系统复制及重组载体的选择系统 复制子复制子常见的复常见的复制子制子pMB1、p15A、ColE1:松弛复制型松弛复制型,每细胞质,每细胞质粒拷贝数粒拷贝数1020个。个。pSC101:严谨复制型严谨复制型
23、,每细胞质粒拷贝数少于,每细胞质粒拷贝数少于5个。个。现在学习的是第40页,共77页选择标记选择标记绝大多数的质粒载体都是使用绝大多数的质粒载体都是使用抗菌素抗性记号抗菌素抗性记号,多为,多为氨苄青氨苄青霉素抗性霉素抗性、四环素抗性四环素抗性、链霉素抗性链霉素抗性、氯霉素抗性氯霉素抗性以及以及卡那霉素卡那霉素抗性抗性等。等。原因:原因:许多质粒本身带有抗菌素抗性基因的抗药性许多质粒本身带有抗菌素抗性基因的抗药性R因子;因子;抗菌素抗性记号具有便于操作、易于选择等优点。抗菌素抗性记号具有便于操作、易于选择等优点。现在学习的是第41页,共77页大肠杆菌基因表达载体的大肠杆菌基因表达载体的3个系统:
24、个系统:DNA复制及重组载体的选择系统复制及重组载体的选择系统外源目的基因的转录系统外源目的基因的转录系统蛋白质的翻译系统蛋白质的翻译系统现在学习的是第42页,共77页(2)外源目的基因的转录系统)外源目的基因的转录系统包括包括启动子启动子 和和转录终止子转录终止子。启动子和终止子因宿主的不同而有差别,在不同的宿主中表达效启动子和终止子因宿主的不同而有差别,在不同的宿主中表达效率也不一样,特别是原核生物和真核生物宿主间完全不同,相互间不率也不一样,特别是原核生物和真核生物宿主间完全不同,相互间不能通用。能通用。启动子启动子外源目的基因转录的起始是基因表达的关键步骤。选择可调外源目的基因转录的起
25、始是基因表达的关键步骤。选择可调控的控的强启动子强启动子是构建一个理想的表达系统首先要考虑的问题。是构建一个理想的表达系统首先要考虑的问题。现在学习的是第43页,共77页P tac=3 P trp=11 P lac启动子启动子-35 区序列区序列-10 区序列区序列 P lacT T T A C A T A T A A T P trp T T G A C AT T A A C T P tacT T G A C AT A T A A T P traA T A G A C A T A A T G T P l lLT T G A C A G A T A C T P recAT T G A T A T
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