目的基因表达精选PPT.ppt
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1、关于目的基因表达第1页,讲稿共62张,创作于星期二1.原核生物基因的表达调控原核生物基因的表达调控2.原核生物的主要转录调控方式原核生物的主要转录调控方式3.原核细胞表达体系与表达载体原核细胞表达体系与表达载体4.真核细胞表达体系真核细胞表达体系5.展示表达技术展示表达技术第2页,讲稿共62张,创作于星期二1.原核生物基因的表达调控原核生物基因的表达调控(1 1)染色体)染色体DNADNA特点特点基因结构简洁有效,无多余序列,必须利用少量的基因结构简洁有效,无多余序列,必须利用少量的DNADNA序列充分存储必要的序列充分存储必要的遗传信息(操纵子、重叠基因)遗传信息(操纵子、重叠基因)一个复制
2、起点(一个复制起点(oriori),一个复制终点(),一个复制终点(terter)(2 2)基因表达特点)基因表达特点1 1种种RNARNA聚合酶,多种聚合酶,多种因子,通过调控因子,通过调控因子的表达来调控不同种类基因表达因子的表达来调控不同种类基因表达 E.coli 有有7种种 70(housekeeping),H,E,S,N,F,FecI 转录与翻译同时进行,无转录后加工,翻译后加工方式简单(酶原)转录与翻译同时进行,无转录后加工,翻译后加工方式简单(酶原)启动子的重要保守区启动子的重要保守区-35-35、-16-16、-10-10区等,区等,RBSRBS序列(序列(SDSD序列与起始密
3、码子间隔序列与起始密码子间隔3 39 9个碱基)个碱基)(3 3)基因表达调节特点)基因表达调节特点 调控层次少:酶活调节调控层次少:酶活调节-转录和翻译调节转录和翻译调节-总体调控总体调控 以转录调控为主,简单而快速(以转录调控为主,简单而快速(mRNAmRNA半衰期比蛋白质短,重新合成半衰期比蛋白质短,重新合成RNARNA在能耗在能耗上也比重新合成蛋白质少)上也比重新合成蛋白质少)第3页,讲稿共62张,创作于星期二第4页,讲稿共62张,创作于星期二2.原核生物的主要转录调控方式原核生物的主要转录调控方式主要方式有:诱导、激活、阻遏、弱化、主要方式有:诱导、激活、阻遏、弱化、Riboswit
4、ch调控(核调控(核糖核酸开关)糖核酸开关)(1)诱导)诱导+激活激活 :lac操纵子的表达调控操纵子的表达调控Cell numbersGlucoseLactose葡萄糖葡萄糖 乳糖乳糖二次生长现象二次生长现象:葡萄糖被优先利用,被基本耗尽时,细胞开始合成有关利用乳糖的酶葡萄糖被优先利用,被基本耗尽时,细胞开始合成有关利用乳糖的酶(生长停滞期),将乳糖运入胞内后继续生长。(生长停滞期),将乳糖运入胞内后继续生长。GlucoseLactoseCell numberssugar concentrationCatabolite Repression(also called glucose repre
5、ssion)第5页,讲稿共62张,创作于星期二底物诱导底物诱导诱导物乳糖(或异乳糖)缺乏时,诱导物乳糖(或异乳糖)缺乏时,lacIlacI编码的阻遏物具有活性,编码的阻遏物具有活性,和操纵基因和操纵基因lacO结合后关闭转结合后关闭转录,起负调控作用录,起负调控作用存在诱导物乳糖(或异乳糖)存在诱导物乳糖(或异乳糖)时,诱导物充当辅阻遏物,时,诱导物充当辅阻遏物,和阻遏蛋白结合使其失活,和阻遏蛋白结合使其失活,转录起始转录起始(效率低)效率低),在在cAMP-CRPcAMP-CRP结合在结合在DNADNA的前的前提下,高效转录提下,高效转录CRPCRP:cyclic AMP cyclic AM
6、P Receptor Protein Receptor Protein 是乳糖是乳糖操纵子转录的正调节物操纵子转录的正调节物(或者(或者CAP)CAP)第6页,讲稿共62张,创作于星期二 激活激活葡萄糖浓度高时,细胞内葡萄糖浓度高时,细胞内cAMPcAMP浓度很低,浓度很低,CRPCRP无法无法被激活,即使阻遏蛋白被激活,即使阻遏蛋白LacILacI失活,操纵子也不失活,操纵子也不能高表达能高表达葡萄糖浓度低造成葡萄糖浓度低造成cAMPcAMP的大量生成,从而激活的大量生成,从而激活CRPCRP启动转录,起正调控作启动转录,起正调控作用用第7页,讲稿共62张,创作于星期二(2)阻遏)阻遏:Tr
7、p 操纵子阻遏操纵子阻遏当当TrpTrp很少时,由很少时,由trpRtrpR编码的阻遏蛋编码的阻遏蛋白没有活性,不能白没有活性,不能和操纵基因结合,和操纵基因结合,转录可以起始。转录可以起始。当当TrpTrp大量存在时,大量存在时,阻遏物可以和作为阻遏物可以和作为辅阻遏物辅阻遏物TrpTrp结合而结合而被激活,然后和操被激活,然后和操纵基因结合,使转纵基因结合,使转录不能起始。录不能起始。TrpTrp反馈阻遏的解除使转反馈阻遏的解除使转录强度提高录强度提高7070倍倍第8页,讲稿共62张,创作于星期二 在大肠杆菌色氨酸操纵子中在存在一种转录的弱化调节,弱化作用的解除可使转录强在大肠杆菌色氨酸操
8、纵子中在存在一种转录的弱化调节,弱化作用的解除可使转录强度升高度升高8-108-10倍。转录的倍。转录的mRNAmRNA的的5 5端存在一段前导链,通过前导链二级结构的变化、端存在一段前导链,通过前导链二级结构的变化、色氨酰色氨酰-tRNA-tRNA(色氨酸)以及核糖体的翻译来控制转录是否继续进行(色氨酸)以及核糖体的翻译来控制转录是否继续进行大肠杆菌色氨酸操纵子大肠杆菌色氨酸操纵子前导链前导链RNARNA二级结构受到氨基酰二级结构受到氨基酰-tRNA-tRNA分子的调节:分子的调节:HisHis、TrpTrp、PhePhe等氨基酸操纵子等氨基酸操纵子(3)弱化)弱化:Trp 操纵子转录弱化操
9、纵子转录弱化前导链的特点:前导链的特点:含有一个起始密码子和一个终含有一个起始密码子和一个终止密码子止密码子含有两个连续的含有两个连续的Trp密码子密码子四段能形成不同二级结构四段能形成不同二级结构的序列,可以形成终止子的序列,可以形成终止子结构或抗终止子结构结构或抗终止子结构(茎环)茎环)第9页,讲稿共62张,创作于星期二一旦转录开始后,核糖体结合在前导链上开始翻译,核糖体紧随在一旦转录开始后,核糖体结合在前导链上开始翻译,核糖体紧随在RNARNA聚合酶之聚合酶之后移动。后移动。TrpTrp缺乏时,由于大多数色氨酰缺乏时,由于大多数色氨酰-tRNA-tRNA空载,核糖体在两个连续的空载,核糖
10、体在两个连续的TrpTrp密码子处密码子处暂时停滞或移动变慢,转录出的前导链暂时停滞或移动变慢,转录出的前导链2 2、3 3区配对形成抗终止子结构,区配对形成抗终止子结构,mRNAmRNA链继链继续随着续随着RNARNA聚合酶的移动而延长,直到转录出完整的产物。聚合酶的移动而延长,直到转录出完整的产物。第10页,讲稿共62张,创作于星期二TrpTrp充足时,大多数色氨酰充足时,大多数色氨酰-tRNA-tRNA载有载有Trp Trp,核糖体快速通过两个连续的,核糖体快速通过两个连续的TrpTrp密密码子并占据前导链码子并占据前导链2 2区的一部分,使区的一部分,使2 2、3 3区不能配对形成抗终
11、止子,而是区不能配对形成抗终止子,而是3 3、4 4区配对,刚好形成终止子结构,区配对,刚好形成终止子结构,mRNAmRNA链从链从RNARNA聚合酶上脱落下来,转录提聚合酶上脱落下来,转录提前终止。前终止。第11页,讲稿共62张,创作于星期二前导链前导链RNA直接感应终端产物的浓度而改变二级结构:直接感应终端产物的浓度而改变二级结构:THI(B1)-box、RFN(B2)-box和和 B12-box维生素操纵子、维生素操纵子、嘌呤操纵子等或与其代谢相关的基因,这种调节结构也称为嘌呤操纵子等或与其代谢相关的基因,这种调节结构也称为“Riboswitch”(ribonucleotide swit
12、ch)(4)Riboswitch第12页,讲稿共62张,创作于星期二可以体外通过对随机可以体外通过对随机RNA序列的筛选得到可以感应特定代谢物浓度的适配体序列的筛选得到可以感应特定代谢物浓度的适配体(aptamer),根据该代谢物浓度变化来开关目标基因的表达),根据该代谢物浓度变化来开关目标基因的表达第13页,讲稿共62张,创作于星期二3.原核表达体系原核表达体系(1 1)启动子)启动子(基本类型基本类型2 2类:组成型和调控型)类:组成型和调控型)lac 启动子启动子 最早应用的表达系统,含最早应用的表达系统,含CRP结合位点及结合位点及lacO,其转录,其转录受受CRP正调控和正调控和la
13、cI负调负调控控。lacUV5 启动子启动子 Plac的突变型的突变型,能够在没有能够在没有CAP的存在下更有效地起始转录,该启动子在转的存在下更有效地起始转录,该启动子在转录水平上录水平上只受只受lacI的调控的调控,因而随后得到了更广泛采用,因而随后得到了更广泛采用-35 -10第14页,讲稿共62张,创作于星期二 tac 启动子启动子/trc启动子启动子 trp启动子启动子-35区和区和lacUV5-10区、区、lacO区杂合区杂合,启动强度更高(约比启动强度更高(约比PlacUV5高高1个个数量级数量级,比比trp启动子高启动子高3倍),适合于高表达系统倍),适合于高表达系统。tacI
14、(-20为界限)为界限)tacII(-11为界,下为界,下游为人工合成的游为人工合成的46bp片段)片段)trc启动子和启动子和tacI类似类似受受IPTG诱导启动子的问题:无诱导物存在时本底表达高(甚至有一些基因不加诱导物时表达水诱导启动子的问题:无诱导物存在时本底表达高(甚至有一些基因不加诱导物时表达水平更恰当)平更恰当)采用采用lacI突变基因:突变基因:lacIq,突变后导致阻遏蛋白表达量增加,突变后导致阻遏蛋白表达量增加第15页,讲稿共62张,创作于星期二 T7噬菌体启动子噬菌体启动子 只有只有T7RNA聚合酶才能使其启动,故可以使克隆基因独自得到表达。聚合酶才能使其启动,故可以使克
15、隆基因独自得到表达。T7RNA聚合酶的聚合酶的效率比大肠杆菌效率比大肠杆菌 RNA聚合酶高聚合酶高5倍左右,它能使质粒沿模板连续转录几周,许多外倍左右,它能使质粒沿模板连续转录几周,许多外源终止子都不能有效地终止它的序列,因此它可转录某些不能被大肠杆菌源终止子都不能有效地终止它的序列,因此它可转录某些不能被大肠杆菌RNA聚聚合酶有效转录的序列。合酶有效转录的序列。这个系统可以高效表达其他系统不能有效表达的基因,但要注意用这种启动子时这个系统可以高效表达其他系统不能有效表达的基因,但要注意用这种启动子时宿主宿主中必须含有中必须含有T7RNA聚合酶聚合酶,如如BL21(DE3)菌株菌株问题:表达强
16、度超强,如何控制?实现诱导表达?问题:表达强度超强,如何控制?实现诱导表达?利用利用lacUV5启动子控制启动子控制T7RNA聚合酶基因的表达,实现诱导聚合酶基因的表达,实现诱导 在在T7启动子下游加上数个启动子下游加上数个lacO序列,使其变为诱导启动子。序列,使其变为诱导启动子。PBAD 启动子启动子 PBAD 启动子受阿拉伯糖诱导,无诱导物时本底表达低,启动子效率较高。另启动子受阿拉伯糖诱导,无诱导物时本底表达低,启动子效率较高。另外随着诱导物浓度增加,启动表达的细胞比例增加(而转录强度并不增加),即外随着诱导物浓度增加,启动表达的细胞比例增加(而转录强度并不增加),即对单个细胞而言表达
17、状态只有对单个细胞而言表达状态只有“0”和和“1”PL启动子启动子 l噬菌体早期左向转录启动子,强度比噬菌体早期左向转录启动子,强度比Trp启动子高启动子高11倍。倍。PL启动子受控于温敏阻遏物启动子受控于温敏阻遏物 cIts857。在低温。在低温(30)时,时,cIts857阻遏蛋白可阻遏其转录。在高温阻遏蛋白可阻遏其转录。在高温(45)时,时,cIts857失活,启动子转录。适合于表达对大肠杆菌有毒的基因产物,缺点是温度转换失活,启动子转录。适合于表达对大肠杆菌有毒的基因产物,缺点是温度转换也可诱导热休克基因,其中有一些热休克基因编码蛋白酶。另外不利于大规模也可诱导热休克基因,其中有一些热
18、休克基因编码蛋白酶。另外不利于大规模生产的应用(升温慢)。生产的应用(升温慢)。第16页,讲稿共62张,创作于星期二n大肠杆菌大肠杆菌典型的典型的SD序列序列为为“AAGGA”,枯草芽孢杆菌为,枯草芽孢杆菌为“GGAGG”,一般来说,一般来说,mRNA与核糖体与核糖体16S rRNA(3-AUUCCUCCA-5).的结合程度越强,翻译的起始效的结合程度越强,翻译的起始效率就越高,率就越高,(2 2)RBS RBS 序列与起始密码子序列与起始密码子在间隔相同的情况下,在间隔相同的情况下,UAAGGAGG的的SD序列比序列比AAGGA的的SD序列能使蛋白质序列能使蛋白质的产量提高的产量提高36倍;
19、倍;对于同一对于同一SD序列,存在一序列,存在一最佳的间隔最佳的间隔。AAGGA的间隔为的间隔为5-7个核苷酸,而个核苷酸,而UAAGGAGG的间隔为的间隔为4-8个核苷酸;个核苷酸;对于同一对于同一SD序列,有翻译所必需的最小间隔。序列,有翻译所必需的最小间隔。AAGGA的最小间隔为的最小间隔为5个核苷酸,个核苷酸,而而UAAGGAGG的最小间隔约为的最小间隔约为4个核苷酸,以保证起始密码子刚好位于核糖体个核苷酸,以保证起始密码子刚好位于核糖体P位。位。大肠杆菌中的起始大肠杆菌中的起始tRNA分子可以同时识别分子可以同时识别AUG、GUG和和UUG三种三种起始密码子起始密码子,但识别频率并不
20、相同,通常但识别频率并不相同,通常GUG为为AUG的的50%,而,而UUG只及只及AUG的的25%。在。在枯草芽孢杆菌中,多数基因的起始密码子为枯草芽孢杆菌中,多数基因的起始密码子为AUG,为起始密码子的最优选择。,为起始密码子的最优选择。从从AUG开始的前几个密码子碱基序列也至关重要,这一序列不能与开始的前几个密码子碱基序列也至关重要,这一序列不能与mRNA的的5端非端非编码区形成茎环结构,否则会严重干扰编码区形成茎环结构,否则会严重干扰mRNA在核糖体上的准确定位在核糖体上的准确定位 第17页,讲稿共62张,创作于星期二E.coliB.subtilis原核生物中普遍存在重叠基因,而且重叠基
21、因之间具有翻译偶联现象:即两个原核生物中普遍存在重叠基因,而且重叠基因之间具有翻译偶联现象:即两个基因的翻译存在固定的计量学关系,机理主要有两种:基因的翻译存在固定的计量学关系,机理主要有两种:核糖体移码或滑动(核糖体移码或滑动(40bp以内)以内),即同一核糖体翻译重叠基因,即同一核糖体翻译重叠基因 mRNA形成二级结构,上游基因的形成二级结构,上游基因的mRNA序列将下游基因的序列将下游基因的SD 序列掩蔽,序列掩蔽,只有上游基因翻译后才能破坏二级结构而暴露出下游基因的只有上游基因翻译后才能破坏二级结构而暴露出下游基因的SD序列,核糖体序列,核糖体才能结合进行下游基因翻译。才能结合进行下游
22、基因翻译。核糖体与核糖体与mRNA结合稳定性在刚开始翻译时较差,遇到二级结构可能会影响翻结合稳定性在刚开始翻译时较差,遇到二级结构可能会影响翻译效率。而在蛋白质链从核糖体中延伸出来后(约译效率。而在蛋白质链从核糖体中延伸出来后(约10个残基)稳定性较强,通个残基)稳定性较强,通常遇到强度大的二级结构也不会影响翻译。常遇到强度大的二级结构也不会影响翻译。第18页,讲稿共62张,创作于星期二(3 3)终止子)终止子表达的基因末端的终止子非常重要,可以避免表达的基因末端的终止子非常重要,可以避免RNARNA聚合酶的通读而聚合酶的通读而合成不必要的合成不必要的RNARNA序列。序列。通读后多余的通读后
23、多余的RNARNA序列可能会形成不利于基因表达的二级结构序列可能会形成不利于基因表达的二级结构通读会影响下游基因的转录,对于质粒,还会影响其复制。通读会影响下游基因的转录,对于质粒,还会影响其复制。通常需要在表达载体的多克隆位点下游加上强终止子,对于通常需要在表达载体的多克隆位点下游加上强终止子,对于T7T7启动子启动子这样的强启动子,甚至需要加这样的强启动子,甚至需要加2-32-3个连续的终止子以防止通读。个连续的终止子以防止通读。同理,也需要防止核糖体同理,也需要防止核糖体“通读通读”而产生不必要的蛋白质,一般而产生不必要的蛋白质,一般在表达载体下游连续加上数个终止密码子在表达载体下游连续
24、加上数个终止密码子(UAAU是是E.coli中最有效中最有效的转录终止序列的转录终止序列)。(4 4)密码子偏爱性)密码子偏爱性在基因受体菌中表达基因供体菌中与密码子对应的在基因受体菌中表达基因供体菌中与密码子对应的tRNAtRNA基因基因根据受体菌的密码子偏爱性进行序列优化后重新合成外源基因根据受体菌的密码子偏爱性进行序列优化后重新合成外源基因第19页,讲稿共62张,创作于星期二(5 5)表达策略)表达策略对于蛋白质产品:对于蛋白质产品:采用高拷贝载体、诱导性强启动子、高效采用高拷贝载体、诱导性强启动子、高效RBS序列,以保证目的蛋白质的产量序列,以保证目的蛋白质的产量(或低(或低拷贝载体上
25、串联多个基因)拷贝载体上串联多个基因)对于代谢物产品:对于代谢物产品:由于表达的蛋白起到催化剂的作用,其量要适中,不能耗费大量碳氮源和能量去合成过由于表达的蛋白起到催化剂的作用,其量要适中,不能耗费大量碳氮源和能量去合成过量催化剂,既要避免过大的代谢负担,也要避免底物的浪费。量催化剂,既要避免过大的代谢负担,也要避免底物的浪费。大量研究表明采用中低拷贝数载体(大量研究表明采用中低拷贝数载体(2030),中等强度启动子效果较好,也可在染色),中等强度启动子效果较好,也可在染色体上整合进行表达,启动子为强启动子体上整合进行表达,启动子为强启动子 生产代谢物时通常要表达数个、甚至数十个基因,这些基因
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