群体遗传结构变精选PPT.ppt
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1、关于群体遗传结构变关于群体遗传结构变第1页,讲稿共81张,创作于星期二第一节第一节 群体的遗传平衡群体的遗传平衡一一、群体的遗传结构、群体的遗传结构 遗传学群体的概念:是研究一个群体内基因传递情况及其频遗传学群体的概念:是研究一个群体内基因传递情况及其频率改变的科学。率改变的科学。群体群体:是各个体间能互配是各个体间能互配(相互交配关系相互交配关系)的集合体的集合体.第2页,讲稿共81张,创作于星期二 群体中个体间互配可使孟德尔遗传因子代代相传遗传学上称为“孟德尔群体”或“基因库”。同一群体内个体基因组合虽有不同,但群体中所有的基因是一定的基因库指一个群体中所含的基因总数。孟德尔群体孟德尔群体
2、第3页,讲稿共81张,创作于星期二 不同的物种的个体并不具有共同的基因库,也就不可能进行交配,因此,它们分属于不同的群体。交配和基因交流是以有性生殖为前提的,因而群体遗传学研究对象是二倍体且能进行有性生殖的生物,而单倍体的微生物和只能进行无性繁殖的生物群体,通常不属于群体遗传学研究范围。第4页,讲稿共81张,创作于星期二随机交配(randommating):指在一个有性繁殖的生物群体中,任何一对雌雄个体不受任何选配的影响而随机结合,即任何一个雌性或雄性的个体与任何一个异性个体的交配概率相同。自然交配:将雌雄个体混放在一处任其自由交配,这种交配方式实际上是有选配在其中起作用。在群体遗传研究中,随
3、机交配是一个重要原则,随机交配的群体标志着每个个体之间的交配是相互独立的。随机交配随机交配第5页,讲稿共81张,创作于星期二群体的遗群体的遗传结构(geneticstructureofpopulation):指群体中各种基因的频率,以及由不同交配系统带来的各种基因型在数量上的分布。通常用基因频率和基因型频率来描述。群体的遗传结构群体的遗传结构第6页,讲稿共81张,创作于星期二基因频率和基因型频率基因频率和基因型频率 孟德尔的杂交试验之后孟德尔的杂交试验之后 遗传学中遗传学中提出了提出了基因型基因型和表现型的概念。和表现型的概念。基因型基因型是基因的一种组合是基因的一种组合 个体遗传组成。个体遗
4、传组成。表现型表现型指生物个体所表现的性状指生物个体所表现的性状 基因型与基因型与环境影响共同作用的结果。环境影响共同作用的结果。第7页,讲稿共81张,创作于星期二 基因频率(genefrequency):指群体中特定基因座上某个等位基因占该座位全部等位基因总数的百分比。基因型频率(genotypefrequency)是指群体中某个特定的基因型个体占全部个体数的百分比。由于某具体性状的表现型是由个体相应的两个等位基因组成的基因型来决定,因此,群体中某一特定基因的频率可以由基因型频率来推算。基因频率和基因型频率基因频率和基因型频率第8页,讲稿共81张,创作于星期二AAAaaaAaaaAa同一位点
5、同一基因位点基因总数12,A=5,a=7,故p=5/12,q=7/12基因型频率:AA=1/6;Aa=1/2;aa=1/3第9页,讲稿共81张,创作于星期二一个群体内由许多不同基因型的个体所组合。基因型是受精时由父母本基因组成 基因型频率需从F2的表现型比例推算出来,再从F3加以验证。基因型频率 推算出基因频率。等位基因频率 决定群体基因性质的基本因素;环境条件或遗传结构不变 等位基因频率不会改变。第10页,讲稿共81张,创作于星期二例:A1A1A2A2 F1 A1A2 F2 1 A1A1:2 A1A2:1 A2A2PF1F2基因型频率改变,但基因在各代中是复制自己,代代相传而不改变孟德尔群体
6、的基本特征。第11页,讲稿共81张,创作于星期二在随机交配群体中,假定某基因座位上有两个等位基因A1和A2,基因频率分别为p和q;它们在群体中组成三种基因型A1A1、A1A2和A2A2,个体数分别为n1、n2、n3,且n1+n2+n3=N。基因型频率用D、H、R表示。如果群体基因型A1A1、A1A2和A2A2的频率分别满足D=p2、H=2pq、R=q2,则该群体为遗传平衡群体,不随世代变化。从基因型频率求基因频率从基因型频率求基因频率第12页,讲稿共81张,创作于星期二二倍体生物各基因型由两个等位基因组成。如A1A1、A1A2、A2A2,A1基因有2n1+n2,A2基因有n2+2n3。第13页
7、,讲稿共81张,创作于星期二表111基因型频率和基因频率基因型总和基因总和A1A1A1A2A2A2A1A2个体数n1n2n3N2n1+n2n2+2n32N频率n1/Nn2/Nn3/N1(2n1+n2)/2N(n2+2n3)/2N1符号表示DHRpq平衡关系D=p2H=2pqR=q2p=D+1/2Hq=R+1/2H第14页,讲稿共81张,创作于星期二例例 据研究据研究,挪威云杉幼苗颜色的遗传受一对等位基因控制挪威云杉幼苗颜色的遗传受一对等位基因控制,并属不完并属不完全显性遗传全显性遗传AA绿色,绿色,Aa黄色,黄色,aa白色。因此,根据其幼苗白色。因此,根据其幼苗颜色的表现就可以识别其基因型。今
8、设某一云杉幼苗群体共有颜色的表现就可以识别其基因型。今设某一云杉幼苗群体共有10000株,其中绿苗株,其中绿苗3000株,黄苗株,黄苗5000株,白苗株,白苗2000株,求其基因株,求其基因型频率和基因频率。型频率和基因频率。解:解:D=3000/10000=0.3 H=5000/10000=0.5 R=2000/10000=0.2 p=D+1/2H=0.3+0.25=0.55 q=R+1/2H=0.2+0.25=0.45第15页,讲稿共81张,创作于星期二二、遗传平衡定律(哈迪温伯格定律)在一个完全随机交配的群体内,如果没有其它因素(如突变、选择、迁移等),则基因频率和基因型频率可以保持一定
9、,各代不变。这一现象由德国医生温伯格(WeinbergW.)和英国数学家哈迪(HardyG.H.)在1908年分别发现,称为哈迪温伯格定律定律(HardyWeinberglaw)。第16页,讲稿共81张,创作于星期二遗传平衡定律的内容在一个大的随机交配群体内,如果没有突变、选择和迁移因素的干扰,则基因频率和基因型频率在世代间保持不变,即群体处于平衡状态。在任何一个大的群体内,不论基因型频率如何,是否处于平衡状态,只要经过一代随机交配,一对常染色体上的基因频率和基因型频率就可达到平衡,以后每代经过随机交配,这种平衡始终保持不变。在平衡状态下,基因型频率与基因频率的关系是:D=p2,H=2pq,R
10、=q2。第17页,讲稿共81张,创作于星期二遗传平衡定律的证明遗传平衡定律的证明假定在一个群体内假定在一个群体内(0世代世代)存在两个等位基因存在两个等位基因A1和和A2,其频,其频率分别是率分别是p0和和q0。经随机交配,根据群体的基因型频率与基因频率的关系,经随机交配,根据群体的基因型频率与基因频率的关系,可计算出可计算出1世代的基因型频率和基因频率:世代的基因型频率和基因频率:D1=P0(A1)P0(A1)=p02,R1=P0(A2)P0(A2)=q02,H1=P0(A1)P0(A2)=2p0q0三种基因型产生配子频率为:三种基因型产生配子频率为:p1=D1+H1/2=p02+2p0q0
11、/2=p02+p0q0=p0(p0+q0)=p0 q1=R1+H1/2=q02+p0q0=q0第18页,讲稿共81张,创作于星期二再经一代随机交配,可计算出2世代的基因型频率和基因频率:D2=P1(A1)P1(A1)=p02,R2=P1(A2)P1(A2)=q02,H2=P1(A1)P1(A2)=2p0q0p2=D2+H2/2=p02+2p0q0/2=p02+p0q0=p0(p0+q0)=p0 q2=R2+H2/2=q02+p0q0=q0显然,以后各世代A1的基因频率仍然是p0,A2的基因频率仍然是q0,与0世代相同。即p1=p2=pn=.p0;q1=q2=.qn=q0因此,亲代群体在随机交配
12、的条件下,只要没有其它影响基因频率的因素干扰,群体的基因频率在所有世代都保持恒定。第19页,讲稿共81张,创作于星期二平衡状态时基因频率计算平衡状态时基因频率计算无显性或显性不完全时无显性或显性不完全时,基因型可直接由表型来识别。只要统计不同表,基因型可直接由表型来识别。只要统计不同表型所占的比例,按公式型所占的比例,按公式D=p2、H=2pq、R=q2,即可算出相应的基,即可算出相应的基因频率。因频率。第20页,讲稿共81张,创作于星期二显性完全时,三种基因型中显性基因纯合体与杂合体表现型相同,不能区分出来,但可以通过性状表现型统计,得出其隐性纯合体的比例。如果群体处于平衡状态,隐性纯合体的
13、基因型频率与隐性基因频率的关系为R=q2,于是可计算出各基因频率。第21页,讲稿共81张,创作于星期二例:已知属于常染色体隐性遗传的白化病(aa)在一特定人群的发生频率(q2)为110000,则:致病基因(a)频率(110000)1/2=1/100=0.01;基因A的频率10.01=0.99;而杂合子携带者的频率为2pq=20.990.01=1.98%。第22页,讲稿共81张,创作于星期二复等位基因的平衡当一位座位上有两个等位基因时,如果群体处于平衡状态,基因型频率将是p2、2pq和q2,它等于等位基因频率的平方(p+q)2。假如存在3个等位基因A、B和C,它们的频率分别为p、q、r,在平衡时
14、基因型频率也等于等位基因频率的平方:(p+q+r)2=p2+q2+r2+2qp+2pr+2qr=p2(AA)+q2(BB)+r2(CC)+2pq(AB)+2pr(AC)+2qr(BC)平衡状态下,由基因型频率求基因频率:p=p2+1/2(2pq+2pr)q=q2+1/2(2pq+2qr)r=r2+1/2(2pr+2qr),即某基因频率是该基因纯合体频率与含有该基因的全部杂合体频率一半之和。第23页,讲稿共81张,创作于星期二若有k个复位等位基因A1,A2,Ai,Ak,相应的基因频率为p1,p2,pi,pk。基因频率与基因型频率的关系可表示为:其中,AiAi表示纯合体,共有k种;AiAj表示杂合
15、体,有k(k1)/2种。第24页,讲稿共81张,创作于星期二例:人类ABO血型受单基因控制,该基因座具有3个复等位基因(IA、IB、IO),其中IA和IB是共显性,IA和IB对IO是显性。设p为基因IA的频率、q为基因IB的频率、r为基因IO的频率,p+q+r=1。表112ABO血型的基因型和表现型频率血型ABABO基因型IAIA、IAIOIBIB、IBIOIAIBIOIO表现型频率p2+2prq2+2qr2pqr2实测值0.330.270.100.31第25页,讲稿共81张,创作于星期二基因IO的频率r=(0.31)1/2=0.56A型和O型的频率为PA+O=IAIA+IAIO+IOIO=p
16、2+2pr+r2=(p+r)2则(p+r)=PA+O1/2=(0.33+0.31)1/2=0.80基因IA的频率p=0.80r=0.24基因IB的频率q=1pr=0.20第26页,讲稿共81张,创作于星期二性连锁基因若等位基因是X连锁的,雌性可以是纯合的或杂合的,但雄性只带有单个的X连锁的等位基因。因此,当群体中的X连锁基因分布处于平衡状态时,在雌性中X连锁位基因型频率和常染色体座位是相同的,为p2(xAxA)、2pq(xAxB)和q2(xBxB);而在雄性中的基因型频率则为p(xAy)和q(xBy),与群体中等位基因的频率相同。由于这个原因,隐性X连锁性状的基因频率雄性比雌性高得多。第27页
17、,讲稿共81张,创作于星期二由于雌、雄个体的性染色体组成不同,雌性个体的性连锁基因占群体的2/3,而雄性个体只占1/3。如果雌、雄的伴性基因频率不等,即p(xAxA)p(xAy),q(xBxB)q(xBy),群体达到平衡(相等)状态的时间和方式不同于常染色体基因,此时,遗传平衡并不是由一个任意的群体只经过一个世代的随机交配就可以达到,而是以一种振荡的方式快速接近。第28页,讲稿共81张,创作于星期二在建立平衡的过程中,雌、雄两性群体中的基因频率随着随机交配世代的增加而交互递减。雄、雌性的基因频率的差异在每一代的随机交配中都减少一半,可用下式表示:di=q i(xBxB)q i(xBy)=1/2
18、q i+1(xBxB)q i+1(xBy)=1/2d i+1其中d i-1表示上一代(第i代)的两群体中xiB基因频率的差异,说明上一代中qi(xBxB)qi(xBy),而下一代中,q i+1(xBxB)q(xBy)i+1。如假设雌雄群体某个伴性基因的初始频率分别为1.0和0.5,经过一世代后,雌性群体的伴性基因频率由1.0下降为0.5,而雄性群体则由0上升为1.0;在二世代,雌性群体的伴性基因频率变为0.75,而雄性群体为0.5。伴性基因频率这种上下波动一直持续到真正达到遗传平衡时为止。第29页,讲稿共81张,创作于星期二虽然按性别分开讨论时,基因频率在两性群体中一代代地改变,但雌、雄个体的
19、所有X染色体的混合基因频率是不变的。因为伴性基因仅仅由一个性别到另一性别,并不影响X染色体的总数中的xA、xB的相对频率。一旦雌、雄群体的伴性基因相等,伴性基因频率在随机交配的几代以后达到哈迪-温伯格比例。第30页,讲稿共81张,创作于星期二在计算平衡状态下随机交配群体的伴性基因频率时,利用性染色体异型的性别群体比较简便。对于XY型,先计算雄性群体伴性基因频率,因为雄性个体只有伴性基因的一个拷贝,因而无论是显性还是隐性的,都可以从表型反映出来。对于ZW型,则首先考虑雌性群体。例:美国黑人男人色盲患者为3.9%,即q(xBy)=q(xBxB)=0.039,则预期色盲美国黑人女人的频率q(xBxB
20、)2=(0.039)2=0.0015。第31页,讲稿共81张,创作于星期二遗传平衡定律的意义1.遗传平衡定律揭示了群体等位基因的基因频率和基因型频率的遗传传递规律,同时也揭示了物种保持群体内性状遗传稳定性的原因。2.群体的遗传平衡是有条件的,如施加选择等措施就可以打破这种平衡。第32页,讲稿共81张,创作于星期二例1.一个大豆的群体中,金色、浅绿色和深绿色分别由共显性等位基因CGCG、CGCD和CDCD产生。这个群体的一个样本包括2个金色、36个浅绿色和162深绿色。确定等位基因CG、CD的频率。解:设等位基因CG、CD的频率分别为p、q。P2=2/200=1/100P=0.1q=10.1=0
21、.9第33页,讲稿共81张,创作于星期二2.假定在某植物群体中,基因Q在遗传上是平衡的,如果它的等位基因q以纯合体(qq)出现时占其群体总数的49%,请问Q基因在配子及合子中的比例是多少?解:设Q、q基因的频率分别为p、qq2=49%q=0.7p=1q=10.7=0.3p2+2pq=149%=51%第34页,讲稿共81张,创作于星期二3.在300株的植物群体中,有7株AA、106株Aa、187株aa,A和a的基因频率是多少?如果随机交配,在相同大小的群体中三种基因型植株的数目应是多少?解:设A、a基因的频率分别为p、q;AA、Aa、aa基因型频率分别为D、H和RP=7/300+1/2106/3
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