生物化学蛋白质精选PPT.ppt
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1、关于生物化学蛋白质第1页,讲稿共72张,创作于星期二一一.蛋白质的酸碱性质蛋白质的酸碱性质 各个解离基团的各个解离基团的pKpK值与游离氨基酸的值与游离氨基酸的不完全相同。短肽的等电点和净电荷量可不完全相同。短肽的等电点和净电荷量可以根据以根据pKpK值计算,值计算,蛋白质的等电点蛋白质的等电点要用等电要用等电聚焦等方法测定。聚焦等方法测定。第2页,讲稿共72张,创作于星期二二二.蛋白质分子的大小与形状蛋白质分子的大小与形状 (一)根据化学组成测定最低相对分子质量(一)根据化学组成测定最低相对分子质量 假定某种微量成分只有一个,测出其百分含假定某种微量成分只有一个,测出其百分含量后,可用比例式
2、算出最低相对分子质量。量后,可用比例式算出最低相对分子质量。若测出两种微量成分的百分含量,分别用若测出两种微量成分的百分含量,分别用比例式算出的最低相对分子质量不相同时,可比例式算出的最低相对分子质量不相同时,可计算两个最低相对分子质量近似的最小公倍数。计算两个最低相对分子质量近似的最小公倍数。第3页,讲稿共72张,创作于星期二 例题:一种纯酶含亮氨酸(例题:一种纯酶含亮氨酸(Mr 131Mr 131)1.65%1.65%,含异亮氨酸(,含异亮氨酸(Mr131Mr131)2.48%2.48%,求最低相对分子质量。,求最低相对分子质量。解:按照解:按照LeuLeu的百分含量计算,最低的百分含量计
3、算,最低Mr XMr X1 1:X X1 1=(100=(100 131)/1.65=7939.4131)/1.65=7939.4 按照按照IleIle的百分含量计算最低的百分含量计算最低Mr XMr X2 2:X X2 2=(100=(100 131)/2.48=5282.3131)/2.48=5282.3 由于由于X X1 1和和X X2 2数字差异较大,提示这种酶含数字差异较大,提示这种酶含LeuLeu和和IleIle不止不止1 1个,为个,为了估算了估算LeuLeu和和IleIle的个数,首先计算:的个数,首先计算:X X1 1/X/X2 2=7939.4/5282.31.5=7939
4、.4/5282.31.5 这种酶含任何氨基酸的个数均应是整数,说明该酶至少含有这种酶含任何氨基酸的个数均应是整数,说明该酶至少含有2 2个个LeuLeu,3 3个个IleIle,其最低相对分子质量为:,其最低相对分子质量为:7939.4 7939.4 2 2=15878.8 =15878.8 或或 5282.35282.33=15846.93=15846.9第4页,讲稿共72张,创作于星期二(二)渗(二)渗透压法测透压法测定相对分定相对分子质量子质量 第5页,讲稿共72张,创作于星期二(三(三 )沉降)沉降分析法分析法测定相测定相对分子对分子质量质量 第6页,讲稿共72张,创作于星期二基本原理
5、:基本原理:离心力离心力(centrifugal forcecentrifugal force,FcFc):):当一个粒子(生物大分子或细胞器)在高速当一个粒子(生物大分子或细胞器)在高速旋转下受到离心力作用时,此离心力旋转下受到离心力作用时,此离心力“Fc”Fc”由下由下式定义:式定义:F=m*a=m*2 r F=m*a=m*2 r a a 粒子旋转的加速度,粒子旋转的加速度,m m 沉降粒子的沉降粒子的有效质量,有效质量,粒子旋转的角速度,粒子旋转的角速度,rr粒子的粒子的旋转半径旋转半径(cm)(cm)。第7页,讲稿共72张,创作于星期二 相对离心力(相对离心力(relative cen
6、trifugal relative centrifugal forceforce,RCFRCF):由于各种离心机转子的半径或者离心管由于各种离心机转子的半径或者离心管至旋转轴中心的距离不同,离心力而受变化,至旋转轴中心的距离不同,离心力而受变化,因此在文献中常用因此在文献中常用“相对离心力相对离心力”或或“数字数字g”g”表示离心力表示离心力,只要,只要RCFRCF值不变,一个样品值不变,一个样品可以在不同的离心机上获得相同的结果。可以在不同的离心机上获得相同的结果。第8页,讲稿共72张,创作于星期二G G1.11(101.11(10-5-5)Rrpm)Rrpm离心半径为离心半径为1010厘米
7、,转速为厘米,转速为80008000,其离心力为:,其离心力为:G G1.111.11*1010-5-5*1010*(80008000)7104 7104 即离心力为即离心力为7104g.7104g.而当离心力为而当离心力为8000g 8000g 时,其转速应为:时,其转速应为:84898489即约为即约为8500rpm8500rpm第9页,讲稿共72张,创作于星期二 沉降系数(沉降系数(sedimentation coefficientsedimentation coefficient,s s):):1924 1924年年SvedbergSvedberg对沉降系数下的定义为颗粒在单位离对沉降
8、系数下的定义为颗粒在单位离心力场中移动的速度。心力场中移动的速度。S S:沉降系数,时常在:沉降系数,时常在1010-13-13秒左右,故把沉降系数秒左右,故把沉降系数1010-13-13秒称秒称为一个为一个SvedbergSvedberg单位,简写单位,简写S S,量纲为秒。,量纲为秒。例如,动物原生质核糖体的沉降系数等于例如,动物原生质核糖体的沉降系数等于80S80S,它,它的含义就是:的含义就是:80801010-13-13s s。细胞及细胞的各组分的沉降系数。细胞及细胞的各组分的沉降系数有很大的差异,所以可以利用生物样品沉降系数的差异采用有很大的差异,所以可以利用生物样品沉降系数的差异
9、采用离心技术将他们彼此分开。离心技术将他们彼此分开。第10页,讲稿共72张,创作于星期二第11页,讲稿共72张,创作于星期二沉降法沉降法沉降法沉降法:又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液又称超速离心法。基本原理:蛋白质分子在溶液中受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。中受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。中受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。中受到强大离心力的作用时,其密度大于溶剂而沉降。在沉降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同的速度在沉降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同
10、的速度在沉降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同的速度在沉降过程中,分子量相同的蛋白质颗粒以相同的速度沉降,在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学沉降,在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学沉降,在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学沉降,在介质中会形成一条清晰的条带,用特制的光学仪器扫描记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降仪器扫描记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降仪器扫描记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降仪器扫描记录,可以显示出所有蛋白质条带位置及沉降速度。物质颗粒在单位离心力场中的沉降速度为恒定值,速度。物质颗粒在单位离心力场中的沉降速度为恒定值,速度。物质颗粒
11、在单位离心力场中的沉降速度为恒定值,速度。物质颗粒在单位离心力场中的沉降速度为恒定值,称沉降系数,用称沉降系数,用称沉降系数,用称沉降系数,用S S S S表示,一个表示,一个表示,一个表示,一个S S S S单位为单位为单位为单位为11011011011013s13s13s13s。蛋白质的沉降系数蛋白质的沉降系数蛋白质的沉降系数蛋白质的沉降系数S S S S(20202020水中)大约为水中)大约为水中)大约为水中)大约为11011011011013-2001013-2001013-2001013-2001013s13s13s13s即即即即1S-200S1S-200S1S-200S1S-20
12、0S。用沉降法求出。用沉降法求出。用沉降法求出。用沉降法求出S S S S值并计算出分子量。注意。值并计算出分子量。注意。值并计算出分子量。注意。值并计算出分子量。注意。文献中经常出现以文献中经常出现以文献中经常出现以文献中经常出现以S S S S为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。为单位描述蛋白质。第12页,讲稿共72张,创作于星期二(四)凝胶过滤法测定相对分子质量(四)凝胶过滤法测定相对分子质量 当含有各种组分的样品流经凝胶层析柱时,当含有各种组分的样品流经凝胶层析柱时,大分子物质由于分子直径大,不易进入凝胶颗粒大分子物质由于分子直径大,不易进入凝胶颗粒的微孔,沿凝胶颗粒
13、的间隙以较快的速度流过凝的微孔,沿凝胶颗粒的间隙以较快的速度流过凝胶柱。而小分子物质能够进入凝胶颗粒的微孔中,胶柱。而小分子物质能够进入凝胶颗粒的微孔中,向下移动的速度较慢,从而使样品中各组分按相向下移动的速度较慢,从而使样品中各组分按相对分子质量从大到小的顺序先后流出层析柱,而对分子质量从大到小的顺序先后流出层析柱,而达到分离的目的。达到分离的目的。第13页,讲稿共72张,创作于星期二第14页,讲稿共72张,创作于星期二n n 若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积若以组分的洗脱体积(Ve)(Ve)(Ve)(Ve)对组分相对分子质量的对数对组分相对分子质量的对数对组分相对分子
14、质量的对数对组分相对分子质量的对数(lgMr)(lgMr)(lgMr)(lgMr)作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。作图,可得一曲线,其中主要部分成直线关系。以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗以此为标准曲线,可以通过测定某一未知组分的洗脱体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。脱体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。脱体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。脱体积,而从标准曲线中查得其相对分子质量。n n
15、在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积在实际应用中多以相对洗脱体积Kav(Kav=Ve/Vt)Kav(Kav=Ve/Vt)Kav(Kav=Ve/Vt)Kav(Kav=Ve/Vt)对对对对lgMrlgMrlgMrlgMr作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的特性。作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的特性。作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的特性。作曲线,称为选择曲线,曲线的斜率说明凝胶的特性。每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、酶与清蛋每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、酶与清蛋每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、酶
16、与清蛋每一类型的化合物,如球蛋白类、右旋糖酐类、酶与清蛋白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,未知相对分子白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,未知相对分子白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,未知相对分子白类等都有各自特定的选择曲线。测定时,未知相对分子质量的组分应位于直线部分为宜。若不在直线部分,可选质量的组分应位于直线部分为宜。若不在直线部分,可选质量的组分应位于直线部分为宜。若不在直线部分,可选质量的组分应位于直线部分为宜。若不在直线部分,可选用另一种凝胶重新试验。用另一种凝胶重新试验。用另一种凝胶重新试验。用另一种凝胶重新试验。第15页,讲稿共72张,创作于星期二第16页,讲稿共72
17、张,创作于星期二(五)五)SDSSDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定相对分子质量聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定相对分子质量 SDSSDS即十二烷基硫酸钠是阴离子去污剂即十二烷基硫酸钠是阴离子去污剂,在水溶,在水溶液中,以单体和分子团的混合形式存在,单体和分子团液中,以单体和分子团的混合形式存在,单体和分子团的浓度与的浓度与SDSSDS总浓度、离子强度及温度有关,为了使单体总浓度、离子强度及温度有关,为了使单体和蛋白质结合生成和蛋白质结合生成蛋白质蛋白质-SDS-SDS复合物复合物,需要采取低离,需要采取低离子强度,使单体浓度有所升高。在单体浓度为子强度,使单体浓度有所升高。在单体浓度为0.5m mol/L
18、0.5m mol/L以上时,蛋白质和以上时,蛋白质和SDSSDS就能结合成复合物;当就能结合成复合物;当SDSSDS单体浓度单体浓度大于大于1m mol/L1m mol/L时,与大多数蛋白质平均结合比为时,与大多数蛋白质平均结合比为1.4g SDS/g1.4g SDS/g蛋白质;在低于蛋白质;在低于0.5m mol/L0.5m mol/L浓度时,其结合比一般为浓度时,其结合比一般为0.4gSDS/g0.4gSDS/g蛋白质。蛋白质。第17页,讲稿共72张,创作于星期二n n由于由于由于由于SDSSDSSDSSDS带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带
19、的带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的带有大量负电荷,当其与蛋白质结合时,所带的负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异,使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而可利用使蛋白质均带有相同密度的负电荷,因而
20、可利用MrMrMrMr差异将各种蛋白质分开。差异将各种蛋白质分开。差异将各种蛋白质分开。差异将各种蛋白质分开。n n在蛋白质溶解液中,加入在蛋白质溶解液中,加入在蛋白质溶解液中,加入在蛋白质溶解液中,加入SDSSDSSDSSDS和疏基乙醇,和疏基乙醇,和疏基乙醇,和疏基乙醇,巯基乙醇巯基乙醇巯基乙醇巯基乙醇可使可使可使可使蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚单位。蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚单位。蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚单位。蛋白质分子中的二硫键还原,使多肽分成单个亚单位。SDSSDSSDSSDS可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋白质构象可使蛋白质的氢
21、键、疏水键打开,还引起蛋白质构象可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋白质构象可使蛋白质的氢键、疏水键打开,还引起蛋白质构象的改变。的改变。的改变。的改变。n n此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液此复合物的流体力学和光学性质均表明,它们在水溶液中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的中的形状近似雪茄形的长椭圆棒长椭圆棒长椭圆棒长椭圆棒。不同蛋白质。不同蛋白质。不同蛋白质。不同蛋白质-SDS-SDS-SDS-SDS复合复合复合复合物的短轴相同,约物的短轴相同,约物的短
22、轴相同,约物的短轴相同,约1.8nm1.8nm1.8nm1.8nm,而长轴则与蛋白质的,而长轴则与蛋白质的,而长轴则与蛋白质的,而长轴则与蛋白质的MrMrMrMr成正成正成正成正比。比。比。比。第18页,讲稿共72张,创作于星期二 测定未知蛋白质测定未知蛋白质MrMr时,可选用相应的一组标准蛋白及时,可选用相应的一组标准蛋白及适宜的凝胶浓度,同时进行适宜的凝胶浓度,同时进行SDS-PAGESDS-PAGE,则可根据已知,则可根据已知MrMr蛋白质的蛋白质的电泳迁移率电泳迁移率和和MrMr的对数的对数作出标准曲线,再根据作出标准曲线,再根据未知蛋白质的电泳迁移率求得未知蛋白质的电泳迁移率求得Mr
23、Mr。它不仅用于蛋白质它不仅用于蛋白质MrMr测定,还可用于测定,还可用于蛋白混合组分的蛋白混合组分的分离和亚组分的分析分离和亚组分的分析,当蛋白质经,当蛋白质经SDS-PAGESDS-PAGE分离后,设分离后,设法将各种蛋白质从凝胶上洗脱下来,除去法将各种蛋白质从凝胶上洗脱下来,除去SDSSDS,还可进行,还可进行氨基酸顺序、酶解图谱及抗原性质等方面的研究。氨基酸顺序、酶解图谱及抗原性质等方面的研究。第19页,讲稿共72张,创作于星期二第20页,讲稿共72张,创作于星期二第21页,讲稿共72张,创作于星期二第22页,讲稿共72张,创作于星期二三、蛋白质的胶体性质与蛋白质的沉淀三、蛋白质的胶体
24、性质与蛋白质的沉淀 (一)(一)蛋白质的胶体性质蛋白质的胶体性质 大小在大小在1-1001-100nmnm范围内;范围内;同种电荷互相排斥;同种电荷互相排斥;质点外围有水化层。质点外围有水化层。(二)(二)蛋白质的沉淀蛋白质的沉淀 1.1.盐析法盐析法 2.2.有机溶剂沉淀法有机溶剂沉淀法 3.3.重金属盐沉淀法重金属盐沉淀法 4.4.生物碱试剂和某些酸类沉淀法生物碱试剂和某些酸类沉淀法 5.5.加热变性沉淀法加热变性沉淀法第23页,讲稿共72张,创作于星期二四、蛋白质分离纯化的一般原则四、蛋白质分离纯化的一般原则 1.1.前处理前处理 要选择合适的材料要选择合适的材料;合适的破碎方法合适的破
25、碎方法;合适的提取液。合适的提取液。2.2.粗分级分离粗分级分离 要方法简便,处理量大。常用盐析、等电点沉淀要方法简便,处理量大。常用盐析、等电点沉淀和有机溶剂分级分离等方法,有时可用超过滤或凝胶和有机溶剂分级分离等方法,有时可用超过滤或凝胶过滤等方法。过滤等方法。3.3.细分级分离细分级分离 主要使用各种层析、电泳,方法要精心选择,巧妙配主要使用各种层析、电泳,方法要精心选择,巧妙配合。后期可用结晶法。合。后期可用结晶法。第24页,讲稿共72张,创作于星期二五、蛋白质的分离纯化方法五、蛋白质的分离纯化方法(一)根据分子大小不同的纯化方法(一)根据分子大小不同的纯化方法1.1.透析和超滤透析和
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